#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 11, 2026; 1:03 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Baker W.J., Savolainen V., Asmussen-lange C., Chase M., Dransfied J., Forest F., Harley M., Uhl N., & Wilkinson M. 2009. Complete Generic Level Phylogenetic Analyses of Palms (Arecaceae) with Comparisons of Supertree and Supermatrix Approaches. Systematic Biology, 58(2): 240-256. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10045] [ The following blocks are input data for analysis step 5127 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5127; DIMENSIONS NTAX=205; TAXLABELS Acanthophoenix_rubra Acoelorraphe_wrightii Acrocomia_aculeata Actinokentia_divaricata Actinorhytis_calapparia Adonidia_merrillii Aiphanes_aculeata Allagoptera_arenaria Alloschmidia_glabrata Alsmithia_longipes Ammandra_decasperma Anigozanthos Aphandra_natalia Archontophoenix_purpurea Areca_triandra Arenga_hookeriana Asterogyne_martiana Astrocaryum_alatum Attalea_allenii Bactris_gasipaes Balaka_seemannii Barcella_odora Basselinia_velutina Beccariophoenix_madagascariensis Bentinckia_nicobarica Bismarckia_nobilis Borassodendron_machadonis Borassus_flabellifer Brahea_berlandieri Brassiophoenix_schumannii Brongniartikentia_lanuginosa Burretiokentia_hapala Butia_eriospatha Calamus_aruensis Calectasia_intermedia Calospatha_scortechinii Calyptrocalyx_albertisiana Calyptrogyne_ghiesbreghtiana Calyptronoma_occidentalis Campecarpus_fulcitus Carpentaria_acuminata Carpoxylon_macrospermum Caryota_mitis Catopsis_montana Ceratolobus_pseudoconcolor Ceroxylon_quindiuense Chamaedorea_microspadix Chamaerops_humilis Chambeyronia_macrocarpa Chelyocarpus_ulei Chuniophoenix_nana Clinosperma_bractealis Clinostigma_savoryanum Coccothrinax_argentata Cocos_nucifera Colpothrinax_wrightii Copernicia_prunifera Corypha_umbraculifera Costus_barbatus Cryosophila_warscewiczii Cyphokentia_macrostachya Cyphophoenix_nucele Cyphosperma_balansae Cyrtostachys_renda Daemonorops_acamptostachys Dasypogon_bromelifolius Deckenia_nobilis Desmoncus_orthacanthos Dictyocaryum_lamarckianum Dictyosperma_album Dransfieldia_micrantha Drymophloeus_beguinii Dypsis_lutescens Elaeis_guineensis Eleiodoxa_conferta Eremospatha_wendlandiana Eugeissona_tristis Euterpe_oleracea Fargesia_sp_557_ny Gastrococos_crispa Gaussia_maya Geonoma_congesta Guihaia_argyrata Hanguana_malayana Hedyscepe_canterburyana Hemithrinax_compacta Heterospathe_elata Howea_belmoreana Hydriastele_microspadix Hyophorbe_lagenicaulis Hyospathe_macrorhachis Hyphaene_thebaica Iguanura_wallichiana Iriartea_deltoidea Iriartella_stenocarpa Itaya_amicorum Johannesteijsmannia_altifrons Juania_australis Jubaea_chilensis Jubaeopsis_caffra Kentiopsis_oliviformis Kerriodoxa_elegans Kingia_australis Korthalsia_cheb Laccospadix_australasica Laccosperma_acutiflorum Latania_verschaffeltii Lavoixia_macrocarpa Lemurophoenix_halleuxii Leopoldinia_pulchra Lepidocaryum_tenue Lepidorrhachis_mooreana Leucothrinax_morrisii Licuala_kunstleri Linospadix_monostachya Livistona_chinensis Lodoicea_maldivica Loxococcus_rupicola Lytocaryum_weddellianum Manicaria_saccifera Marojejya_insignis Masoala_madagascariensis Mauritia_flexuosa Mauritiella_aculeata Maxburretia_rupicola Medemia_argun Metroxylon_salomonense Moratia_cerifera Musa_rosea Myrialepis_paradoxa Nannorrhops_ritchiana Nenga_pumila Neonicholsonia_watsonii Neoveitchia_storckii Nephrosperma_vanhoutteanum Normanbya_normanbyi Nypa_fruticans Oenocarpus_bataua Oncocalamus_tuleyi Oncosperma_tigillarium Orania_lauterbachiana Oraniopsis_appendiculata Parajubaea_torallyi Pelagodoxa_henryana Phoenicophorium_borsigianum Phoenix_reclinata Pholidocarpus_macrocarpus Pholidostachys_pulchra Physokentia_rosea Phytelephas_aequatorialis Pigafetta_elata Pinanga_simplicifrons Pinanga_simplicifrons_b Plectocomia_mulleri Podococcus_barteri Pogonotium_ursinum Polyandrococos_caudescens Ponapea_ledermanniana Prestoea_pubens Pritchardia_arecina Pritchardiopsis_jeanneneyi Pseudophoenix_vinifera Ptychococcus_paradoxus Ptychosperma_macarthurii Raphia_farinifera Ravenea_louvelii Reinhardtia_simplex Retispatha_dumetosa Rhapidophyllum_hystrix Rhapis_excelsa Rhopaloblaste_augusta Rhopalostylis_baueri Roscheria_melanochaetes Roystonea_oleracea Sabal_bermudana Salacca_ramosiana Satakentia_liukiuensis Satranala_decussilvae Schippia_concolor Sclerosperma_mannii Serenoa_repens Socratea_exorrhiza Solfia_samoensis Sommieria_leucophylla Syagrus_smithii Synechanthus_warscewiczianus Tectiphiala_ferox Thrinax_radiata Trachycarpus_fortunei Tradescantia_pallida Trithrinax_campestris Typha_angustifolia Veillonia_alba Veitchia_arecina Verschaffeltia_splendida Voanioala_gerardii Vriesia_psittacina Wallichia_disticha Washingtonia_robusta Welfia_regia Wendlandiella_gracilis Wettinia_hirsuta Wodyetia_bifurcata Zea_mays Zombia_antillarum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4294] TITLE Palms_Morphology; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5127; DIMENSIONS NCHAR=105; FORMAT