#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 10, 2024; 13:24 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Cialdella A., Salariato D., Aagesen L., Giussani L., Zuloaga F., & Morrone O. 2010. Phylogeny of New World Stipeae (Poaceae): an evaluation of the monophyly of Aciachne and Amelichloa. Cladistics, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10359] [ The following blocks are input data for analysis step 5812 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5812; DIMENSIONS NTAX=39; TAXLABELS Achnatherum_bromoides Achnatherum_chingii Achnatherum_diegoense Achnatherum_eminens Achnatherum_inebrians Achnatherum_multinode Achnatherum_psilantherum Aciachne_acicularis Aciachne_flagellifera Aciachne_pulvinata Amelichloa_ambigua Amelichloa_brachychaeta Amelichloa_brevipes Amelichloa_caudata Amelichloa_clandestina Anatherostipa_brevis Austrostipa_elegantissima Austrostipa_nodosa Hesperostipa_comata Hesperostipa_neomexicana Jarava_leptostachya Jarava_media Jarava_plumosula Nassella_arcuata Nassella_melanosperma Nassella_novari Nassella_pampagrandensis Ortachne_erectifolia_a Ortachne_erectifolia_b Oryzopsis_asperifolia Pappostipa_vaginata_a Pappostipa_vaginata_b Piptatherum_miliaceum Piptochaetium_lasianthum Piptochaetium_medium Piptochaetium_montevidense Piptochaetium_napostaense Poa_holciformis Ptilagrostis_porteri ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Piptochaetium_medium GTCTCGTTAGCTTTTTCTTTTTTAAAG?AAAAAAATTTAGTAATTAT?????AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA?????ACTTCTATCATAAATGAGTAGATCTATCATA?TAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA????GAA???????TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT???????AAAGA?CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA?AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCG?CATCCTTA?TTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA??TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATATAGAATATAGATAAATAGACACA??CATCTAGATATATTCTAGATCTTCTTTCTTTACTA????????TATATTTATCT???????ATTTTAACAAATTCAATATTAAATATTAAAATAAAAAAAACCTA??????????????????????ACTTTTTCTATTATCCATTA?TGTGTATCTATCCGT????????????????????????????????????AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAAC?ATAGAGGAAGAATGAA?GGGAAAATCCT?TCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATC? 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Piptochaetium_napostaense GTCTCGTTAGCTTTTTCTTTTTTAAAG?AAAAAAATTTAGTAATTAT?????AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAA?????ACTTCTATTATAAATGAGTAGATCTATCATA?TAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATAGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA????GAA???????TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT???????AAAGA?CTGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA?AATTTTTTGAAAGCTCCATTGCGGGATTTAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTA?TTGAATTAGAATACTTTACCGCGATTCAATAAGAGTAAAAATAAGGAGA??TTTTTTTAAGAAAGATTACATTATCTATAAATCTAGAATATAGATAAATAGACACA??CATCTAGATATATTCTAGATTTTCTTTCTTTACTA????????TATATTTATCT???????ATTTTAACAAATTCAATATTAAATAT?????TAAAAAAAACCTA??????????????????????ACTTTTTCTATTATCTATTAATGTGTATCTATCCGT????????????????????????????????????AATATTTTTGAATATTATGAAATTAGAGAAATTTGCACGCTTTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGAAGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCCAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAAC?ATAGAGGAAGAATGAA?GGGAAAATCCT?TCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTTGAACCCGCTTGGATC? Poa_holciformis