#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 21, 2024; 12:20 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Inderbitzin P., Bostock R.M., Trouillas F., & Michailides T.J. 2010. A six-locus phylogeny reveals high levels of species diversity in Botryosphaeriaceae from California almond. Mycologia, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10398] [ The following blocks are input data for analysis step 5868 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep5868; DIMENSIONS NTAX=132; TAXLABELS Botryosphaeria_dothidea_PD107 Botryosphaeria_dothidea_PD122 Botryosphaeria_dothidea_PD146 Botryosphaeria_dothidea_PD255 Botryosphaeria_dothidea_PD27 Botryosphaeria_dothidea_PD296 Botryosphaeria_dothidea_PD313 Botryosphaeria_dothidea_PD314 Botryosphaeria_dothidea_PD315 Botryosphaeria_dothidea_PD33 Botryosphaeria_dothidea_PD4 Botryosphaeria_dothidea_PD58 Botryosphaeria_dothidea_PD68 Botryosphaeria_dothidea_PD71 Dichomera_eucalypti_PD290 Dichomera_eucalypti_PD293 Dichomera_eucalypti_PD294 Dichomera_versiformis_PD295 Diplodia_mutila_PD46 Diplodia_mutila_PD61 Diplodia_mutila_PD73 Diplodia_mutila_PD75 Diplodia_seriata_PD13 Diplodia_seriata_PD272 Diplodia_seriata_PD34 Diplodia_seriata_PD47 Diplodia_seriata_PD50 Dothiorella_iberica_PD257 Dothiorella_sarmentorum_PD280 Dothiorella_sarmentorum_PD78 Dothiorella_sarmentorum_PD79 Lasiodiplodia_theobromae_PD161 Lasiodiplodia_theobromae_PD20 Lasiodiplodia_theobromae_PD270 Macrophomina_phaseolina_PD112 Nattrassia_mangiferae_PD103 Nattrassia_mangiferae_PD104 Nattrassia_mangiferae_PD105 Neofusicoccum_andinum_PD252 Neofusicoccum_arbuti_PD244 Neofusicoccum_arbuti_PD245 Neofusicoccum_arbuti_PD281 Neofusicoccum_arbuti_PD282 Neofusicoccum_arbuti_PD283 Neofusicoccum_arbuti_PD284 Neofusicoccum_australe_PD253 Neofusicoccum_australe_PD298 Neofusicoccum_luteum_PD285 Neofusicoccum_mediterraneum_PD1 Neofusicoccum_mediterraneum_PD108 Neofusicoccum_mediterraneum_PD115 Neofusicoccum_mediterraneum_PD120 Neofusicoccum_mediterraneum_PD123 Neofusicoccum_mediterraneum_PD125 Neofusicoccum_mediterraneum_PD127 Neofusicoccum_mediterraneum_PD129 Neofusicoccum_mediterraneum_PD132 Neofusicoccum_mediterraneum_PD138 Neofusicoccum_mediterraneum_PD139 Neofusicoccum_mediterraneum_PD14 Neofusicoccum_mediterraneum_PD141 Neofusicoccum_mediterraneum_PD143 Neofusicoccum_mediterraneum_PD144 Neofusicoccum_mediterraneum_PD145 Neofusicoccum_mediterraneum_PD147 Neofusicoccum_mediterraneum_PD155 Neofusicoccum_mediterraneum_PD16 Neofusicoccum_mediterraneum_PD2 Neofusicoccum_mediterraneum_PD24 Neofusicoccum_mediterraneum_PD25 Neofusicoccum_mediterraneum_PD271 Neofusicoccum_mediterraneum_PD273 Neofusicoccum_mediterraneum_PD274 Neofusicoccum_mediterraneum_PD275 Neofusicoccum_mediterraneum_PD276 Neofusicoccum_mediterraneum_PD278 Neofusicoccum_mediterraneum_PD279 Neofusicoccum_mediterraneum_PD30 Neofusicoccum_mediterraneum_PD311 Neofusicoccum_mediterraneum_PD312 Neofusicoccum_mediterraneum_PD48 Neofusicoccum_mediterraneum_PD49 Neofusicoccum_mediterraneum_PD5 Neofusicoccum_mediterraneum_PD53 Neofusicoccum_mediterraneum_PD55 Neofusicoccum_mediterraneum_PD56 Neofusicoccum_mediterraneum_PD67 Neofusicoccum_mediterraneum_PD82 Neofusicoccum_mediterraneum_PD84 Neofusicoccum_mediterraneum_PD87 Neofusicoccum_mediterraneum_PD88 Neofusicoccum_mediterraneum_PD9 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD149 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD246 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD247 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD248 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD249 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD301 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD302 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD484 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD86 Neofusicoccum_nonquaesitum_PD90 Neofusicoccum_parvum_PD106 Neofusicoccum_parvum_PD140 Neofusicoccum_parvum_PD142 Neofusicoccum_parvum_PD148 Neofusicoccum_parvum_PD17 Neofusicoccum_parvum_PD18 Neofusicoccum_parvum_PD250 Neofusicoccum_parvum_PD251 Neofusicoccum_parvum_PD286 Neofusicoccum_parvum_PD29 Neofusicoccum_parvum_PD39 Neofusicoccum_parvum_PD43 Neofusicoccum_parvum_PD57 Neofusicoccum_parvum_PD59 Neofusicoccum_parvum_PD6 Neofusicoccum_parvum_PD62 Neofusicoccum_parvum_PD65 Neofusicoccum_parvum_PD81 Neofusicoccum_parvum_PD92 Neofusicoccum_parvum_PD93 Neofusicoccum_parvum_PD94 Neofusicoccum_ribis_PD254 Neofusicoccum_ribis_PD288 Neofusicoccum_ribis_PD289 Neofusicoccum_ribis_PD299 Neofusicoccum_ribis_PD300 Spencermartinsia_viticola_PD258 Spencermartinsia_viticola_PD74 Sphaeropsis_sapinea_PD23 Sphaeropsis_sapinea_PD80 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M5154] TITLE 'Botryosphaeriaceae, 6-locus'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep5868; DIMENSIONS NCHAR=3003; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . ] Botryosphaeria_dothidea_PD107 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Botryosphaeria_dothidea_PD315 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Botryosphaeria_dothidea_PD71 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Diplodia_seriata_PD13 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Diplodia_seriata_PD272 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Lasiodiplodia_theobromae_PD270 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Neofusicoccum_arbuti_PD283 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD1 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD125 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD139 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD145 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD24 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD275 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD311 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD53 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Neofusicoccum_mediterraneum_PD84 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Neofusicoccum_nonquaesitum_PD246 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Neofusicoccum_parvum_PD140 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Neofusicoccum_parvum_PD250 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Neofusicoccum_parvum_PD43 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Neofusicoccum_parvum_PD65 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