DATATYPE=Standard SYMBOLS= "0 1 2 3 4 5 A C G T" MISSING=? GAP= -; CHARSTATELABELS 1 Dichotomous_branching / absent present, 2 Leaf_shape / palmate pinnate_incl_bipinnate, 3 Leaf_sheath / gradually_splitting_toward_the_base remaining_tubular_for_at_least_75%_length_until_leaf_abscission_or_marcescence, 4 Leaf_sheath / without_abscission_zone sheath_with_a_clearly_defined_vertical_abscission_zone, 5 Leaf_sheath / not_disintegrating_into_fibers disintegrating_into_fibers, 6 Leaf_sheath / fibres_not_spine_like spine_like, 7 Leaf_sheath_extension / absent present 'ligule-like' oppositipetiolar, 8 Stilt_roots / absent present, 9 Emergent_spines / absent present_on_foliar_organs_only on_foliar_organs_and_stems, 10 Root_spines / absent present, 11 Petiolar_teeth / absent present, 12 Petiole_split_at_base / absent present, 13 Adaxial_hastula / absent present, 14 Primary_leaf_splitting / adaxial adaxial_with_haut abaxial absent, 15 Secondary_splits / occurring_between_the_folds along_abaxial_folds, 16 Lamina_with_central_abaxial_fold_deeply_split / absent present, 17 Leaflets / entire leaflets_praemorse_with_respect_to_single_folds, 18 Phloem_strands_in_petiole / one two, 19 Lamina_anatomy / dorsiventral isolateral, 20 Silica_bodies / spherical hat_shaped, 21 Resin_gum_canals / absent present, 22 Guard_cells / outer_walls_not_thickened thickened, 23 Flowering / pleonanthic acropetal_hapaxanthic basipetal_hapaxanthic, 24 Prophyll / complete incomplete, 25 Prophyll / shorter_than_PD_bract more_or_less_the_same_length_or_longer, 26 Rachillae / all_of_the_same_order of_different_orders, 27 Prophyll_tip / beaked rounded U_shaped, 28 Prophyll_split_with_respect_to_main_axis / abaxially adaxially marginally apically, 29 Peduncular_bracts / five_to_seven four three two one absent, 30 Peduncle / much_longer_than_the_rachis about_the_same_length shorter_than_the_rachis, 31 Rachis_bracts / similar_to_PD_bract_and_prophyll much_smaller_than_PD_bract_and_prophyll, 32 Inflorescence_branching / spicate branched_to_one_order branched_to_two_or_more_orders, 33 Inflorescence_branches / arranged_more_or_less_distichously radially, 34 First_order_branches / basal_conspicuously_longer_than_the_rest same_length_throughout basal_ones_shorter, 35 Inflorescence_branches / lacking_flowers_basally with_flowers_to_their_insertions, 36 Rachillae / not_pendulous pendulous, 37 Rachillae / shorter_than_the_rachis longer_than_the_rachis, 38 Rachilla_bracts / not_tubular tubular, 39 Flowers / superficial sunken_in_pits, 40 Cincinnus / simple acervulus triad dyad 'absent (flowers solitary)', 41 Flowers_or_flower_clusters / spiral distichous decussate, 42 Flowers / closed_in_bud open_precociously, 43 Flower_sex / Bisexual_only Bisexual_and_Unisexual Unisexual_only, 44 Sexual_expression / monoecy_or_polygamomonoecy dioecy_or_polygamodioecy, 45 Staminate_and_pistillate_flowers / not_dimorphic dimorphic, 46 Perianth / trimerous greater_than_trimerous, 47 Perianth / tepals sepals_and_petals, 48 Perianth / not_a_cupule cupule, 49 Pedicelliform_corolla / absent present, 50 Hermaphrodite_flower_sepals / distinct connate, 51 Hermaphrodite_flower_sepals / imbricate valvate, 52 Hermaphrodite_flower_petals / distinct connate, 53 Hermaphrodite_flower_petals / imbricate valvate, 54 Staminate_flower_sepals / distinct connate, 55 Staminate_flower_sepals / imbricate valvate, 56 Staminate_flower_petals / distinct connate, 57 Staminate_flower_petals / imbricate valvate, 58 Pistillate_flower_sepals / distinct connate, 59 Pistillate_flower_sepals / imbricate valvate, 60 Pistillate_flower_petals / distinct connate, 61 Pistillate_flower_petals / imbricate valvate, 62 Stamens / three six more_than_six, 63 Stamen_filaments / straight inflexed, 64 Stamen_filaments / of_equal_length of_two_lengths, 65 Stamen_filaments / distinct connate_in_a_ring, 66 Stamens / free adnate_to_corolla, 67 Anthers / elongate rounded, 68 Connective / not_projecting projecting, 69 Pollen_aperture_number / none one two three, 70 Aperture_position / polar equatorial_or_subequatorial meridional, 71 Aperture_type / 'sulcate incl ext sulc, brevisulc et trichotomosulc' porate zonosulcate_incl_incomplete_zonosulcate, 72 Sulcate_grains / trichotomosulcate_grains_absent trichotomosulcate_grains_present_in_part trichotomosulcate_grains_exclusively_present, 73 Pollen_shape / spheroidal ellipsoidal oblate_spheroidal oblate_rounded_triangular, 74 Tectum / tectate_including_semi_tectate intectate, 75 Symmetry / at_least_one_plane_of_symmetry without_symmetry, 76 Supratectate_processes / absent present, 77 Intectate_processes / absent present, 78 Pistillode / gynoeciform trifid pyramidal capitate attenuate lageniform, 79 Staminodes / absent present, 80 Staminodes / distinct in_a_ring, 81 Staminodes / not_adnate_to_corolla adnate_to_corolla, 82 Staminodes / sterile_anthers_present sterile_anthers_absent, 83 Carpels / one three more_than_three, 84 Carpels / distinct connate_basally