GACTCGTTATTTTTTTTT??????AAG?AAAAAAACTTAGTAATTATAGAAAAGAAAATTAACTACTAACCAACTTATTGCTTCGTATTGTCGATATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAATAAATACCTCTATTATAAATGAATAGATGTATCATA?TAGTTGTAGCAACTGC???TTTTTCTATAAAAAAGAAATGAGATTCTAGGTTGTGAAGCAAAAATAAAGGGATGTAGATAAAGGGAGGGATGATAGAAAGAAGGAAGAGGAATTAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTGCATCATAAAAAACAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAACTAATAGAGAATTAGAAATCGTAACTTGAAAAAAGAACTCTAAATTTAAAGCAATAATAAAGAATAAAGAGCCGACCGGATTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGATCTTTTTTTTGAAGCTCCATTGTGGAATTAAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACGGAACCTATGATTTAATATTAACAAATAAGACAGGAAAGAGTAAATATTCGCCCGCGAAATCCTTA?TTGAATTAGAATACTTTACCATTATTCAATAAGAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAAAAAAAACCTA??????????????????????ACTTTTTATATTATCTATTAATGTGTATCTATCCCT????????????????????????????????????AATATTTTTGAATATTATGGAATTAGAGAAATTTGCACGCTCTCTCATTTCATTCGCGAGGAGCTGGATGAGACGAAACTCTCATGTCCAGTTTTGCAGTAGAGATGGAACTAAGAAAGAACCATCGACTATAACCCGAAAAGAACCAGATTTCGCAAACAAC?ATCGAGGAAGAATGAA?AGGAAAATCCT?GCCGAGGCAATCGTATTTGTTTTGGTAGATATGCTCTTCAAGCACTGGAACCTGCTTGGATC? Ptilagrostis_porteri GTCTCGTTAGTTTTTTCTTTTTTAAAG?AAAAAAACTTAGTAATTAT?????AGAAAATTAACTAATAACCAACCTATTGCTTCGTATTGTCGAGATCCTAACTAAGAAACAGTCACTATATGAAAAAATACTTCTATCATAAATGAGTAGATCTATCATA?TAGTTGTAGCAACTGCAATTTTTTCTCTAAAAAAGAAATGGGATTCTAGGTTGTGAAGGAAAACTAAAGGGATGTGGATAAAGGGAGGGATGATAGAAA????GAAGAAGAA?TAAGTAAGATATAGGATTCCAATATGTATGGTCTATGAATTACATCATAAAAGGCAATGTGATAAAGCATCAATATAATAAAAATAACAGAGAATTCGAAATCGTAACTTGAAACAAGAACTACAAATTTAAAGCAATAAT???????AAAGAGCCGCTCGGGTTAATAAAACTGAGAAAATTAACTCGGAAAGA?AATTTTTTGGAAGCTCCATTGCGGGATTCAGACCTAACCATTCAAGGAGAAGCAGTGGGAACGACAGAACCTATGACTCCATA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 5812 ] BEGIN TREES; TITLE rpl16_trees; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5812; TREE Fig._2 = [&R] (Poa_holciformis,(Oryzopsis_asperifolia,((Hesperostipa_comata,((Ptilagrostis_porteri,(Achnatherum_psilantherum,(((((Jarava_leptostachya,(Jarava_media,Jarava_plumosula)),(Achnatherum_multinode,Achnatherum_eminens)),(Nassella_arcuata,Nassella_novari)),((Amelichloa_brachychaeta,(Amelichloa_clandestina,(Nassella_pampagrandensis,Nassella_melanosperma))),(Amelichloa_caudata,Amelichloa_ambigua))),(((Achnatherum_inebrians,Achnatherum_bromoides),(Piptatherum_miliaceum,Achnatherum_diegoense)),(Austrostipa_elegantissima,Austrostipa_nodosa))))),(((Aciachne_acicularis,((Anatherostipa_brevis,Aciachne_pulvinata),(Ortachne_erectifolia_b,Ortachne_erectifolia_a))),(Piptochaetium_medium,(Piptochaetium_lasianthum,(Piptochaetium_montevidense,Piptochaetium_napostaense)))),(Aciachne_flagellifera,(Amelichloa_brevipes,(Pappostipa_vaginata_a,Pappostipa_vaginata_b)))))),(Achnatherum_chingii,Hesperostipa_neomexicana)))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr7299] END;