#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 11, 2024; 20:44 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Les D., Murray N., & Tippery N. 2009. Systematics of Two Imperiled Pondweeds (Potamogeton vaseyi, P. gemmiparus) and Taxonomic Ramifications for subsection Pusilli (Potamogetonaceae). Systematic Botany, 34(4): 643-651. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10060] [ The following blocks are input data for analysis step 5153 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5153; DIMENSIONS NTAX=71; TAXLABELS Potamogeton_berchtoldii_AY714288 Potamogeton_berchtoldii_AY714289 Potamogeton_berchtoldii_Bearcamp.06.060 Potamogeton_berchtoldii_Bearcamp.06.061 Potamogeton_berchtoldii_BeseckLk.CT.1 Potamogeton_berchtoldii_BeseckLk.CT.3 Potamogeton_berchtoldii_BeseckLk.CT2 Potamogeton_berchtoldii_Bigelow.07.066 Potamogeton_berchtoldii_CaptiveLk.MN Potamogeton_berchtoldii_ColumbiaLk.CT Potamogeton_berchtoldii_CoventryLk.06.015 Potamogeton_berchtoldii_CoventryLk.06.117 Potamogeton_berchtoldii_DonnasPd.MN Potamogeton_berchtoldii_EF526402 Potamogeton_berchtoldii_EF526403 Potamogeton_berchtoldii_GreerLk.MN Potamogeton_berchtoldii_Kanasatka.06.067 Potamogeton_berchtoldii_LeesPd.06.064 Potamogeton_berchtoldii_LongLk.MN Potamogeton_berchtoldii_MansfieldHollow Potamogeton_berchtoldii_MdBolton.07.045 Potamogeton_berchtoldii_PachaugPd.07.085 Potamogeton_berchtoldii_Pemig.06.062 Potamogeton_berchtoldii_Pleasant.MN Potamogeton_berchtoldii_Quaddick.06.106 Potamogeton_berchtoldii_StarkPd.MN.pseudoclone1 Potamogeton_berchtoldii_WilsonPd.ME Potamogeton_clystocarpus_AY714283 Potamogeton_clystocarpus_AY714284 Potamogeton_compressus_DQ840310 Potamogeton_cristatus_DQ840323 Potamogeton_foliosus_AY714292 Potamogeton_foliosus_AY714293 Potamogeton_foliosus_BeseckLk.CT Potamogeton_foliosus_MtHigby.CT Potamogeton_foliosus_MudgePd.CT.clone1 Potamogeton_foliosus_Orange.CT Potamogeton_gemmiparus_BigelowPd.06.045 Potamogeton_gemmiparus_BigelowPd.06.048 Potamogeton_gemmiparus_BigelowPd.CT Potamogeton_gemmiparus_Pemig.06.063 Potamogeton_gemmiparus_Pickerel.06.014.5 Potamogeton_gemmiparus_Pickerel.06.014.8 Potamogeton_gemmiparus_PowersLk.06.013 Potamogeton_gemmiparus_WilsonPd.ME.clone2 Potamogeton_octandrus_DQ840316 Potamogeton_pusillus_DQ840294 Potamogeton_pusillus_DQ840295 Potamogeton_pusillus_DQ840296 Potamogeton_pusillus_MudgePd.CT.clone2 Potamogeton_pusillus_PineMtn.MN Potamogeton_pusillus_TenMileLk.MN Potamogeton_vaseyi_Beseck.07.011 Potamogeton_vaseyi_CoventryLk Potamogeton_vaseyi_CrystalLk.06.040 Potamogeton_vaseyi_CrystalLk.06.042 Potamogeton_vaseyi_CrystalLk.06.044 Potamogeton_vaseyi_GardnerLk Potamogeton_vaseyi_LkMarie.07.027 Potamogeton_vaseyi_LkMemphremagog.VT Potamogeton_vaseyi_LongLk.MN Potamogeton_vaseyi_Missisquoi.VT Potamogeton_vaseyi_MtHigby.07.005 Potamogeton_vaseyi_OzawindibLk.MN Potamogeton_vaseyi_PachaugPd.07.084 Potamogeton_vaseyi_SandLk.MN Potamogeton_vaseyi_SandLk.MNb Potamogeton_vaseyi_StarkPd.MN.pseudoclone2 Potamogeton_vaseyi_WilsonPd.ME.clone1 Potamogeton_vaseyi_WintergreenLk Potamogeton_zosteriformis_Missisquoi.VT ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Potamogeton_berchtoldii_CaptiveLk.MN TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCA??----------------------------------------------------ACCAA---------------??GCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAAAATTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTT--CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAA? 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Potamogeton_berchtoldii_CoventryLk.06.117 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCGTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------ACCAA---------------CGGCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAAAATTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTT--CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_berchtoldii_DonnasPd.MN TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCA??----------------------------------------------------ACCAA---------------CGGCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_berchtoldii_EF526402 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------ACCAA---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Potamogeton_berchtoldii_GreerLk.MN TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCA??