#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 01, 2026; 11:03 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Chemisquy M., Giussani L., Scataglini M., Kellogg E., & Morrone O. 2010. Phylogenetic studies favour the unification of Pennisetum, Cenchrus and Odontelytrum (Poaceae): a nuclear, plastid and morphological combined analysis, and nomenclatural. Annals of Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10252] [ The following blocks are input data for analysis step 5593 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5593; DIMENSIONS NTAX=53; TAXLABELS Cenchrus_agrimonioides Cenchrus_brownii Cenchrus_calyculatus Cenchrus_ciliaris Cenchrus_echinatus Cenchrus_incertus Cenchrus_myosuroides Cenchrus_pilosus Cenchrus_setigerus Ixophorus_unisetus Odontelytrum_abyssinicum Paspalidium_geminatum Pennisetum_alopecuroides Pennisetum_basedowii Pennisetum_chilense Pennisetum_clandestinum Pennisetum_flaccidum Pennisetum_foermeranum Pennisetum_frutescens Pennisetum_glaucocladum Pennisetum_glaucum1 Pennisetum_glaucum2 Pennisetum_hordeoides Pennisetum_lanatum Pennisetum_latifolium Pennisetum_macrourum Pennisetum_massaicum Pennisetum_mezianum Pennisetum_montanum Pennisetum_natalense Pennisetum_nervosum Pennisetum_orientale Pennisetum_pedicellatum Pennisetum_polystachion_subsp._atrichum Pennisetum_polystachion_subsp._polystachion Pennisetum_purpureum Pennisetum_ramosum Pennisetum_schweinfurthii Pennisetum_setaceum Pennisetum_sieberianum Pennisetum_sphacelatum Pennisetum_squamulatum Pennisetum_thunbergii Pennisetum_trachyphyllum Pennisetum_tristachyum Pennisetum_unisetum Pennisetum_villosum Pennisetum_violaceum Rupichloa_acuminata Setaria_palmifolia Setaria_parviflora Setaria_sphacelata Stenotaphrum_secundatum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4892] TITLE 'ndhF trnL-F'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5593; DIMENSIONS NCHAR=2998; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Setaria_palmifolia ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAA?GCTTTTGTAACTAATCGTGTAAGGGATTT?GGTCTGTTATTACGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAAAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCTTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTAATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC??????AGAGAGATATTAAAAAAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACAGCATTTTATATGTTTCGGATAT?TTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAGAATTACAGCAGTACTAAAAAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGA?TCAATAGAGATTTGATTTTATCAGCAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCAAAATTCCTGGTAATACAAGAAAAAAGATAGGATCCTTTAGTACTTCCTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGTTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTTGAGGAAAGTTCGAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTTT??????ACAAGGGAATCCAAAAAAAAACTTTATGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACAAATTTTTTCGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTATCAATGGAGTA???????????????????????????????CTAAGTGATAACT?TCCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATGAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCTTTTTTG?AAAAAAC????AAGTGGTTCTCAAACTAGAACCCAAAGGAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATCGAAGTAATTACGTTGTGTTGGTAGTGGAACTCCCTCGAAATACTAGAAAGAAGGG??CT?????TTATACATTTAATACACACG?TATAGATACTGACATAGCAAACGATTAATCACAGAACCCCTATCATA?????ATATAGGTTCTTTATTTTATA??TTTTTTTTTTTAGAATGAAATTAGGAATGATTATGAAATAGAAAATTCTGAATTTTTTT?AGAATTATTGTGAATCCATTCCAATCGAATATTGAGTAATCAAATCCTTCAATTCATTGTTTTGAGATC?????A?????AAAGTGGATTAATCGAACGAGGATAAAGAGAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAACAATGAAATTTCTAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTATAAGTCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCACCCAAACCCTCTTTTATTCCCT????????????????AACCATAGTAGTTATCC??????TTTTTTTTTC?TTTTATCAATGGGTTTAAGATTCATTAGCTTTCTCATTCTACTCTTTCTTTCACAAAGGAGTGCGACGAGAACTCAATGAATCTTATGCTATTCATTAAATAGACGATTTCTTTTTTATTTGATAGGACTA????????????CCCCCC?CCA?TTCCAAATTTGGAATGGAATAC?TTTATTTATTTTTTAGTCCCTTTAATTGACATAGATGCAAATACTCTA?CTAGGATGATGCACAAGAAA? Setaria_parviflora ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGCATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGGAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTACATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACCGGTCGGAATGTGTTCCTATCTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCA???????????????????????????????????TAATCG?TTAGGGGATTTAGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAAAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCTTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACCTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCAGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTACCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTAATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTATAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC??????CGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCAAAAGCTTTATTGTTCTTACGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATTTGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGAGATTTGATTTTATCAACAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCAAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCCTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGTTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCCAAGTGGCTAACTCCTTCACTAAACTTTTTTGAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCGTATGAATTTCTCATTAAGGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATTTTCTATGGATCTACCTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTGT??????AAAAGGGAATCCAAAAAAAAACTTTTTGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGGGTGTTATAGATGGAATTATCAATGGA?T????????????????????????????????CTAAGTGATAACT?TCCATATTCAGAGAAACCCTGGAATGAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCC?TTTTTTG?AAAAAAC????AAGTGGTTCTCAAACTAGAACCCAAAGGAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATCGAAGTAATTACGTTGTGTTGGTAGTGGAACTCCCTCAAAATACTATAAAGAAGGG??CT?????TTATACATTTAATACACACG?TATAGATACTGACATAGCAAACGATTAATCACAGAACCCCTATCATA?????ATATAGGTTCTTTATTTTCTA????TTTTT?TTTAGAATGAAATTAGGAATGATTATGAAATAGAAAATTCTGAATTTTTTT?AGAATTATTGTGAATCCATTCCAATCGAATATTGAGTAATCAAATCCTTCAATTCATTGTTTTGAGATC?????A?????AAAGTGGATTAATCGAACGAGGATAAAGAGAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAACAATGAAATTTCTAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTATAAGTCGTGAGGGTTCAAGTCCCTTTATCCCCACCCAAACCCTCTTTTATTCCCT????????????????AACCATAGTAGTTATCC???????TTTTTTTTC?TTTTATCAATGGGTTTAAGATTCATTAGCTTTCTCATTCTACTCTTTCTTTCACAAAGGAGTGCGACGAGAACTCAATGAATCTTATGCTATTCATTAAATAGACGATTTCTTTTTTATTTGATAGGACTA?????????????CCCCC?CCA?TGCCAAATTTGGAATGGAATAC?TTTATCGATTTTTTAGTCCCTTTAATTGACATAGATGCAAATACTCTA?CTAGGATGATGCACAAGAAA? Setaria_sphacelata ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTCGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGCTTTCGTAACTAATCGTGTAGGAGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTCTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCTTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCCGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTTATATCCCTACCCTTAATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCTTGCTCAGAGAGATATT???????????????????????????TCTCTATTGGGTTATAAAATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTTTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCCTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGC?TTTTATTTGTTTCGGAAATATTTACTTACTTTTGAAGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGAGATTTGATTTTATCAACAATGAAGGATGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCCAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCCTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACAATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGTTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTTGAGGAAAGTTCTAATTCTTCTATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCCACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTGT??????AAAAGGGAATCAAAAAAAAAACTTTTTGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTATCAATGGAGTA?GATTGTATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTGCTAAGTGATAACT?TCCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATGAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCTTTTTTG?AAAAAAC????AAGTGGTTCTCAAACTAGAACCCAAAGGAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATCGAAGTAATTACGTTGTGTTGGTAGTGGAACTCCCTCGAAATACTAGAAAGAAGGG??CT?????TTATACATTTAATACACACG?TATAGATACTGACATAGCAAACGATTAATCACAGAACCCCTATCATA?????ATATAGGTTCTTTATTTTATA????TT????????????????????????????????????????????????TTTTTTT?AGAATTATTGTGAATCCATTCCAATCGAATATTGAGTAATCAAATCCTTCAATTTATTGTTTTGAGATC?????A?????AAAGTGGATTAATCGAACGAGGATAAAGAGAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAACAATGAAATTTCTAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTATAAGTCGTGAGGGTTCGAGTCCCTCTATCCCCACCCAAACC?TCTTTTATTCCCT????????????????AACCATAGTAGTTATCC????????TTTTTTTC?TTTTATCAATGGGTTTAAGATTCATTAGCTTTCTCATTCTACTCTTTCTTTCACAAAGGAGTGCGACGAGAACTCAATGAATCTTATGCTATTCATTAAATAGACGATTTCTTTTTTATTTGATAGGATTA????????CCCCCCCCCC?CCA?TTCCAAATTTGGAATGGAATAC?TTTATTAATTTTTTAGTCCCTTTAATTGAGATAGATGCAAATACTCTA?ATAGGATGATGCACAAGAAA? Stenotaphrum_secundatum ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCAACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCGCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGGTTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTATAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGGGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC??????AGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCTAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTACGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAAAGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCCAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCCTTTGGGGCTAAAAAAACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAGCTCCTTCAATAAACTTTTTCGAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTGT??????AAAAGGGAATCAAAAAAAAAACTTTTTGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTACCAATGGAGTG??????????????????????????????GCTAAGTGATAACT?TCCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATGAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCTTTTTTG?AAAAAAC????AAGTGGTTTTCAAACTAGAACCCAAAGGAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATCGAAGTAATTACGTTGTGTTGGTAGTGGAACTCCCTCGAAATACTAGAAAGAAGGG??CT?????TTATACATTTAATACACACG?TATAGATACTGACATAGCAAACGATTAATCACAGAACCCCTATCATA?????ATATAGGTTCTTTATTTTATA??TTTTTTTTTT?AGAATGAAATTAGGAATGATTAGGAAATAGAAAATTCTGAATTTTTTT?AGAATTATTGTGAATCCATTCCAATCGAATATTGAGTAATCAAATCCTTCAATTCATTGTTTTGAGATC?????A?????AAAGTGGATTAATCGAACGAGGATAAAGAGAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACTGACAACAATGAAATTTCTATTATAAGGAGAATCCGTCGACTTTATAAGTCTTGAGGGTTCAAGTCCCTTGATCCCCACCCCAACCCTTTTTTATTCCCC????????????????AAACAATGTAGTTATCCTCTA??????TTTTTCTTTTAATCAATGGGTTTAAGATTCATTAGCTTTCTCATTCTACTCTTTCTTTCACAAAGGAGTGCGACGAGAACTCAATGAATCTTATGCTATTCCTTAAATAGACGATTTCTTTTTTATTTGATAGGACTA????????????CCCCCC?CCATTTC?AAATTTGGAATGGAATAC?TTTATTGATTTTTTAGTCCCTTTAATTGACATAGATGCAAATACTCTA?CTAGGATGATGCACAAGAAA? ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'ndhF trnL-F') = N: 1-2998; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'ndhF trnL-F') = N: 1-2998; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5593 ] BEGIN TREES; TITLE Tb11252; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5593; TREE Fig._1b = [&R] (Rupichloa_acuminata,(Ixophorus_unisetus,Stenotaphrum_secundatum,(Paspalidium_geminatum,((Setaria_sphacelata,(Setaria_palmifolia,Setaria_parviflora)),(Pennisetum_lanatum,(Pennisetum_trachyphyllum,(Pennisetum_clandestinum,Pennisetum_alopecuroides,Pennisetum_frutescens,Pennisetum_macrourum,Pennisetum_flaccidum,Pennisetum_glaucocladum,Pennisetum_orientale,Pennisetum_unisetum,Pennisetum_thunbergii,Pennisetum_natalense,Pennisetum_sphacelatum,(Pennisetum_villosum,Odontelytrum_abyssinicum),((Pennisetum_purpureum,Pennisetum_massaicum,Cenchrus_agrimonioides,((Cenchrus_echinatus,(Cenchrus_incertus,Cenchrus_myosuroides)),(Cenchrus_pilosus,Cenchrus_brownii)),(Cenchrus_ciliaris,Cenchrus_setigerus),(Pennisetum_setaceum,Cenchrus_calyculatus)),(Pennisetum_nervosum,Pennisetum_basedowii)),(Pennisetum_foermeranum,(Pennisetum_schweinfurthii,(Pennisetum_glaucum1,Pennisetum_sieberianum,Pennisetum_violaceum,Pennisetum_squamulatum))),(Pennisetum_latifolium,Pennisetum_montanum,Pennisetum_tristachyum,Pennisetum_chilense),(Pennisetum_mezianum,(Pennisetum_ramosum,(Pennisetum_pedicellatum,(Pennisetum_polystachion_subsp._polystachion,Pennisetum_hordeoides,Pennisetum_polystachion_subsp._atrichum))))))))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6856] END;