#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 11, 2025; 21:38 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Fiaschi P., & Plunkett G. 2011. Monophyly and phylogenetic relationships of Neotropical Schefflera (Araliaceae) based on plastid and nuclear markers. Systematic Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11418] [ The following blocks are input data for analysis step 7204 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep7204; DIMENSIONS NTAX=61; TAXLABELS Heteropanax_fragrans_4927 Schefflera_acuminata_21679 Schefflera_acuminata_8583 Schefflera_aff_lilacina_7771 Schefflera_aff_paniculitomentosa_250 Schefflera_aff_robusta_4971 Schefflera_aff_varisiana_4542 Schefflera_angulata_8589 Schefflera_aurata_3083 Schefflera_botumirimensis_3086 Schefflera_brenesii_4755 Schefflera_burchellii_2990 Schefflera_calva_942 Schefflera_capixaba_690 Schefflera_cf_lasiogyne_7467 Schefflera_cf_violacea_13877 Schefflera_cf_violacea_7922 Schefflera_chimantensis_3198 Schefflera_cordata_3106 Schefflera_decaphylla_3217 Schefflera_delavayi_5021 Schefflera_dielsii_15066 Schefflera_diplodactyla_14000 Schefflera_epiphytica_1882 Schefflera_fantsipanensis_4853 Schefflera_glabrata_3170 Schefflera_gleasonii_7369 Schefflera_grandigemma_1475 Schefflera_harmsii_15078 Schefflera_heptaphylla_4941 Schefflera_herzogii_9695 Schefflera_instita_17775 Schefflera_longipetiolata_3117 Schefflera_macrocarpa_3087 Schefflera_minutiflora_12901 Schefflera_morototoni_13999 Schefflera_panamensis_33 Schefflera_patula_15080 Schefflera_quinquestylorum_9094 Schefflera_robusta_4437 Schefflera_rodriguesiana_5199 Schefflera_ruschiana_956 Schefflera_sandiana_11260 Schefflera_sciodaphyllum_3129 Schefflera_sciodaphyllum_5454 Schefflera_selloi_6009 Schefflera_sp_A_aff_jahnii_12609 Schefflera_sp_A_aff_jahnii_13115 Schefflera_sp_B_aff_jahnii_8582 Schefflera_sp_C_Werff_21615 Schefflera_sp_D_Neill_13849 Schefflera_sp_D_Werff_21800 Schefflera_spruceana_3210 Schefflera_stilpnophylla_13020 Schefflera_ternata_1328 Schefflera_ternata_158 Schefflera_tipuanica_4046 Schefflera_tremula_20083 Schefflera_umbellata_3204 Schefflera_umbrosa_931 Tetrapanax_papyrifer_4971 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M8558] TITLE Neotropical_Schefflera_ETS_alignment; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep7204; DIMENSIONS NCHAR=470; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Schefflera_ternata_158 ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTCATTCTTGCTCCAAGAGCAATATGCCTTGGACCAATTCGGTTGCCTGTGTTGTATACCTACGTTGATGGAATTCGCTCGTCCAATCACTTTTTATTCACCTTGTGCTGCTT-ACGCGGTGCAGGATGAACCATGCAGTGTCCTTTGTTGGGCATTCTTGCCTTGCGTTCGCGCGATGCAGGAAATGGCCAATGTC-TGACACTCGAATTCTCGGATACGGAACCTT-AAGCGGGCAACGGGTCTTTGGCCTTGATTT-GCCCAAACTAAG---------TTCTTACGAACGACTGTCGTGCCC-GTTTTGACCTGAGGATGCTTTTGGTCCGAC?????????????????????????????????????? Schefflera_tipuanica_4046 GTTGGCATAGTGTACGTAAGGCGCGTGAGTGGTGTTTGGTTTGCTTGGGTTGGTCGGATCCCTGCTTGTGCAGCGACGTCCACTCTCACATACCTTTTCATTCTTGCTCCAAGAGCAATATGCCTTGGACCAATTCGGTTGCCTGTGTTGTATACCTACATTGATGGAATTCGCTCGTCCAATCGCCCCTTATTCACCTTGTGCTGCTT-ACGCGGTGCAGGATGAACCATGCAGTGTCCTTTGTTGGGCATTCTTGCCTTGCGTTCGCGCGATGCAGGAAATGGCCAATGTC-TGACACTCGAATTCTCGGATACGGAACCTT-AAGCGGGCAACGGGTCTTTGGCCTTGATTT-GCCCAAACTAAG---------TTCTTACGAACGACTGTCGTGCCC-GTTTTGACCTGAGGATGCTTTTGGTCCGACTGGCTCATGCGGTGCAGACGTCGAAGAGGAATGCTA?C Schefflera_tremula_20083 GTTGGCATAGTGTACGTAAGGCGCGTGAGTGGTGTTTGGC{AT}TGTCTGGGTTGGTCAGATCCCTGCTTGTGCAGCGACGGCCGCTCCTACATCCCTTTTCATTCTTGCTCCAAGAGCGATATGCCTTGGACCAATTCGGTTCCCTGTGTTGTATACCTACGTTGATGGAATTTGCTCGTCCAATCACCCCTTATTCACCTTGTGCTGCTT-ACGCGGTGCGGGATGAACCATGCAGTGTCCTTTGTTGTCCGTTCTTGCCCTGCGTCTGCGGGATGCATGAAATGGCCAATTTTGTGACACTCGAATTCTCGGATACGGAACCCT-AAGCGGGCAACGGGTCTTTGGCCTCGACTT-GCCCAAACTGAG---------CTCTTACGAACGACTGTCGCGCCC-GTCTTGACCTGAGGATGCTTTCGGTCCGACTGGCTCATGCGGTGCCGACGTCGAAGAGGAATGCTACC