#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 08, 2026; 12:23 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hafner M., Sudman P., Villablanca F., Spradling T., Demastes J., & Nadler S. 1994. Disparate rates of molecular evolution in cospeciating hosts and parasites. Science, 265: 1087-90. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S572] [ The following blocks are input data for analysis step 823 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep823; DIMENSIONS NTAX=17; TAXLABELS Geomydoecus_actuosi Geomydoecus_chapini Geomydoecus_cherriei Geomydoecus_costaricensis Geomydoecus_ewingi Geomydoecus_expansus Geomydoecus_geomydis Geomydoecus_nadleri Geomydoecus_oklahomens Geomydoecus_panamensis Geomydoecus_perotensis Geomydoecus_setzeri Geomydoecus_texanus Geomydoecus_thomomyus Geomydoecus_trichopi Thomomydoecus_barbarae Thomomydoecus_minor ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2194] TITLE COI; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep823; DIMENSIONS NCHAR=379; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Geomydoecus_actuosi CGAAATGTATATTTTAATCCTACCAGGATTCGGTTTAATTTCTCACATTATTTTATTAGAAAGAGGAAAAAAACAGGTTTTTGGCACTGTTGGTATAATTTATGCGATAATGGCTATTGGTGTATTGGGATTTGTGGTTTGAGCTCACCACATATTCACTGTTGGAATAGATGTAGATAGTCGAGCGTATTTTACTAGGGCAACTATAGTAATTGCGGTACCTACTGGGGTAAAAGTTTTTAGGTGACTTGCTACCTCCTTTGGAAGTCGAATTTCCTTCTCCGTTTCGATAATATGGGCCTTCGGCTTTATTTTTTTGTTTACTATTGGCGGTATAACGGGCTTAGTGTTGGCAAATTCATGTGTAGACGTCGTCTTC Geomydoecus_chapini CGAGGTATATATTTTAATTTTACCAGGTTTCGGTTTAATTTCCCAGATTATTCTATTCGAAAGGGGAAAGAAACAGGTTTTTGGAACTGTCGGGATGATTTATGCTATAATGGCTATTGGTATTCTTGGGTTTGTCGTTTGGGCGCATCACATGTTTACCGTAGGGATGGATGTTGACAGTCGAGCATATTTTACTAGAGCTACAATGGTTATTGCTGTTCCGACAGGAGTAAAAGTATTCAGTTGATTAGCTACTTCATTTGGAAGTCGGATTTCGTATTCCGTTTCTATTTTGTGAACCCTTGGGTTCGTATTTTTATTTACGGTTGGAGGAATGACAGGATTAGTTTTGGCTAATTCGTGTGTTGATGTGGTCCTA Geomydoecus_cherriei AGAAGTCTATATTTTGATTTTACCCGGATTTGGTTTAATTTCCCAAATTATTTTATTCGAAAGAGGGAAAAAGCAGGTTTTTGGTACCGTGGGTATAATTTATGCGATAATAGCAATCGGAGTATTGGGTTTCGTGGTATGGGCTCATCACATGTTTACCGTTGGAATGGATGTAGATAGCCGAGCATACTTCACAAGAGCAACGATAGTAATTGCTGTTCCAACCGGGGTGAAAGTATTTAGATGATTAGCCACTTCGTTCGGGAGTCGAGTCTCTTATTCCGTCTCTATACTTTGAACTTTGGGGTTCGTATTCTTGTTTACGGTAGGAGGAATAACAGGGTTAGTTTTAGCAAACTCATGTGTGGACGTAGTCCTA Geomydoecus_costaricensis 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AGAAGTTTACATTTTGATTCTTCCAGAATTCGGTTTAATTTCCCATATTATTTTACTTGAGAGAGGAAAGAAACAAGTTTTTGGGACTGTTGGGATGATTTATGCGATAATGGCGATTGGAGTTTTAGGGTTTGTAGTCTGAGCTCACCACATATTTACTGTTGGGATAGATGTTGACAGTCGGGCATATTTTACCAGGGCAACCATGGTGATTGCAGTGCCCACTGGGGTTAAAGTTTTTAGGTGGTTGGCTACTTCTTTTGGTAGTCGACTTTCGTATTCAATTTCGACACTTTGGGCATTTGGGTTTATTTTCTTATTTACTATTAGGGGTACGACTGGATTAGTTTTGGCGAATTCGTGTGTAGATGTAGTCCTA Geomydoecus_geomydis AGAAGTATACATTCTAATCCTTCCGGAATTTGGTTTAATTTCTCATATTGTATTATTGGAAAGGGGAAAAAAGCAGGTTTTTGGTACTGTTGGGATAATTTACGCAATAATAGCAATTGGAGTTCTTGGTTTTGTAGTCTGAGCTCACCACATATTTACTGTAGGAATGGATGTTGATAGCCGGGCATATTTTACTAGGGCGACTATGGTAATTGCGGTACCTACTGGGGTAAAGGTTTTTAGATGATTGGCCACTTCTTTCGGGAGGCGAATTTCATACTCCGTTTCGACACTGTGGGCATTTGGTTTCATTTTCCTATTTACTATTGGTGGGATAACAGGTTTAGTTTTAGCAAATTCATGTGTGGATGTGGTCCTA Geomydoecus_nadleri 