#NEXUS
[!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file.


Generated on December 27, 2025; 15:28 GMT

TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
O'leary M. 1999. Parsimony analysis of total evidence from extinct and extant taxa,
and the cetacean-artiodactyl question. Cladistics, 15(3): 315-330.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10029]

[ The following blocks are input data for analysis step 5095 ]
BEGIN TAXA;
        TITLE  TaxaForAnalysisStep5095;
        DIMENSIONS NTAX=37;
        TAXLABELS
            Agriochoerus
            Ambulocetus
            Andrewsarchus
            Ankalagon
            Archaeotherium
            Arctocyon
            Balaenoptera_edeni
            Basilosaurus
            Camelus_dromedarius
            Diacodexis
            Dissacus
            Dorudon
            Elomeryx
            Eoconodon
            Equus_caballus
            Hapalodectes
            Harpagolestes
            Hexaprotodon_liberiensis
            Hippopotamus_amphibius
            Hyopsodus
            Hyracotherium
            Meniscotherium
            Mesonyx
            Ovis_aries
            Pachyaena
            Pakicetus
            Phenacodus
            Poebrotherium
            Protocetidae_sp._Cross_Whale
            Protocetus
            Remingtonocetus
            Sinonyx
            Sus_barbatus
            Synoplotherium
            Tapirus_terrestris
            Tragulus_javanicus
            Tursiops_truncatus
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4225]

	TITLE param_e;
	LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5095;
	DIMENSIONS NCHAR=2613;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560       570       580       590       600       610       620       630       640       650       660       670       680       690       700       710       720       730       740       750       760       770       780       790       800       810       820       830       840       850       860       870       880       890       900       910       920       930       940       950       960       970       980       990       1000       1010       1020       1030       1040       1050       1060       1070       1080       1090       1100       1110       1120       1130       1140       1150       1160       1170       1180       1190       1200       1210       1220       1230       1240       1250       1260       1270       1280       1290       1300       1310       1320       1330       1340       1350       1360       1370       1380       1390       1400       1410       1420       1430       1440       1450       1460       1470       1480       1490       1500       1510       1520       1530       1540       1550       1560       1570       1580       1590       1600       1610       1620       1630       1640       1650       1660       1670       1680       1690       1700       1710       1720       1730       1740       1750       1760       1770       1780       1790       1800       1810       1820       1830       1840       1850       1860       1870       1880       1890       1900       1910       1920       1930       1940       1950       1960       1970       1980       1990       2000       2010       2020       2030       2040       2050       2060       2070       2080       2090       2100       2110       2120       2130       2140       2150       2160       2170       2180       2190       2200       2210       2220       2230       2240       2250       2260       2270       2280       2290       2300       2310       2320       2330       2340       2350       2360       2370       2380       2390       2400       2410       2420       2430       2440       2450       2460       2470       2480       2490       2500       2510       2520       2530       2540       2550       2560       2570       2580       2590       2600       2610       2620       2630    ]
[                                         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .    ]