Schefflera_umbellata_3204 GTTGGCATAGTGTACGTAAGGCGCGTGA{GT}TGGTGTTCGGTTTGTTTGGGTTGGTCGGATCCCTGCTTGTGCAGCGACGGCCGCTCTTACATCCCTTTTCATTCTTGCTCCGAGAGCGATATGCCTTGGACCAATTTGGTTGCCTGTGTTGTATACCTACGTTGATGGAATTCGCTCGTCCAATCACCCCTTATTCACCTTGTGCTGCTT-ACGCGGTGCGGGATGAACCATGCAATGTCCTTTGTTGTCCATTCTTGCCCTGCGTTCGCGCGACGCATGAAATGGCCAATGTTGTGACACTCGAATTCTCGAATACGGAACCTT-AAGCGGGCAACGGGTCTTTGGCCTTGATTT-GCCCAAACTAAG---------TTCTTACAAACGACTGTCGCGCCC-GTTTTGACCTGAGGATGCTTTCGGTCCGACTGGCTCATA????????????????????????????? Schefflera_umbrosa_931 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACTTCCCTTTTCATTCTTGCTCCAAGAGCGTTATGCCTTGGACCAATTTGGTTGCCTGTGTTGCGTACCTACGTTGATGGAATTCGCTCGTCCAATCGCCCCTTATTCGCCTTGTGCTGCTT-ACGCGGTGCAGGGTGAACCATGCAATGTCCGTCGTTGTCCGTTCTTGCCCTTCGTTCACGCGACGCATGAAATGGCCAATGATGTGACACTCGAATTATCGGATACGGAACCCTTAAGAGGGCAACGGGTCTTTGGCCTTGATTT-GCCTAAACTAAG---------TTCTTACAAACGACTGTCTCGCCC-GTTTTGACCTGAGGATGCTTTCGGTCCGACTGGCTCATGCGGTGCAGACGTCGAA{CG}AGGAATGCTACC Tetrapanax_papyrifer_4971 ???????????????????????????????????????????????????????????????GCTTGTGCAGCGACGACTGCTCTCACATCCCTTTTCATTCTTTCTCCAAGAGCAATATGCCTTGGACCAATTCGGTTGCCTGTGTTGTATACCTACGTTGATGGAATTTGCTCGTCCAATCATCCCTTATTCACTTTGTGCTGCTC-ACGCGGTGCGGAATGAACCACGCAGTGTCCTTTGTTGTCCGTTCTTGCCTCGCGTTCGTGCGACGCATGAAATGGCCAATTTGGTGACACTCGAATTCTAGGATACGGAACCTT-AAGCGGGTAACGGGCCTTTGGCCTTGATTT-GCCCAAACTAAGCGTTCTCGCTTCTTAAGAACGATTGTCGCGCCC-GTTTTGACCTGAGGATACTTTCGGTCCGACTGGATCATG{CT}GGTGCCGGCGTCGAAGAG?????????? ; END; [ The following blocks are output data for analysis step 7204 ] BEGIN TREES; TITLE Neotropical_Schefflera_ETS_Consensus; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep7204; TREE Consensus_tree_of_39_ = [&R] (Tetrapanax_papyrifer_4971,(Schefflera_heptaphylla_4941,((Schefflera_fantsipanensis_4853,Schefflera_delavayi_5021),(Heteropanax_fragrans_4927,((Schefflera_gleasonii_7369,Schefflera_tremula_20083),(Schefflera_sp_A_aff_jahnii_13115,Schefflera_sp_A_aff_jahnii_12609,Schefflera_sp_B_aff_jahnii_8582),((Schefflera_harmsii_15078,(Schefflera_aff_varisiana_4542,(Schefflera_chimantensis_3198,Schefflera_spruceana_3210,Schefflera_umbellata_3204))),((Schefflera_longipetiolata_3117,(Schefflera_calva_942,Schefflera_grandigemma_1475),(Schefflera_capixaba_690,Schefflera_ruschiana_956)),(Schefflera_decaphylla_3217,(Schefflera_aurata_3083,(Schefflera_umbrosa_931,(Schefflera_selloi_6009,(Schefflera_burchellii_2990,Schefflera_morototoni_13999),(Schefflera_botumirimensis_3086,Schefflera_cordata_3106,Schefflera_macrocarpa_3087))))))),((Schefflera_glabrata_3170,(Schefflera_instita_17775,Schefflera_rodriguesiana_5199),(Schefflera_patula_15080,Schefflera_stilpnophylla_13020)),(((Schefflera_sp_D_Neill_13849,Schefflera_sp_D_Werff_21800),(Schefflera_panamensis_33,Schefflera_robusta_4437,Schefflera_aff_robusta_4971)),((Schefflera_diplodactyla_14000,(Schefflera_sciodaphyllum_3129,Schefflera_sciodaphyllum_5454)),((Schefflera_angulata_8589,Schefflera_sp_C_Werff_21615),((Schefflera_minutiflora_12901,Schefflera_sandiana_11260),(Schefflera_aff_lilacina_7771,Schefflera_cf_violacea_7922,Schefflera_cf_violacea_13877)),(Schefflera_dielsii_15066,Schefflera_cf_lasiogyne_7467,Schefflera_quinquestylorum_9094,(Schefflera_acuminata_8583,Schefflera_acuminata_21679),(Schefflera_brenesii_4755,Schefflera_epiphytica_1882),(Schefflera_ternata_158,Schefflera_ternata_1328),(Schefflera_herzogii_9695,Schefflera_aff_paniculitomentosa_250,Schefflera_tipuanica_4046))))))))))); [! 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