#NEXUS
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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Souza J., Pires-zottarelli C.A., & Harakava R. 2011. Isomucor (Mucoromycotina): a
new genus from a Cerrado reserve in São Paulo State, Brazil. Mycology, .

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11738]

[ The following blocks are input data for analysis step 7624 ]
BEGIN TAXA;
        TITLE  TaxaForAnalysisStep7624;
        DIMENSIONS NTAX=18;
        TAXLABELS
            Isomucor_trufemiae_MMBF87.09
            Isomucor_trufemiae_MMBF88.09
            Mucor_circinelloides_f._circinelloides_CBS195.68
            Mucor_circinelloides_f._circinelloides_FSU6154
            Mucor_fuscus_CBS132.22
            Mucor_genevensis_CBS114.08
            Mucor_hiemalis_f._corticola_FSU3008
            Mucor_hiemalis_f._hiemalis_CBS201.65
            Mucor_indicus_CBS226.29
            Mucor_mucedo_CBS109.16
            Mucor_piriformis_CBS169.25
            Mucor_plumbeus_A220
            Mucor_plumbeus_FSU6161
            Mucor_plumbeus_FSU6178
            Mucor_racemosus_f._racemosus_CBS260.68
            Mucor_racemosus_f._sphaerosporus_FSU500
            Mucor_ramosissimus_CBS135.65
            Mucor_renisporus_KJ1119
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M9821]

	TITLE Isomucor_ITS_matrix;
	LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep7624;
	DIMENSIONS NCHAR=405;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                                            10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400     ]
[                                                             .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .     ]
Isomucor_trufemiae_MMBF87.09                         ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTGCGTGGCGTTTGAGAGATGCTTAAGATGCTAATCGAGCCACGATCAAGCTTAGGCTTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGTATTAATATTGTAACATGACCTAAAAGCTCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCACCTGTTGGTATTCCAACAGGTACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAAAAGGCCTGGATAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTTGGGGCCTCTCAAATAATTTTTAAACTTGATCTG
Isomucor_trufemiae_MMBF88.09                         ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTGCGTGGCGTTTGAGAGATGCTTAAGATGCTAATCGAGCCACGATCAAGCTTAGGTTTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGTATTAATATTGTAACATGACCTAAAAGCTCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCACCTGTTGGTATTCCAACAGGTACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAAAAGGCCTGGATAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTTGAGGCCTCTCAAATAATTTTTAAACTTGATCTG
Mucor_circinelloides_f._circinelloides_CBS195.68     ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTACTTGACGCTTGAGGGATGCTCCGGATGTTAACCAAGTCATAGTCAAGCTTAGGCTTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATCCAACAGGCCTGATCAACTTTTTTTTAATATAAAGAGAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_circinelloides_f._circinelloides_FSU6154       ATCATTAAATAATTTACTGTGAAATGTATTATTACTTGACGCTTGAGGGATGCTCCGGATGCTAACCGAGTCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAATGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATCCAACAGGCCTGATCAACTTTTTTTTAATATAAAGAGAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_fuscus_CBS132.22                               ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTGTATGGCGCTTGAGAGATGTCTGGAATGCTAATCGAGCCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTACCTTATTATTTACCAAAAGAATTCAGTATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCCTTTTGGTATTCCAAAAGGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTCTTTCAAACAGGCCTGAGTAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTTTTTGGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_genevensis_CBS114.08                           ATCATTAAATAATTTACTGTGAAACGTATTATTACCTGACGCTTGAGGAATGCCTAGGATGTTAACCTAGTCGGGACCGAGCTTAGGCTCGATATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCTGAATAAATATTGTAACATGACTTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCTTTGGTATTCCAAGGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTACCTAGCAGGCTTGAGCAACTTTTTTTTAATATAAAGGAGAGTTACAAAGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_hiemalis_f._corticola_FSU3008                  ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTTTTAATTTTCAGTGTTTGAGGAATGTCTTGAATGTTAACCGAGCTGAAGTCAGGTTTAGACCTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGTATTATTATTGTAACATAGCGTAAAAAACTTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCAATGGTATTCCATTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACACCCCACATTCATAAAGGCCTGAACAACATTTTTTTAATATAAAGGAATGCTCTATGGGGCCTCCCAAATAATTCTTAAATTTGATCTG
Mucor_hiemalis_f._hiemalis_CBS201.65                 ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTTTTAATTTTCAGCGTTTGAGGAATGTCTTGAATGTTAACCGAGCTGAAGTCAGGTTTAGACCTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGTATTATTATTGTAACATAGCGTAAAAAACTTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCAATGGTATTCCATTGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACACCCCACATTCATAAAGGCCTGAACAACATTTTTTTAATATAAAGGAATGCTCTATGGGGCCTCCCAAATAATTCTTAAATTTGATCTG
Mucor_indicus_CBS226.29                              ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTTTTTATTTATGACGTTAAGGGGATGTCTTGAATGTTAACCTAGTCATAGTCAAGCTTATGCTTGGTACCCGATTACTTACCAAAAGAATTCAGTTTAAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCACTCAATGGTATTCCATTGAGTACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACAACCCTTATTCAAAAAGGCCATATCGATACTTTTTTAATTTAAAGGTAAAGCATGTTGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAACTTGATCTG
Mucor_mucedo_CBS109.16                               ATCATTATATATTTTACTGTGAACTGTATTATTTCATGACGCTTGAGGAATGCTTCAGATGTTAACCGAGTCGTGGTCAAGCTTAGGCTTGGTGTCCTATTATTATCCAAAAGAATTCATTTTAAATATTTTAATATGGCGTAAAAAACTCATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGGTCAATGGTATTCCATTGACCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACTACCCCACATTTATATGGCAGAAGGGATGCCCATTAAACCTAATTGAAAGATTTTGGAGGCCACTCAAATAATTTTAAAATTTGATCTG
Mucor_piriformis_CBS169.25                           ATCATTAAATAATTTACCGTGAACTGTATTATTACGCGGCGCTTGAGGAATGCTTCAGATGTTAACCGAGTCGTGATCAAGCTTAGGCTTGGTGTCCTATTATTATCCAAAAGAATTCATTTTAAATATTTTAATATGGCTTAAAAAACCATTAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCATCTTGCGGTCGTTGGTATTCCAACGACCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACACCCCACATCTTAAATGGCTAAGATAACTTTTTTTTTAATTAAAAGATTGGTTTTGGAGGCCACTCAAATAATTTCAAATTTTGATCTG
Mucor_plumbeus_A220                                  ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTATTTGACGTTTGAGGGATGTTCCAGATGTTAACCGAGTCATAATCAGGTTTAGGCCTGGTATCCTATTATTTACCAAATGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATCCAACAGGCCTGAACAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_plumbeus_FSU6161                               ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTATTTGACGTTTGAGGGATGTTCCAAATGTTAACCGAGTCATAATCAGGTTTAGGCCTGGTATCCTATTATTTACCAAATGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATTCAACAGGCCTGAACAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAACTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_plumbeus_FSU6178                               ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTATTTGACGTTTGAGGGATGTTCCAAATGTTAACCGAGTCATAATCAGGTTTAGGCCTGGTATCCTATTATTTACCAAATGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATTCAACAGGCCTGAACAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAACTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_racemosus_f._racemosus_CBS260.68               ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTATTTGACATTTGAGGGATGTTCCAAATGTTAACCGAGTCATAATCAGGTTTAGGCCTGGTATCCTATTATTTACCAAATGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATCCAACAGGCCTGAACAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAACTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_racemosus_f._sphaerosporus_FSU500              ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTATTTGACGTTCGAGGGATGTTTCAAATGTTAACCGAGTCATAATCAGGTTTAGGCCTGGTATCCTATTATTTACCAAATGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACACCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATCCAACAGGCCTGAACAACTTTTTTTTAATATAAAGGAAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAATCTTTAAATTTGATCTG
Mucor_ramosissimus_CBS135.65                         ATCATTAAATAATTTACTGTGAAATGTATTATTACTTGACGCCTGAGGAATGTTCCAAATGTTAACCGAGTCATAGTCAAGCTTAGGCTTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACGTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATCCAACAGGCCTGATCAACTTTTTTTTAATATAAAGAGAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAATTTGATCTG
Mucor_renisporus_KJ1119                              ATCATTAAATAATTTACTGTGAACTGTATTATTACTTGACGCTTGAGGGATGCTCCAGATGCTAACCGAGTCATAATCAAGCTTAGGCTTGGTATCCTATTATTTACCAAAAGAATTCAGAATTAATATTGTAACATGACCTAAAAAATCTATAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATATTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGCAACTTGCGCTCATTGGTATTCCAATGAGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAACAAACCCTCTATCCAACAGGCCTGATCAACTTTTTTTTAATATAAAGAGAAGCTCTTTGGGGCCTCCCAAATAATTTTTAAATTTGATCTG
;
END;