connate_throughout connate_by_styles_only, 85 Carpels / not_pseudomonomerous pseudomonomerous, 86 Ovule_attachment / basal lateral pendulous, 87 Ovules / anatropous hemianatropous campylotropous orthotropous, 88 Ovules / micropyles_not_towards_center with_micropyles_toward_center_of_gynoecium, 89 Pericarp / lacking_scales with_scales, 90 Pericarp / corky_warts_absent corky_warts_present, 91 Endocarp_externally / smooth sculptured, 92 Endocarp_internally / smooth sculptured, 93 Endocarp / continuous endocarp_discontinuous_i.e._with_pore_or_operculum, 94 Endocarp_pores / basal lateral apical, 95 Endocarp / lacking_basal_button with_basal_button, 96 Pyrenes / absent present, 97 Stigmatic_remains / apical_or_subapical lateral_and_basal, 98 Seed_attached / basally laterally, 99 'Seed coat penetration (postament)' / absent present, 100 Endosperm / homogeneous ruminate, 101 Embryo / basal_to_subbasal lateral apical_to_subapical, 102 Stamen_development / centripetal centrifugal, 103 Germination / adjacent_ligular remote_ligular remote_tubular, 104 Eophyll / entire bifid palmate pinnate, 105 Chromosome_number_n / 18. 17. 16. 15. 14. 13. 12., ; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 ] [ . . . . . . . . . . ] Acanthophoenix_rubra 011100?0200002-10?????001103421210101002002010100----1011000021000001000100002100112122000000-00010000032 Acoelorraphe_wrightii 00101010001010-00100??000123410211110000000--01000011--------1001100100010100-----13000000000-00001010200 Acrocomia_aculeata 01101000200002-10101??000003411111100002002010100----0001000011001001002300001110112013000001100000010013 Actinokentia_divaricata 011100?0000002-10?????0011??421211100002002010100----0001000020000001000101004100112121000000-0001000001? Actinorhytis_calapparia 01110000000002-10100??00110?421210000002002010100----0001000021000001000101004100112111000000-0001010001? Adonidia_merrillii 01110010000002-11100??00?1??121210000002002010100----00010000200000010001010051001121??000000-00010100012 Aiphanes_aculeata 01101000200002-11101??000000401111000002002010100----1-0100111001000100010100111111201300000110000001001? Allagoptera_arenaria 11101010000002-1010???000-1340-0-----002002010100----1001000021010001000101002110112010000001000000000?02 Alloschmidia_glabrata 01110010000002-10?????00111?421211100002002010100----0001000011000001000101003100112121000000-0001001001? Alsmithia_longipes 01100000000002-1010???000103401221000002002010100----0001000011000001000101004100112121000100-00010000?1? Ammandra_decasperma 011010?0000002-10?????000-1342-0-----004012111000----0---00002000010101-20000-100022001001000-1100000123? Anigozanthos ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Aphandra_natalia 011010?0000002-10?????000-1342-0-----004012111000----0---00002000000100010100-100022001001000-11000001230 Archontophoenix_purpurea 01110010000002-10?????001101421210110002002010100----000100002000000100010100410011211?000000-00000100014 Areca_triandra 01110010000002-1010???00-110511200000002102010100----001000000000000100010100-1?0112100000000-00000100012 Arenga_hookeriana 01101010000000-01001??200-1000-0---0-002002010100----001100112000001100011001-10??12011000000-00000010202 Asterogyne_martiana 01001000000003-1010???000001401111101012002010100----001-001120011001000101001111112021000000-0010000001? Astrocaryum_alatum 01001030200002-10?????000010411111100002002010100----0-111-1-11001001000101001101112013000001200000020011 Attalea_allenii 01101000000002-10?????000013411110100002?02010100----?????????000000100010100211011200?000101000000100202 Bactris_gasipaes 01101000200002-10?????0000?3401111001002002010100----1-111?111000100100130100-11111201300000110000001001? Balaka_seemannii 01110000000002-11?????0001??411210100002002010100----000100002000000100010100510011212?000000-00010000??? Barcella_odora 01101000000002-10?????0000??401111100002002010100----0001000011010001000101001110112013000001100000010?0? Basselinia_velutina 01110010000002-10?????0101?-411210101002002010100----0001000011000001000101002100112121000000-0010000001? 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TACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCGCCTGAGGAAGCAGGGGCAGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAAACCGTTGTCGGAGAGGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTACGAGCTCTACGTCTGGAGGATCTGCGAATTCCCACTTCTTATTCCAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGTATCCAATCTGAAAGAGATAAGTTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAGAACTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAGGATGATGAAAACGTGAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCGCTTTATAAAGCGCAGTCCGAAACGGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCCGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACTGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTCGTTATTGCCGCGATAACGGCCTACTTCTTCACATCCATCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTGGGTAAACTGGAAGGGGAACGTGAGATGACTTTGGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGTCGCGGTATCTTTTTTACTCAAGATTGGGTCTCTATGCCAGGTGTTATACCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCCCTGACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTTGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCCGGTGCAGTAGCTAATCGGGTGGCTTTAGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAAGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTAGCAAATGGAGCCCTGAACGTCTCGAGAGCATCAAAGCTAGCATCGAAACTCGAAAGCTTGACTTCGATGCTTATGTTGGTATGTTACTTTGCCA-CAGCA--CCTAG-TTGTTAGTA---TTCCAAGAA---TTGGCAGA----GCAC-AAATTTGTCGGTATAATATGGAGCAATGTCATTAGTCTT---GATTGCTGAATATAGTAA----TATACTTCGATA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCTACCAAATGCTTCATGAAAAAA----------------CTAATCAAACTAACAAAGCA-----TCT----GATCAATAA----GTCAAATAA-TGCACAAAACATGGTGGACTGACAATGTGATATTA-----CT-----TCATGTGTAATTTTTTT-----GGTACCT-------TTTTTCAAAAGAA---------------------------------------------------------T----GATTCAT-TGAGACAA----TGAGACAATTAGATA-TGTG---GAGTCTCAT-----GTTCTTCTGATATCAGAA--TCCA-CTATTT-CTTTAGCACTCTTGGATTGCTGACAGCTTA-TACA--TTGCTACCCTTGGCAGACCCGCAGAAGCAATATGCTGATGTTGTAATCGAAGTTTTGCCGACACAATTAATTCCTGATGACAA---TGAAAGGAAGGTGCTGAGAGTTCGCTTGATGATGAAAGAAGGGGTGAAATACTTCGATCCAGTTTACCTCTTCGACGAAGGGTCCACTGTTTGGGTCTACAAGCTCGATGACAAGA---TTGCCAA---GCTCTTTGTTCGGCCGAGGGGCTGGCACTTGCCAGAGGCCCATATCCTCATCGACGGTGAACCGGCGACCGGCTGCCTCGTGGACTTCGGCCTCTACTTCTTCCATAACCATGCCACCTTCCGGGC{CT}ACCCAAGGGGCCGGCTTTGGACCTTTCTTCTATCTCCCCAAGATGGAGCACTCAAGGGA-GACAGGGAGGCCAAGATATGGAATTGTGTCTTCGAGAGGGCGGAGA{AG}GTTCGCCGGAATAGGAGG---GGGGAGCATCAGGGCTACGGTCCTGATCGAGACTCTTCCGGCGGTGTTTCAAATGAATGAGATCCTCTATGAGCTGAGGGACCACTCCATTGGGTTGAACTGTGGAAGATGGGACTACATCTTCAGCTACGCCAAGACCTTCCAAGCCCACCCGGACCGCCTCCTCCCCGACCGGGTGCAGGTGGGGATGACCCAGCACTTCATGCGGAGCTACTCCGACCTCCTCATCCGCACCTGCCACCGCCGCGGCGTCCACGCCATGGGTGGCATGGCGGCGCAGATTCCGATCAGGGATAATCCGGCAGCCAATGAAGCAGCCCTGGAGCTGGTGAGGAAAGACAAGCTGCGAGAAGTCCGAGCAGGTCATGATGGCACCTGGGCTGCTCACCCGGGCCTCATTCCGGCCATCTTGGAGGTGTTCACGAGAAACATAGGCAACAAAAAGGCTAACCAGATTCGGACAGCAAAGAGGGAGGATGCGGACAGCATTACCGAAGAGGACCTGCTGCAGAGGCCCAGAGGTGCGGGGACGGTGGAGGGCCTCCGGCTGAACACCAGGGTTGGAATCCAGTACATCGCGGCCTGGCTCACCGGGACCGGATCGGTGCCGCTCTACAATCTCATGGAGGATGCAGCGACCGCGGAGATCAGCAGGGTTCAGAACTGGCAATGGCTCAAATATA---????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Acoelorraphe_wrightii 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Acrocomia_aculeata 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Actinorhytis_calapparia 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Adonidia_merrillii 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Aiphanes_aculeata 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Asterogyne_martiana 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Astrocaryum_alatum 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Barcella_odora 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Basselinia_velutina 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Burretiokentia_hapala 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Butia_eriospatha 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Calamus_aruensis 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Calectasia_intermedia 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Calyptrogyne_ghiesbreghtiana 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Chamaedorea_microspadix 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Chambeyronia_macrocarpa 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Chelyocarpus_ulei 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Clinostigma_savoryanum 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Coccothrinax_argentata 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Cocos_nucifera 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Copernicia_prunifera 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Corypha_umbraculifera 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Costus_barbatus 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Cyphokentia_macrostachya 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Cyphophoenix_nucele 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Cyphosperma_balansae 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Dictyosperma_album 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Dransfieldia_micrantha 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Drymophloeus_beguinii 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Eremospatha_wendlandiana 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Gastrococos_crispa 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Gaussia_maya 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Hydriastele_microspadix 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Iguanura_wallichiana 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Iriartea_deltoidea 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Itaya_amicorum 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Johannesteijsmannia_altifrons 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Juania_australis 