#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 21, 2025; 11:38 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Marazzi B., & Sanderson M.J. 2010. Large-Scale Patterns of Diversification in the Widespread Legume Genus Senna and the Evolutionary Role of Extrafloral Nectaries. Evolution, 64(12): 3570-3592. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10568] [ The following blocks are input data for analysis step 6051 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep6051; DIMENSIONS NTAX=88; TAXLABELS Caesalpinia_decapetala Cassia_fistula Chamaecrista_desvauxii Delonix_regia Gleditsia_triacanthos Senna_acclinis Senna_aciphylla Senna_acuruensis_var_acuruensis Senna_acuruensis_var_catingae Senna_aff_velutina Senna_andrieuxii Senna_aphylla Senna_apiculata Senna_argentea Senna_armata Senna_arnottiana Senna_artemisioides_syn_phyllodinea Senna_atomaria Senna_barclayana Senna_bauhinioides Senna_bicapsularis Senna_birostris_var_hookeriana Senna_cana_var_calva Senna_cernua Senna_chacoensis Senna_chloroclada Senna_coronilloides Senna_corymbosa Senna_covesii Senna_crassiramea Senna_crotalarioides Senna_dariensis_var_hypoglauca Senna_didymobotrya Senna_galeottiana Senna_gardneri Senna_glutinosa Senna_hayesiana Senna_herzogii Senna_hilariana Senna_hirsuta_var_hirta Senna_hirsuta_var_leptocarpa Senna_holwayana Senna_indet_sect_Chamaefistula Senna_indet_ser_Bacillares Senna_indet_ser_Subverrucosae Senna_italica Senna_kurtzii Senna_macranthera Senna_magnifolia Senna_martiana Senna_mexicana Senna_mucronifera Senna_multijuga_var_lindleyana Senna_multijuga_var_multijuga Senna_nicaraguensis Senna_notabilis Senna_obtusifolia Senna_occidentalis Senna_pallida Senna_paradictyon Senna_pendula Senna_phlebadenia Senna_pilifera Senna_pinheiroi Senna_pleurocarpa Senna_polyantha Senna_purpusii Senna_quinquangulata Senna_reticulata Senna_rigida Senna_rizzinii Senna_robiniifolia Senna_rugosa Senna_scabriuscula Senna_septemtrionalis Senna_siamea Senna_silvestris_var_guaranitica Senna_skinneri Senna_spectabilis Senna_splendida_var_gloriosa Senna_subulata Senna_tonduzii Senna_uniflora Senna_unijuga Senna_velutina Senna_villosa Senna_williamsii Senna_wislizeni ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M5699] TITLE Senna_matrix; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep6051; DIMENSIONS NCHAR=2857; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Cassia_fistula 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Chamaecrista_desvauxii 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Delonix_regia 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Gleditsia_triacanthos 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Senna_acclinis 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Senna_artemisioides_syn_phyllodinea 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Senna_glutinosa 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Senna_hayesiana 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Senna_herzogii 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Senna_hilariana 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Senna_holwayana 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Senna_rigida 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Senna_rizzinii 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Senna_robiniifolia 