#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 20, 2025; 11:37 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Flook P., Klee S., & Rowell C. 1999. Combined molecular phylogenetic analysis of the Orthoptera (Arthropoda, Insecta) and implications for their higher systematics. Systematic Biology, 48(2): 233-253. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S602] [ The following blocks are input data for analysis step 881 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep881; DIMENSIONS NTAX=35; TAXLABELS Acheta_domesticus Acrida_turrita Agathemera_crassa Batrachideidae_sp. Batrachotetrix_sp. 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GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Acheta_domesticus TGTCTTCTTGTTTTGATTTGAAGTCGTGCCTGCCCACTGAGGA--------GTTGAATGGCCGCGGTATATTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGGAGGCTGGAATGAATGGTTTGACGAAATAATAACTGTCTCGGAGTGATGT---ATTGAATTTTACTTTTGAGTTAAAAGGCTCAAA-TGAAAATAGGGGACGAGAAGACCCTATAGATCTTA-ATAT-TATTAT-ATTGA-------AATTTATGTTTGGTGGT-------TTTTTATA--GATGTTAATATATT---GTATTTGGTT-GGGGTGACAAGAGAATAA-TTTAACTTCTTTATGTTTAA-----CTATGATGATTGGTTAA-----TTGATCCTGTATT---ATGGAATGAAGATAAAGATACCTTAGGGATAACAGCGTAATGTTATTG-GAGAGTTCATATTGATAATAAAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGAAGATTGTT-AAGTGCAGGAGCT--TAATATATTGGTCTGTTCGACCATTGAATTCTT Acrida_turrita ??????????????????????????GGCCTGCTCACTGATATAA------TTTAAAGAGCCGCGGTAATTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTCTTAATTTGAGGCTGGAATGAATGGTTTGACGAAAAATCAACTGTCTCTTATTAAATT---TTTGAATTTAACTTTTGAGTTAAAAGGCTTAAA-TTTATCTTTAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTA-ACAA-ATTA---ATTTA-------TTATTTA--TTTTGGTGAAT-----ATTTTAT--TTAATTTTTTAAT----TTGTTTTGTT-GGGGTGACGTGAAGAATA-AATAAACTCTTCATTATAAATT---CATTAATTTATGTTTTT-----ATGATCCATAATTT--ATGATCATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTGTTTTT-GAGAGCTCTTATCGACAAAGCAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGATTATTTTT-GGGTGCAGTAGCT--CAATAATTAGGTCTGTTCGACCTTTAATTTCTT Agathemera_crassa ????????????????????????????????????AAATGATT-------TTTTAATGGCCGCGGTATATTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTTTATTAATTGTGGACTTGTATGAATGGTTGGACGAAATATTTACTGTCTCATATTAAATAT--ATTGAATTTAATTTTTTTGTTAAAAAGCTTAAA-TTTTTTTGGAGGACGAGAAGACCCTATAGATCTTT-ATTA-TTTTT--ATTT--------TTAAATGTTTTGT-----------TTCTTTTT--ATTAATTTTTAAA----ATTTTTTGTT-GGGGTGACACGGAGATTT-AATTAACTCTTTTATATAATGTA--CAATGGTTTTTGTTTA------TTGGATCTTTTATT--ATTGTTTATTAGATTAGATACCTTAGGGATAACAGCGTAATTCTTTTT-GAGAGTTCATATCGACAATGGAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGAATAATTTTGGG-TGTAGATGTT--CAAAA???????????????????????????? Batrachideidae_sp. ?????????????????????????????????????????????????????TGAAGAGCCGCGGTAATTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATAATTAGTTTATTAATTGTAAACTTGTATGAATGGTTTGACGAGGTTAATGCTGTCTCTATTTTATTT---ATATAATTTAACTTTTTAGTTAAAAGGCTAAGA-TTTTATTTTGGGACGATAAGACCCTTTAGAGCTTT-ATTT-TT-----ATTT--------CTTTATA--TATTTTTGGAA----ATTTTTTA--TTTATTGTTTAATA---AAATTTTGTT-GGGGTGATGTGAATAATT-AATAAACTTTTCATTTATTTTT---CATTGATTTATGTATTTT----TTGATCCATTATTA--TTGATTTTAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTATTTTT-GAGAGTTCATATTGACAAAATAGATTGCAACCTCCATGTTGGATTAATATTAATTTTTCGGTGTAACTGCTGATTAGTATTTGGTCTGTTCGACCATTAAATTCTT