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Jubaea_chilensis 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Jubaeopsis_caffra 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Kentiopsis_oliviformis 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Kerriodoxa_elegans 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Kingia_australis 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Korthalsia_cheb 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Laccosperma_acutiflorum 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Leopoldinia_pulchra 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Lepidocaryum_tenue 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Leucothrinax_morrisii 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Licuala_kunstleri 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Linospadix_monostachya 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Livistona_chinensis 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Manicaria_saccifera 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Mauritia_flexuosa 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Mauritiella_aculeata 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Maxburretia_rupicola 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Medemia_argun 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Metroxylon_salomonense 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Moratia_cerifera 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Nannorrhops_ritchiana 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Nenga_pumila 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Neonicholsonia_watsonii 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Neoveitchia_storckii 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Nephrosperma_vanhoutteanum 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Nypa_fruticans 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Oncosperma_tigillarium 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Phoenix_reclinata 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Pholidocarpus_macrocarpus 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Pholidostachys_pulchra 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Physokentia_rosea 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Phytelephas_aequatorialis 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Pigafetta_elata 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Pinanga_simplicifrons 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Pinanga_simplicifrons_b 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Plectocomia_mulleri 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Podococcus_barteri 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Pogonotium_ursinum 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Ponapea_ledermanniana 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Prestoea_pubens 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Pseudophoenix_vinifera 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Raphia_farinifera 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Rhapis_excelsa 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Rhopaloblaste_augusta 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Rhopalostylis_baueri 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Roscheria_melanochaetes 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Roystonea_oleracea 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Sabal_bermudana 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Salacca_ramosiana 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Satakentia_liukiuensis 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Schippia_concolor 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Serenoa_repens 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Socratea_exorrhiza 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Solfia_samoensis 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Sommieria_leucophylla 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Syagrus_smithii 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Synechanthus_warscewiczianus 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Veitchia_arecina 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Verschaffeltia_splendida 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Voanioala_gerardii 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Wallichia_disticha 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Washingtonia_robusta 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Welfia_regia 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Zea_mays