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Senna_unijuga 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((((Gleditsia_triacanthos:0.031511,Caesalpinia_decapetala:0.026892):1.07E-8,Delonix_regia:0.022506):0.002187,Chamaecrista_desvauxii:0.033505):0.0,(Cassia_fistula:0.016136,((((((Senna_didymobotrya:0.002664,Senna_italica:0.011557):0.006144,(Senna_reticulata:0.008193,Senna_martiana:0.004826):0.001065,Senna_notabilis:0.006817):4.64E-4,Senna_paradictyon:0.012939,(Senna_magnifolia:0.003631,Senna_pleurocarpa:0.01054):4.13E-4):0.004875,Senna_nicaraguensis:0.011441):0.005558,((((((Senna_purpusii:0.007739,(((Senna_mexicana:0.00269,Senna_pendula:8.98E-4):0.001794,(Senna_hilariana:0.003134,((Senna_septemtrionalis:0.00135,Senna_indet_sect_Chamaefistula:4.82E-4):0.003888,Senna_bicapsularis:0.001346):0.001449):9.69E-4):0.002905,((Senna_birostris_var_hookeriana:0.001413,Senna_corymbosa:0.00772):4.44E-4,Senna_subulata:0.003204):0.001274):4.8E-4,(Senna_cernua:0.008688,((((Senna_occidentalis:0.0,Senna_scabriuscula:0.0):0.001513,Senna_barclayana:0.003469):0.002346,Senna_hirsuta_var_leptocarpa:0.00145):0.001175,Senna_hirsuta_var_hirta:0.002616):5.26E-4):0.004782):5.27E-4,Senna_arnottiana:0.004939):0.001079,((((Senna_crotalarioides:0.0,Senna_apiculata:0.0):0.001349,Senna_argentea:0.0):0.002706,((Senna_armata:0.003983,Senna_covesii:0.005475):4.22E-4,Senna_bauhinioides:8.97E-4):8.95E-4):4.21E-4,Senna_villosa:0.01466):0.005856):0.008904,(((((((Senna_robiniifolia:4.47E-4,Senna_pallida:0.0):0.003731,Senna_holwayana:0.004253):0.004973,Senna_tonduzii:0.008734):0.001846,((((Senna_chacoensis:4.39E-4,Senna_aphylla:0.0):8.81E-4,Senna_rigida:8.88E-4):4.4E-4,Senna_crassiramea:0.0):0.004263,Senna_kurtzii:0.002932):8.83E-4):0.002031,(((Senna_multijuga_var_multijuga:8.68E-4,Senna_multijuga_var_lindleyana:0.001891):0.002678,Senna_acuruensis_var_acuruensis:0.001884):0.003285,Senna_acuruensis_var_catingae:0.006758):0.002639):5.18E-4,Senna_williamsii:0.009482):0.003278,(Senna_uniflora:0.003971,((Senna_aff_velutina:4.41E-4,Senna_velutina:4.38E-4):4.38E-4,Senna_cana_var_calva:0.001324,Senna_phlebadenia:8.77E-4):0.003095):0.002551):0.004065):0.002641,((((Senna_pilifera:0.017849,(Senna_mucronifera:0.001388,Senna_obtusifolia:0.003483):0.002839):9.0E-4,((Senna_macranthera:8.65E-4,Senna_dariensis_var_hypoglauca:0.0,Senna_gardneri:0.0,Senna_pinheiroi:4.31E-4,Senna_quinquangulata:8.7E-4,Senna_rizzinii:4.31E-4,Senna_rugosa:0.001733,Senna_splendida_var_gloriosa:8.7E-4):0.001534,((Senna_hayesiana:0.006106,Senna_herzogii:0.003107):4.37E-4,Senna_indet_ser_Bacillares:0.004297):0.001621):0.006416,Senna_chloroclada:0.012582):0.001034,((Senna_acclinis:0.002626,Senna_aciphylla:0.004873):4.26E-4,((Senna_coronilloides:0.0058,Senna_artemisioides_syn_phyllodinea:0.004511):0.001306,Senna_indet_ser_Subverrucosae:0.004875):4.73E-4,Senna_glutinosa:0.001311):0.001336):0.004713,Senna_skinneri:0.008558):0.003652):0.003398,(((Senna_spectabilis:0.005956,Senna_atomaria:0.008643):0.001765,(Senna_unijuga:0.001801,Senna_wislizeni:9.0E-4):0.003628):4.36E-4,Senna_andrieuxii:0.006644):0.001388):0.002072):8.72E-4,(Senna_siamea:0.008039,(Senna_silvestris_var_guaranitica:0.009719,(Senna_galeottiana:0.0,Senna_polyantha:0.0):0.003929):4.83E-4):0.00241):0.004339):0.003284); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr9444] END;