#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on October 10, 2025; 21:35 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Mcdade L., Daniel T., Kiel C., & Borg A.J. 2012. Phylogenetic placement, delimitation, and relationships among genera of the enigmatic Nelsonioideae (Lamiales: Acanthaceae). Taxon, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12503] [ The following blocks are input data for analysis step 8826 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep8826; DIMENSIONS NTAX=69; TAXLABELS Agalinis_heterophylla Anisosepalum_lewallei_Fig2 Antirrhinum_majus Aphelandra_leonardii Avicennia_marina Barleria_lupulina Bartsia_alpina Buddleja_davidii Byblis_gigantea Byblis_liniflora Callicarpa_dichotoma Callitriche_verna Ceratotheca_triloba Cyclocheilon_somalense Elytraria_imbricata_Fig2 Euphrasia_stricta Exarata_chocoensis Fraxinus_chinensis Genlisea_hispidula Globularia_cordifolia Gynocraterium_guianense Halleria_lucida Justicia_caudata Lamium_purpureum Lantana_camara Leucophyllum_frutescens Lindenbergia_sp. Lindernia_brevidens Martynia_annua_Fig2 Mazus_spicatus Melampyrum_lineare Mendoncia_phytocrenoides Mimulus_aurantiacus Myoporum_parvifolium Nelsonia_canescens Neuracanthus_africanus Olea_europea Paliavana_prasinata Paulownia_tomentosa Pedicularis_foliosa Petrea_volubilis Phlogacanthus_thyrsiflorus Phryma_leptostachya Pinguicula_agnata Pinguicula_grandiflora Plantago_lanceolata Proboscidea_fragrans Rehmannia_chingii Ruellia_californica Schlegelia_parviflora Scrophularia_arguta Sesamum_indicum_Fig.2 Stachytarpheta_dichotoma Staurogyne_trinitensis Stemodiopsis_buchananii Stilbe_albiflora Synapsis_ilicifolia Syringa_vulgaris Tabebuia_striata_ Tecoma_stans Tecomaria_capensis Thomandersia_hensii Torenia_baillonii Uncarina_grandidieri Utricularia_striatula Utricularia_vulgaris Verbena_bracteata Verbena_urticifolia Veronica_persica ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M11966] TITLE Nelsonioideae_and_Lamiales_Fig_2; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep8826; DIMENSIONS NCHAR=3791; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Agalinis_heterophylla ---CAGTCCTCT-GCTCTACCAGCT-GAGCTATCCC-GACC-ATTCCCAATGTAGCA------TCCTA---------------TGCTA-ATTTTATTA--------------------GATGACTGGGG-----TCTATGTCAATT------------AAAGGGAC------------AAGGGG----AAATTT-CAAAGGTTT-CTCCAAGTCCTGT-------------------AATTTCTTGGATCTTCAAAAA------GACGA-CTTTCG-AAG------------TTTCAGTA----GGAGTAATGTT------ATTGATTGTGAAGCATTC----------------------------------------------------AAATAGGAATT-----CCTTGC-------TTAATTT-----------------GGATGTGTATT------CTATAT------------CAC-----------ATG-----TGATAAGAGAAGGG-----CATTT-AT----------------------------------------GCCACAATA-------------CGTTTGTCAAAAA-----GAATCAGA-------------ATAAGGAATTTGGAACCGCT------------------------------------------------------------------------------TTGGG-------------GGGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTTAAAAGTCGACGGATTTTCC----------------------------------------------------TTTTACTATAAATTTCATTGTTGCCGG-TATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCGATTAATC--AGATCTTTT--AAAAAAGATCTA-TCGGACTAT-----GGAGTGAA-TGA-TTTGAT-------GAATGAA------------------TATTCTTT---------ATGGAAGAAA------TTCATACCAATTCTTCCACTTTT-------CGTATT------------------CAAAAATACAGA-------TACAGATTTGGGCCATCATT-----AATCAATCATTTTATTTT------GATATAGTATTCAATA-------------GATAC-GTTTATCC-TTCATCCTTTC-------------TGA----AGTTT-------------CATTCCTCT-----ATCAGC------GCAATCAACTCCATTTGTT-----AGAACAGCTTCCATTGAGTCTCTGCACCTATCCTTTTTTT--------CGTTTTC-------TGAACC------TTTGTTTTGAGAAAACA-----------------GGATTTGGCTCAGGATTGCCCTTTTTTCTTAATTCCAGGGTTTCTCTGAATTTGAAAGTTATCACTTAGTAGGTTTCCATACCAAGGCTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTTTTTTTTTT----ATTATACCTTTCGTTCCACTTCCAGTTCCTATGCTAATAGGGGTGGGACTTCTTCTTTTTCCCACAGCCACAAAAAATCTTCGTCGTATGTGGGCCTTTCCGAGTATTTTATTGTTAAGTATAGTCATGATTTTTTCAGCTAATCTATCTATTCAGCAAATAAATAGCAGTTCTAGCTATCAATATGTATGGTCTTGGACCCTCGATAATGATTTTTCTTTCGAATTTGGCTACTTGATTGATCCACTTACTTCTATTATGTTACTGTTAATCACTACTGTTGGAATTATGGTTCTTATTTATAGTGATAATTATATGGCCCACGATCAAGGATACTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTCAGTACTTCCATGTTGGGATTAGTGACTAGTTCAAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTGGTTGGAATGTGTTCCTATCTATTAATAGGGTTTTGGTTTACACGACCTCCTGCTGCAAATGCTTGTCAAAAAGCATTTGTAACTAATCGTGTAGGAGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTCTAGGTTTATATTGGATAACAGGTAGTTTTGAATTTCGGGATTTATTCGAAATATTCAATAACTTGATTTATAATCAT------GAAGTAAATTCGCCTTTTGTTACTTTGTGTGCTACTCTATTATTTGCCGGTGCAGTCGCCAAATCTGCACAATTTCCCCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGACCCACTCCTATTTCGGCTCTGATACATGCTGCTACCATGGTAGCGGCAGGGGTTTTTCTTGTAGCTCGCCTTCTTCCTCTTTTCATAGTTATACCCTATATAATGAATTTTATCTCGTTGATAGGAATAATCACAGTCTTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAAAAGGGTTTAGCCTATTCGACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTGGGAATGGGGTCTTACCGAAGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTATTTTTAGGGTCTGGATGCGTTATTCATTCGATGGAAACAGTTGTTGGCTATTCTCCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTTTTATGGGCGGTTTAACAAAGTATGTACCAATTACCAAAACCTCTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCGCCCCTTGCTTGTTTTTGGTCAAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTATATTCGCCGATTTTCGCAATACTAGCTTGGTCCACAGCAGGATTAACCGCCTTTTATATGTTTCGGATCTATTTACTTACTTTTGAAGGGCATTTAAACGTTTATTTTCAAAATTACACTGGAAATCAAAATATCTCTTTGTATTCGATATCTCTGTGGGGTAAGAGGTGTTCGA------AACGAA---TTAATACAAATTTTGATTTA---------------TTAAGAATGAA------------------TAATAATGAAAGTTCTTCTTTTTTTT------CCAAAAAGA------CATATCGAAGTGATGAGAATGTAC------------------GAAAAAATAATGGCCGACAGCCTTTTATTAATATT------------GTTCATCAGGATAA---TAAAAATAATAAAAAACCTTTTTCTTATCCTTATGAATCGGACAATACTATGTTATTTCCGTTACTTGTATTAGTCCTATTTACGTTGTTTGGTGGATTTCTAGGAATTCCT---------TTTAATCAAGA------AAGAACAGG------TTTGGATATATTATCCAAATGGTTAGCTCCGTCTATTAACCTTTTACATCAAAAGTTAAGGGATTCCGTAGATTGGTAT------GAGTTTTTGAAAGATGCAACTTTTTCAGTAAGTATAGCTTATTTTGGAATATTTTTGGCGTCCTTTTTATATAAACCCATTTATTCTTCTTTCAAAAATTTCGACTTAATTAATTCATTTCT------TAAAATAGGCCCGAAGCGGAGCTATTGGGACAAAATTATAAACGCTCTATATGATTGGTCATATAATCGTGCTTATATAGATGCTTTTTATACAATATCTTTTACTGGGTCGA-TACGCGGATTGGCTCAATTAACTCATTTTTTTGATAGACGAATAATTGATGGAATTGCGAATGGGGTTGGTATCATGAGTTTCTTTGTATTTTTT