TATAAATTGACTTACTACACCCCGGAGTACGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAGCTCGGGGTTCCGCCTGAAGAAGCAGGAGCTGCAGTAGCTGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATCGAGCCCGTTCCTGGGGACCCAGATCAATATATCTGTTATGTAGCTTATCCATTAGACCTATTTGAAGAGGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAACGTATTTGGTTTCAAAGCCTTACGCGCTCTACGTTTGGAGGATCTACGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCACGGTATCCAAGTTGAAAGGGATAAGTTGAACAAGTACGGTCGTCCTTTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAAAATTACGGTAGAGCGTGTTATGAGTGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTAAACTCACAACCATTTATGCGCTGGAGAGACCGTTTCGTCTTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCACAAGCCGAAACTGGTGAAATCAAGGGGCATTACTTGAATGCGACTGCAGGTACATGCGAAGAAATGATTAAGAGAGCTGTATTTGCAAGGGAATTAGGGGTTCCTATTGTAATGCATGACTACTTAACAGGAGGATTCACCGCAAATACTACTTTGTCTCATTATTGCCGCGACAACGGCCTACTTCTTCACATTCACCGAGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTCCGTGTATTAGCTAAAGCATTGCGTATGTCGGGGGGAGATCATATCCACTCCGGTACAGTAGTAGGTAAGTTAGAAGGGGAACGCGAAATAACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGTTCTCGCGGTATCTTTTTCACTCAGGACTGGGTATCCATGCCAGGTGTTATACCGGTGGCTTCTGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCAGCTCTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCCGTATTACAATTTGGTGGAGGAACTTTAGGACATCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGCAGCTAATCGTGTGGCTTTAGAAGCCTGTGTACAAGCTCGTAACGAAGGGCGCGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCAAAGCAGCTTGCAAATGGAGTGCTGAAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGACGTACGAGCTCAACGACCGAA---CCGCCA---AGCTCTTCGTCCGGCCCCGCGGCTGGCACCTCCCCGAGGCGCACATCCTCATCGACGGCGAGCCGGCCATCGGCTGCCTCGTCGACTTCGGCCTCTACTTCTTCCACAACCACGCTGCCTTCGGCGCGGGCCAGGGCGCCGGCTTCGGGCCCTTGTGTGACCTGCCCAAGATGGAGCACTC---------CAGAGAAGCGAGGATATGGAACGGGGTGTTCCAGAGAGCGGAGAAAGCTGCTGGGATCGAGCC---GGGGAGCATCCGGGCGACGGTGCTGGTGGAGACGTTGCCGGCGGTGTTCCAAATGAACGAGATCCTGCACGAGCTGCGCGAACACTCGGCGGGACTCAACTGCGGCCGCTGGGACTACATCTTCAGCTACGTCAAGACGTTCCGCGCCCACCCGGACCGCCTCCTCCCCGACCGCGCCCTCGTCGGCATGGCCCAGCACTTCATGCGCTCCTACTCCCACCTCCTCATCCACACCTGCCACCGTCGCGGAGTCCACGCCATGGGCGGCATGGCGGCTCAGATCCCGATCAAGGACGATGCGGCGGCGAACGAGGCGGCACTGGAGCTGGTGCGCAAGGACAAGCTGAGGGAGGTGCGCGCGGGCCACGACGGCACGTGGGCGGCGCACCCGGGGCTCATCCCGGCGATACGGGAGGTCTTCGAGGGCCACCTCGGCGGGAG---GCCGAACCAGATCGGCGACGCCGCAGGGCACGAGGGCGCCAGCGTCAAGGAGGAGGACCTCATCCAGCCGCCGCGGGGCGCGCGCACGGTGGACGGTCTGCGGCTCAACGTCCGCGTGGGCGTGCAGTACCTCGCGGCGTGGCTGGCCGGCTCCGGCTCCGTCCCGCTGTACAACCTGATGGAGGACGCGGCTACGGCGGAGATCAGCCGCGTCCAGAACTGGCAGTGGCTGCGCCACGGAG------------------ATGAGAACCAATCCTACTACTTCGCGTCCCGGGATTTCCACAATTGAAGAAAAAAGCGTAGGGCGTATTGATCAAATTATTGGACCCGTGCTGGATATCACTTTTCCCCCGGGCAAGTTGCCTTATATTTATAATGCTTTGATAGTCAAGAGTCGAGACACTGCCGATAAGCAAATTAATGTGACTTGTGAGGTACAACAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTGGCTATGAGTGCTACAGAGGGGTTGATGAGAGGAATGGAAGTGATTGACACGGGAACTCCTCTCAGTGTTCCAGTCGGTGGAGCTACTCTCGGACGAATTTTTAACGTTCTTGGGGAGCCTATTGACAATTTGGGTCCTGTGGATACTAGTGCAACATTTCCTATTCATAGATCTGCGCCTGCCTTTATCGAGTTAGATACGAAATTATCTATCTTTGAAACAGGTATTAAGGTGGTCGATCTTTTAGCTCCCTATCGACGTGGAGGAAAAATCGGACTGTTTGGGGGGGCAGGAGTAGGTAAAACAGTACTCATCATGGAATTAATCAATAACATTGCTAAAGCTCATGGAGGCGTATCCGTATTTGGCGGAGTAGGGGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTATATGGAAATGAAGGAATCCGGAGTAATTAATGAAAAAAATATTGAGGAATCAAAGGTAGCTCTAGTCTATGGCCAAATGAATGAACCGCCGGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTAACTGCCCTAACTATGGCAGAATATTTCCGAGATGTTAATAAGCAAGACGTGCTTTTATTCATCGATAATATCTTTCGTTTTGTTCAAGCAGGATCGGAAGTATCCGCCTTATTAGGCAGAATGCCCTCCGCAGTGGGTTATCAACCTACCCTTAGTACAGAAATGGGTTCTTTGCAAGAAAGAATTACTTCTACCAAAAAGGGATCTATAACTTCGATCCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGACGATTTGACCGACCCTGCTCCTGCCACAACATTTGCACATTTGGACGCTACTACCGTACTTTCCAGAGGATTAGCTTCCAAGGGTATTTATCCCGCAGTGGATCCTTTAGATTCAACCTCAACTATGTTACAGCCTCGGATTGTTGGCAACGAACATTATGAAACTGCGCAAAGAGTTAAGGAAACTTTACAACGTTACAAAGAACTTCAGGACATTATCGCAATTCTTGGATTGGATGAATTATCGGAGGAGGATCGTTTAACTGTAGCAAGAGCACGAAAAATCGAGCGGTTCTTATCACAACCGTTCTTTGTGGCAGAAGTTTTTACCGGTTCTCCAGGAAAGTATGTTGGTCTTGCAGAAACAATTAGGGGATTTCAACTAATCCTTTCCGGAGAATTAGACGGCCTACCCGAACAGGCTTTTTATTTAGTGGGGAACATCGATGAAGCTAGCACGAAAGCTATAAACTTAGAAGAGGAGAGCAAATTG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Zombia_antillarum 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4374] TITLE Palms_Molecular_B; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5127; DIMENSIONS NCHAR=11335; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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Acrocomia_aculeata 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Anigozanthos 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Balaka_seemannii 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Basselinia_velutina 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Beccariophoenix_madagascariensis 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Bentinckia_nicobarica 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Borassodendron_machadonis 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Brahea_berlandieri 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Brassiophoenix_schumannii 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Calyptrocalyx_albertisiana 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Campecarpus_fulcitus 