#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 20, 2025; 13:48 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Jung T., & Burgess T. 2009. Re-evaluation of Phytophthora citricola isolates from multiple woody hosts in Europe and North America reveals a new species, Phytophthora plurivora sp. nov. Persoonia, 22: 95-110. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10021] [ The following blocks are input data for analysis step 5068 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5068; DIMENSIONS NTAX=29; TAXLABELS Phytophthora_boehmeriae_CBS291.29_AY564165 Phytophthora_capsici_302_AY129166 Phytophthora_citricola_CBS221.88_IMI021173_FJ237512 Phytophthora_citricola_CBS295.29_FJ665244 Phytophthora_citricola_I_US1_FJ665242 Phytophthora_citricola_I_US10_FJ665243 Phytophthora_citricola_P1817_AY564170 Phytophthora_citrophthora_CBS274.33_AY564171 Phytophthora_colocasiae_ATCC56193_AY129173 Phytophthora_cryptogea_HR1sspp99_AY564174 Phytophthora_inflata_IMI342898_AY564187 Phytophthora_inflata_InfGaul_AY894685 Phytophthora_multivora_CBS124094_FJ237506 Phytophthora_multivora_CBS124095_FJ237508 Phytophthora_multivora_DDS1450_FJ237504 Phytophthora_multivora_VHS16439_FJ237505 Phytophthora_multivora_WAC13200_FJ237509 Phytophthora_multivora_WAC13204_FJ237507 Phytophthora_palmivora_CBS236.30_AY564197 Phytophthora_plurivora_CBS124087_FJ237510 Phytophthora_plurivora_CBS1240872_FJ665240 Phytophthora_plurivora_CBS124089_FJ665237 Phytophthora_plurivora_CBS124090_FJ237511 Phytophthora_plurivora_CBS124091_FJ665238 Phytophthora_plurivora_CBS124092_FJ665241 Phytophthora_plurivora_CBS124093_FJ665236 Phytophthora_plurivora_PLU77_FJ665239 Phytophthora_quininea_CBS407.48_AY564200 'Phytophthora tropicalis PD97/11132 AY564161' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4583] TITLE Plurivora_COX; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5068; DIMENSIONS NCHAR=742; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=N GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Phytophthora_boehmeriae_CBS291.29_AY564165 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tropicalis PD97/11132 AY564161',Phytophthora_capsici_302_AY129166)))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6683] END;