Batrachotetrix_sp. ATGGCTTTTGATTATAATTTAAGTCTGGCCTGCTCACTGACTTGT------TTTGAAGAGCCGCGGTATTTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGGAGGCTGGAATGAATGGTTTGACGAGGAGTTGGCTGTCTCTATTTAATAT---TTAGAATTTAACTTTTGAGTTAAAAGGCTCAAA-TTTTTCTTTAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTT-ATAT-TTT----ATTTT-------TATATAG--TCTCCTGTTAG-----TTTTTCT--ATATTTAATATATG---ATATTTTGTT-GGGGTGACATGAAGAATA-ACTAAACTCTTCATTATTAAAT---CATTGATTTATGTTGTT-----TTGATCCATAATTT--ATGATCATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTGTTTTG-GAGAGCTCAAATCGATAAAGCAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGAAAAATGCT-GGGTGCAGTAGCT--TAGTAAT-AGGCTGT?????????????????? Bullacris_membracioides ?????????????????????????TGCCCTGCTCACTGATTT--------TTTGAAGAGCCGCGGTATTATGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGGGGACTTGAATGAATGGGTTGACGAAGAATTAACTGTCTTTACTTAATAT---CTAAAATTTAACTTTTGAGTTAAAAGGCTTAAA-TCTTTCTTTGGGACGATAAGACCCTATAGAGCTTA-ATAT--------ATTTTT------TGTAATT--ATTTTTGTTGA-----TTTTCTT--TTTATTTAATAATT---ATATTTCATT-GGGGTGATGTGAAGAATT-AATAAACTTTTCATTTTAAAAT---CATAAATTAATGTGTTT-----TTGATCCATAATTT--ATGATCATAAGAT-AAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATAAATTTT-GAGAGTTCTTATTAACAAATTGGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGAAATATTTT-AGGTGTAGAGGCT--TAAAGA??????????????????????????? Ceuthophilus_carlsbadensis TGTCTTTTTGAAAATAATATAAAGTCTGGCCTGCCCACTGAAAGA------TTTAAAGGGCTGCAGTATTTTGACTGTACAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTTGGGACTGGAATGAATGGTTTAACGAAGTATTAACTGTCTTAATGTAATAA---TTAGAATTTAATTTTTGAGTTAAAAAGCTTAAA-TGATATTGGAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTT-ATA--G------AT----------AAAATATATTCTTTTTTTAGTAG-TTTATAAAGTTTATATTAAAAT-----TTATTTTATT-GGGGTGATATGAAGAATA-AATTAACTCTTTATAATTTGAAC--CATTAATGTATGAATAG-----TTGATCCATTTATA--ATGATTATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTTCGTTT-GAGAGTTCAAATCGACAAGGAAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGGAAAAAATT-GGGTGTAGAAGTT--CAAATTTTAAGTCTGTTCGACTTTTAAATCCTT Comicus_campestris TGTCTTTAAGATTAAAATTTAAAGTCTGGCCTGCTCTATGATGCA------ATTAAATGGCCGCGGTAATTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTTGTCTTTTAAATGAGGTCTGGAATGAAAGGTTTGACGAGAGACTAACTGTCTCAGAATTAATT---TTAGAATTTAAAATTTTAGTAAGAATGCTGAAA-TGAGTTTATGGGACGAGAAGACCCTATAGAGTTTT-ATA--A------ATT---------AAAAGTTATCG-------------TTAGTTATT-AAGTAATTGTTAAT---TTATTTTGTT-GGGAGGACATGAAGATAT--TATAGCTCTTTATTGTAAATAT--CATTAATTTATGTTTAA-----TTGATCCAGTATTA--TTGATTATAAGATTAAACTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTTCGTTA-AAAAGTTCATATTTACAATGGAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGGATTACTAATAAATGCAGAAGTT-TAGTTAAGTGAGTCTGTTCGACTTTTAAATCCTT Cylindraustralia_kochii ????????????????????????????????CTCACTGAATG--------GTTAAAGAGCCGCGGTATTTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTTGTCTTTTAATTGAAGAATGGTATGAATGGTTAAACGAGAAGTAGACTGTTTCATAAGAAAAA---TTAGAATTTAACTTTTAAGTGAAAAGGCTTAAA-TATTAATTAGGGACGAGAAGACCCTATAGAGTTTA-ATTA-ATA----AT----------TATACAA--TAAGATTTAGTCA--ATAATATT--TATTGTATAATTAT---TGGTTTAGTT-GGGGCGACTAAAGGAATA-GATAAACTCCTTTATTTTATTATT-CATGAATGAATGATAT------TTGATCCAAAAGTT--TTGATTATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTACATTT-AAGAGTTCATATCGACAATGTAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGATAAATTAA-TGGTGTAGAAG????????????????????????????????????? Cyphoderris_monstrosus ??????????????????????GTCTGGCCTGCCCACTGAATCTAA-----TTTGAAGGGCCGCGGTATTTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGAAGGCTGGAATGAATGGTTTAACGAGGTATTAACTGTCTCATACTAATTT---ATGGAATTTAACTTTTGAGTTAAAAGGCTTAAA-TTTTGTTATAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTA-AAGT-TTAG---ATTT--------AATTTTCTTTTGGGTG--------TTTATTAA--ATTTATGAGTATA----AATTTTAGTT-GGGGTGACGTAAAGATTA-ATATAACTCTTTTTATATTTAAA--CATTAATTTATGGTTTA-----TTGATCCATCAATG--GTGATTAAAAGATAAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATGTTTTTT-GAGAGTTCTTATCGACGAAAAAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGGTATATAATTGGGTGTAGAAGTT--AA??????????????????????????????? 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Stiphra_robusta ??????????????????????????GACTCGCTCAATGAAA---------ATTAAATAGCCGCGGTATTTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGAAGGCTGGAATGAATGGTTTAACGAGGAGTTGACTGTCTCTAATTAATAT---ATTGAATTTAACTTTTGAGTGAGAAGGCTTAAA-TTTAATTTAAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTT-TTT---------ATTTTGTTAA--TATTGAT--TAAGACTATT------TTTTTAT--TTTGTTTAATGATTT--GTATTTTGTT-GGGGTGACAGTGAAGATA-AATAAACCTTTATTTTTTTTTT---CATTATTGTATGTTTT------TTGATCCCGAATTT--TGGAACATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTATTTTT-GAGAGTTCTTATTAACAAAATAGATTGCAACCTCGATGTTGGATTAAGATAAAGATT-AGGTGCAATGGCT--TAATTGTTT???????????????????????? Systella_rafflesi CTTTTAGATATAATAATTAAAGGTCGTGCCTGCTCACTGATTAATAG----ATTTAAGGGCCGCAGTAATTTGACTGTGCAAAGGT-AGCATAATCAATAGTTTTTTAATTGGAAACTGGGATGAATGGTTTGACGAAAAATTAACTGTCTCTTAATAATAT---TTAGAATTTAACTTTTAAGTTAAAAGGCTTAAAATTTTTCTTTAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTG-AT----------ATTTTT------TATATAATTTTGTTTTTACTTTT--ATTTTT------ATATTAAAAAA---ATATTTTGTT-GGGGTGATATAAAGGATA-TTTAAACTCTTTATTATTTATT---CATTGATTAATGTTTTT-----TTGATCTAAAATTT--TTGATTATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTATTTTT-GAGAGTTCATATTGACAAAGTAGTTTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGATTAATATTTGGTGTAGAGGCTA---AAAAATTAGGTCTGTTCGACCTTTAAATTCTT Systella_sp. TTTTAGATTGAAATAATTCTAAGTCGTGCCTGCTCACTGATTAATAT----ATTTAAGAGCCGCAGTAATTTGACTGTGCAAAGGT-AGCATAATCAATAGTTTTTTAATTGAAAACTGGAATGAATGGTTTGACGAGAAATTGACTGTCTCTTAATAACAT---TTAGAATTTAACTTTTAAGTTAAAAGGCTTAAATATTTTCCATAGGACGATAAGACCCTATAGAGCTTT-AT----------ATTTTAAT----TATATAAA-ATTTTATGTTT-----ACTTTAT--TTTTATATTTTATAT--ATATTTTGTT-GGGGTGATATAAAGAATA-TTTAAACTCTTTATTATTATTA---CATTAATTTATGTTTTTT----TTGATCCAAAATTT--TTGATTATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTATTTTT-GAGAGTTCTTATTGACAAAATAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGATAAAATTTTGGTGTAGAGGCTA---AAAAATTAGGTCTGTTCGACCTTTAAATTCTT Tanaocerus_koebeli