[ The following blocks are output data for analysis step 7624 ]
BEGIN TREES;
      TITLE Isomucor_ITS_tree;
      LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep7624;
      TREE ITS_tree = [&R] ((((((((Mucor_plumbeus_FSU6178:0.0,Mucor_plumbeus_FSU6161:0.0)81:0.00256,Mucor_racemosus_f._racemosus_CBS260.68:0.00257)76:0.00262,Mucor_racemosus_f._sphaerosporus_FSU500:0.01048)77:0.00252,Mucor_plumbeus_A220:0.0)99:0.02097,((Mucor_ramosissimus_CBS135.65:0.01835,Mucor_circinelloides_f._circinelloides_CBS195.68:0.00273)75:0.00251,(Mucor_renisporus_KJ1119:0.00232,Mucor_circinelloides_f._circinelloides_FSU6154:0.00531)76:0.00255)91:0.00854)0:0.0,Mucor_genevensis_CBS114.08:0.0986)92:0.02798,(((Mucor_hiemalis_f._hiemalis_CBS201.65:0.0,Mucor_hiemalis_f._corticola_FSU3008:0.00254)99:0.07911,Mucor_indicus_CBS226.29:0.1245)93:0.04001,((Isomucor_trufemiae_MMBF88.09:0.00503,Isomucor_trufemiae_MMBF87.09:0.0)99:0.04378,Mucor_fuscus_CBS132.22:0.02914)97:0.03527)0:0.0)100:0.04294,(Mucor_piriformis_CBS169.25:0.05721,Mucor_mucedo_CBS109.16:0.1101)100:0.09735);
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr47542]


END;