Agriochoerus                     ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Ambulocetus                      ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Andrewsarchus                    ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Ankalagon                        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Archaeotherium                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Arctocyon                        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Balaenoptera_edeni               CCCAACCATCCACCACTTTTCCCAGCCACAGCCTCTAGTCTATTCCTAC{AG}CTGGGCCAATCCCTTCCCCTATCCTTCCACAAAACATCCTGACTCTTGCTCAGCCCCCTGTGGTGGTGCCTTTCCCTCAGCCTGAAATAATGGAAATCCCCAAAGCTAAGGAGACTATCCTTCCTAAGCATAAAGAAATGCCCTTCCCTATATCTCCAGTAGAGCCCTTTATTGAAAGCCAGAGCCTGACTCTCACTGATCTTGAAAATCTGCACCTTCCTCTGCCTCTGCTCCAGTCCTTGATGCACCAGCCTCCCCAGCCTCTTCCTCCTACCCCCATGTTTCCTCCTCAGCCCCTGCCGTCCCTTTC------------TCAGCCCAAAGTCCTGCCTATTCCCCAGCAAGTGGTGCCCCACATCCAGAGACATATGCCCATCCAGGCCCAAAGATTCGTAAGTAGTTTTT--A-T--GTTTCTCGCTGTGTTTGCACTGGACGTG--GGCAGAGAAATAAAAGAAATTCTCTCTCAAATACCATTTGGCAGTTTAGAC--TTTTTTTTAAAAA----CGTAGTCTAGGTTTTACCTATTTTGATT---A---GTAGATCTTATGTA-GCTTTTTATCAGGATTTTTAATCACTCTATT---ATTGTATTTTCAGGGTAGTTATTGCCCAACTACCTGTGGAATTGCAGATTTCCTGTCTACTTACCAAACCAGTGTAGACAAGGATCTACAGAATTTGGAAGGAATCTTACGTCAAGTTGAGAACAAGACATCAGAAGCCAGAGAGTTGGTCAAAGCAATCCAGATCAGCTACCGCTCTGATGGACCAGCA{AG}AGCCAAGTGAGAATCTAACCACCACTGACTGAGAACTTCATCTGTGAAGTTCTTTTGCTGTTATTTCAGTGGTTCTGTTTGTTTACGTA-TTTTTATGTCTCTGATCCCATGTTACAGATGGGATAGACAGTGCTACCAAGATTTCCAAGAAAATGTTGTTGTTCAATGAAAAAACAGTAAAATATATTCCAATTCATTATGTGCTGAGTAGGTATCCTAGTT{AG}TGGACTCAATTACTACCAGCACAGACTAGCTGCACTAATTAATAACCAATTTATGCCTTACCCATATTATGCAAAGCCAGTTGCAGTTAGGCCACATGCCCAAATTCCTCAATGGCA{AG}TTCCTGCCAAATATC-CACCCACCTA-CTGTGGCACATCACCCACACCCACGTCCATCATTTATTGCCATTCCACCAAAGAAAACTCAGGA-TAAAACAGTCATCCCTATCATCAATACCATTGCTACTGCTGAGCCTACACTTATACCTACCACTGAACCA----AT--AGTGAACACTG------TAGT-----------TA-CTCCAGAAGCTTCCTCAGAATTC---ATCACGAGTACACCTGAGACCACCACAGTCCAAGTTACTTCACCTGTGGTCTAAATGACCAACATCCGAAAAACACACCCACTAATAAAGATTGTCAACGATGCATTCGTTGATCTCCCCACCCCATCAAATATCTCCTCATGATGAAATTTCGGCTCCCTACTCGGCCTCTGCTTAATTACACAAATCCTAACAGGCCTATTCCTAGCAATACACTACACACCAGACACAACAACCGCCTTCTCATCAGTTGCACACATTTGCCGAGACGTAAACTACGGCTGAGTTATCCGATACCTACACGCAAACGGAGCCTCCATATTCTTCATCTGTCTCTACGCTCACATAGGACGAGGCCTATACTACGGCTCCTATGCCTTTCGAGAAACATGAAACATCGGAGTTATCCTACTATTCACAGTTATAGCCACCGCATTCATAGGCTACGTCCTACCCTGAGGACAAATATCATTTTGAGGCGCAACCGTCATCACCAACCTCTTATCAGCAATCCCATACATTGGTACTACCCTAGTCGAATGAATCTGGGGCGGTTTCTCTGTAGATAAAGCAACACTAACACGCTTTTTTGCCTTCCACTTTATCCTCCCCTTCATTATTCTAGCACTAGCAATGGTCCACCTCATTTTCCTCCACGAAACAGGATCCAATAACCCCACAGGTATTCCATCCAACATAGACAAAATCCCATTCCACCCCTATTACACAACTAAAGACATTCTAGGCGCCCTACTACTAATCCTAACCCTACTAATGCTAACCCTATTCGTACCCGACCTACTTGGAGACCCAGACAACTACACTCCAGCAAATCCACTCAGTACCCCAACACACATTAAACCAGAATGATATTTCCTATTTGCATACGCAATCCTACGATCAATTCCCAACAAATTAGGCGGAGTCTTAGCCCTACTACTCTCAATCCTAATCCTAGCCTTAATCCCAATACTCCACACATCTAAACAACGAAGCATAATGTTCCGACCCTTTAGCCAATTCCTATTTTGAGTCCTAATTGCAGACTTACTAACCCTGACATGAATCGGCGGCCAACCCGTAGAACACCCCTACGTAATCGTAGGCCAATTCGCATCCATCCTCTATTTCCTCCTAATTCTAGTACTAATACCAGTAACTAGTCTTATCGAGAATAAACTTATAAAATGAAGA
Basilosaurus                     ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Camelus_dromedarius              AAAAAAAATCTACACCTTTCCCCAGCCCCAGTCTCTAGTCTATTCTCACACTGAGCCCATCCCTTACCCTATCCTTCCACAAAACTTTCTGCCGCCTCTTCAGCCTGCTGTGATGGTACCTTTTCTTCAGCCTAAAGTAATGGATGTCCCCAAAACTAAGGAGACCATCATTCCTAAGCGCAAAGAAATGCCCTTGCTTCAGTCTCCAGTAGTGCCCTTTACTGAAAGCCAGAGCCTGACTCTCACTGATCTCGAAAATCTGCACCTTCCTCTGCC{AT}CTGCTCCAGTCTTTGATGTACCAGATTCCCCAGCCT{AG}TTCCTCAGACCCCCATGATTCCTCCTCAGTCCCTGCTGTCCCTTTC------------TCAGTTCAAAGTCCTGCCTGTTCCCCAGCAAATGGTGCCCTACCCCCAGAGAGCCATGCCTGTGCAAGCCG{AC}AAGATTTGTAAGTCGTTTTTTTG-TTCGTTTCTGGCTGTGTTTGAACTGGACAGG--GGTGGAGGAATAAAAGGAATTCTCTCGCAAAGACCATTTGGCATTTTAGAC--ATTAAAAAAAAAAACGAAACAGTCCATGTTTTATCTATTTTTTTTTTAACTGGTGGATTTTATGTA-GCTTTTTGTCAAGA{CT}TTTAAATCACTCTGTT---GTTGTACTTTCAGGGTAGTTACTGCCCGACTACCTGTGGCATTGCGGATTTCCTGTCTACTTACCAAAACAGCGTGGACAAGGATCTGCAGACTTTGGAAGACATCCTACATCAAGTTGAGAACAAAACGACAGAGGCCAGAGAGCTGATCAAAGCCGTCCAAATCAGCTATAACCCTGCCGAGCCGTCAAAGCCAAGTGAGATTCTAACCACCCCCGACTGGGAAAATCATCTG{CT}GAAGTTCTTTTGCTGTGGTTTTAGCAGTTCTGTTTGCTTAAGTA-TTTTTATATCTCTGACCCCATATTACAGGTAGGATAGAGAGTGCTACCAAGGATTTCAAGAAAATGATG???????????????????????????????????????????????????????????????TATGGAATCAATTACTACCAACACAGACTAGCTGTACCAATTAATAACCAATTTATTCCTTATCCAAATTATGCAAAGCCAGTTGCAATTAGACTACATGCTCAAATTCCTCAGTGCCAAGCCCTGCCAAATATC-GACCCACCTA-CTGTGGAACGTCGGCCACGTCCACGTCCATCATTTATTGCCATTCCCCCAAAGAAAACCCAGGA-TAAAACAGTCATCCCCGCCATCAATACTGTTGCTACTGTTGAACCTCCAGTCATACCTACCGCTGAACCA----GT--AGTGAACACTG------TAGT-----------TA-TTGC{AG}GAAGCTTCCTCAGAATTCATCACCACAAGTACACCCGAGACCACCACAGTCCAAATTACTTCAACTGAGATCTAAATGACAAACATCCGAAAATCACACCCACTTCTAAAAATTATAAACGACGCATTCATTGACCTTCCAGCCCCCTCCAATATTTCATCATGATGAAACTTCGGCTCTCTACTAGGAGTTTGCTTAATTATACAAATCCTGACAGGACTATTCCTGGCAATACATTATACATCCGACACAACAACAGCCTTCTCTTCAGTCGCACACATCTGCCGAGATGTTAACTACGGCTGAATCATTCGATATTTACATGCTAACGGAGCTTCCATATTCTTCATTTGCTTATATATTCACGTGGGTCGCGGGCTTTATTACGGCTCGTATACCTTTTCAGAAACCTGAAACGTTGGAATGGTTTTATTGTTCACAGTAATAGCAACAGCTTTCATGGGCTACGTCCTTCCATGAGGACAGATATCATTCTGAGGAGCAACAGTAATTACTAATTTGCTCTCAGCAATCCCCTATATCGGCACAACACTAGTAGAATGGATTTGAGGTGGTTTCTCCGTAGATAAAGCCACCCTCACACGATTCTTCGCCTTCCATTTCATCCTACCATTCATTATCACGGCTCTAGTGGCCGTACACCTACTATTTCTACACGAAACAGGTTCTAATAACCCAACAGGAATTTCCTCAGACATAGATAAAATCCCATTCCATCCCTATTACACGATTAAAGATATCCTAGGAGCACTACTACTGATGCTAGCCCTACTTATCCTCGTATTATTCTCACCAGACTTATTAGGAGACCCTGACAACTACACTCCCGCCAACCCCCTCAATACACCACCACATATCAAGCCGGAATGATATTTCCTGTTCGCATACGCTATTCTACGATCAATCCCCAACAAATTAGGAGGCGTACTGGCCTTAGTCCTCTCCATCTTAATCCTAGCATTTATCCCCGCACTACACACATCAAAACAACGAAGCATAACATTCCGTCCCATTAGTCAATGCCTGTTTTGAGTACTAGTAGCTGATCTACTAACCCTGACATGAATTGGGGGACAACCAGTAGAACCCCCATTCATCATAATTGGCCAAGTGGCATCTATCCTGTACTTCTCCCTAATCCTAATTCTCATGCCCGTAGCAGGAATCATTGAAAACCGTATCCTAAAATGAAGA
Diacodexis                       ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Dissacus                         ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Dorudon                          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Elomeryx                         ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Eoconodon                        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Equus_caballus                   ???????ATCAGCCGCTTTGTCCAGCCACAGCCTGTAGTCTATCCTTATGCTGAGCCAGTCCCTTACGCTGTCGTTCCACAAAACATCCTGC{CT}TCTGGCTCAGCCTCCTATAGTG---CCTTTCCTTCAGCCCGAAATAATGGAAGTCTCCCAAGCTAAGGAGACCATCCTTCCTAAGCGCAAAGTGATGCCCTTCCTCAAATCTCCAATAGTGCCCTTTTCTGAACGCCAAATCTTGAATCCCACTAAT{AG}GTGAAAATCTGCGCCTTCCTGTGCATCTGATCCAGCCTTTCATGCACCAGGTCCCCCAGTCTCTTCTTCAGACTCTAATGCTTCCTTCTCAGCCTGTGCTATCTCCTCC------------TCAGTCTAAAGTTGCACCTTTTCCTCAGCCTGTGGTGCCCTACCCTCAGAGAGATACACCTGTCCAAGCTTAAAGATTTGTAAGTAATTTTT--A-T--GTTTCTCGCTGTGTTTGAACTGGAAAGG--GGCAGAGGAATGAAAGGAATTCTCTCATAAATATCATTTAGCGTTTTAAAC--TCTTTTTTTTTTTA--ACATAGTCTACATTTTAGCTATTTTTATT---G---ATAGATTTTAAGTATAGCTTTCATCAAGATTTCTAATCACTCTC{CT}T---GT---ATTTCCAGGGCAGTTATTGTCCGACTACCTGTGGAATTGCAGATTTCCTGTCGAATTACCAAACCAGTGTGGACAAGGATCTACAGGATTTTGAAGACATCTTACATCGAGCTGAAAATCAAACCTCAGAAGCCGAACAACTGATCCAAGCAATCCGAACCAGCTATAATCCTGATGAACCACCAAAGACAGGTGAGAAACGGAATACCACCGACGGAGAAAATAATTTGTGGATTTCTTTTGCTGTTGTTTTAGTTGTTGTATTTGTCTGAGCA-AGTTTATGTCTCTGATCCCATATTACAGGCAGAATAGATGCTGCTACTAGAGAGTCCAAGAAAATGATG?????????????????????????????????ATTTATTATGTGCTGAATAGCTCTCCTCGTTATGAACCCATCTACTACCAACATAGACTAGCTGTACTAATTAATAATCAACATATGCCTTACCAATATTATGCAAGACCAGCTGCAGTTAGGCCACATGTCCAAATTCCTCAATGGCAAGTCCTGCCAAATATC-TACCCATCCA-CTGTGGTACGTCATCCACGCCCGCATCCATCATTTATTGCCATTCCTCCAAAGA{AG}ACTTCAGGA-GAAAACAGTCATCCCTAAGATCAATACTATTGCTACTGTTGAGCCTACACCTATTCCTACCCCTGAACCA----AC--AGTGAACAATG------CAGT-----------CA-TTCCAGACGCCTCCTCAGAATTCATCATCGCCAGCACACCTGAGACTACCACAGTTCCAGTTACTTCACCTGTGGTCTAAATGACAAACATCCGGAAATCTCACCCACTAATTAAAATCATCAATCACTCTTTTATTGACCTACCAGCCCCCTCAAACATTTCATCATGATGAAACTTCGGCTCCCTCCTAGGAATCTGCCTAATCCTCCAAATCTTAACAGGCCTATTCCTAGCCATACACTACACATCAGACACGACAACTGCCTTCTCATCCGTCACTCACATCTGCCGAGACGTTAACTACGGATGAATTATTCGCTACCTCCATGCCAACGGAGCATCAATATTTTTTATCTGCCTCTTCATTCACGTAGGACGCGGCCTCTACTACGGCTCTTACACATTCCTAGAGACATGAAACATTGGAATCATCCTACTTTTCACAGTTATAGCTACAGCATTCATGGGCTATGTCCTACCATGAGGCCAAATATCCTTTTGAGGAGCAACAGTCATCACGAACCTCCTATCAGCAATTCCCTACATCGGTACTACCCTCGTCGAGTGAATCTGAGGTGGATTCTCAGTAGACAAAGCCACCCTTACCCGATTTTTTGCTTTCCACTTCATCCTACCCTTCATCATCACAGCCCTGGTAGTCGTACATTTACTATTTCTTCACGAAACAGGATCTAACAACCCCTCAGGAATCCCATCCGATATGGACAAAATCCCATTCCACCCATATTATACAATTAAAGACATCCTAGGACTCCTCCTCCTGATCTTGCTCCTACTAACTCTAGTATTATTCTCCCCCGACCTCCTAGGAGACCCAGACAACTACACCCCAGCTAACCCTCTCAGCACTCCCCCTCATATTAAACCGGAATGGTACTTCCTGTTTGCCTACGCCATCCTACGCTCCATTCCCAACAAACTAGGCGGCGTATTAGCCCTAATCCTCTCCATCCTGATCCTAGCACTCATCCCCACCCTCCACATATCAAAACAACGAAGCATAATATTCCGGCCTCTCAGCCAATGCGTATTCTGACTCTTAGTGGCAGACTTACTGACACTAACATGAATCGGCGGACAGCCAGTGGAACACCCATACGTAATTATCGGCCAACTGGCCTCAATCCTCTACTTCTCCCTAATTCTCATTTTTATACCACTCGCAAGCACCATCGAAAACAATCTCCTAAAATGAAGA
Hapalodectes                     ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Harpagolestes                    ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Hexaprotodon_liberiensis         ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????{AC}AAGATTTGTAAGTAGTTTTT--ACT--GTTTCTCGCTGTGTTGGAACTGGACGTG--GGC{AG}GAGGAATGAAAGAAATTCTCTCACAAATATCATTTGGCAGTTTAGACTTTTTTTTTTTTAAA----CATAATCTAGGTTTTACCTGTTTTTGTT---A---GTGGATCTTATGTA-GCTTTTTATCAG{AG}ATTTTTAATCACTCTATT---GTTTTATTTTCAGGGTAGTTATTGCCCA{AG}CTACCTGTGGAGTTGCAGATTTCCTGTCTAATTACC{AG}AACCAGTGTAGACAAGGATCTACAGAATTTGGAAAGCATTGTTCATGAGGTTGAGAACAAGACATCAGAAGCCAGGGAGCTGGTCAAAGCAATCCAAATCAGCTACAACCCTGATGAACCAGAAAAGCCAAGTGAGAATCTCA-CACTGCTGATTGAGAACTTCATGTGTGAAGTTCTTTTGCTGTTATTTC{AG}GTGGTTCTGTTTGCTTACGTA-TTTTTATGTCTCTGACCCCATATTACAGGTAGGATAGAGAGTGCTACCAAGAATTCCAAGAAAATG{AT}TG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGACAAACATCCGAAAATCTCACCCCCTAATAAAAATCATCAACGACGCACTCGTTGACCTCCCAGCTCCATCAAACATCTCATCATGATGAAACTTCGGCTCCCTACTCGGCATCTGCTTAATCCTACAAATTCTAACAGGCCTATTCCTAGCCATACACTACACACCAGACACACTTACCGCATTCTCATCGGTAACCCATATCTGCCGTGATGTAAACTATGGATGAGCCATCCGCTACATACACGCAAACGGCGCATCCATCTTCTTTATCTGCCTCTTTATTCACGTAGGACGCGGCCTATACTATGGCTCCTACACATTCCTAGAAACCTGAAATATCGGAGTTATCTTACTACTCACAACCATAGCCACCGCATTTATAGGTTACGTACTACCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGGGCAACAGTCATCACCAACTTACTATCAGCTATCCCCTACATTGGAACAGACCTAGTAGAATGAATCTGAGGAGGCTTTTCTGTAGATAAAGCCACCCTTACACGATTCTTTGCCTTCCACTTTATTCTTCCATTCATCATCATAGCACTAGCCGCCGTCCACCTACTGTTTCTCCACGAAACAGGGTCCAACAACCCAACAGGAATCCCCTCAAACGCAGACAAAATCCCATTCCACCCCTATTACACAATCAAAGATATCCTGGGCGTACTACTTCTAATAACAATACTACTCACACTAACCTTATTTGCCCCAGACCTCCTAGGGGACCCAGACAACTACACCCCCGCAAACCCCCTTAGCACACCACCACACATCAAACCAGAATGATATTTCCTGTTCGCATACGCAATTCTCCGATCAATCCCTAACAAACTGGGAGGCGTACTAGCCCTAGTCCTCTCAATCCTAATCCTAGCCCTCATCCCAATATTACATACATCCAAACAACGAAGCCTAATATTTCGACCCCTTAGCCAGTGCCTGTTCTGAGCATTAATCGCCGACCTACTAACACTCACATGGATTGGAGGACAACCCGTCGAACACCCCTACATCATTATCGGGCAACTCGCCTCCATCCTATACTTCCTCTTGATTTTAGTACTAATGCCAGTAGCAGGCATTATCGAAAATAAACTCCTAAAATGAAGA
Hippopotamus_amphibius           CCC??AA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGCCTCTTGCTCAGCCCCCTGTGGTGGTGCCTTTCCTTCAGCCTGAAATAATGGAAGTCCCCAAAGCAAAGGAGACTATCCTTCCTAAGCATAAAGAAATGCCCTTCTCTAAATCTCCAGTAGAGCCCTTTACTGAAAGGCAGAGCCTGACTCTTACTGATCTTGAAAATCTGCA{AG}CTTCCCCTGCCTCTGCTTCAGTCCTGGATGCACCCAC{AG}TTCCCAGCCTCTTTCTCCTACCCTCATGTTTCCTTCTCAGCCCTTGCAGTCCCTTCCACAGCCCGTTTCTCAGCCCCAAGCCCTGCCTATTCCCCAGCAAGTGGTACCCTACCCACAGAGAGAGATGCCCACCCAGGCCC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTTTCAATGGAAAAACAGTCAAATATATTCCAGTTCATTATGTGATGAGTAGGTATCCTAAATATGGACTCAATTACTACCAATGCAGACCAGCTGCACTAATTAATAACCAATTTATGCCTTACCCATATTATGCAAAGCCAGTTGCAGTTAAGCCACATGCCCAAATCCCTCAATGGCAAGCCCTGCCAGATATC-AACCCACCTA-CTGTGCCATGTCGCCGACGCCCACATCCATCATTTCTTGCCATTCCACCAA{AT}GAAAGATCAGAA-TAAAACAGTCATTCCTATCATCAATACCATTGCTACC{AG}TTGAGCCTACACTTATACCTACCACTGAACCA----AT--AGTGAACACTG------TAGT-----------TA-CTACAGAAGCTTCTTCAGAATTC---ATCACAAGCACACCTGAGACCACCACAGTCCAAGTTACTTCACCCGTGGTCTAAATGACAAACATCCGAAAATCTCACCCCTTAATAAAAATTATCAACGATGCATTCGTTGACCTCCCAGCTCCATCAAACATCTCATCGTGATGAAACTTCGGCTCCCTACTTGGCGTCTGCCTAATCCTACAAATTCTAACAGGCCTATTCCTGGCCATACACTACACACCAGATACACTCACCGCATTCTCATCGGTAACCCACATCTGCCGTGATGTAAACTACGGGTGAGTCATCCGCTACATACACGCAAACGGCGCATCCATCTTCTTCATCTGCCTCTTTACTCACGTAGGACGCGGCCTATACTATGGCTCCTACACATTCCTAGAAACCTGAAACATCGGAGTTATCTTACTACTCACAACCATAGCTACCGCGTTTATAGGCTACGTACTGCCATGAGGACAAATGTCATTCTGAGGGGCAACAGTCATTACCAACTTACTGTCAGCTATCCCCTATATTGGAACAGACCTAGTAGAATGAATCTGAGGAGGCTTTTCCGTAGACAAAGCCACCCTTACACGATTCTTTGCCTTCCACTTTATTCTTCCATTCGTTATCACAGCACTAGCCATCGTCCATCTACTATTCCTCCATGAAACAGGATCCAACAACCCAACAGGAATCCCCTCAAACGCAGACAAAATCCCATTCCACCCCTATTACACAATCAAGGACATCCTAGGTATCCTACTCCTAATAACAACACTACTCACACTAACCTTATTTGCCCCAGACCTCCTAGGGGACCCAGACAACTACACCCCCGCAAACCCCCTTAGCACACCACCACACATTAAACCAGAATGATATTTCCTGTTCGCGTACGCGATTCTCCGATCAATCCCCAACAAACTAGGAGGCGTCCTAGCCCTAGCTCTCTCAATCCTAATCCTGGCCCTAATCCCAATACTACACACATCCAAACAACGAAGCCTAATATTTCGACCCCTCAGCCAATGCCTGTTTTGAGCACTAATCGCCGACCTACTAACACTCACATGAATTGGAGGACAACCCGTCGAACACCCCTTCATCATCATCGGACAAGTCGCCTCAATCCTATATTTCCTCTTAATCTTAGTACTAATGCCCGTAGCAGGCATTATCGAAAACAAACTCCTAAAATGAAGA
Hyopsodus                        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Hyracotherium                    ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Meniscotherium                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Mesonyx                          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Ovis_aries                       CCCCCAAATCCACCCCTTTGCCCAGGCACAGTCTCTAGTCTATCCCTTCACTGGGCCCATCCCTAACAGCCTCCCACAAAACATCCTGCCTCTTACTCAAACCCCTGTGGTGGTGCCGCCTTTCCTTCAGCCTGAAATAATGGGAGTCCCCAAAGTGAAGGAGACTATGGTTCCTAAGCACAAGGAAATGCCCTTCCCTAAATATCCAGTTGAGCCCTTTACTGAAAGCCAGAGCCTGACTCTCACTGATGTTGAAAAGCTGCACCTTCCTCTGCCTCTGGTCCAGTCTTGGATGCACCAGCCTCCCCAGCCTCTTCCTCCAACCGTCATGTTTCCTCCTCAGTCCGTGCTGTCCCTTTC------------TCAGCCCAAAGTTCTGCCTGTTCCCCAGAAAGCAGTGCCC------CAGAGAGATATGCCCATCCAGGCCTAAAGATTTGTAAGTTACTTTT--A-T--GTTTCTCTCTGTGTTTGAACTGGACTTG--GGCAGAGAAATTTT-TATTCCTTATAAGAGAT-TCTTTAGCAAATATCAT---TTGACAGTTTAGA----CTT---------TTTAA-AAACATAGTC---T---AGGTTTTACCTGTT-TTTATTTATCAGGATTTTTTA--ATCACACT---GTTGTATTTTCAGGGTAGTTATTGCCCAACTACCTGTGGAATTGCAGACTTCCTGTCTAATTACCAAACCAGTGTAGACAAGGATCTACGAAATTTGGAAGGCATCTTCTATCAGGTTGAGAACAAAACATCAGAAGCCACAGAGCTGGTCAAAGCAATCAAGATCAGCTATAACCCTGATGAACCGTCAAAGCCAAGTGAGACTCTAACTGCCACTGACTGAGAGAGTCATCTATGAAGTGCTTTTGC{CT}GTTATTTTAGTGGTTCTGTTTGCTTATGTA-TTTTTATATCTCTGATCCCATATTACAGGTAACATAGAGAGTGCTACCAAGAATTACAAGAGAATGATGTTCTTCGATGACAAAATAGCCAAATATATCCCAATTCAGTATGTGCTGAGTAGGTATCCTAGTTATGGACTCAATTACTACCAACAGAGACCAGTTGCACTAATTAATAATCAATTTCTGCCATACCCATATTATGCGAAGCCAGTTGCAGTTAGGTCACCTGCCCAAACTCTTCAATGGCAAGTTTTGCCAAATGCTGTGCCTGCCAAGTCCTGCCAAGACCAGCCAACTGCCATGGCACGTCACCCACACCCACATTTATCATTTATGGCCATTCCACCAAAGAAAGATCAGGATAAAACAGAAATCCCTGCCATCAATACCATTGCTAGTGTTGAGCCTACAGTACACAGTACACCTACCACTGAAGCAGTAGTGAACACGGTAGATAATCCAGAAGCTTCCTCAGAATCTATTGCGAGTGCACCTGAGACCAACGCAGCCCAAGTTACTACAACCGAGGTCTAAATGATCAACATCCGAAAAACCCACCCACTAATAAAAATTGTAAACAACGCATTCATTGATCTCCCAGCTCCATCAAATATTTCATCATGATGAAACTTTGGCTCTCTCCTAGGCATTTGCTTAATTTTACAGATTCTAACAGGCCTATTCCTAGCAATACACTATACACCTGACACAACAACAGCATTCTCCTCTGTAACCCACATTTGCCGAGACGTGAACTATGGCTGAATTATCCGATATATACACGCAAACGGGGCATCAATATTTTTTATCTGCCTATTTATGCATGTAGGACGAGGCCTATACTATGGATCATATACCTTCCTAGAAACATGAAACATCGGAGTAATCCTCCTATTTGCGACAATAGCCACAGCATTCATAGGCTATGTTTTACCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGAGCAACAGTTATTACCAACCTCCTTTCAGCAATTCCATATATTGGCACAAACCTAGTCGAATGAATCTGGGGAGGATTCTCAGTAGACAAAGCTACCCTCACCCGATTTTTCGCCTTTCACTTTATTTTCCCATTCATCATCGCAGCCCTCGCCATAGTTCACCTACTCTTCCTCCACGAAACAGGATCCAACAACCCCACAGGAATTCCATCGGACACAGATAAAATTCCCTTCCACCCTTATTACACCATTAAAGACATCCTAGGTGCTATCCTACTAATCCTCACCCTCATGCTACTAGTACTATTCACGCCTGACTTACTCGGAGACCCAGACAACTACACCCCAGCAAACCCACTTAACACTCCCCCTCACATCAAACCTGAATGATACTTCCTATTTGCGTACGCAATCTTACGATCAATCCCTAATAAACTAGGAGGAGTCCTCGCCCTAATCCTCTCAATCCTAGTCCTAGTAATTATACCCCTCCTCCATACATCAAAGCAACGGAGCATAATATTCCGACCAATCAGTCAATGTATATTCTGAATCCTAGTAGCCGACCTATTAACACTCACATGAATTGGAGGCCAGCCAGTTGAACACCCCTACATCATTATTGGACAACTAGCATCTATTATATATTTCCTTATCATTCTAGTCATAATACCAGTAGCTAGCATCATCGAAAACAACCTCCTAAAATGAAGA
