#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 10, 2026; 5:37 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Choi Y., Thines M., & Shin H. 2011. A new perspective on the evolution of white blister rusts: Albugo s.str. (Albuginales; Oomycota) is not restricted to Brassicales but also present on Fabales. Organisms Diversity and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11211] [ The following blocks are input data for analysis step 6952 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep6952; DIMENSIONS NTAX=39; TAXLABELS Albugo_candida_ex_Arabidopsis_halleri Albugo_candida_ex_Arabis_turrita Albugo_candida_ex_Aubrietia_deltoidea Albugo_candida_ex_Berteroa_incana Albugo_candida_ex_Biscutella_laevigata Albugo_candida_ex_Brassica_juncea Albugo_candida_ex_Capsella_bursa_pastoris Albugo_candida_ex_Descurainia_sophia Albugo_candida_ex_Diplotaxis_erucoides Albugo_candida_ex_Diptychocarpus_strictus Albugo_candida_ex_Draba_verna Albugo_candida_ex_Draba_verna_b Albugo_candida_ex_Eruca_sativa Albugo_candida_ex_Erysimum_cuspidatatum Albugo_candida_ex_Heliophila_meyeri Albugo_candida_ex_Iberis_amara Albugo_candida_ex_Lunaria_sp. Albugo_candida_ex_Raphanus_sativus Albugo_candida_ex_Sisymbrium_leteum Albugo_candida_ex_Thlaspi_arvense Albugo_capparis_ex_Capparis_rupestris Albugo_chardoni_ex_Cleome_anomala Albugo_hesleri Albugo_hohenheimia Albugo_ipomoeae_panduratae Albugo_koreana Albugo_laibachii Albugo_leimonios Albugo_lepidii Albugo_mauginii_ex_Onobrychis_crista_galii Albugo_occidentalis Albugo_resedae_ex_Reseda_alba Albugo_resedae_ex_Reseda_alba_CA340 Albugo_trianthemae Albugo_voglmayrii Pustula_tragopogonis Wilsoniana_achyranthis Wilsoniana_bliti Wilsoniana_portulacae ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M7854] TITLE NDE; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep6952; DIMENSIONS NCHAR=561; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Albugo_candida_ex_Arabidopsis_halleri TATGGAAGGTATTATTAATTTTCATCATGATTTAATGTATTTTTTAATTATTATTACAATTTTTGTATGCTGGATTTTATTTCGAATTATTTTTATGTTTAGTGAAAATAAAAACCCTATTGCTGAAACTTTTGTACATGGATCTACTATTGAAATTATTTGGACTAGTATTCCAGCATTAATTTTATTAATTATTGCAATACCTTCATTTGCATTATTGTATTCGATGGATGAAATTATTTATCCCCTTATTACTATAAAAGTAATAGGAAGTCAATGGTACTGGACCTATGAATATTCAGACTGTTT---TTCATTTGAAAATGAA---GATATTAATGAAAGTTTGATTTTTGATAGTTATATGTTACAAGAAGATGACTTAAAATTAGGTCAATTTAGATTGTTAGAAGTAGATAATCGAGTTATTGTACCTACATATACACATATACGTATTTTAATAACAGCTTCAGATGTTTTACATTCTTGGGCTATTCCTTCATTAGGTATAAAGTTAGATGCATGTCCGGGAAGATTAAACCAAACTTCAATGTTTATAAA Albugo_candida_ex_Arabis_turrita 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[! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr27636] END; BEGIN TREES; TITLE mp_boot; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep6952; TREE MP_pruned = [&R] ((Albugo_ipomoeae_panduratae:0.308374,((Wilsoniana_bliti:0.087761,(Wilsoniana_portulacae:0.034748,Wilsoniana_achyranthis:0.041382):0.012223):0.10831,(Albugo_trianthemae:0.109129,Pustula_tragopogonis:0.156315,Albugo_occidentalis:0.107035):0.030352):0.100074):0.108899,(Albugo_lepidii:0.048404,Albugo_leimonios:0.03491,Albugo_hesleri:0.020399,Albugo_voglmayrii:0.055206,Albugo_hohenheimia:0.045655,Albugo_koreana:0.060631,(Albugo_candida_ex_Descurainia_sophia:0.012853,Albugo_laibachii:0.021171,(Albugo_candida_ex_Diptychocarpus_strictus:0.006614,(Albugo_mauginii_ex_Onobrychis_crista_galii:0.0,(Albugo_resedae_ex_Reseda_alba_CA340:0.0,Albugo_resedae_ex_Reseda_alba:0.002222):0.004366):0.008934):0.014097):0.0165,(Albugo_candida_ex_Sisymbrium_leteum:0.0,(Albugo_candida_ex_Draba_verna:0.0,Albugo_candida_ex_Erysimum_cuspidatatum:0.0,Albugo_candida_ex_Biscutella_laevigata:0.0,Albugo_candida_ex_Lunaria_sp.:0.0,Albugo_candida_ex_Thlaspi_arvense:0.0,Albugo_candida_ex_Aubrietia_deltoidea:0.0,Albugo_candida_ex_Arabidopsis_halleri:0.0,Albugo_candida_ex_Eruca_sativa:0.0,Albugo_candida_ex_Heliophila_meyeri:0.0,Albugo_candida_ex_Iberis_amara:0.0,Albugo_candida_ex_Capsella_bursa_pastoris:0.0,Albugo_candida_ex_Berteroa_incana:0.0,Albugo_chardoni_ex_Cleome_anomala:0.0,Albugo_capparis_ex_Capparis_rupestris:0.002151,Albugo_candida_ex_Brassica_juncea:0.002145,Albugo_candida_ex_Arabis_turrita:0.002161,(Albugo_candida_ex_Diplotaxis_erucoides:0.0,Albugo_candida_ex_Raphanus_sativus:0.0):0.002152):0.002163):0.086903):0.108899); [! 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