Anisosepalum_lewallei_Fig2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?T?GGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTTAAAAGTCGACGGATTTTCC----------------------------------------------------TCTTACTATAAATTTCATTGTTGCCGG-TATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTGTTCTCGTCCGATTAATC--AGTTCTTTA-----AAAGATCCA-TCGGACTGT-----GGAGTGAA-TGA-TTTGAT-------GAATGAA-------------TATTTGATTCTTT--CTTCAATGCGGAATCAA------TTCACACCAATTCTTCCATTTTT-------CATAG-------------------AAAAAACACAGA-------TAGAGATTCGGGCCATCATT---------AATCATTT------------GATATAGTATTCAATA-------------GATAC-GTTTATCC-TTCATCCTTTC-------------TGA----AGTTTCGATGGAAA----GATTCCTCT-----ACCAAC------GCAATCAACTCCATTTGTT-----AGAACAGCTTCCATTGAGTCT{CT}TGCACCTATCCTTTTTTTTTT-----CGTTTTC-------GGAACC------TTTGTTTTGAGAAAACG-----------------GGATTTGGCTCAGGATTGCCCTTTTTTATTAATTCCGGGGTTTCTCTGAATTTGAAAGTTATCAC??AGT???????????????????????????????TTT???????TTTTT?T??????TT---------------------------------------------------------TTTCTTTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGTCTATGGGCTTTTCCGAGTATTTTATTGTTAAGTATAGTCATGATTTTTTCAACTAATCTATCTATTGAGCAAATAAATAATAGTTCTATCTATCAATATGTATGGTCTTGGACCCTTGATAATGATTTTTCTTTAGAATTCGGCTACTTGATCGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATGTTAATCACTACTGTTGGAATTATGGTTCTTATTTATAGTGATAATTATATGGCTCACGATCAAGGATACTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTCAGTACTTCCATGTTGGGATTAGTTATTAGTTCGAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTGGTTGGAATGTGTTCTTATCTATTAATAGGATTTTGGTTCACACGACCTCCTGCGGCAAATGCTTGTCAAAAAGCGTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGTTTTTATTGGATAACGGGAAGTTTTGAATTTAGAGATTTATTCGAAATATTCAATAATTTGGTTTCTAAT---------CAAGTCAACTATGCATTTGTTACTTTGTGTGCTCTTCTATTATTTGCCGGTGCAGTTGCTAAATCGGCACAATTTCCTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGGCCCACTCCGATTTCGGCTCTTATACATGCTGCTACTATGGTAGCAGCGGGGATTTTTCTTGTAGCTCGTCTTCTTCCTCTTTTCATACTTATACCTTCTACAATGAATTTCATTTCGTTGATAGGCATAATCACAGTATTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGAGGGGTTTAGCCTATTCCACAA?GTCTCAA?TGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGAATGGGGTCTTGTCGAAGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTATTTTTAGGATCTGGATCCGTTATTCATTCAATGGAAACTGTTGTTGGCTATTCTCCGGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAAACATGTACCGATTACCAAAACCTCTTTTCTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCGCCT?TT?CTT???TTTGGTCAAAAGATGA--------------------------------------------------------------------------TTTATATGTTTCGGATCTATTTACTTACTTTTGAAGGACATTTAAACGTTCATTTTCAAAATTACATCGGCAACCAAAATAACTTTTTATATTCAATATCTCTCTGGGGTAAAGGGTGTTCAA------AAAGAA---TTAAGAAGAATTTTCGTTTA---------------TTAAGAATGAA------------------TAATAATCAAAGTTATTCTTTTTTTT------CGAAAAAAA------CATATCGAAGTGATGAGAATGTAA------------------GAAAAAGAAATAGGGGACAAACCTTTATTAATATT------------GTTCGTTTTGATAA---TAAAAAG---------TCTTTTTCTTATCCTTATGAATCGGACAACACTATGTTATTGTCTTTACTTGTATTAGTCCTCTTTACTTTGTTTGTTGGATCTTTAGGAATTCCT---------TTTAATCAAGA------AAGAACACA------TTTGGATATATTATCCAAATGGTTAGCTCCGTCTATTAACCTTTTACATCAAAAGTCAAAGGATTCCACGGATTGGTAT------GAATTTTTGAAAGATGCCATTTTTTCAGTTAGTATAGCTTATTTCGGAATATGTTTAGCGTCCTTTTTATATAAACCCATTTATTCCTCTTTCAAAAATTTTGACTTAATTAATTCATTTGT------TAAAACAGGTCCGAAGAGAAGACGTTGGGACAAAATGATAAACGTCCTATACGATTGGTCATATAATCGTGCTTATATGGATGCTTTTTATACAACATCTTTTACTAGGTCGA-TAAGAGGGTTGGCTGAATTAACTCATTTTTTTGATAGACGAGTAATTGATGGAATTACAAA----------------------------GTTTTT 