Pachyaena                        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Pakicetus                        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Phenacodus                       ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Poebrotherium                    ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Protocetidae_sp._Cross_Whale     ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Protocetus                       ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Remingtonocetus                  ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Sinonyx                          ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Sus_barbatus                     AAAAAAAATCCACCAGTTTCCCCAGCCTCAGCCTCTAGCCCATCCTTACACCGAGCCCATCCCTTACCCCATCCTTCCACAAAACATCCTGCCTCTTGCCCAGGTCCCTGTGGTGGTGCCTCTTCTTCATCCTGAAGTAATGAAAGATTCCAAAGCTAAGGAGACCATTGTTCCCAAGCGTAAAGGAATGCCCTTCCCTAAATCTCCAGCAGAGCCTTTTGTGGAAGGCCAGAGCCTAACTCTCACCGATTTTGAA-----GT-CCTTTCTCTGCCTCTGCTCCAGTCTCTGATGCACCAGATTCCCCAGCCTGTTCCTCAGACCCCCATGTTTGCTCCTCAGCCCCTGCTGTCCCTGCC------------TCAGGCCAAAGTCCTGCCTGTTCCCCAGCAAGTGGTGCCCTTCCCCCAGAGAGATATGCCCTTCCAGGCC?AGAGATTTGTAAGTAGCTTTT--A-T--GTTTCTCGCTGTGTTTGAGCTGGAGGGGAGGGCAGAGGAATAAAAGAAATTCTCTCGCAAATACCGTGTGGCCCATTTAG---ACTTTTTTTAAAAG---CATAGTCTAGGTTTTGTCTATTTTTTTA--AAC-AGTAGATTTCAGGTA-GCTTTTTATGAAAAAGTTTAATCACTGTATTAAAATTATATTTTCAGGGTAGTTACTGCCCAACTATGTGTGGGATCGCAGGTTTCCTGTCTACTTACCAAAACACTGTAGAGAAGGATCTACAGAATTTGGAGGGCATCCTACATCAAGTTGAGAACAAAACATCGGAAGCCAGAGAGCTGATCAAAGCCATCCAGATCAGCTATAACCCTGAAGATCTATCAAAACCAGGTGAGAATCTGACCAGCGCTGCCTGAGAAAATCATCTGTGGGGTTCTTTTGCTGTTGTTGTAGTGGTTTTGTTGGCTTGAGT{AG}TTTTTTATG{CT}CTCTGACCCCATCTTATAGATAGGATACAAAGTGCCACCAAGGAGTCCAAGAAAATGTTGTTATTCAATGAAGAAAAAGTCAAATATATCCCAATTTATTACATGCTGAATAGGTTTCCTAGTTATGGATTT--TT-CTACCAACATAGATCAGCTGTATCACCTAATAGACAATTTATACCTTACCCATATTATGCAAGGCCAGTTGTAGCTGGGCCACATGCTCAAAAACCTCAATGGCAAGACCAGCCAAATGTC-TACCCACCTA-CAGTGGCACGTCGCCCACGCCCACATGCATCATTTATTGCCATTCCCCCAAAGAAAAATCAGGA-TAAAACGGCCATCCCTGCTATCAATTCCATTGCTACTGTTGAGCCTACAATTGTACCTGCCACTGAACCA----AT--AGTGAACGCTGAACCAATAGTGAACGCTGTAGTAACTCCAGAAGCTTCCTCAGAATTCCTCATCACAAGCGCACCTGAGACCACCACTGTCCAAGTCACTTCACCCGTGGTCTAAATGACCAACATCCGAAAATCACACCCACTAATAAAAATTATCAACAACGCATTCATTGACCTCCCAGCCCCCTCAAACATCTCATCATGATGAAACTTCGGTTCCCTCTTAGGCATTTGCCTAATCTTGCAAATCCTAACAGGCCTATTCTTAGCAATACATTACACATCGGACACAACAACAGCTTTCTCATCAGTAACACATATCTGTCGAGACGTAAATTACGGATGAGTTATTCGCTACCTACATGCAAACGGAGCATCCATATTCTTCATCTGCCTGTTCATCCACGTAGGCCGGGGCCTATATTACGGATCCTATATGTTCCTAGAAACATGAAACATTGGAGTAATCCTACTATTTACCGTTATAGCAACAGCCTTCATAGGCTACGTCCTGCCCTGAGGACAAATATCATTCTGAGGAGCTACGGTCATCACAAATCTACTATCAGCTATCCCCTATATCGGAACAGACCTCGTAGAATGAATCTGAGGGGGCTTTTCCGTCGACAAAGCAACCCTTACACGATTCTTCGCCTTTCACTTTATCCTGCCCTTCGTCATTACCGCCCTCGCAGCCGTACATCTCCTATTCCTACACGAAACCGGATCCAATAACCCCACCGGAATTTCATCAGACATAGACAAAATTCCATTTCACCCATACTACACTATCAAAGACATTCTAGGAGCCTTATTTATAATACTAATCCTACTAATCTTAGTACTATTCTCACCAGACCTACTAGGAGACCCAGACAACTACACCCCAGCAAACCCACTAAACACCCCACCCCATATTAAACCAGAATGATACTTCTTATTCGCCTACGCTATTCTACGTTCAATCCCCAATAAACTAGGCGGAGTGTTAGCCCTAGTAGCCTCCATCCTAATCCTAATTTTAATGCCCATACTACACACATCCAAACAACGAAGCATGATATTTCGACCACTAAGTCAATGCCTATTCTGAATACTAGTAGCAGACCTTATCACACTAACATGAATTGGAGGACAACCCGTAGAACACCCATTCATCATCATCGGTCAACTAGCCTCCATCCTATACTTCCTAATCATTCTAGTACTGATACCAATCACTAGCATCATCGAAAACAACCTATTAAAATGAAGA
Synoplotherium                   ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Tapirus_terrestris               ???????ATCAATCGCTTTGTCCAGCCACAGCCTGTAGTCTATCCATTTACTGAGCCAATCCCTTATGCTTTCCTTCCACAAAACGTCCTGCCTTTTGCTCAGCCTCCTGTAGCTCTGCCTTTCCTTCAGCCTGAAAAAATGGAAGCCCCCCAAGCTAAGGAGACCATCTTTCCTAAGCCCAAAGTGATGTCCTTCCTTAAATCTCCAATAGTGCCCTTTTCTGAACGCCAAATCTTGAATCCCACTAATGGTGAAAATCTGCGTCTTCCTCTGCATCCGATCCAGTCTTTGATGCACCAGGTCCCTCAGCCTCTTCATCAGACTCTAATGCTTCCTTCTCAACCCGTGCAGTCCCCTCC------------TCAGTCCAAAGTCCCACCTTTTCCCCAGCAAGTGGTGCCCTACTCTCAGAAAGATATACCTGTTGAAGCCTAAAGATTTGTAAGTAATTTTT--A-T--GTTTCTTGCTGTGCTTGGACTGGAGAGG--GGCAGAGGCATAAAAGGAGTTCTCTCACACATATAATTTGGC{AG}-TTTTAA---ACTCTTTTTTTAA----CATAGTCTACATTTTAGCTATTTTTATT---A---ATAGATTTTAAGTGTAGCTTTTATCAAGATTTCTAATCACTCTATT---GTTGTGTTTTCAGGGTAGTTATTGTCCTACTACCTGTGGAATTGCAGATTTCCTGTCGACTTACCAAACC{AG}GTGTAGACAAGGATTTACAGGTTTTGGAGGACATCTTAAATCAAGCTGAAAACAAAACATCAGAAGCCAAAGAACTGATCAAAGCCATCCAAGTCAGGTATAAACCTGATGAACCAACAAAGCCAGGTGAGAAACTGAATACCACTGAGTGAGAAAATAACTTGTGAAGTTCTTTTGCTGTTGTTTTAGTGGTTCTAGTTACCTAAGTA-ATTTTATGTCTCTAATTCCGTATTACAGGCGGAATAGATAGTGCTACTAGGGAGTCCAAGAAAATGCTGTTGTTCGATCAGAAAACCATCAAATATATCCCAATTCATTATGTGCTGAATATCTCTCCTAGTCAGGAACCCAATTACTACCAACATAGACCAGTTGTACCAATTAATAATCAACAGATGCCTTACCGATATTATGCAAGACCAGTTGCAGTTAGGCCACATGCCCAAATTCCTCAATGGCAAGTCCTGCCAAATATC-TACCCATCCA-CTGTGGTACGTCATCCATACCGACGTCCATCATTTATTGCCATTCCTCCAAAGAAACTTCAGGA-TAAAACAGTCAGACCTAACATCAATACCATTGCTACTGTTGAGCCTACACTTATTCCTACCACTGAACCA----AC--AGTGAACAATG------TAGT-----------CG-TTCCAGAAGCTTCCTCAGAATTCATCATCACAAGCACACCTGAGACTACCACAATCCCAGTTACTTCACCCGTGGTCTAAATGACCAACATCCGAAAATCCCACCCGCTAATCAAAATTATCAATCACTCATTTATCGACCTACCAACCCCATCAAACATCTCATCCTGATGAAACTTTGGCTCCCTTTTAGGAATATGCCTAATCTTACAAATTATCACGGGCCTATTCTTAGCCATACACTATACATCAGATACAACCACTGCCTTCTCATCCGTAGCCCATATTTGCCGAGATGTAAATTACGGATGAATTATCCGCTATCTCCACGCTAACGGAGCATCCATATTCTTCATCTGCCTATTTATCCACGTAGGACGAGGTTTGTACTATGGATCCTACACATTCCTAGAAACATGAAACATCGGAATTATTCTACTATTCACAGTGATGGCAACAGCATTCATAGGCTACGTCCTGCCGTGAGGACAAATGTCCTTCTGAGGAGCAACCGTAATCACAAACCTCCTCTCAGCCATCCCATACATTGGCACAAACCTCGTTGAATGAATCTGAGGAGGCTTTTCCGTTGATAAAGCCACCCTGACCCGATTTTTCGCATTTCACTTTATTCTCCCATTCATCATTACAGCCCTAGTAATCGTACACCTTCTATTTCTCCATGAAACAGGATCTAACAACCCATCAGGAGTCTCATCTGACATAGACAAAATCCCATTCCACCCATATTACACAACCAAAGACATTTTAGGCTTTCTAGTACTAATCTTAATACTCCTCATTCTAGTATTATTCTCACCCGAATTACTAGGGGACCCCGATAACTACACACCAGCTAATCCTCTCAGCACTCCTCCACATATCAAACCAGAATGATATTTTCTATTTGCCTACGCAATTCTACGATCCATCCCCAACAAACTAGGAGGCGTGCTAGCCCTTATCCTCTCTATTTTGATTCTAGCAATTATCCCAATACTCCATACATCAAAACAACGAAGCATAATGTTTCGACCACTAAGCCAATGTGTATTCTGACTATTAGTAGCAGACCTACTTACACTCACATGAATCGGAGGACAACCAGTTGAACACCCATTCATTATTATCGGCCAACTAGCATCAATCCTATACTTCTCCCTAATCTTAGTGTTTATACCCCTTGCAAGCGCAATCGAAAACAACTTCCTAAAATGAAGA
Tragulus_javanicus               CCCCCAAATCCACCTCTTTCCCCAGCCACAATCTCTAGTCTTCCCCCCCACTGGGTCCTTCCCCTACATGCTCCCACAAAACATCCTGCCTCTTGCTCAAAATCCTGTGGTGGTGCCCCCTTTCCTTCAGCCCGGAATAATGGAAATCCCCAACGTGAAGGAGACTATGGCACCTAAGCACAAAGAAATGCCCTTCCTTAAAGCTCCAGTAGAATCCTTTACTGAAGGCCAGAGGCTGACTCTCACTGATGTCGAAAATCTGTACCTTCCTCCATCTCCGCTCCAGCCTTGGATGCACCAGATTCCCCAGCCTACTCCTCTGAACTTCATGTTTCGTCCTCAGTCCCTGCTGTCCCTTAC------------TCAGTCCAAAGTCCTGCCAGTTCCTCAGAAAGAGGTGCCCTACCCCCAGAGAGGTATGCCCATCCAAGCCTAAAGATTTGTAAGTAGCTTTC--A-T--ATTTCTCTCTGTGTTTGAACTGTACTTG--GGCAGAGGAATAAAATAAATTCTGTAGCAAATATCATTTGGCAGTTTAGA---GTTTTTTTTAAAA----AAA---------CATAC-TCTAGGTGTT---A---AGAGATACTATGTG-GCTTTTAATTGGGATTTAAAA--ATCATACT---ATTGTATTTTCAGGGTAGTTACTGCCCAACTACCTGTGGAATTGCAGATTTCCTGTCTAACTACCAAACCAGCGTAGACAAGGATCTACACAATTTGGAAAGCATCTTGTATCAGGTTGAGAACAAAACATCAGAAGCCAGAGAGCTGGTCAAAGCAATTCAAATCAGCTATAACCCTGATGAAGCATCAAAGCCAAGTGAGAATCTAACCACCACTGACTGAGAAAGTCATCTATGAAGTTCTCTTGTTGTTTTAGTGGT-TCTATTTACTTATGCATT-TTTTTATGTCTCTGACCCCACATTACAGACAAGATAGAGAGTGCTACCAGGAATTCCAAGAAAATGATGTTCTTCAATGACAAAACAATTAAATATATCCCAATTCCTTATTTGCTGAATAGATATCCTAGTTATGGACTCAATTACTACCAGCAAAGGCCACCTGCACTAATTAATAACCAATTTCTGCCGTTCTCATTTTATGCAAAGCCAATGGCAGTTAGGTCACCTGCCCAAATTCTTCAGTGGCAAGTCCCGCTGAATGCTGTGTCTGCCAAGCCCTGCCAAGCCCCGCCAACTACTATGGCACGTCGCCCACGCCCACATTTATCATTTATGGCCATTCCACCAAAGAAAGATCAGGATAAAACAGACACCCCTACCATCAATACCATTGTTACTGTTGAGCCTACA----AC--TACACCCACCACTGAATCAATAGTGAACACTGTAGCTACTCTAGAAGCTTCCTCAGAATCTATCGCCAGTGCACCTGAGACTACCACAGTCCAAGTTACTTCAGCTGAGGTTTAAATGATCAACATACGAAAATCACACCCACTAATAAAAATTGTCAACAACGCATTCATTGATCTCCCAGCCCCATCAAATATCTCATCATGATGAAACTTCGGCTCTCTCTTAGGCATCTGCCTCCTCCTACAAATTCTAACAGGCCTATTCCTAGCAATACACTACACATCAGACACATCAACAGCCTTCTCCTCAGTAACCCACATCTGCCGAGACGTAAACTACGGATGAATCATTCGTTATATACACGCAAACGGAGCCTCCATATTCTTTATTTGCCTGTACATGCATGTAGGACGAGGCCTATACTACGGATCCTACACCTTCCTAGAAACCTGAAACATTGGAGTGATTCTCCTACTCACAGTGATAGCCACAGCATTCATAGGGTACGTTCTACCCTGAGGACAGATATCTTTCTGAGGAGCCACAGTCATCACCAACCTCTTATCAGCTATCCCATACATTGGCACAGACTTGGTCGAATGAATCTGAGGTGGTTTTTCAGTAGACAAAGCAACCCTTACACGATTCTTTGCCTTCCACTTTATCCTTCCATTTATCATTACAGCCCTAGTCCTAGTCCACCTTTTATTTCTCCACGAAACAGGATCTAATAACCCCACAGGAATCCCCTCAGACGCAGACAAAATCCCCTTCCACCCATACTACACTATTAAAGACATTCTAGGGGTTCTAGCCCTATTTCTAGCCCTAATACTACTAGTCCTATTCTCACCCGACCTACTTGGAGACCCAGATAACTACACCCCCGCCAACCCCCTTAACACACCACCCCATATCAAACCCGAATGATATTTCTTATTTGCATACGCAATTCTTCGGTCAATCCCCAATAAACTAGGAGGAGTCCTAGCACTCATCGCATCAATTTTAATCCTACTACTCATGCCCCTTCTCCACACATCTAAACAACGAAGCATAATATTCCGACCAATCAGCCAATGCCTGTTCTGACTGCTAGCAGCAGACCTATTAACCCTTACATGAATTGGAGGTCAACCTGTAGAACACCCCTATATTGTAATTGGACAACTCGCATCAATTTCATATTTCTCTATCATCCTAGTACTAATGCCAGTAGCAGGAATGATCGAAAACAAGCTTCTAAAATGAAGA
