#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 13, 2026; 5:27 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hirayama K., Tanaka K., Raja H., Miller A.N., & Shearer C. 2010. A molecular phylogenetic assessment of Massarina ingoldiana sensu lato. Mycologia, 102(3): 729-746. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10172] [ The following blocks are input data for analysis step 5411 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5411; DIMENSIONS NTAX=45; TAXLABELS Arthopyrenia_salicis Botryosphaeria_dothidea Byssothecium_circinans Cochliobolus_heterostrophus Cucurbidothis_pityophila Delitschia_didyma Didymella_cucurbitacearum Didymella_exigua Dothidea_insculpta Helminthosporium_velutinum Keissleriella_cladophila Lophiostoma_brevi_KT1215 Lophiostoma_brevi_KT1399 Lophiostoma_heterosporum Lophiostoma_macrostomum_KT635 Lophiostoma_macrostomum_KT709 Massaria_platani Massarina_eburnea Massarina_eburnea_3953 Massarina_ingoldiana_ATCC200398 Massarina_ingoldiana_KH100 Massarina_ingoldiana_KH114 Massarina_ingoldiana_KH155 Massarina_ingoldiana_KH241 Massarina_ingoldiana_KH68 Massarina_ingoldiana_KT1096 Massarina_ingoldiana_KT1107 Massarina_ingoldiana_KT891 Massarina_ingoldiana_KT966 Massarina_sp_R56 Massariosphaeria_typhicola_KT667 Massariosphaeria_typhicola_KT797 Montagnula_opulenta Neotestudina_rosatii Neottiosporina_paspali Phaeosphaeria_avenaria Pleomassaria_siparia Pleospora_herbarum Preussia_terricola Saccharicola_bicolor Setomelanomma_holmii Spencermartinsia_viticcola Sporormia_lignicola Ulospora_bilgramii Zopfia_rhizophila ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4702] TITLE Massarina_ingoldiana_SSU; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5411; DIMENSIONS NCHAR=911; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arthopyrenia_salicis 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Massarina_ingoldiana_SSU) = N: 1-911; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Massarina_ingoldiana_SSU) = N: 1-911; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5411 ] BEGIN TREES; TITLE Tb10819; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5411; TREE SSU = [&R] (Dothidea_insculpta,(Arthopyrenia_salicis,(((((((Massarina_sp_R56,(Lophiostoma_brevi_KT1215,(Lophiostoma_brevi_KT1399,(Massarina_ingoldiana_ATCC200398,(Massarina_ingoldiana_KH100,Massarina_ingoldiana_KH241))))),(Massarina_ingoldiana_KT966,(Massarina_ingoldiana_KH114,(Massarina_ingoldiana_KT1107,Massarina_ingoldiana_KT1096)))),(Massariosphaeria_typhicola_KT797,Massariosphaeria_typhicola_KT667)),((Lophiostoma_heterosporum,(Lophiostoma_macrostomum_KT709,Lophiostoma_macrostomum_KT635)),((Pleomassaria_siparia,Byssothecium_circinans),((((Setomelanomma_holmii,Phaeosphaeria_avenaria),(Didymella_exigua,Didymella_cucurbitacearum)),(Pleospora_herbarum,Cochliobolus_heterostrophus)),(Massaria_platani,((Massarina_ingoldiana_KT891,(Massarina_ingoldiana_KH155,(Keissleriella_cladophila,Massarina_ingoldiana_KH68))),((Montagnula_opulenta,Cucurbidothis_pityophila),((Saccharicola_bicolor,Neottiosporina_paspali),(Helminthosporium_velutinum,(Massarina_eburnea,Massarina_eburnea_3953)))))))))),(Delitschia_didyma,Zopfia_rhizophila)),(Preussia_terricola,Sporormia_lignicola)),(Neotestudina_rosatii,Ulospora_bilgramii))),(Botryosphaeria_dothidea,Spencermartinsia_viticcola)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6592] END;