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Carpentaria_acuminata 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Caryota_mitis 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Ceratolobus_pseudoconcolor 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Ceroxylon_quindiuense 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Chamaedorea_microspadix 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Chuniophoenix_nana 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Clinosperma_bractealis 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Coccothrinax_argentata 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Colpothrinax_wrightii 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Copernicia_prunifera 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Corypha_umbraculifera 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Cyphokentia_macrostachya 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Desmoncus_orthacanthos 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Dictyocaryum_lamarckianum 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Dictyosperma_album 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Dransfieldia_micrantha 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Dypsis_lutescens 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Elaeis_guineensis 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Gastrococos_crispa 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Heterospathe_elata 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Iriartella_stenocarpa 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Itaya_amicorum 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Jubaea_chilensis 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Jubaeopsis_caffra 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Kentiopsis_oliviformis 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Korthalsia_cheb 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Laccospadix_australasica 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Laccosperma_acutiflorum 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Latania_verschaffeltii 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Lavoixia_macrocarpa 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Leopoldinia_pulchra 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Licuala_kunstleri 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Linospadix_monostachya 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Livistona_chinensis 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Lodoicea_maldivica 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Loxococcus_rupicola 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Masoala_madagascariensis 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Mauritia_flexuosa 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Mauritiella_aculeata 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Maxburretia_rupicola 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Medemia_argun 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Metroxylon_salomonense 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Moratia_cerifera 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Musa_rosea 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Myrialepis_paradoxa 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Nannorrhops_ritchiana 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Nenga_pumila 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Oncosperma_tigillarium 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Pelagodoxa_henryana 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Pholidostachys_pulchra 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Pinanga_simplicifrons_b 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Plectocomia_mulleri 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Podococcus_barteri 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Pseudophoenix_vinifera 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Ptychosperma_macarthurii 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Rhapidophyllum_hystrix 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Roystonea_oleracea 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Sabal_bermudana 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Salacca_ramosiana 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Satakentia_liukiuensis 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Satranala_decussilvae 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Schippia_concolor 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Socratea_exorrhiza 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Solfia_samoensis 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Synechanthus_warscewiczianus 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Trachycarpus_fortunei 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Trithrinax_campestris 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Wallichia_disticha 