#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 05, 2025; 18:17 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Jabaily R.S., & Sytsma K.J. 2010. Phylogenetics of Puya (Bromeliaceae): Placement, Major Lineages, and Evolution of Chilean Species. American Journal of Botany, 97(2): 337–356. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11314] [ The following blocks are input data for analysis step 7062 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep7062; DIMENSIONS NTAX=59; TAXLABELS Aechmea_nudicaulis Ananas_comosus Ananas_nanus Billbergia_euphemiae Billbergia_laxiflora Bromelia_agavifolia Bromelia_balansae Bromelia_flemingii Cryptanthus_bromelioides Cryptanthus_dorothyae Deinacanthon_urbanianum Greigia_sp. Neoregelia_cruenta Ochagavia_elegans Orthophytum_gurkenii Pepinia_sanguinea Pitcairnia_orchidifolia Portea_fosteriana Puya_alpestris_1 Puya_alpestris_2 Puya_angusta Puya_angusta_2 Puya_bicolor Puya_boliviensis_1 Puya_boliviensis_2 Puya_castellanosii Puya_chilensis_1 Puya_chilensis_2 Puya_coerulea_1 Puya_compacta Puya_dasylirioidea Puya_dyckioides Puya_ferreyrae Puya_ferruginea_1 Puya_ferruginea_2 Puya_ferruginea_3 Puya_gilmartiniae Puya_goudotiana Puya_hamata Puya_harmsii Puya_herrerae Puya_lanata Puya_lineata Puya_macrura Puya_mima Puya_nana Puya_nitida_2 Puya_nutans Puya_obconica Puya_pygmaea Puya_raimondii Puya_raimondii_1 Puya_santosii Puya_trianae Puya_ultima Puya_venusta_1 Puya_venusta_2 Puya_wrightii Puya_yakespala ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M8217] TITLE PhyC; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep7062; DIMENSIONS NCHAR=1048; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Aechmea_nudicaulis -------------------------------GGGAATAT-TCCTTTACTGTGTGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCTGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAATGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGCTTGGTGGTTTGCCATCACACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAG-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTACTTCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTCATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAGAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTGTCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCACGGTCTTCGT-- Ananas_comosus ATCTCTAGG-CT-ACAG-TCTTTACCCAG?TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGTTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCCACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCACCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCATGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAA-GGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGACGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTTC Ananas_nanus ATCTCTAGG-CT-ACAG-TCTTTACCCAG-GGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATG-TTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGTTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTTTCTCGGCTTGCACTATCCTGCCACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGTCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGACGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Billbergia_euphemiae ---------------------TTACCCAG-{CT}GGGAATAT-TCCTTTACTGTGTGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTT{AT}TCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCTGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTGGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAATGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGCTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCT{GT}CGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTCATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAA{AG}-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGA{GT}TCGCAGATAAAGGATATTGTGG{CT}GTGGCTTTTAGAGTG{CT}CATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAACGGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCACG---------- Billbergia_laxiflora ATCTCTAGG-CT-ACAG-TCTTTACCCGG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGTGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTTTGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTG{CT}GATTGCACTGCTCTGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACC{AG}GCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGG{AC}TTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTTCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTCATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTGTCATGATGGGTC{AT}ACAGGGTTGAGCACCGACAG{CT}TTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGA{AT}CCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCATT- Bromelia_agavifolia ATCTCTAGG-CT-ACAG-TCTTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGCGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACCGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTC?AC{AG}TTGAGAGCTCCTCATGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAATTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGACTCGCAGATAAAGGACATAGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGTTCTACAGGCTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAGGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTG{AC}AAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACC{AG}GCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Bromelia_balansae ------------------------------------------------------------------TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGCGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACCGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTGAGAGCTCCTCATGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAAAGTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAATTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGT{CT}AAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGACTCGCAGATAAAGGACATAGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGTTCTACAGGCTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAGGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA------------------------------------------------------------------------- Bromelia_flemingii ATCTCTAGG-CT-ACAG-TCTTTACCCAGCTGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGCGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACCGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTGAGAGCTCCTCATGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAGCCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCC{AG}AGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAATTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTCAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGACTCGCAGATAAAGGACATAGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGTTCTACAGGCTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTT{GT}GGAG?CGCAGTCTGTGGCAT{CG}GCCGCAATTAGGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTC{GT}ATCCCACACTG--------------------------------------------------------------------------------------- Cryptanthus_bromelioides ----------------------------G-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCACGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCCGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCATGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAGGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGCTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTGATGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCTGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCGATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCC?C{AG}CTGC-------------------------------------------------------------------------------------- Cryptanthus_dorothyae