#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 13, 2026; 5:26 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hirayama K., Tanaka K., Raja H., Miller A.N., & Shearer C. 2010. A molecular phylogenetic assessment of Massarina ingoldiana sensu lato. Mycologia, 102(3): 729-746. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10172] [ The following blocks are input data for analysis step 5412 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5412; DIMENSIONS NTAX=54; TAXLABELS Arthopyrenia_salicis Bimuria_novaezelandiae Botryosphaeria_dothidea Byssothecium_circinans Cochliobolus_heterostrophus Cucurbitaria_elongata Curreya_pityophila Delitschia_didyma Delitschia_winteri Didymella_cucurbitacearum Didymella_exigua Dothidea_insculpta Herpotrichia_juniperi Lepidosphaeria_nicotiae Leptosphaeria_maculans Letendraea_helminthicola Lophiostoma_brevi_KT1215 Lophiostoma_brevi_KT1399 Lophiostoma_heterosporum Lophiostoma_macrostomum_KT635 Lophiostoma_macrostomum_KT709 Massaria_platani Massarina_eburnea_3953 Massarina_ingoldiana_ATCC200398 Massarina_ingoldiana_KH100 Massarina_ingoldiana_KH114 Massarina_ingoldiana_KH155 Massarina_ingoldiana_KH241 Massarina_ingoldiana_KH68 Massarina_ingoldiana_KT1096 Massarina_ingoldiana_KT1107 Massarina_ingoldiana_KT891 Massarina_ingoldiana_KT966 Massarina_sp_R56_1 Massariosphaeria_typhicola_KT667 Massariosphaeria_typhicola_KT797 Montagnula_opulenta Neotestudina_rosatii Neottiosporina_paspali Ophiosphaerella_herpotricha Phaeodothis_winteri Phaeosphaeria_avenaria Phoma_herbarum Pleomassaria_siparia Pleospora_herbarum Preussia_terricola Setomelanomma_holmii Setosphaeria_monoceras Spencermartinsia_viticola Sporormia_lignicola Trematosphaeria_pertusa Ulospora_bilgramii Verruculina_enalia Zopfia_rhizophila ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4261] TITLE 'Massarina ingoldiana, combined'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5412; DIMENSIONS NCHAR=1963; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arthopyrenia_salicis 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Bimuria_novaezelandiae 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Botryosphaeria_dothidea 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Delitschia_didyma 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Delitschia_winteri GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCCTTGGTGATTCATGATAACTTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGACTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGTACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGGTTCGGTCGGGCCTTTCCTTCTGGAGAACCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATCAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGGC--TCCCTTGGGGGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGTGTTTCGG-CGAGGGCCTGGGTCTAAGTTCCTTGGAACGGGACGTCATAGAGGGTGAGAACCCCGTACGTGGCCCCTGGTCTTCGCC-ATGTGAAACCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTATATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGCCTGCAGTCGTTCATCCGGGCCTCGCGCCCGGTGCACTCGTCTGCAG-GCAGGCCAGCATCGGTTGGGGCGGCCGGACAAAGGCCTTGGGAATGTGGCTCTCTTC--GGGGA--GTGTTATAGCCCAGGGCGC---AATACGGCC-AGCCCCGA-CCGAGGAC-CGCGCTTCG--GCTAGGATGCTGGCATAATGGTCGCAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGA-CCCCCGCAAGGGGCGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTATTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTGCTTAATTGAACGTGGACATTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Didymella_cucurbitacearum GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAACCCCGACTTCGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAACGCCCTTCGGGGCTTCTTGGTGATTCATGATAACTTCACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCTCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGCCTGGCTGGCAGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTTGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGAGAACCTCATGCCCTTCACTGGGTGTGTTGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGG---CGTCTTCGGCGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGCGCTTTGG-CATTGGCAGCGGTCCAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGGTCGCTAGCCTTTACC-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCCTGTAGTTGCTCATCCGGGTTTC-TACCCGGTGCACTCTTCTATAG-GCAGGCCAGCATCAGTTTGGGCGGTTGGATAAAGGTCTCTGTCATGTACCTCCTTTC--GGGGA-GATCTTATAGGGGA-GACG---ACATGCAACC-AGCCTGGA-CTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAACGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCTTTCG---GGGTGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCTTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTGATTGAACGTGGACAGTTGAATGTATCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Didymella_exigua GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAACCCCAACTTCGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAACGCCCTTCGGGGCTTCTTGGTGATTCATGATAACTTCACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCTCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGCCTGGCTGGCAGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTTGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGAGAACCTCATGCCCTTCACTGGGTGTGTTGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGG---CGTCTTTGGCGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGCGCTTTGG-CATTGGCAGCGGTCCAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGGTCGCTAGCCTTTACC-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCCTGTAGTTGCTCATCCAGGTTTT-TACCTGGTGCACTCTTCTATAG-GCAGGCCAGCATCAGTTTGGGCGGTTGGATAAAGGTCTCTGTCATGTACCTCTCTTC--GGGGA-GAACTTATAGGGGA-GACG---ACATGCAACC-AGCCTGGA-CTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCTTTCG---GGGTGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCTTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTGATTGAACGTGGACAGTTGAATGTATCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Dothidea_insculpta 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Herpotrichia_juniperi GATAGTACCTTACCACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGAAGGGGTGTGTTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTTTGGTGATTCATGATAACCTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATATAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGTCTGGCTAGCGGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTTGTCCGGCTGGACCTTTCCTTCTGGAGAACCTCATGCCCTTCACTGGGTGTGTTGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGATCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAATAGCTCAAATTT-GAAATCTGG---CCCTTTCAGGGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGCGCTTTGG-TGTCGGCAGCAGCCTAAGTTCCTTGGAACAGGTCATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGGCTGCTTGTCTTCACC-GTGTAAAGCCCCTTCGATGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACGTGCCCGTAGTTGCTCATCTGGGGTTT-TCCCCAGTGCACTCTTCTATAG-GCAGGCCAGCATCAGTTCGGGCGGTTGGAGAAAGACCTGTGTCACGTAGCTCTCTTC--GGGGA--GTGTTATAGGGCA-GGTG---GAATGCAACC-AGCCTGAA-CTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCTCG---GGGCGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTTCTTAATTGAACGTGGACATTTGAATGTATCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Lepidosphaeria_nicotiae GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTTTGGTGATTCATGATAACTTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTCGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGAGATCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTTGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGGC--CCCGTTGGGG-TCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGCGCTTTGG-CGTTGGCCCTGGCCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCGCAGAGGGTGAGAACCCCGTACGTGGCCGGTGGTCTTCGCC-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCCTGTAGTTGCTCATCCGGGCTTC-CGCCCGGTGCACTCTTCTGCGG-GCAGGCCAGCATCAGTCCAGGCGGCCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTGGCTCCCTTC--GGGG--AGTGTTATAGCCCAGGGCGC---AATGCGGCC-AGCTTGGA-CTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGGGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCTCG---GGGCGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTGCC-GAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCATGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTAATTGAACGTGGACATTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Leptosphaeria_maculans 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Letendraea_helminthicola 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Massaria_platani 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Massarina_eburnea_3953 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Massarina_ingoldiana_KT891 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Ophiosphaerella_herpotricha 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Phaeodothis_winteri 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Phaeosphaeria_avenaria 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Phoma_herbarum 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Pleomassaria_siparia 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Pleospora_herbarum 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Preussia_terricola 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Setomelanomma_holmii GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAACCCCAACTTCGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTTCTTGGTGATTCATGATAACTTTACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCTCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGTCTGGCTGGCAGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTTGTCCGGCCGGGCCTT-CCTTCTGGAGAACCTCATGCTCTTCACTGGGCGTGTTGGGGA-CCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAA{AT}{AT}TTGAAATCTGGG--CTCTTTCAGGGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGCGCTTTGG-TGTCGGCAGCGGTCCAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGGTCGCTAGCCTTCGCC-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCCTGTAGTTGCTTATCCGGACTTT-TGTCCGGTGCACTCTTCTGCGG-GCAGGCCAGCATCAGTTTGGGCGGTTGGATAAAGGTCTCTGTCATGTACCTCTCTTC--GGGGA-GGCCTTATAGGGGA-GACGG--ACATGCAACC-AGCCTGGA-CTGAGGTC-CGCGCAT{AC}T--GCTAGGATGCTGGCGTAAGGGCTGT{AG}AGCGG{CG}CCGTCTTGAAACACGGACC{AT}{AT}{GT}{CG}{AT}GT{AC}{GT}TAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCAGACGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCTTT----GGGTGCACCATCCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATGGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCTTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTC{ACG}{AGT}{ACG}TCCGAAGTTTCCCTCAGGAT-GCAGTA-CGTATTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTGATTGAACGTGGACACTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Setosphaeria_monoceras GATAATACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTTCGGAAGGGATGTGTTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTTTTTGGTGATTCATGATAACTTTACGGATCGCATA-GCCTTGCGCTGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCTCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGCCTGGCTGGCGGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTCGTCCGGCCGGGCCTT-CCTTCTGAAGAACCTCATGCCCTTCACTGGGCGTGTTGGGGAATCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAAAATAGGGCGTGCGTTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGAGACGCCGCAATGATTAACAGGAACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTACTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGG---CTCTTTCAGAGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGCGCTTTGG-CTTTGGCAGCGGTCCAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGGTCGCTAGCTATTGCC-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCTTGCAGTTGCTCATCCGGGCTTT-TGCCCGGTGCACTCTTCTGCAG-GCAGGCCAGCATCAGTTTGGGCGGTGGGATAAAGGTCTCTGTCATGTACCTCTCTTC--GGGGA-GGCCTTATAGGGGA-GGCG---ACATACCACC-AGCCTAGA-CTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGCAA---GGGTGCACCATC-GACCGATCCTGAAGTTTACGGAAGGATTTGAGTAAGAGCATGGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCTTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTATTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCATGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGCCCTTTGTTACTTAATTGAACGCGGGCATTTGAATGAAACGTTATTAGTGGGCCATTTTTGGT Spencermartinsia_viticola GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCCTTGGTGATTCATGATAACTTAACGAATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTATCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATACCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGGGATCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAATAGCTCAAATTT-GAAAGCTGG---CCCCTTTGGGGTCCGCGTTGTAATTTGTAGAGGATGATTCGG-CGAGGGCTCCCGTCTAAGTCCCCTGGAACGGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGATGGGTTGCCTTAGCC-ATGTGAATCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGTCCGCAGTTGCTCAGCCGGTCTCC-TGACCGGCGTACTCTTCTGCGG-CCAGGCCAGCATCAGTTCGGGCGGTCGGATAAAGACCCTAGGAATGTAGCTCCTCTC----GGGGAGTGTTATAGCCTGGGGTGG---AATGCGGCC-AGCCTGGA-CTGAGGAT-CTCGCTTCG--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATACGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCTCAC---GGGTGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGAATTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTAGTTGAACGTGGACACTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Sporormia_lignicola GATAGTACCTTACTACATGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCAACTTCGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGAGAGCCCCATGCCCTTCACTGGGCGTGCGGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGG---CTCTTTCAGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGCTTTGG-AGTTGACTGTGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCGCAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGGCCGCCAGTCTTCTCC-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCCTGTAGTTGCTCATCCGGGCTTT-TGCCCGGTGCACTCTTCTATAG-GCAGGCCAGCATCAGTCGCGGCGGTTGGATAAATGTCTGCACAATGTACCTCTCTTC--GGGGA-GGACTTATAGGGCA-GGCG---GCATACAACC-AGCTGCGA-TTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCTCG---GGGTGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTAATTGAACGTGGACATTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Trematosphaeria_pertusa GATAGTACCTTACCACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGAAGGGGTGTGTTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTTTGGTGATTCATGATAACCTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATATAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAACTTGGGTCTGGCTAGCGGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTTGTCCGGCTGGACCTTTCCTTCTGGAGAACCTCATGCCCTTCACTGGGTGTGTTGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGATCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAATAGCTCAAATTT-GAAATCTGG---CTCTTTCAGGGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGCGCTTTGG-TGTCGGCAGCGGCCTAAGTTCCTTGGAACAGGTCATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGGCTGCTTGTCTTCACC-GTGTAAAGCCCCTTCGATGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACGTGCCCGTAGTTGCTCATCTGGGGATT-TCCCCAGTGCACTCTTCTATGG-GCAGGCCAGCATCAGTTCGGGCGGTTGGAGAAAGACCTGTGTCACGTAGCTCTCTTC--GGGGA--GTGTTATAGGGCA-GGTG---GAATGCAACC-AGCCTGGA-CTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCTCG---GGGTGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTTCTTAATTGAACGTGGACATTTGAATGTATCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Ulospora_bilgramii GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTTTGGTGATTCATGATAACTTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGAGAGCCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGGC--TCCCTTGGGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGCTTTGG-CGTTGGCCCCGGCCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAACCCCGTACGTGGCCGGCGGTCTTCGCC-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCCTGTAGTTGCTCATCCGGGCTCT-TGCCCGGTGCACTCTTCTGCGG-GCAGGCCAGCATCAGTCCAGGCGGTCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTGGCTCTCTTC--GGGG--AGTGTTATAGCCCAGGGTGC---AATGCGGCC-AGCTTGGA-CTGAGGTC-CGCGCATCT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAACGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCTCG---GGGCGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTGCC-GAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCATGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTAATTGAACGTGGACATTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Verruculina_enalia GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTTTGGTGATTCATGATAACTTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGAGAGCCTCATGCCCTTTACTGGGTGTGTAGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGGC--CCTCT---GGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGCGCTTTGG-TGTTGGCCCCGGCCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAACCCCGTACGTGGCCGGCGGCCTTCGCT-GTGTAAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATACTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGCCTGTAGTTGCTCACCTGGGCTCT-TGCCCAGCGCACTCTTCTGCGG-GCAGGCCAGCATCAGTTCAAGCGGTCGGACAAAAGCCCTAGGAATGTGGCTCCTTCC--GGGG--AGTGTTATAGCCTAGGGCAT---AATGCGGCC-AGCTTGGA-CTGAGGTC-CGCGCATTT--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAGCCCGAGCGCGAAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCCCG---GGGCGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTGCC-GAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCATGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTGATTGAACGTGGACATTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT Zopfia_rhizophila GATAGTACCTTACTACTTGGA-TAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTTGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCTTTGGTGATTCATGATAACTTAACGGATCGCATG-GCCTTGCGCCGGCGACGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGACTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCC-GACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCT?GCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGAGAGCCGCATGCCCTTTACTGGGCGTGTTGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACGTTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCGCAACAGCTCAAATTT-GAAATCTGGCCCTCCTTTGGGGGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGAGCTTCGG-CGTCGGCGTCGGCCTAAGTTCTTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAACCCCGTACGTGGCCGTCAGCCTTTGCC-GTGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATAGCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAAAAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAGCCAGACTTGTCTGCGGTTGTTCATCCGGGCC-CACGCCCGGTGCACTCGTCCGCAG-GCAGGCCAGCATCAGTTCGGGCGGTCGGATAAAGGCCCCGGGAATGTAGCTCTCTTC--GGGGA--GTGTTATAGCCCGGGGTGC---AATGCGGCC-AGCCTGGA-CTGAGGTC-CGCGCTTCG--GCTAGGATGCTGGCGTAATGGCCGCAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCT-AACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCGGACGCGCAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCCTCG-GGGGTGCACCATC-GACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACTATCTAGTAGCTGGTTCCTG-CCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTATTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTT-GTTACTTTGTTGAACGTGGACATTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'Massarina ingoldiana, combined') = N: 1-1963; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'Massarina ingoldiana, combined') = N: 1-1963; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5412 ] BEGIN TREES; TITLE Tb10820; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5412; TREE combined = [&R] (Dothidea_insculpta,((((((((Leptosphaeria_maculans,(Cucurbitaria_elongata,(Setomelanomma_holmii,(Ophiosphaerella_herpotricha,Phaeosphaeria_avenaria)))),(Didymella_cucurbitacearum,(Didymella_exigua,Phoma_herbarum))),(Pleospora_herbarum,(Cochliobolus_heterostrophus,Setosphaeria_monoceras))),((Preussia_terricola,Sporormia_lignicola),(Lophiostoma_heterosporum,(Lophiostoma_macrostomum_KT635,Lophiostoma_macrostomum_KT709)))),(Arthopyrenia_salicis,(Byssothecium_circinans,((Massaria_platani,(Massarina_ingoldiana_KH68,(Massarina_ingoldiana_KT891,Massarina_ingoldiana_KH155))),((Massarina_eburnea_3953,Neottiosporina_paspali),(Montagnula_opulenta,((Bimuria_novaezelandiae,Phaeodothis_winteri),(Curreya_pityophila,Letendraea_helminthicola)))))))),(Pleomassaria_siparia,(Herpotrichia_juniperi,Trematosphaeria_pertusa))),((Verruculina_enalia,(Lepidosphaeria_nicotiae,(Neotestudina_rosatii,Ulospora_bilgramii))),((Massariosphaeria_typhicola_KT667,Massariosphaeria_typhicola_KT797),((Massarina_sp_R56_1,(Lophiostoma_brevi_KT1215,Lophiostoma_brevi_KT1399)),((Massarina_ingoldiana_KH241,(Massarina_ingoldiana_ATCC200398,Massarina_ingoldiana_KH100)),(Massarina_ingoldiana_KT966,(Massarina_ingoldiana_KH114,(Massarina_ingoldiana_KT1096,Massarina_ingoldiana_KT1107)))))))),(Zopfia_rhizophila,(Delitschia_didyma,Delitschia_winteri))),(Botryosphaeria_dothidea,Spencermartinsia_viticola)); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6291] END;