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Welfia_regia 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Zombia_antillarum 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The following blocks are output data for analysis step 5127 ] BEGIN TREES; TITLE Tb10535; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5127; TREE Fig._2 = [&R] (((Anigozanthos,(Hanguana_malayana,Tradescantia_pallida)),(Costus_barbatus,Musa_rosea)),((((((((((((((((Acanthophoenix_rubra,Tectiphiala_ferox),Deckenia_nobilis),Oncosperma_tigillarium),((Dictyosperma_album,Rhopaloblaste_augusta),((Iguanura_wallichiana,((Nephrosperma_vanhoutteanum,Phoenicophorium_borsigianum),(Roscheria_melanochaetes,Verschaffeltia_splendida))),Masoala_madagascariensis))),((Areca_triandra,(Nenga_pumila,Pinanga_simplicifrons)),((Bentinckia_nicobarica,Clinostigma_savoryanum),Cyrtostachys_renda))),((((Actinokentia_divaricata,Kentiopsis_oliviformis),Chambeyronia_macrocarpa),Actinorhytis_calapparia),(((Adonidia_merrillii,((Balaka_seemannii,Solfia_samoensis),Veitchia_arecina)),((Brassiophoenix_schumannii,Ptychococcus_paradoxus),((Carpentaria_acuminata,Wodyetia_bifurcata),Normanbya_normanbyi),Drymophloeus_beguinii)),(Ponapea_ledermanniana,Ptychosperma_macarthurii)),((Alloschmidia_glabrata,Basselinia_velutina),Burretiokentia_hapala,((Campecarpus_fulcitus,Cyphophoenix_nucele),Veillonia_alba),Cyphosperma_balansae,Physokentia_rosea),((Alsmithia_longipes,Heterospathe_elata),Dransfieldia_micrantha,(Laccospadix_australasica,Linospadix_monostachya)),Archontophoenix_purpurea,(((Brongniartikentia_lanuginosa,Lavoixia_macrocarpa),Clinosperma_bractealis),(Cyphokentia_macrostachya,Moratia_cerifera)),Calyptrocalyx_albertisiana,(Carpoxylon_macrospermum,(Neoveitchia_storckii,Satakentia_liukiuensis)),(Hedyscepe_canterburyana,Rhopalostylis_baueri),Howea_belmoreana,(Hydriastele_microspadix,Loxococcus_rupicola),Lepidorrhachis_mooreana)),((Dypsis_lutescens,Marojejya_insignis),Lemurophoenix_halleuxii)),((((((Asterogyne_martiana,Geonoma_congesta),(Calyptrogyne_ghiesbreghtiana,Calyptronoma_occidentalis)),(Pholidostachys_pulchra,Welfia_regia)),Manicaria_saccifera),Leopoldinia_pulchra),(Pelagodoxa_henryana,Sommieria_leucophylla)),((Euterpe_oleracea,((Neonicholsonia_watsonii,Oenocarpus_bataua),Prestoea_pubens)),Hyospathe_macrorhachis)),((Orania_lauterbachiana,Sclerosperma_mannii),Podococcus_barteri)),((((((Acrocomia_aculeata,Gastrococos_crispa),((Aiphanes_aculeata,Desmoncus_orthacanthos),(Astrocaryum_alatum,Bactris_gasipaes))),(Barcella_odora,Elaeis_guineensis)),(((((((Allagoptera_arenaria,Polyandrococos_caudescens),((Attalea_allenii,Lytocaryum_weddellianum),Syagrus_smithii)),(Cocos_nucifera,Parajubaea_torallyi)),(Butia_eriospatha,Jubaea_chilensis)),Voanioala_gerardii),Jubaeopsis_caffra),Beccariophoenix_madagascariensis)),Reinhardtia_simplex),Roystonea_oleracea)),(((Chamaedorea_microspadix,Gaussia_maya),(Synechanthus_warscewiczianus,Wendlandiella_gracilis)),Hyophorbe_lagenicaulis)),(Dictyocaryum_lamarckianum,((Iriartea_deltoidea,Wettinia_hirsuta),Iriartella_stenocarpa,Socratea_exorrhiza))),((((Ammandra_decasperma,Aphandra_natalia),Phytelephas_aequatorialis),((Ceroxylon_quindiuense,Juania_australis),(Oraniopsis_appendiculata,Ravenea_louvelii))),Pseudophoenix_vinifera)),((((((Acoelorraphe_wrightii,Serenoa_repens),Brahea_berlandieri,(((Chamaerops_humilis,((((Guihaia_argyrata,Rhapis_excelsa),Maxburretia_rupicola),Rhapidophyllum_hystrix),Trachycarpus_fortunei)),((((Johannesteijsmannia_altifrons,Pholidocarpus_macrocarpus),Pritchardiopsis_jeanneneyi),Licuala_kunstleri),Livistona_chinensis)),(Copernicia_prunifera,Pritchardia_arecina),Washingtonia_robusta)),Colpothrinax_wrightii),((((Chelyocarpus_ulei,Trithrinax_campestris),(((Coccothrinax_argentata,(Hemithrinax_compacta,Leucothrinax_morrisii),Thrinax_radiata),Zombia_antillarum),Schippia_concolor)),Cryosophila_warscewiczii,Itaya_amicorum),Sabal_bermudana)),Phoenix_reclinata),(((((Arenga_hookeriana,Wallichia_disticha),Caryota_mitis),((Bismarckia_nobilis,(Hyphaene_thebaica,Medemia_argun),Satranala_decussilvae),(Borassodendron_machadonis,Borassus_flabellifer),Latania_verschaffeltii,Lodoicea_maldivica)),Corypha_umbraculifera),(Chuniophoenix_nana,(Kerriodoxa_elegans,Nannorrhops_ritchiana))))),Nypa_fruticans),(((((((Calamus_aruensis,Ceratolobus_pseudoconcolor),((Calospatha_scortechinii,Daemonorops_acamptostachys),(Pogonotium_ursinum,Retispatha_dumetosa))),((Myrialepis_paradoxa,Pinanga_simplicifrons_b),Plectocomia_mulleri)),(Metroxylon_salomonense,Pigafetta_elata)),((Eleiodoxa_conferta,Salacca_ramosiana),Korthalsia_cheb)),((Eugeissona_tristis,Raphia_farinifera),(Lepidocaryum_tenue,(Mauritia_flexuosa,Mauritiella_aculeata)))),((Eremospatha_wendlandiana,Laccosperma_acutiflorum),Oncocalamus_tuleyi))),(Calectasia_intermedia,Dasypogon_bromelifolius,Kingia_australis),((Catopsis_montana,Vriesia_psittacina),((Fargesia_sp_557_ny,Zea_mays),Typha_angustifolia))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6585] END;