Tursiops_truncatus               CCCAACCATCCACCGCTTTTCCCAGCCACAGCCTCTAGTCTATTCCTACACTGGGCCAATCCCTTACCCTATCCTTCCACAAAACATCCTGCCTCTTGCTCAGCCCCCTGTGCTGGTGCCTTTCCCTCAGCCTGGAATAATGGAAGTCCCCAAAGCTAAGGAGAC{CT}CTCCTTCCTAAGCATAAAGAAATGCCCTTCCCTAAATCTCCAGTAGAGCCC{CT}TTATTGAAAGCCAGAGCCTGACTCTCAATGATCTTGAAAATCTGCACCT{AT}CCTCTGCCTCT{GT}CTCCAGTCCTTGATGCACCAGCCTCCCCATCCTCTTCCTCCTACCCCCATGTTTCCTCCTCAGCCCCTGCAGTCCCTTTC------------TCAGCCCAAAGTCCTGCCTATTCCCCAGCAAGTGGTGCCCTACCTCCAGAGAGATATGCCCATCCAGGCCCAAAGATTTGTAAGTAGTTTTT--A-T--GTTTCTCGCTGTGTTTGCGCTGGATGTG--GGCAGAGAAATATAAGAAATTCTCTCGCAAATATCATTTGGCAGTTTAGAC--TTTTTTTTTTTAA----TGTAGTCTAGGTTTTACCTATTTTGATT---A---GGAGATCTTATGTA-GCTTTTTATCAGGATTTTAAAGCACTCTATT---ATTGTATTTTCAGGGTAGTTATTGCCCAACTACCTGTGGAATTGCAGATTTCCTGTCTACTTACCAAACCAATGTAGACAAGGATCTACAGAATTTGGAAGGCATCTTACGTCAGGTTGAGAACAAGACATCAGAAGCCAGAGAGTTGGTCAAAGAAATCCAGATCAGCTACCGCTCTGATGGACCAGCAAAGCCAAGTGAGAATCTAACCACCACTGACTGAGAACTTCAACTGTGAAGTTCTTTTGCTGTTATTTCAGTGGTTCTGTTTGTTTATGTA-TTTTTATGTCTTTGATCCCATGTTACAGGTGGGATAGAGAGTGCTACCAAGAATTCCAAGAAAATGTTGTTGTTCAATAAAAAAACAGTAAAATATAT{CG}CCAATTCATTATGTGCTGAGTAGGTATCCTAGTTATGGACTCAATTACTACCAGCACAGACCAGTTGCACTAATTAATAACCAATTTATGCCATACCTATATTATGCAAAGCCAGTTGTAGTTAGCCCACATGCCCAAATTCCTCAATGGCAATTCCTGCCAAATATC-CACCCACCTA-CTCTGGCACATCACCCACACCCACGTCCATCATTTACTGCCATCCCACCAAAGAAAACTCAGGA-TAAAACAGCAATCCCTATCATCAATACCATTGCTACTGTTGAGCCTACACTTATACCTACCACTGAACCA----AT--AGTGAACACTG------TAGT-----------TA-CTCCAGAAGCTTCCTCAGAATTC---ATCACGAGTACACCTGAGACCACCACAGTCCAAGTTGCTTCACCTGTGGCCTAAATGACCAACATCCGAAAAACACACCCACTAATAAAAATCCTCAATGATGCGTTCATCGATCTACCCACTCCATCTAGTATCTCTTCTTGATGAAATTTTGGTTCCTTACTAGGCCTCTGCCTAATTATACAAATCCTAACAGGATTATTCCTAGCAATACATTACACGCCAGACACCTCAACTGCTTTCTCATCAGTCGCACACATCTGCCGAGATGTCAACTATGGCTGATTCATCCGCTATCTACACGCAAACGGAGCCTCTATATTCTTCATCTGTCTATATGCCCACATTGGACGTGGCCTATACTATGGTTCTTATATATTCCAAGAAACATGAAACATTGGTGTACTCTTACTATTAACAGTCATAGCTACTGCATTCGTAGGCTACGTTCTGCCCTGAGGACAAATATCATTCTGAGGCGCAACCGTCATCACCAATCTCTTATCAGCAATCCCTTATATTGGCACTACCTTAGTCGAATGAATCTGAGGTGGATTTTCCGTAGACAAAGCAACATTAACACGCTTTTTCGCTTTCCACTTTATTCTTCCATTCATCATCACAGCATTGGCAGCCGTTCACCTACTATTCCTACACGAAACAGGATCCAACAACCCCACAGGAATCCCATCCAATATAGACATAATCCCATTCCACCCTTATTATACAATCAAAGACATCCTAGGCGCCTTACTCTTAATCTTAACCTTACTAGCATTAACCCTATTCGCCCCCGACCTACTAGGAGACCCTGATAACTACACCCCAGCAAACCCACTAAGCACCCCTGCACACATCAAACCAGAATGATACTTTCTATTCGCATACGCAATCTTACGATCAATCCCTAATAAGCTCGGAGGAGTCCTAGCGCTATTACTCTCCATCCTTGTCCTAATCTTTATCCCAATACTTCAGACATCCAAACAACGAAGCATAATATTCCGACCCTTCAGCCAATTCCTATTTTGAACCCTAATCGCTGACCTCTTAACCTTAACATGAATTGGAGGCCAACCCGTAGAACACCCATATATCATTGTAGGCCAATTAGCATCTATTCTATACTTCCTCCTAATCCTAGTGCTAATACCAACAGCCGGCCTTATTGAAAATAAACTTCTAAAATGAAGA
;
END;

BEGIN SETS;
	CHARSET cytb (CHARACTERS = param_e) =  1474-2613;
	CHARSET retroposons (CHARACTERS = param_e) =  1-7;
	CHARSET gamma (CHARACTERS = param_e) =  570-1005;
	CHARSET beta (CHARACTERS = param_e) =  8-569;
	CHARSET sequence (CHARACTERS = param_e) =  8-2613;
	CHARSET kappa (CHARACTERS = param_e) =  1006-1473;
END;
BEGIN CODONS;
CODONPOSSET  CodonPositions (CHARACTERS = param_e) = 
		N: 1-2613;
CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = param_e) = 
		N: 1-2613;
END;
BEGIN ASSUMPTIONS;
	WTSET  NONSEQUENCE = 1: 8-2613 , 8: 1-7 ;
	WTSET * NONSEQUENCE = 8: 1-7 , 1: 8-2613 ;
END;
[ The following blocks are output data for analysis step 5095 ]
BEGIN TREES;
      TITLE Tb10503;
      LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5095;
      TREE Strict_e = [&R] ((Protocetidae_sp._Cross_Whale,(Protocetus,(Basilosaurus,(Equus_caballus,Tapirus_terrestris,Dorudon)))),((Camelus_dromedarius,Sus_barbatus,Agriochoerus,Poebrotherium,Andrewsarchus,Eoconodon,Hapalodectes,(Hexaprotodon_liberiensis,Hippopotamus_amphibius),(Tragulus_javanicus,Ovis_aries),(Elomeryx,(Archaeotherium,(Diacodexis,(Hyracotherium,(Meniscotherium,(Phenacodus,(Arctocyon,Hyopsodus,(Balaenoptera_edeni,Tursiops_truncatus))))))))),(Dissacus,Ankalagon,(Sinonyx,(Pachyaena,(Mesonyx,(Synoplotherium,(Harpagolestes,(Remingtonocetus,(Pakicetus,Ambulocetus))))))))));
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6079]


END;