----------------------------------------------------ACCAA---------------CGGCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATT???????????????????? Potamogeton_berchtoldii_Kanasatka.06.067 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Potamogeton_berchtoldii_LeesPd.06.064 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Potamogeton_berchtoldii_LongLk.MN 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Potamogeton_berchtoldii_MansfieldHollow TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGC???????????????????----------------------------------------------------ACCAA---------------??????????CTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAA????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_berchtoldii_MdBolton.07.045 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------ACCAA---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_berchtoldii_PachaugPd.07.085 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCA??????????????????????????????????----------------------------------------------------ACCAA---------------??????????CTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_berchtoldii_Pemig.06.062 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGA????????????????----------------------------------------------------ACCAA---------------CGGCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_berchtoldii_Pleasant.MN ????????????????????GAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCA??----------------------------------------------------ACCAA---------------??????????CTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAA? Potamogeton_berchtoldii_Quaddick.06.106 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTC{CG}TCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCA??----------------------------------------------------ACCAA---------------??????????CTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAAAATTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_berchtoldii_StarkPd.MN.pseudoclone1 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGC???????????????????----------------------------------------------------ACCAA---------------??GCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTTTCTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_berchtoldii_WilsonPd.ME TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAG{AT}CTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCA??----------------------------------------------------ACCAA---------------??????????CTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTT--GCCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACTAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAAAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_clystocarpus_AY714283 ?????????????????????????????????CATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCT--TTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATC????????????????????????????????????????????????----------------------------------------------------ACCCA---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_clystocarpus_AY714284 ?????????????????????????????????CATAATCTATCATCGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAAATCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCT--TTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATC????????????????????????????????????????????????----------------------------------------------------ACCCA---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_compressus_DQ840310 ??????????????????????AGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTTGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCATCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTTTGAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCTTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCTGGAATTCGTGCAAGGGCACGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATAGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCA??????????????????????????????????----------------------------------------------------CACAA---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_cristatus_DQ840323 ??????????????????????AGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCAAGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCACGGCGACTTGTTTGTACTAGTGAA-TCCCTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGGGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCTTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTTTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGCCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCGCTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCA??????????????????????????????????