GTCTTTTTAATTATAATATGAAGTCTGGCCTGCTCACTGATTA--------ATTAAAGAGCCGCGGTATTTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGAAGGCTGGTATGAATGGTTTGACGAGGAATTAACTGTCTCTTAGTAATTG---ATGGAATTTAACTTTTGAGTTAGAAGGCTCAAA-TGTTTTTTGAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTA--TAT-ATTT---AT----------TGTAATG--TATTTTTGGA------TTGTTTT--TTTACATGCATTAGTT-ATATTTTGTT-GGGGTGACATAAAGGATA-ATTAAACTCTTTATTTTGTAAT---CATTAATTAATGATTAA-----TTGATCCATAATTT--ATGATCATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTAATTTT-GAGAGTTCATATTGACAAATTAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGATGAATTCT-GGGTGCAGAAGCC--CAGTGATTAGGTCTGTTCGACCTTTAAATTCTT Tettigonia_viridissima ??????????????????????????????TGCCCACTGATGATTT-----ATTAAAGGGCCGCGGTATTTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGAAGGCTGGTATGAATGGTTTGACGAGATATAAGCTGTCTCTGTATAATAAT--ATATAATTTAACTTTTGAGTCAAAAGGCTTAAA-TAAATATAAAAGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTT-ATAT-ATAATT-GTAACT------TGTATTATTTGGAGG---------TATTGTAA--ATAAGTATGAATTAT--ATGTTTTGTT-GGGGTGACATGAAGATAT-AATAAACTCTTTATTATTTAAA---CATTGATTTATGATTAA-----TTGATCCATTATTA--ATGATTATAAGATAAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTTTTTTT-GAGAGTTCTTATCGACAAGAAAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGGAATATGACTAGGTGTAGAAGTT--TA??????????????????????????????? Xyronotus_aztecus GTCTTTTTGATAATAATTTAAAGTCTGACCTGCTCACTGATGTTA------ATTAAAGAGCCGCGGTAATTTGACCGTGCAAAGGT-AGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGAAGACTGGAATGAATGGTTTGACGAGGAATTAACTGTCTCTGTATAAAAT---ATATAATTTAACATTTAAGTTAAAAGGCTTAAA-TTTATCTCAAGGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTA-ATATATTTTTTTATATT-------TGTATATGATAGTTTTGAAAT----ATATTTT-----------AT-A-TT-ATATTTTGTT-GGGGTGACATAAGGAATA-AATAAACTCTTTATTATTAAAT---CATTAATTTATGTTTAA-----TTGATCCAAAATTT--TTGATCATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTGTTTTT-GAGAGTTCTTATCTACAAAGCAGATTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGAAAAATTTT-TGGTGTAGAAGTCA-AAAT-ATTAGGTCTGTTCGACCTTTAAATTCTT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 16S) = N: 1-558; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 16S) = N: 1-558; END; [ The following blocks are output data for analysis step 881 ] BEGIN TREES; TITLE Tb5658; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep881; TREE Fig._1a_16S = [&R] (((((((((((((Acrida_turrita,Gomphocerippus_rufus),Oedipoda_coerulescens),(Glauia_terrea,Batrachotetrix_sp.)),Tanaocerus_koebeli,(Rhainopomma_montanum,((Physemacris_variolosa,Bullacris_membracioides),Pneumora_inanis))),(Xyronotus_aztecus,(Systella_rafflesi,Systella_sp.))),(Stiphra_robusta,Prosarthria_teretrirostris)),(Prosphena_scudderi,Pyrgomorpha_conica)),((Euschmidtia_cruciformis,Homeomastax_dentata),(Neotridactylus_australis,Cylindraustralia_kochii))),(Batrachideidae_sp.,Paratettix_cucullatus)),((Tettigonia_viridissima,Ruspolia_nitidula),((Hemideina_crassidens,(Comicus_campestris,Ceuthophilus_carlsbadensis)),(Agathemera_crassa,Phyllium_bioculatum)))),Cyphoderris_monstrosus),Grylloblatta_rothi),Gromphodorhina_portentosa); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr3562] END;