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CGAAGTTTATATTTTGATTTTACCAGGTTTTGGGTTAATTTCTCAAATTATTTTATTCGAGAGAGGAAAGAAGCAAGTTTTTGGAACTGTAGGAATAATCTATGCTATAATAGCAATTGGAGTTCTTGGATTCGTGGTTTGAGCTCATCACATATTCACGGTTGGGATGGATGTGGATAGCCGGGCATATTTTACAAGAGCTACGATAGTAATTGCTGTTCCTACTGGAGTTAAAGTGTTTAGATGATTAGCCACTTCTTTTGGAAGCCGAATTTCATATTCGGTTTCGATACTTTGAACGCTGGGATTCGTATTCCTATTCACCGTGGGAGGGATGACAGGATTGGTGTTAGCTAATTCGTGCGTAGATGTGGTCCTA Geomydoecus_texanus TGAAGTTTATATTTTGATCCTTCCAGGATTTGGATTAATCTCCCACATTGTCCTGTTAGAAAGAGGAAAGAAACAAGTCTTTGGTACTGTCGGAATAATTTATGCAATAATAGCAATTGGGGTTCTTGGTTTTGTAGTTTGAGCCCACCACATGTTTACTGTAGGGATAGATGTTGATAGCCGGGCATATTTTACTAGAGCTACCATGGTAATTGCGGTACCTACTGGAGTAAAGGTCTTTAGGTGGCTTGCTACTTCTTTTGGAAGTCGGATTTCGTATTCCGTATCAATACTATGGTCATTTGGTTTTATTTTTTTATTTACTATCGGCGGCATGACAGGATTAGTTTTAGCAAATTCTCGAGTAGACGTGGTACTA Geomydoecus_thomomyus TGAAGTGTATATTTTAATTCTACCAGGATTTGGTTTGATTTCTCGAATCATTTTGTTCGAAAGAGCAAAAAAACAAGTGTTCGGTACAGTAGGCATAATTTATGCTATAACTGCTATTGGAGTATTGGGGTTTGTGGTGTGAGCCCATCACATGTTTACTGTTGGTATAGATGTAGATAGTCGAGCATACTTTACTAGAGCAACTATAGTTATTGCTGTCCCTACTGGGGTAAAAGTATTTAGATGGCTTGCTACATCTTTTGGCAGCCGAGTGTCTTACTCTGTCTCTCTTTTATGATCTTCTGGATTTGTATTCCTATTTACTGTAGGAGGAATAACTGGTTTGGTATTAGCTAATTCATGTGTAGATGTAATTTTA Geomydoecus_trichopi AGAGGTTTATATTCTTATTCTTCCTGGATTTGGGTTAATTTCCCACATTATTTTATTTGAGAGAGGAAAAAAGCAGGTTTTCGGCACTATTGGGATAATTTATGCTATAATGGCTATTGGTGTTCTTGGCTTTGTAGTTTGAGCCCACCATATGTTTACTGTGGGGATAGATGTGGATAGACGAGCTTATTTTACTAGAGCAACAATGGTTATTGCTGTTCCTACTGGAGTAAAAGTTTTTAGTTGGTTAGCTACTTCTTTTGGTGGACGAATGTCGTACTCAGCTTCTATAATGTGGGCAGTAGGGTTTGTGTTTTTATTCACCGTTGGGGGTATGACTGGGTTGGTTTTGGCAAATTCTTGTGTAGATGTAGTTCTC Thomomydoecus_barbarae CGAAGTTTATATTTTAATCTTACCAGGGTTTGGTTTAATTTCTCAAATCATTTTGTATGAAAGAGGAAAGAAGCAGGTTTTTGGGACTATTGGGATGATTTATGCTATAATGGCGATTGGGGTATTAGGTTTTGTGGTTTGAGCACATCATATATTCACCGTTGGGATAGATGTCGATAGTCGGGCATATTTTACCAGGGCTACTATGGTAATTGCTGTTCCTACTGGAGTAAAAGTGTTTAGTTGATTAGCTACATCTTTTGGTAGACGAATATCATATTCTATTTCCATGATATGAGCAATTGGGTTTGTATTTTTATTTACCGTTGGAGGGATGACTGGTTTAGTTTTAGCAAATTCTTGTGTGGATGTGGTTCTT Thomomydoecus_minor CGAGGTTTATATTTTGATCCTTCCTGGATTTGGATTAATCTCCCAGATTATCCTTTATGAAAGAGGAAAGAAACAGGTTTTTGGGACAATTGGAATGATTTACGCTATAATAGCAATTGGGGTATTAAGGTTTGTGGTTTGGGCCCATCACATATTTACTGTAGGCATAGATGTAGATAGACGGGCTTATTTCACCAGAGCCACTATGGTAATTGCTGTTCCAACTGGGGTAAAGGTATTCAGGTGATTGGCCACATCTTTTGGGAGACGGATGTCATATTCTATTTCTATACTCTGGGCAATCGGGTTTGTATTTTTATTCACTGTCGGGGGGATGACTGGTTTAGTTTTGGCAAATTCTTGTGTGGATGTGGTTTTA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = COI) = 1: 2-377\3, 2: 3-378\3, 3: 1-379\3; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = COI) = 1: 2-377\3, 2: 3-378\3, 3: 1-379\3; END; [ The following blocks are output data for analysis step 823 ] BEGIN TREES; TITLE Tb5600; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep823; TREE Fig._2A = [&R] ((((Geomydoecus_chapini,((Geomydoecus_setzeri,Geomydoecus_panamensis),(Geomydoecus_cherriei,Geomydoecus_costaricensis))),((Geomydoecus_expansus,(((Geomydoecus_ewingi,Geomydoecus_texanus),Geomydoecus_actuosi),(Geomydoecus_geomydis,Geomydoecus_oklahomens))),(Geomydoecus_nadleri,Geomydoecus_trichopi))),(Geomydoecus_thomomyus,Geomydoecus_perotensis))Geomydoecus,(Thomomydoecus_barbarae,Thomomydoecus_minor)Thomomydoecus); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr3503] END;