ATCTCTAGG-CT-TCAG-TCTTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCACGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCCGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCATGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAGGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGCTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTGATGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCTGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCGATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAAGGATGACGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Deinacanthon_urbanianum --------------------------------GGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACCGGGTACGACCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCACGGCCAAGTAATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCA{AG}GCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGGTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGACGAGGAAGAAACCGGCAGCGACCAACAACAGCACATGGCGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCCCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATATTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCGCTTT-ATTACAAGAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTG{CG}C{CT}TTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Greigia_sp. ------AGG-TT-ACAG-TCTTTACCCAG-TGGGAACAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCACGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGCGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGTTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTCATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAGAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTTGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGTACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGATTTGGGAGACGCAGTCTGCGGCGTGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACAAAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Neoregelia_cruenta ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCC{AG}CAGGCCTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCTGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCC?CTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGAGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGTTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTTCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCACAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTGTCATGATGC{AG}TCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCTGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCAC{AT}CTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGTTGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Ochagavia_elegans ATCTCACGG-TT-ACAG-TCTTTACCCAG-TGGGA{AG}TAT-TCCTTTACTGTGTGATGTTT{AT}-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACCGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCACGGCGAAGTAATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCCGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGTTCTATTGCCTCCCTCGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTCATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTTGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGTACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGATTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGAAAAATGCATCCGCGGTCT------ Orthophytum_gurkenii --------------------------------------------------------------GGT???GGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCACGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGACCTGGACCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTCATGAAGAACAAGGTGAGGATGATTTGCGATTGCACCGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTGAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTCGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCGGCGACCAACAGCAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCGCTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTCGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGACGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Pepinia_sanguinea ---------------------------------GAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTTAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGCAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTACGATTGCACTGCTCCGCCAGTCAAGGTGATACAGGACAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCATGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGTTCTATCGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAATGAGGATGAGGAAGAAATCGGTGATGACCAACAACAACACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCGAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCGTATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGACGCTCCCATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTCGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTATAGAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGGACTACACCTTCTGAGTCTCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTGGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGGAGAAGCCGGTTATCCTGGTGCTTCTGCTTTGGGAGATGTAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCGAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGA?CCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCATT- Pitcairnia_orchidifolia --------------CAG-TCTTTACCCAG-{CT}GGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATG{CT}{CT}{CT}??GGT-TCGGGAGGTTAGCGAGCTTACGGGG{GT}ACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGCAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTACGATTGCACTGCTCCGCCAGTCAAGGTGATACAGGACAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGTTCTATCGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAATCGGCGATGACCAACAACAACACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCGAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCGTATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGACGCTCCCATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTCGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTTTATTATAGAAA-TCAATTTTGGCTTCTT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Portea_fosteriana ATCTCTAGG-CT-ACAG-TCTTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTGCTGTGCGA{CT}GTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAGGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCTGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCCGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCT{CT}GTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGCTTGGTGGTTTGCCATCACACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGGTATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAAGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACACTTCTTTGTGATATGCTTCTTCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGCGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGT{GT}GTGTGGCTTTTAGAGTGTCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTTCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCAGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCAT--------------- Puya_alpestris_1 -------------------------------GGGAACAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGTGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTACATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCGCTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCGCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCTGGTTATCCCCGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGAGGTCTTCGTT- Puya_alpestris_2 ATCTCAAGG-TT-ACAGATCTTTACCCAG-TGGGAACAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGTGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCGCTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCGCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Puya_angusta -----------------------------------------CCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCATGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCATTTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCACAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCTGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Puya_angusta_2 --------------------------------------------------------------------------------------------ACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATC{CT}TGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGG{AG}AGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAA{AG}GAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCT{AG}TTGGTATTTTC{AT}CTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTAC{AC}GGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGG{CT}TATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGA{AG}CCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_bicolor ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCACGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_boliviensis_1 -------------------------------GGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTG{CT}GATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTC?ACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTC{CT}GTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGG{AG}AGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCC{AG}CTCAGATATGC{GT}TGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAG{CT}ATTCAGCTGAACAAGGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCTCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTC{CT}TGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGCTATCCCGG{CT}GCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGG{AC}GAT?A-A-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGC---------------------------------------------- Puya_boliviensis_2 ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCAACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGAAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCGTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAGGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCTCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGCTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_castellanosii -------------------------------GGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCT?CCGGGTTGAGC?CCG?CAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAG??????ATGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCA------------------------------------------------ Puya_chilensis_1 ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGG{AC}ATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCAACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGAAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCGTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAGGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCTCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGCTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_chilensis_2 ---------------------TTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCAACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGAAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCGTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAGGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCTCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Puya_coerulea_1 ---------------------------------------------------GCGATGTTTT{AT}GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGG{CT}GAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGTGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCGCTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCGCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCA{AT}GATGGCTCTACAG{AG}GTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCTGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TG{GT}GGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGAGGTCTTCGTT- Puya_compacta ------------------------CCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGA---------------------------------------------------- Puya_dasylirioidea -------------------CCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-C Puya_dyckioides ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGAGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATT{AG}CAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGA??ATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_ferreyrae -------------------CCTTACCCAG-?GGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAACTGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGG------------------------ Puya_ferruginea_1 ------AGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAGCCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_ferruginea_2 ------------------------------TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGAAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTC-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAGCCGGCTGATAGGGATGATGTGGGACGGAAAATGCATTC------------- Puya_ferruginea_3 ------------------------------TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAGCCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_gilmartiniae ---------------------------------------------------------------------------GAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAG????AGCCGAGTG{CT}AGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCAACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGAAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCGTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAGGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCTCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGCTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_goudotiana ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-?GGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGG{GT}CTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGA?GATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_hamata ----------------------------------AATAT-TCCTTTACTGTGCGA{CT}GTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGG{CT}GAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Puya_harmsii ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAA{CT}GAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATAC{AG}AGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGC{AG}GCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGA{AG}CCGGCTGATAGGG?TG?TGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_herrerae ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCATGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAGCCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_lanata ATCTCAAGG-TT-ACAGATCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGAGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCCGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAA-------------------- Puya_lineata ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCACGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_macrura -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGAT?TGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATC{CT}TGTCCGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGG{CT}TGCCACGCTCAGTATATGG{CT}TAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTC{CT}GTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCA{GT}TGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAG{CT}ATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTA{CG}AGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCT{AG}TTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCA{CT}GGTGC{AG}GCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGG{CG}TCTAC{AC}GGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGC{CT}GGTTATCCCGG{CT}GCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGC{CT}GCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTA?A-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACC{AG}GCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCG{AG}GGTCT------ Puya_mima -----------------------------------------------------------------------------------------------------TGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGTGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCATTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCT{CT}TGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTACAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCATGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCACAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCTGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAGA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCAGCT?ATAGGGATGATGAGGGACG{AG}AAAA-------------------- Puya_nana AT{CT}TCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTT{AG}CTGTG{CT}GATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGAGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACC{AG}GCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAG{CG}AAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_nitida_2 ------AGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCACGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_nutans ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGC?ATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGG?TGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATAC{AG}AGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGG{AG}CGGAAAATGCATCCGCGGTCTTC---- Puya_obconica -----------------------------------------------------------------------------------------------------TGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCG---------- Puya_pygmaea -----------T-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_raimondii --------------------CTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTCCCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAGCCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_raimondii_1 ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAGCCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_santosii ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCC{GT}TATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAACTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGT-- Puya_trianae ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG?TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCA{AG}CTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTATGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGC{AG}GCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGGCGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_ultima ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCCTTACCCAG-TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCCCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA?TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Puya_venusta_1 ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCTTTACCCAG-?GGGAACAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGG?GAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGTGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCGCTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCGCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGCTCTACAGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCTGGTTATCCCGGTGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCCGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCCGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_venusta_2 ATCTCAAGG-TT-ACAG-TCTTTACCCAG-TGGGAACAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATTTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGTGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCTTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGCTGCCACGCTCAGTATATGGCTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCTGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCGCTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGTATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTGTTGGTATTTTCGCTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Puya_wrightii ------------------------------TGGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTAC{CG}GGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGAGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCCGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACAAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCAGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCG{AG}C?CTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAACCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTCTTCGTT- Puya_yakespala -------------------------------GGGAATAT-TCCTTTACTGTGCGATGTTTT-GGT-TCGGGAGGTGAGCGAGCTTACGGGGTACGATCGGGTGATGGCTTACATGTTCCACGAAGACGAGCATGGCGAAGTTATAGCCGAGTGTAGGAGATCGGATCTGGAGCCTTATCTCGGCTTGCACTATCCTGCTACTGATATCCCGCAAGCTTCGAGGTTTCTTTTTATGAAGAACAAAGTGAGGATGATTTGCGATTGCACTGCTCCGCCGGTCAAGGTAATACAGGATAAGAGACTAGCTGAGCCGCTGATCCTGTCGGGCTCGACGTTAAGAGCTCCTCACGGTTGCCACGCTCAGTATATGGTTAATATGGGCTCTATTGCCTCCCTTGTCATGTCCGTTACCATTAACGAGGATGAGGAAGAAACCGGCAGTGACCAACAACAGCACATGGGGAGGAAGCTTTGGGGTTTGGTGGTTTGCCATCATACGAGCCCAAGGTTTGTCCCTTTTCCACTCAGATATGCTTGTGAGTTCCTGTTGCAA-GTGTTCAGCATTCAGCTGAACAAAGAGGTAGAGTTAGAGGCTCAAGCAAAGGAGAAGCATATCCTCCAG-ACCCAGACCCTTCTTTGTGATATGCTTCTGCGAGATGCTCCTATTGGTATTTTCACTCAGTCGCCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGCCACGGTGCGGCACTTT-ATTACAAAAA-TCAATTTTGGCTTCTTGGAACTACACCTTCTGAGTCGCAGATAAAGGATATTGTGGCGTGGCTTTTAGAGTATCATGATGGGTCTACCGGGTTGAGCACCGACAGCTTGGCAGAAGCCGGTTATCCCGGCGCTTCTGCTTTGGGAGACGCAGTCTGTGGCATGGCTGCAATTAAGATTACTTCAAA-GGATTTTATGTTTTGGTTCCGATCCCACACTGCAAAGGAGATTAAA-TGGGGTGGAGCTAAAAATGAGCCGGCTGATAGGGATGATGAGGGACGGAAAATGCATCCGCGGTC------- ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * UNTITLED (CHARACTERS = PhyC) = N: 1-1048; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = PhyC) = N: 1-1048; END; [ The following blocks are output data for analysis step 7062 ] BEGIN TREES; TITLE PhyC; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep7062; TREE c._Fig._4 = [&R] ((Pepinia_sanguinea:0.004338,Pitcairnia_orchidifolia:0.0):0.0148725,(((Bromelia_agavifolia:0.0,(Bromelia_balansae:0.0,Bromelia_flemingii:0.002157):0.0):0.01095,(Orthophytum_gurkenii:0.014946,(Neoregelia_cruenta:0.008064,(Portea_fosteriana:0.008208,(Billbergia_laxiflora:0.002962,(Aechmea_nudicaulis:0.005143,Billbergia_euphemiae:0.001014):0.002024):0.001965):9.19E-4):0.003895,((Ananas_comosus:0.001834,Ananas_nanus:0.003085):0.002982,(Cryptanthus_bromelioides:0.0,Cryptanthus_dorothyae:0.0):0.010938):0.001922):8.6E-4):0.002537,((Deinacanthon_urbanianum:0.012611,(Greigia_sp.:0.007262,Ochagavia_elegans:0.006882):0.008227):9.66E-4,((Puya_mima:0.007973,Puya_alpestris_2:0.002316,Puya_venusta_2:0.002316,Puya_venusta_1:0.002316,(Puya_alpestris_1:0.00203,Puya_coerulea_1:0.0):0.0033299999999999996):0.004381,((Puya_boliviensis_1:0.001105,(Puya_boliviensis_2:0.0,(Puya_chilensis_1:0.0,(Puya_chilensis_2:0.0,Puya_gilmartiniae:0.0):0.0):0.0):0.0):0.009965,(Puya_angusta:0.005694,((Puya_ferruginea_2:0.0046165,Puya_angusta_2:7.4225E-4,Puya_raimondii:0.0014845,Puya_ferruginea_1:4.865E-4,Puya_ferruginea_3:4.865E-4,Puya_yakespala:4.865E-4,Puya_herrerae:0.0014615,Puya_raimondii_1:4.865E-4,Puya_harmsii:0.0):4.865E-4,(Puya_castellanosii:0.002177,Puya_ultima:0.001317,Puya_ferreyrae:0.0,Puya_santosii:0.001461,(Puya_dyckioides:0.0,Puya_nana:2.4375E-4,(Puya_macrura:0.00236,(Puya_lanata:0.0,Puya_wrightii:0.0):4.875E-4):4.875E-4):9.74E-4):0.004949125,(Puya_trianae:9.78E-4,(Puya_nutans:0.0,((Puya_compacta:0.0,(Puya_hamata:0.0,(Puya_obconica:0.0,Puya_pygmaea:0.0):0.0):0.0):0.0,Puya_goudotiana:9.73E-4,Puya_dasylirioidea:9.73E-4,Puya_lineata:0.001949,(Puya_bicolor:0.0,Puya_nitida_2:0.0):0.001949):4.885E-4):4.885E-4):0.008858125):0.001040125):0.00208025):0.0041605):0.001325):0.001758):0.0148725); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr31307] END;