----------------------------------------------------CCCAA---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_foliosus_AY714292 ?????????????????????????????????CATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTGTATTTACTAGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTTTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCTTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCTTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTTTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATC????????????????????????????????????????????????----------------------------------------------------CCCAC---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Potamogeton_foliosus_BeseckLk.CT TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACACGTGAAGTGCGTGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTAGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTTTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCTTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCTTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTTTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------??????????CTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTATGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GGCCTTGCAAAAAAAA-TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTT--CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTATGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTATATCACTATGCAATAACTCTATATATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAA???????????????????????????? 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Potamogeton_vaseyi_LkMarie.07.027 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------?GGCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATT???????????????????? Potamogeton_vaseyi_LkMemphremagog.VT TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------??GCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAA? Potamogeton_vaseyi_LongLk.MN TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------CGGCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAA????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_vaseyi_Missisquoi.VT TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTA???????????----------------------------------------------------CCCAC---------------??GCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAAA Potamogeton_vaseyi_MtHigby.07.005 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------?GGCTAGGATCTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTTTCTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTT??????????????????????????????? Potamogeton_vaseyi_OzawindibLk.MN TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_vaseyi_PachaugPd.07.084 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAG?????????????????????????????????----------------------------------------------------CCCAC---------------??????????CTTTTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAA????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_vaseyi_SandLk.MN ???????????????????GGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------?????????????TTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTG?????????????????? Potamogeton_vaseyi_SandLk.MNb TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCA??????????????????????????????????----------------------------------------------------CCCAC---------------?????????????TTACACATTTGGATGAAGTAACGAATTCGTCTAGACTTTTGGTTGAGTCTATAAGACCACGACTGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTCAAA? Potamogeton_vaseyi_StarkPd.MN.pseudoclone2 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGC???????????????????----------------------------------------------------CCCAC---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_vaseyi_WilsonPd.ME.clone1 TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCG????????????????????----------------------------------------------------CCCAC---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_vaseyi_WintergreenLk TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACTCGTGAAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCATGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTGGAGAGTTGGGTGTGCCTAACAACCCCTCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTT-GAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTTCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGTTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTCTAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCATGACGGTTGAAGTCTTGTAGTCC---------------GCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATGGCACGTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CCCAC---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGATCCTGAAAGGTAATGCATGGAAAAAATAGCATGTCGTATTAATTTTTAATGTAGAATTTTTTAGGATATACCATTCTTACGGAATTGGTACAAAAAACATAGTTTTGCTTTTTTTT-GCCCTTGCAAAAAAA--TTCACATTTATGGACCGAATGAATAAATGGATAGAGTACTAAGCTCCAATTCCAGGGAAACAAAAAGCAACCAGCTTATGTTCTTAATTTGAATGATTACCCGACCTAATTAGATGTTAAAAACGAATTAGTACCTGATTCGGGAAAGGATTACCCTGTGAGTGGATTATCTATTTTTGGAATCCTAACTATTTTTTTTTT-CTATTTTAGAGTGCAAACGGATGTGTAAAAGAAACTGTATATTGATAAAGAGAATTTATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATTGGGTTGCTAAAATAAAGGATTTTTAACCTTCTCTTTTGTAATGTTAACAAATATAAACCCATTGTAGGGAAAAAGAGAAAAAGATCCGTTGACTGGACTATTTGTTTCCGTGGTATCTATTTTTGTATCAATATGCAATAACTCTATAGATGTACCTTGTTATGACCATATCGCACTATGTATCATTTAATAACTAAAGAAGTGCTTCTGACTCTGGTTCAAATATGATTTGAAATGGAAGAATTC???? Potamogeton_zosteriformis_Missisquoi.VT TTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCATAATCTATCATTGTAGACCGAGAACACGTTTAGTGCATGCGTGGTGTGTTCCTTTGTTGGTCTATCCACGCGAGCCTCCCCTCTCTCTATTTACTTGAGCGTTGGGTGTGCCTAACAACCCATCGGCACGTACTGTGCCAAGGTAATCAATGGAAGTCGTGGTGGTGGTACCGTGTGTGCTCCATAGCGACTTGTTTGTACTAATGAA-TCCTTTTGAGGATATCAGATGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGTCCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAAGCTTCCGGGCCGAGGGCAAGCCTGCGTGGGCGTCAAGTTACGTTGCTCGCTCACCCTCCTCGAGGTCCATTTTC----TTGAGGCCTCTTGGTTAAGGTGTTCGAAGTGGAGATTGACCCTCCATTCTCTTTCGACGAATGGTGGGTTGAAGTTTATAGTGCCGCCGGAATTCGTGCAAGGGCACGACGGTTGAAGTCTCGTAGTCCTGGGCATCTTCGTCCGCTACGGCTTACTTGTCGTTCTCGTCGATCCGGTGTCGTTCCCAGTTCATAGCACTTTGCCTTGACCAACATCGCGACCCCACGTCAGGCTAGATCACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAAT----------------------------------------------------CACAA---------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN SETS; CHARSET ITS_DNA (CHARACTERS = combined) = 1-780; CHARSET ITS_indel (CHARACTERS = combined) = 781-800; CHARSET trnK (CHARACTERS = combined) = 801-1545; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = combined) = N: 1-1545; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = combined) = N: 1-1545; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5153 ] BEGIN TREES; TITLE Tb10561; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5153; TREE Fig._1 = [&R] (((Potamogeton_berchtoldii_AY714288,Potamogeton_berchtoldii_AY714289,Potamogeton_berchtoldii_EF526402,Potamogeton_berchtoldii_EF526403,Potamogeton_berchtoldii_ColumbiaLk.CT,Potamogeton_berchtoldii_LongLk.MN,Potamogeton_berchtoldii_MdBolton.07.045,Potamogeton_berchtoldii_DonnasPd.MN,Potamogeton_berchtoldii_Pleasant.MN,Potamogeton_berchtoldii_WilsonPd.ME,Potamogeton_berchtoldii_Bearcamp.06.060,Potamogeton_berchtoldii_Bearcamp.06.061,Potamogeton_berchtoldii_Pemig.06.062,Potamogeton_berchtoldii_Kanasatka.06.067,Potamogeton_berchtoldii_LeesPd.06.064,Potamogeton_berchtoldii_BeseckLk.CT.1,Potamogeton_berchtoldii_BeseckLk.CT2,Potamogeton_berchtoldii_BeseckLk.CT.3,Potamogeton_berchtoldii_Quaddick.06.106,Potamogeton_berchtoldii_CoventryLk.06.117,Potamogeton_berchtoldii_CoventryLk.06.015,Potamogeton_berchtoldii_CaptiveLk.MN,Potamogeton_berchtoldii_GreerLk.MN,Potamogeton_berchtoldii_MansfieldHollow,Potamogeton_berchtoldii_Bigelow.07.066,Potamogeton_berchtoldii_PachaugPd.07.085,Potamogeton_berchtoldii_StarkPd.MN.pseudoclone1,(Potamogeton_clystocarpus_AY714283,Potamogeton_clystocarpus_AY714284),(Potamogeton_gemmiparus_BigelowPd.CT,Potamogeton_gemmiparus_BigelowPd.06.045,Potamogeton_gemmiparus_BigelowPd.06.048,Potamogeton_gemmiparus_Pemig.06.063,Potamogeton_gemmiparus_PowersLk.06.013,Potamogeton_gemmiparus_Pickerel.06.014.5,Potamogeton_gemmiparus_Pickerel.06.014.8,Potamogeton_gemmiparus_WilsonPd.ME.clone2)),(Potamogeton_cristatus_DQ840323,(((Potamogeton_foliosus_AY714292,Potamogeton_foliosus_AY714293,(Potamogeton_foliosus_MtHigby.CT,Potamogeton_foliosus_Orange.CT,Potamogeton_foliosus_BeseckLk.CT,Potamogeton_foliosus_MudgePd.CT.clone1)),(Potamogeton_pusillus_DQ840294,Potamogeton_pusillus_DQ840295,Potamogeton_pusillus_DQ840296,(Potamogeton_pusillus_TenMileLk.MN,Potamogeton_pusillus_PineMtn.MN,Potamogeton_pusillus_MudgePd.CT.clone2))),(Potamogeton_octandrus_DQ840316,(Potamogeton_vaseyi_CrystalLk.06.040,Potamogeton_vaseyi_CrystalLk.06.042,Potamogeton_vaseyi_CrystalLk.06.044,Potamogeton_vaseyi_GardnerLk,Potamogeton_vaseyi_WintergreenLk,Potamogeton_vaseyi_CoventryLk,Potamogeton_vaseyi_LkMarie.07.027,Potamogeton_vaseyi_PachaugPd.07.084,Potamogeton_vaseyi_LkMemphremagog.VT,Potamogeton_vaseyi_MtHigby.07.005,Potamogeton_vaseyi_Beseck.07.011,Potamogeton_vaseyi_LongLk.MN,Potamogeton_vaseyi_OzawindibLk.MN,Potamogeton_vaseyi_StarkPd.MN.pseudoclone2,Potamogeton_vaseyi_SandLk.MN,Potamogeton_vaseyi_SandLk.MNb,Potamogeton_vaseyi_Missisquoi.VT,Potamogeton_vaseyi_WilsonPd.ME.clone1))))),(Potamogeton_zosteriformis_Missisquoi.VT,Potamogeton_compressus_DQ840310)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6283] END;