#NEXUS
[!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file.


Generated on April 10, 2026; 14:09 GMT

TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Bašilova J., & Rakauskas R. 2012. Phylogenetic relationships of Dysaphis pyri (Boyer
de Fonscolombe) and Dysaphis reaumuri (Mordvilko) (Hemiptera, Sternorrhyncha:
Aphididae): COI and EF-1α evidence. Organisms Diversity & Evolution, .

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12354]

[ The following blocks are input data for analysis step 8575 ]
BEGIN TAXA;
        TITLE  TaxaForAnalysisStep8575;
        DIMENSIONS NTAX=26;
        TAXLABELS
            Aphis_gossypii_AY227082
            Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569
            Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568
            Dysaphis_plantaginea_EU701636
            Dysaphis_plantaginea_JF521490
            Dysaphis_plantaginea_JN546627
            Dysaphis_plantaginea_JN546628
            Dysaphis_plantaginea_JN546629
            'Dysaphis pyri CZ 05-43'
            'Dysaphis pyri FR J11-05'
            'Dysaphis pyri IT 09-20'
            'Dysaphis pyri LT 04-107'
            'Dysaphis pyri LT 04-133'
            'Dysaphis pyri LT 04-25'
            'Dysaphis pyri LT 05-104'
            'Dysaphis pyri LT 11-43'
            'Dysaphis pyri LT 11-58'
            'Dysaphis pyri TR 11-32'
            'Dysaphis pyri TR 11-33'
            'Dysaphis pyri TR 11-37'
            'Dysaphis reaumuri GE J11-12'
            'Dysaphis reaumuri GE J11-13'
            'Dysaphis reaumuri GE J11-23'
            'Dysaphis reaumuri TR 11-23'
            Dysaphis_rumecicola_GU978795
            Toxoptera_citricida_EF591607
            ;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M12517]

	TITLE 'Dysaphis-COI';
	LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep8575;
	DIMENSIONS NCHAR=217;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                                    10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       ]
[                                                     .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .       ]
Aphis_gossypii_AY227082                      TTTTAGGAGCAATTAATTTCATCTGTACTATCTTAAATATAATACCTAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTATTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATATTATTAATTTTATCCTTACCTGTATTAGCTGGTGCTATTACTATATTATTAACAGATCGAAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGTGGGGGAGACCCTATTCT
Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569      TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACTATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCCATTTTATTAATTTTATCCTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATACTATTAACTGACCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGGATCCTAATTTT
Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568     TTTTAGGAGCAATTAATTTCATTTGTACTATTTTAAACATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTTCCTTGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACAATACTATTAACTGACCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGGATCCCAATTTT
Dysaphis_plantaginea_EU701636                TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT
Dysaphis_plantaginea_JF521490                TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT
Dysaphis_plantaginea_JN546627                TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT
Dysaphis_plantaginea_JN546628                TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT
Dysaphis_plantaginea_JN546629                TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT
'Dysaphis pyri CZ 05-43'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri FR J11-05'                    TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri IT 09-20'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri LT 04-107'                    TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri LT 04-133'                    TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri LT 04-25'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri LT 05-104'                    TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri LT 11-43'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri LT 11-58'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri TR 11-32'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri TR 11-33'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis pyri TR 11-37'                     TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT
'Dysaphis reaumuri GE J11-12'                TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT
'Dysaphis reaumuri GE J11-13'                TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT
'Dysaphis reaumuri GE J11-23'                TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT
'Dysaphis reaumuri TR 11-23'                 TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT
Dysaphis_rumecicola_GU978795                 TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACTATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATCCCACTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCCATTTTATTAATTCTATCCTTACCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACAATACTATTAACTGACCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCTATCTT
Toxoptera_citricida_EF591607                 TTCTAGGAGCAATTAATTTCATTTGTACAATTATAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATCCCTTTATTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCAGTTTTAGCCGGTGCTATTACCATACTATTAACTGATCGAAATCTTAATACTTCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGGGGAGACCCTATTCT
;
END;

[ The following blocks are output data for analysis step 8575 ]
BEGIN TREES;
      TITLE 'Dysaphis-COI-MP';
      LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep8575;
      TREE MPT = [&R] (Aphis_gossypii_AY227082,Toxoptera_citricida_EF591607,(('Dysaphis pyri IT 09-20',('Dysaphis pyri FR J11-05',((((('Dysaphis pyri LT 11-58','Dysaphis pyri TR 11-37')0.0301,('Dysaphis pyri LT 05-104','Dysaphis pyri LT 04-25')0.0265)0.0048,('Dysaphis pyri LT 11-43','Dysaphis pyri TR 11-32')0.0263)0.0026,('Dysaphis pyri TR 11-33','Dysaphis pyri CZ 05-43')0.0203)0.0064,('Dysaphis pyri LT 04-133','Dysaphis pyri LT 04-107')0.0247)0.0629)0.6608)0.9987,(((Dysaphis_plantaginea_JN546627,((Dysaphis_plantaginea_JN546629,Dysaphis_plantaginea_JN546628)0.1055,(Dysaphis_plantaginea_EU701636,Dysaphis_plantaginea_JF521490)0.1067)0.1849)0.8618,('Dysaphis reaumuri GE J11-12',('Dysaphis reaumuri GE J11-13',('Dysaphis reaumuri GE J11-23','Dysaphis reaumuri TR 11-23')0.1682)0.2332)0.8328)0.3562,(Dysaphis_rumecicola_GU978795,(Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568,Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569)0.7606)0.3799)0.3096)0.7768);
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr52553]


END;