#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on January 11, 2026; 20:05 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Lee J.Y., Joseph L., & Edwards S. 2011. A Species Tree for the Australo-Papuan Fairy-wrens and Allies (Aves: Maluridae). Systematic Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11849] [ The following blocks are input data for analysis step 7789 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep7789; DIMENSIONS NTAX=26; TAXLABELS Amytornis_ballarae_1a Amytornis_barbatus_3a Amytornis_dorotheae_2a Amytornis_goyderi_1a Amytornis_housei_1a Amytornis_merrotsyi_1a Amytornis_purnelli_1a Amytornis_striatus_1a Amytornis_textilis_1a Clytomias_insignis_1a Gerygone_olivacea_1a Malurus_alboscapulatus_1a Malurus_amabilis_1a Malurus_coronatus_1a Malurus_cyaneus_2a Malurus_cyanocephalus_1a Malurus_elegans_1a Malurus_grayi_1a Malurus_lamberti_1a Malurus_leucopterus_1a Malurus_melanocephalus_1a Malurus_pulcherrimus_1a Malurus_splendens_1a Stipiturus_malachurus_1a Stipiturus_mallee_1a Stipiturus_ruficeps_1a ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M10159] TITLE Single_allele_matrix; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep7789; DIMENSIONS NCHAR=7828; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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CTCCAGCCATGGGACAGAACAAAAGTTGCAACAGTGATGATGCTTTATCTTCCACAACTTACTCCAGCAACACTTCCGTGGATGCCAATAATGAAATCTGCTTCAAAGAGGCCTGAAAAGAAGATTTTTCTCTTTTCAAATTCTGAGTCACTGATTTTGAAATTG-------------------------------------GCTAACTCATTGCATTTGTGACTGTGGTTTAACTAAAACCACCTAAGGCTGATAATGTCATCATGAACTCTCACATTCAAAA-TGAAGCTAAAACCTTAGCTAAGCCCCTTGTCTGAATGCAGCTTTCCAGTTCATTCAGAGCAGCATAGCACTCAGCATTTTCCCTCCAACAACAGGGAGAAAGAAAAAGAAAACCCCTTTCTGGCCTCCCAGAATATTGCTGCATGGAATACACTGTCACTCCTACTGCAAACTTTTTTAAGAGACAATATTGGAGACTGAGGATCATTAATGGGACTGGATCTGTTTCTGGTGCCCCAGGTGGCCTCCTCCTTGCTGTGCTTCTAAGAACTGCATTTTGTTCTCTGGAAGACAGCATTAAATTTTTCCCTTTTTTTGAACTAGTTGGTTGACACAG-------------TCCAAATGTGCGCCAGAGGATGAACCTTGCTGTCTGGCACCAGTAACTGGCAACAAGGAGAAATCTCTCCCCATTTCCCTCATACATTGGAGAATATGAAGGAGCTTAACCCCACTGAACCATGCTCTTATTCTAATTCTT-ATCTACAAAACCTCAAACATCAAGAAAACAGAAGCTTGGGGTGTTTTACAGTTTCAGATTGCAAGTGGAATTTGGGAATCACTTTTCAGCTTGCTGGTATCTCCCATAACTAAGAAGGTTGTAGCAGTGCAAACAACCTGG-AAAAACACAGACTACATTTTCAACCCCACTTCTTCAAAAAGGTTTTCTCATTTACATTGCTTTCACTCGAGCCTAATTCTCTATGCAACCTGCCATGAGACTTTCCCTTACCAACACTTCCTGGGATTTATTTTCTT-ACTCCTCCACTGCTACCCT--ACCCCTACCTTGCTCAGCAAGAGTATTCATCACCCCCATCCCGGATCAGAATCTTTATTACTCACCGGAACATGAAGAACTTTGAC-TTAAACATCCATCTGGAACCTCAGTACTGACAAATTCTGGAAATGCATTTTGCATTTTTGAAGTGGAGAGAAGAAGCAAAGTAATGAAAAACATGCAACAGAAGAAAAGGTCTCAGCTGCAGAAGAGGGACACGAGAGACATCTTGCTGTATCCTCATTGGTCTGCCTCCCAAACGGGAACAGTTTTGCATTCCTCTTGGGAAGGGGACACGGGGAAGGGCTCAGGGGAGCAAGCAGAGATGCCCTCGCGTACAAAACCCCTCAGGGGGGCTGCACAGGCAGCCCCAGTGAAACACCTTGGGCGAAG-CAGCGGAGGGAGCGCACCCCGCCCGTGCCATGGCCATGCACACAACATGTGCATGTCACAACCATTTGTCTGCATGAATGAGAACACA-GAGCACGAGCCAGCGGTGAAGGTGAAAAGAACACACCCAGAGGGAAGAGCGTGCTCTTCGGACCAGTTCTGAGAAACAACGGAGGAAAATATTAAAACAAACTACCCGTCAAAAAA-CCTCCAAAGGACCACCCCTGCAGAAAGCAAACCACCACGTACTCCAGGGAATCCAGGCTGGCCAGGGGGACCACGTTCTCCTTTCAAGCCAGCTGTACCCTAATTTTTGGAAAGTATAAGTGTACTTCTTGCCTGGCTGGCAAGACAGAACACATCATCCTCTCTGAATATTTTGTAACTGGGATTTAGCACAGGTATCTGTCATGTTGACGAAAGTGGATTATTTCTACTGAGTTCAATGGAAACAGAACTAGGTTCCTTGTGGAATAGCACATGGAAATCACAGCTAGTGTGCA-TGCAGCTAACTGGAACATGTGGGCCATGTTTCCAGTAGTGGATCTGGGAGCAGATGTGAGCTCCACATTCAGCTCTGTACCCAGACCGGCTAAACTCTTATCAGTGCAAGGTTTTGAAGCATTAGTTTCCAGAAGAGGACAAAGATGCTGCAACAGACTTGAATCTTGTCTTAACCATGTCCACTTGGATAACTGTGCAGCTGAAGATTATATTTCCAACTACGGCATAGGATTTGACCCGGCAGAGAATGAATTTGACTATGGCTTATGCAATGAAGTAGTTAACGTAGTCTGCTCGCCTAAACCTGATGCTTTCAACCCATGTGAAGATATCATGGGATACAACGTTCTGAGAGTCCTGATATGGTTCATCAACATCCTCGCTATTACTGGGAACACCGTGGTCCTCATTATTTTAATAAGCAGCCAGTACAAGCTCACTGTTCCTCGCTTTCTCATGTGCAATCTGGCCTTTGCAGACCTCTGCATCGGGATCTACCTGCTGCTCATCGCCTCGGTGGACGCCCGCACCAGCGGGCACTACTACAACCACGCCATAGACTGGCAAGGAAGAATGTCTTTATAGCATGTGCCAAACGGTTTTAAATCTTGTCCTAAACTAATTGGTATCGTACCGGGTTCCGTCGTTCACTGACCAAATGTAAGCTGTGTAAGTTCCAGTGCTTGCTGATTTTAGGTGATTATGGATA----TTCTTTCTTAATGAAAATATCACTGCGTGGGGGG------TCGGCCCCTGGCTTGTTTGAACTTTATCAAGACTCTTTGTAAATCGTTGGTACTTCAATCATGCTTTCCCTGAGCTCCCCCGGGCTCGGGATCGGGATGCTCCGAGCCCGTCTGTGAGCATGCTTTGCTGCTGCCCAGCTGTACCCGAAAGTTAGGCCTCCTGGCTCCAATGTTGCTGTTGTCTAGAGATCTCTCTCTCT----GCAGGTTACCACCAATCCTAACACCATCTCCCCCATCAGCTTATCCAACAGTCACTACGGTGTGGCAGGACAATGACAGATACCATCCAAAGCCAGTTTTGCACATGGTTTCATCAGAGCATTCAACAGACCTCAATGAGAATTATAATAAATCAACAGAACCTTCAGGGAAGAACGAACCCAGCGAACACGCGGAGAAGAGGCTGGAGCGCAACTTAAGTTTTGAGATCAAGAAGGTACCTCTTCAGGAGGGACCACGAAGCTTTGATGGGAACTCCCTGTTGAACAGGGGACATGCAATTAAAATTAAGCCTGTGTCATCCTGTGTAATTGATAAGAGCTTTAAGCCACAGGAACAGATTTCAGGGGATTCATTTGTAGATACTTCTCAAAACTCATGTGTGGAATACAGCGTGCCACAGTCTAACACAGCCTTAATACCTTCACCAGAAAGTCTGCAGAGCCAGCAGGTGTCTGATACCCCACCCAGACCAGATCGTCTGCCTTTGACAGAGAAGGGACATGCCACGTGGTCACTACATGGGCCTGAAAATGCACTGCGTACGTCCGTGTCTGAAGAGTTGTCTTCAGACACCTTGTGTCACGGTGTTCAAACTCTCTCTCTAGCATCAAACACCCCAGTTGAACATCCTTCCAGTGATAATGTTGATCCTTCTCCTCTTTCTGTTCGAGCACCCCTCTGTTTTACTAATCCTCTCCATTCAGATGATTCTGACACGGATGAGATGAACTTTGACGGAGCCATGAGCAAAAGCGCGTCCAATGTGTCAACCGCAAGTGCCACAGTCTCTGCTGCCGTTTACAGACAAAGATTCTAATGTCAGAGGAGCAGCTGTTCACCTGCTGCAGTTCTTGGCTTCAAAAATAAAAGCGGAACAGATTGCTCCATTTTTTCCTTTGGTAAGTGCCCATCTCTCTAGTGCCATGACTCATATCAGTGAGGGAATTCAGGAAGATTCATTGAAAATCTTGGACGTTTTATTGGAAGCATACCCAGCTCTTCTTACAGACCGCAGCGTTATATTGTTGAAGAATTTTGTAGAGCTTATTTCTCACCAGCAACTCTCAAAAAGACTGAAAAGCAGGGACAAACTTTCCTGGATGCTCTCTGTTAACCCGAATCGCAGAGTAACTTCTCAGCAGTGGAGGTTGAATGTACTTACCAGGCTCAAGAAGTTTCTCCAAGCAGTGGTAGATGGATCCAGTGGTACAGAAGATGAAGGGCTTCAAGAGCAGAAGGACAACTCTCATTCTGTGAGGAACCCAATATGTATTAGTTGGAAGCTCCATGCAAATAATCAGCAACATATACAACTGTTTGAAAGTGGTGGCTTACGACCAAGGAGCCAAGGGCAAGGTTGGTGGGCGCTGGAAGTAAAGAAGCAGGCAGGATGGCCTTTAGTGGTGTGCTGAACCCCTGCTGGTCTCCTCTTTCCTCCTTCACCGATCACTTGTGTTCTCATGCCTTGATGTTAACAAAAATCACATCAGCCTGGATTGGCTATTGCTGCTGCTTTT---CTTCCTGGAGGGGTCTGGTGGCTTCCTCAGTCAAGGGG-AAGCAAGTTCCCTGTGGAACTGGGATGACTCCTTGCTGGCATCTTCAATTCCTGCTGAGCATGTCCCTTATCCCCCTGATATGAGTTGGCACGACATATGCAGGAGTTCACTCAGGTTCACATGAGAATGATGGCTCAGAGTTTTCAGAATATCAGTGTTACTGCTGCAAATCCAGTACCCTTCATCAATGGCCTACCCTTTGAGCCTGCCCTCTTCTCACACGTGTCACATGCTGCATATGACTGCAATCCAGAAGTGGAAAACTTCAAGGAAACTATTCAGCAGTTGGAAGGTCGCCTGGTAAGACAGGATCACCAAATCAGGGAACTCATCGCTAAAATGGAGACTCAGAACACTCACATGGCGGAACTCAGACGTACTATCCGAAATTTGGAGGGAAAGGTTACGGAAATGGAGGCCCAGCAGTGTAACGGTATTTATATCTGGAAGATTGAGAACTTCAGCGGACTGCAGAAAGCCCAGGA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Amytornis_barbatus_3a CTCCAGCCACGGGACAGAACAAAAGTTGCAACAGTGATGATGCTTTATCTTCCACAACTTACTCTAGCAACACTTCCGTGGATGCCAATAATGAAATCTGCTTCAAAGAGGCCTGAAAAGAAGATTTTTCTCTTTTCAAATTCTGAGTCACTGATTTTGAAACTG-------------------------------------GCCAACTCATTGCATTTGTGACTGTGGTTTAATTAAAACCACCTAAGGCTGATAATGTCATCATGAACTCTCACATTCAAAA-TGAAGCTAAAACCTTAGCTAAGCCCCATGTCTGAATGCAGCTTTCCAGTTCATTCAGAGCAGCATAGCACTCAGCATTTTCCCTCCAACAACA--------------GAAAACCCCTTTCTGGCCTCCCGGAACATTGCTGCATGGAATACACTGTCACTCCTACTGCAAACTTATTTAAGAGACAATATTGGAGACTGAGGATCATTAATGGGATTGGGTCTGTTTCTGGTGCCCCAGGTGGCCTCTTCCTTGCTGTGCTTCTAAGAACTGCATTTTGTTCTCAGGAAGACAGCATTAAATTTTTCCCTTTTTT-GAACTGGTTGGTTGACACAG-------------TCTAAATGTGCGCCAGAGGACGAACCTTGCTGTCTGGCACCAGTAACTGGCTCCAAGGAGAAGTCTCGCCCCATTTCCCTCATACACTGGAGAATATGAAGGAGCTTAACCCCACTGAACCATGCTCTTATTCTAATTCTT-ATCTACAAGACCTCAAACATCAAGAAAGCAGGAGCTTGGGGTGTTTTACAGTTTCAGATTGCAAGTGGAATTTGGGAATCACTTTTCAGCTTGCTGGTATCTCCCATAACTAAGAAGGTTGTAGCAGTGCAAACAACCTGG-AAAAACACAGACCACATTTTCAACCCCACTTCTTCAAAAAGGTTTTCTCATTTACATTGCTTTCACTCGAGCCTAATTCTCTATGCAACCTGTCATGAGACTTTCCCTTACCGACACTTCCTGGGATTTATTTTCTT-ACTCCTCCACTGCTACCCT--ACCCTTACCTTGCTCAGCCATAGTATTCATCACCCCCATCCCAGAGCAGAATCTTTACTACTCACCAGAACATGAAGAACTTTGAC-TTAAACATCCATCTGGAACCTCAGTACTGACACATTCTGGAAATGCATTTTGCATTTTTGAAGTGGAGAGAAGAAGCAAAGTAATGAAAAACATGCAACAGAAGAAAAGGTCTCAGCTGCAGAAGAGGGACACGAGA--CATCTTGCTGTATCCTCATTGGTCTGCCTCCCAAACGGGAACAGTTTTACATTCCTCTTGGGAAGGGGACACGGGGAAGGGCTCAGGGGAGCAAGCAGAGATGCCCTCGCATACAAAACCCCTCAGGGGGGCTGCACAGGCAGCCCCAGTGAAACACCTTGGGCGAAGGCAGCGGAGGGAGCACACCCCGCCCGTGCCCTGGCCATGCACACAACATGTGCATGTCACAACCATTTGTCTGCATGAATGAGAACACA-GAGCACGAGCCAGCGGTGAAGGTGAAAAGAACACACCCAGAGGGAAGAGCGTGCTCTTCAGATCAGTTCTGAGAAACAACAGAGGAAAATATTAAAACAAACTCCCCATCAAAAAA-CCTCCAAAGGATCACCCCTGCAGAAAGCAAACCACCACGTACTCCAGGGAATCCAGGCTGGCCAGGGGGACCACGTTCTCCTTTCAAGCCAGCTGTACCCTAATTTTTGGAAAGTATAAGTGTACTTCTTGCCTGGCTGGCAAGACAGAACACATCATCTTCTCTGAATATTTTGTAACTGGGATTTAGCACAGGTATCTGTCAGATTGACGAAAGTGGATTATTTCTACTGAGTTCAATGGAAACAGAACTAAGTTCCTTGTGGAACAGCACATGGAAATCACAGCTAGTGTGCA-TGCAGCTGACTGGAACATGTGGGCCATGTTTCCAGTAGTGGATCTGGGAGCAGATGTGAGCTCCACATTCAGCTCTGTACCCAGACTGGCTGAACTCTTATCAGTGCAAGGTTTTGAAGCATTAGTTTCCACAAGAGGAGAAAGATGCTGCAACAGACTTGAATCTTGTCTTAACCATTTCCACTTGGATAACTGTGCAGCTGAAGATTATATTTCCAACTACGGCATAGGATTTGACCCGGCAGAGAATGAATTTGACTATGGCTTATGCAATGAAGTAGTTAACGTAGCCTGCTCGCCTAAACCTGATGCTTTCAACCCATGTGAAGATATCATGGGATACAATGTTCTGAGAGTCCTGATATGGTTCATCAACATCCTCGCTATTACTGGGAACACCGTGGTCCTCATTATTTTAATAAGCAGCCAATACAAGCTCACTGTTCCTCGCTTTCTCATGTGCAATCTGGCCTTTGCAGACCTCTGCATCGGGATCTACCTGCTGCTCATCGCCTCGGTGGACGCCCGCACCAGCGGGCACTACTACAACCACGCCATAGACTGGCAAGGAAGAATGTCTTTATAGCATGTGCCAAACGGTTTTAAATCTCGTCCTAAACTAATTGGTATCGTACCGGGTTCCGTCGTTCACTGACCAAATGTAAGCTGTGTAAGTTCCAGTGCTTGCTGATTTTAGGTGATTATGGATA----TTCTTTCTTAATGAAAATATCACTGCGTGGGGGGG-----TCGGCCCCTGGCTTGTTTGAACTTTATCAAGACTCTTTGTAAATCGTTGGTACTTCAATCATGCTTTCCCTGAGCTCCCCCGGGCTCGGGATCGGGATGCTCCGAGCCCGTCTGTGAGCATGCTTTGCTGCTGCCCAGCTGTACCCGAAAGTTAGGCCTCCTGGCTCCAATGTTGCTGTTGTCTAGAGATCTCTCTCTCT----GCAGGTTACCACCAATCCTAACACCATCTCCCCCATCAGCTTATCCAACAGTCACTACGGTGTGGCAGGACAATGACAGATACCATCCAAAGCCAGTTTTGCACATGGTTTCATCAGAGCATTCAACAGACCTCAATGAGAATTATAATAAATCAACAGAACCTTCAGGGAAGAACGAACCCAGCGAACACGCGGAGAAGAGGCTGGAGCGCAACTTAAGTTTTGAGATCAAGAAGGTACCTCTTCAGGAGGGACCACGAAGCTTTGATGGGAACTCCCTGTTGAACAGGGGACATGCAATTAAAATTAAGCCTGTGTCATCCTGTGTAATTGATAAGAGCTTTAAGCCACAGGAACAGATTTCAGGGGATTCATTTGTAGATGCTTCTCAAAACTCATGTATGGAATACAGCGTGCCACAGTCTAACACAGCCTTAATACCTTCACCAGAAAGTCTGGAGAGCCAGCAGGTGTCTGATACCCCACCCAGACCAGATCGTCTGCCTCTGACAGAGAAGGGACACGCCACGTGGTCACTACATGGGCCTGAAAATGCACTGCGTACGTCCGTGTCTGAAGAGTTGTCTTCAGACACCTTGTGTCACGGTGTTCAAACTCTCTCTCTAGCATCAAACACCCCAGTTGAACATCCTTCCAGTGATAATGTTGATCATACTCCTCTTTCTGTTCGAGCACCCCTCTGTTTTACTAATCCTCTCCATTCAGATGATTCTGACACGGATGAGATGAACTTTGACGGAGCCATGAGCAAAAGCGCGTCCAATGTGTCAACCGCAAGTGCCACAGTCTCTGCTGCCGTTTACAGACAAAGATTCTAATGTCAGAGGAGCAGCTGTTCACCTGCTGCAGTTCTTGGCTTCAAAAATAAAAGCGGAACAGATTGCTCCATTTTTTCCTTTGGTAAGTGCCCATCTCTCTAGTGCCATGACTCATATCAGTGAGGGAATTCAGGAAGATTCATTGAAAATCTTGGACGTTTTATTGGAAGCATACCCAGCTCTTCTTACAGACCGCAGCGTTATATTGTTGAAGAATTTTGTAGAGCTTATTTCTCACCAGCAACTCTCAAAAAGACTGAAAAGCAGGGACAAACTTTCCTGGATGCTCTCTGTTAACCCGAATCGCAGAGTAACTTCTCAGCAGTGGAGGTTGAATGTACTTACCAGGCTCAAGAAGTTTCTCCAAGCAGTGGTAGATGGATCCAGTGGTACGGAGGATGAAGGGCTTCAAGAGCAGAAGGACAACTCTCATTCTGTGAGGAACCCAATATGTATTAGTTGGAAGCTCCATGCAAATAATCAGCAACATATACAACTGTTTGAAAGTGGTGGCTTACGACCAAGGAGCCAAGGGCAAGGTTGGTGGGCGCTGGAAGTAAAGAAGCAGGCAGGATGGCCTTTAGTGGTGTGCTGAACCCCTGCTGGTCTCCTCTTTCCTCCTTCACCGATCACTTGTGTTCTCATGCCTTGATGATAACAAAAATCGCATCAGCCTGGATTGGCTATTGCTGCTGCTTTT---CTTCCTGGAGGGGTCTGGTGGCTTCCTCAGTCAAGGGG-AAGCAAGTTCCCTGTGGAACTGGGATGACTCCTTGCTGGCATCTTCAATTCCTGCTGAGCATGTCCCTTATCCCCCTAATATGAGTTGGCACGACATATGCAGGAATTCACTCAGGTTCACATGAGAATGATGGCTCAGAGTTTTCAGAATATCAGTGTTACTGCTGCAAATCCAGTACCCTTCATCAATGGCCTACCCTTTGAGCCTGCCCTCTTCTCACACGTGTCACATGCTGCATATAACTGCAATCCAGAAGTGGAAAACTTCAAGGAAACCATTCAGCAGTTGGAAGGTCGCCTGGTAAGACAGGATCACCAAATCAGGGAACTCATCGCTAAAATGGAGACTCAGAACACTCACATGGCAGAGCTCAGACGTACTATCCGAAATTTGGAGGGAAAGATTACGGAAATGGAGGCCCAGCAATGTAACGGTATTTATATCTGGAAGATTGAGAACTTCAGCGGACTGCAGAAAGCCCAGGA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Amytornis_dorotheae_2a 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Malurus_coronatus_1a 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Malurus_elegans_1a 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Malurus_grayi_1a 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Malurus_splendens_1a 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Stipiturus_malachurus_1a 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