#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 18, 2025; 7:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Santos J., Correia V., & Phillips A. 2010. Primers for mating-type diagnosis in Diaporthe and Phomopsis: their use in teleomorph induction in vitro and biological species definition. Fungal Biology, 114(2-3): 255-270. 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Phomopsis_viticola_AY745083 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Phomopsis_viticola_CBS114016 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Valsa_ambiens_DQ862041 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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5628 ] BEGIN TREES; TITLE Tb11287; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5628; TREE Fig._5 = [&R] (Leucostoma_niveum_DQ862035,Valsa_ambiens_DQ862041,(((Diaporthe_crotalariae_CBS_162_33,(Diaporthe_phaseolorum_var_meridionalis_AF398893,(Diaporthe_aspalathi_DQ286249,Diaporthe_aspalathi_DQ286250))),((Phomopsis_sp_Ph_C169_1,(Diaporthe_cynaroidis_EU552093,(Diaporthe_viticola_CBS_113201,Diaporthe_viticola_Di_C006_2,Diaporthe_viticola_111))),((Phomopsis_phoenicicola_CBS_161_64,Phomopsis_sp_EU259179),((Diaporthe_perjuncta_CBS_109745,(((Phomopsis_amygdali_11A,Phomopsis_amygdali_16A),(Diaporthe_G_type_930811_17,Diaporthe_G_type_930811_14)),((Phomopsis_viticola_AY745081,Phomopsis_viticola_115,(Phomopsis_viticola_AY745083,Phomopsis_viticola_CBS114016)),(Phomopsis_viticola_AY745082,Phomopsis_viticola_114)))),((Diaporthe_hickoriae_CBS_145_26,(Phomopsis_sp_Ph_C173_1,(Diaporthe_neotheicola_Di_C004_1,Phomopsis_theicola_DQ286260,Diaporthe_neotheicola_CBS_123209,Diaporthe_neotheicola_Ph_C196_1,Diaporthe_neotheicola_CBS_123208,Diaporthe_neotheicola_Ph_C195_1,Diaporthe_neotheicola_Di_C004_6,Diaporthe_neotheicola_Ph_C190_1,Diaporthe_neotheicola_Ph_C182_1))),((Phomopsis_sp_439B4,Phomopsis_sp_152,Phomopsis_sp_AY745054,(Diaporthe_W_type_P_Pt_16,Diaporthe_W_type_P_Pt_19),(Phomopsis_cotoneastri_Di_C005_7,Phomopsis_sp_151,Diaporthe_sp_Di_C005_8,Phomopsis_cotoneastri_Di_C005_6,Phomopsis_cotoneastri_Di_C005_9,Phomopsis_cotoneastri_Di_C005_5,Phomopsis_cotoneastri_Di_C005_4,Diaporthe_sp_Di_C005_3,Diaporthe_sp_Di_C005_2,Diaporthe_sp_Di_C005_1,Phomopsis_cotoneastri_Di_C005_10,Phomopsis_cotoneastri_CBS_439_82)),(Diaporthe_vaccinii_CBS_160_32,Diaporthe_alleghaniensis_CBS_495_72))))))),((((Phomopsis_sp_Ph_C188_1,(Phomopsis_sp_Ph_C194_1,Phomopsis_sp_9_DQ286259)),((Phomopsis_cuppatea_AY339354,Phomopsis_cuppatea_DQ286258),(Diaporthe_stewartii_CBS_193_36,(Phomopsis_sp_FJ389009,(Diaporthe_angelicae_Ph_C121_1,Diaporthe_angelicae_CBS_111592,Diaporthe_angelicae_Ph_C094_2,Diaporthe_angelicae_Ph_C068_2,Phomopsis_dauci_CBS_315_49,Diaporthe_angelicae_Ph_C032_1))),(Diaporthe_lusitanicae_Ph_C170_1,(Diaporthe_lusitanicae_CBS_123212,Diaporthe_lusitanicae_Di_C001_7,Diaporthe_lusitanicae_CBS_123213)))),((Diaporthe_sp_Di_C007,Phomopsis_sp_Ph_C189_1),(Phomopsis_sp_Ph_C180_1,Phomopsis_sp_Ph_C174_1))),((Diaporthe_melonis_CBS_507_78,Diaporthe_helianthi_CBS_592_81),(Phomopsis_sp_Ph_C192_1,(Phomopsis_sp_Ph_AC002,Phomopsis_sp_Ph_AC003)))),((Diaporthe_ambigua_CBS_123210,(Diaporthe_ambigua_CBS_114015,Diaporthe_ambigua_DQ286242,Diaporthe_ambigua_CBS_123211)),(Diaporthe_strumella_var_longispora_CBS_194_36,Phomopsis_sclerotioides_CBS_296_67)))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr6894] END;