#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 11, 2026; 7:07 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Voigt K., Cigelnik E., & O'donnell K. 1999. Phylogeny and PCR identification of clinically important Zygomycetes based on nuclear rDNA sequence data. Journal of Clinical Microbiology, 37(12): 3957-3964. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S570] [ The following blocks are input data for analysis step 821 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep821; DIMENSIONS NTAX=42; TAXLABELS Absidia_coerulea_NRRL_1315 Absidia_coerulea_NRRL_A_9483 Absidia_corymbifera_NRRL_28639 Absidia_corymbifera_NRRL_2982 Absidia_glauca Absidia_repens Apophysomyces_elegans_NRRL_2232 Apophysomyces_elegans_NRRL_2863 Basidiobolus_haptosporus Basidiobolus_ranarum Chlamydoabsidia_padenii Cokeromyces_recurvatus Conidiobolus_coronatus_NRRL_191 Conidiobolus_coronatus_NRRL_286 Conidiobolus_incongruus Conidiobolus_lamprauges Cunninghamella_bertholletiae Cunninghamella_elegans Cunninghamella_polymorpha Echinosporangium_transversale Micromucor_ramannianus Mortierella_polycephala Mortierella_wolfii Mucor_amphibiorum Mucor_circinelloides Mucor_hiemalis Mucor_indicus Mucor_mucedo Mucor_racemosus Mucor_ramosissimus Rhizomucor_miehei Rhizomucor_pusillus_NRRL_2543 Rhizomucor_pusillus_NRRL_28626 Rhizomucor_variabilis Rhizopus_azygosporus Rhizopus_microsporus_var_chinen Rhizopus_microsporus_var_micros Rhizopus_microsporus_var_rhizop Rhizopus_oryzae Rhizopus_stolonifer Saksenaea_vasiformis Syncephalastrum_racemosum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2192] TITLE 18S_rDNA; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep821; DIMENSIONS NCHAR=1881; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Absidia_coerulea_NRRL_1315 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Apophysomyces_elegans_NRRL_2863 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Basidiobolus_haptosporus 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Basidiobolus_ranarum 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Chlamydoabsidia_padenii 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Cokeromyces_recurvatus CAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAATAAATTT-ATATTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATGATCTACGTGACAAAATCT-TTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCACAAAA-GCC-TGG------C---AACGGGTGCACTTATTAGGTACAAAACCAATATTGCGTCTTTGGCCCAATTTTTATGGTGAATCATAATAATTAAGCGGATCG-ATGGCTTCGTGCCGGCGACG-GTCCACTCGATTTTCTGCCCTATCATGGTTGA-GATTGTAAGGTAGTGGCTTACAATGCCTACAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGCAGGGCCTTTA-AGGTCTT-GCAATTGGAATGAGTACAATTTAA-TCCCTTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAACGTCCGTAGTCAAATTTTAGTCTTTTAGGTGATGCGGTTTGGCCTTCATTGGTCAAGCAAGTTGTTACC--AAG-ACTCTGGCT-GATTTCTGCTTTTTCTC-TCTTCGGGGGGGAAAGAGTAGATAATTAAGCC-------------------------------------ATTACCATGAGCAAATCAGAGTGTTTAAA-CAGGCTTTTTAAGCTTGATTGTGTTAGCATGGAATAATGAAATATGACTTTATGTACTATTTT-GTTGGTTTTTAAGAAC--AAAGTAATGATGAATAGAAACGGTTGGGGGCATTTGTATTTGGTCGCTAGAGGTGAAATTCTTGGATTGACCGAAGACAAACTACTGCGAAAGCATTTGACCCAGGACGTTTTCATTGATCAAGGTCTAAAGTTAAGGGATCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTTAACCACAAACTATGCCGACTAGAGATTGGGCTTGTTTA-TTAT-GACTA-----GCTCAGCATCTTA-GCGAAAGTAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGGACGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAAGCTCTTTCTAGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGT-CTTAGTTCGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTTATTCTACTAAATAGACAGGCCAACTTTTTAGTTGG-TT-CA-TGGAATTTTATTCCAT-CTGGCTTCTTAGAGAGACTATC-GGCTTGAAGCCGAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTT-CTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGAAGTCAGCGAGTT--------------AT-AA---CCTTGGCCGGAAGGTCTGGGTAAA-TTTT-GAAACTTCATCGTGCTGGGGATAGAGCTTTGTAATTATCGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTT-ATAGTGAGCATATGGGAAGCTCGCTTCGGACGACG-CAAGTTGTCTTTAGCGGGA---CGAACT----------ATGG---------CAAACTAAGCTATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACA Conidiobolus_coronatus_NRRL_191 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Conidiobolus_incongruus CAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGCAA-TTT-ATACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAATTTCAGTGAAAGT-----TTACCAAATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAATTGA-GTCTCG-CCGA---A-AGGGAGATGCATTTATTAGATGAAA--CCAAC--------AA------------TTTGGTGAATCATAGTAACTTTGCTGATCGCATGGCCTTGTGCTGGCGATAATTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTAT---CGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGATAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGCGCCTGAGAAATGGCGACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACAGGGAGGTAGTGACAAAAAATAACAATACAGGGCCACT---GGTCTT-GTAATTGGAATGAGTACAATGTAAACACCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAACGCCCGTAGTCGAACTTCAGGA----AGACTGAATTCATTTTCAGTCGAC-CTTTAAATCTACCTGGCCC-AGG--TTATTAATTTAAT---------------TTGGGTCGCTAAAGGTA-------GAACGT---------------------------------------TTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGTTTAT-A----TGAATACATTAGCATGGAATAATGGAATAAGTCAGCAG--CTTATTT-CGTTGGTTT---AGA-GTTGCAAACATGATGAATAGGGATGGTTGGGGCCATTAGTATTTAATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTAAAGACTAACTTATGCGAAAGCATTTGG-CAAATCCATTCCCATTGATCAAGGACGAAAGTTGGGGGATCGAAGATGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACTATAAACTATGCCGACCAGGGATTGGATCAGATT-A--TAC---TG-----ATTCAGCACCTTGAGTGAAAACAGAGTCTTTAGGTTCTGGGGGGAGTATATT-CGCAAGTATGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGTCCAGACATGAGAAGGATTGACAGTTTGATAGTGCTTTCTTGATTTTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTTAACCT-TTAAATAGTC-------TTTTGTA----------------ATA-CGTTAC?AA-AAACTTCTTAAAGGGACTGTT-GGTGTTTAACCAACGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTT-CTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGAAGGCAGCGAGTTAAATGGATCTTTTATCCAGTTTCCTGCTCCGGAAGGAGTGGGTAATCTTGT--AAACTTCATCGTGCTGGGGATAATCCATTGCAATTATTGGATTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGTACGTGTCATCAGCACGTGCTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTT--TAGTGAGGCCTCTGGATTTGAAGCTTGGAGTTGG-CAACGATTCTAAGCTTTA---GAGAAAT-----------TGGT--------CAAACTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACA Conidiobolus_lamprauges 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Cunninghamella_bertholletiae 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Micromucor_ramannianus 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Mortierella_polycephala 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Mortierella_wolfii 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Mucor_amphibiorum 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Mucor_circinelloides 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Mucor_hiemalis 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Mucor_ramosissimus 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Rhizomucor_miehei 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Rhizomucor_variabilis 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Rhizopus_azygosporus 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TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr3500] END;