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Byblis_gigantea 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Byblis_liniflora 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Callicarpa_dichotoma 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Cyclocheilon_somalense 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Elytraria_imbricata_Fig2 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Euphrasia_stricta 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Exarata_chocoensis 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Fraxinus_chinensis 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Genlisea_hispidula 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Globularia_cordifolia 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Mendoncia_phytocrenoides 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Paulownia_tomentosa 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Pinguicula_agnata 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Pinguicula_grandiflora 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Plantago_lanceolata 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Schlegelia_parviflora 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Scrophularia_arguta TTTCAGTCCTCT-GCTCTACCAGCT-GAGCTATCCC-GACC-ATTCCCAATGTAGCA------TCCCA---------------TTCTC-ATTTTATTA--------------------GATTACTGGAG-----TCTATGTCAATT------------AAAGAGAC------------AAGGGGGG----ATTA-CAACGTTTT-CTCCAAGTCCTGT-------------------AATTTCTTGGATCTTCAAAAA------GACGA-CTTTGT-AAG------------TTTCAGTAAGTATGAGTAATGCT------ATTGATTGTGCATGATTC----------------------------------------------------AAATAGGGATT-----CCTTGC-------TTAATTT-----------------GGATGTCTATT------CTATAT------------CAT-----------ATG-----TGATAAAAGAAATT-----CATTT-AC----------------------------------------GCCCAAATA-------------CGTTTGTAAAA-------GAATCAA---------AAAGATAAAGGAATTTGAAACCCCTAACA-------------------AAAAAGGGGGATAGGATAAATA--------TTTTGGGAGTCAAA----TAGGCTTTTTTT-------------GGGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTTAAAAGTCGACGGATTTTCC----------------------------------------------------TCTTACTATAAATTTCATTGTTGCCGG-TATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCGATTAATC--AGTTCTTTA-----AAAGAACTA-TCAGACTAT-----GGAGTGAA-TGA-TTTGAT-------GAATGAATATTT--------TATTTGATTCTTT--CTTCAATGTGGAATAAA------TTCACATCAATTTTTCTATTTTT-------CATAT------------------AAAAAAATAAAGA-------TAAAGATTCGGGCCATCATT---------AATCATTT------------GATATAGTATTCAATA-------------GATAC-GTTTATCC-GTCACCCTTTC-------------TGA----AGTTTCGATGGAAA----GATTTCTCT-----ACCAAC------GCAGTCAACTCCATTTGTT-----AGAACAGCTTCCATTGAGTCTCTGCACCTATCCTTTTT----------CGCCTTC-------TGAACC------TTTGTTTTGAGAAAACA-----------------GGATTTGGCTCAGGATTGCCCATTTTT-TTAATTCCGGGGTTTCTCTGAATTTGAAAGTTATCACTTAGTAGGTTTCCATACCAAGGCTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTGGATGATACCCTTCCTTCCACTTCCAGTTCCTATGTTAATAGGAGTGGGACTTCTTCTTTTTCCGACAGCAACAAAAAAACTTCGTCGTATGTGGGCTTTTCCGAGTATTTTATTGTTAAGTATAGTCATGATTTTTTCAATTAATCTGTCTATTCAGCAAATAAATAGCAATTTTATCTATCAATATGTATGGTCTTGGACGCTCGATAATGATTTTTCTTTAGAATTCGGCTACTTGATAGATCCGCTTACTTCTATTATGTTAATGTTAATCACTACTGTTGGAATTATGGTTCTTATTTATAGTGATAATTATATGGCTCACGATCAAGGATACTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTTAGTACTTCCATGTTAGGATTAGTTACTAGTTCTAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTGGTTGGAATGTGTTCCTATCTATTAATAGGGTTTTGGTTCACACGACCTCCTGCAGCAAATGCTTGCCAAAAGGCATTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTCTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTATTGGATAACTGGGAGTTTTGAATTTCGGGATTTATTCGAAATATTCAATAACTTGATTTATAATAAT------GAAGTAAATTCTCCATTTGTTACTTTGTGTGCGGCTCTATTATTTGCCGGTGCAGTTGCTAAATCTGCACAATTTCCCCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGACCCACTCCTATTTCGGCTCTTATACA??CTGCTACTATGGT????????GGATTTTTCTTGTAGCTCGCCTTCTTCCTCTTTTTATACTTATACCTTATATAATGAATTTAATCTCGTTGATAGGCATAATCACAGTATTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGAGGGGTTTAGCCTATTCGACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGAATGGGATCTTATAGAAGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTATTTTTAGGGTCTGGATCCGTTATTCATTCAATGGAAACTGTTGTTGGCTATTCTCCGGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTGATGGGCGGTTTAACAAAACATGTACCAATTACCCAAATTTCTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCGCCTCTTGCTTGTTTTTGGTCAAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCGCCGATTTTTGCAATAATAGCTTGGGCGACGGCAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATCTATTTACTTACTTTTGAGGGG?ATTTAAACGTTAATTTTCAAAATTACAGTGGCAGTCAAAATATCCCCTTCTATTCAATATCTCTATGGGGTAAAGGGTGTTCGA------AAAGAA---TTAATAAAAATTTGCGTTTA---------------TTAAGAATGAA------------------TAAGAATGAAAGTTCTTCTTTTTTTT------CGAAAACGA------CCTATCGAAGTGATGGCAATGTAA------------------GAAAAAAAAATAGGGAACGCCCCTTTATTAATATT------------CTTCATTTTGATAA---TAAAAAG---------CCTTATTCCTATCCCTATGAATCAGACAATACTATGTTATTTCCTTTACTTGTATTAGTCCTATTTACTTTGTTTGTTGGAATTTTGGGAATTCCT---------TTTAATCAAGA------AGGAACAGA------TTTGGACATATTATCCAAATGGTTAGCTCCGTCTATCAACCTTTTACATCAAAAGTCGAAGGATTCAGCAGATTGGTAT------GAATTTTTTAAGGATGCCGTTTTTTCAGTCAGTATAGCTTATTTTGGAATATTTATAGCGTCCTTTTTATATAAACCCATTTATTCTTCTTTTAAAAATTTTGACT?AATTAATTTATTTGT------TAAAACAGGTCCGAAGAGAAGACATTGGGACAAACTTCTAAA??????ATATGATTGGTCATA??????????????????????????????????????????????????????????-GTGGCTCAATTAACTCATTTTTTTGATAGACAAGTAATTGATGGAATTACGAATGGGGTTGGTGTTATGAGTTTCTTTGTATTTTTT Sesamum_indicum_Fig.2 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Stachytarpheta_dichotoma ?????????????????????AGCT-GAGCTATCCC-GACC-ATTCCCAACGTAGCA------TCCC----------------TCCTC-ATTTTATTA--------------------GATGACTGGGG-----TCTATGTCAATT------------AAAGGGAC------------AAGGGG------ATTA-CAAAG-TTT-CTCCAAGTCCTGT-------------------AATTTCTTGGATCTTCAAAAA------GACGA-CTTTCT-AAG------------TTTCAGTA----TGAGTAATGCT------ATTGATTGGGAATCGTTC----------------------------------------------------AAATAGGG-----------TGC-------TTAATTT-----------------GGATGTGTATT------CTATAT------------CAC-----------ATG-----TGATAAGAGAAAGC-----CATTT-AC----------------------------------------GCCCCAATA-------------CGTTTGTCAAA-------CAATCAGA---------AAGATAAAGGAATTTGGAACCGCTAACG------------------AAAACAAGGGGATAGGATAAGGG--------TTTTGGGAGTCAAA----TAGGCTTTTTT--------------GGGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTTTAAAGTCGACGGATTTTCC----------------------------------------------------TCTTACTATAAATTTCATTGTTGCCGG-TATTGGCATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCAATTAATC--AGTTCTTTA-----AAAGATCTA-TCGGACTAT-----GGAGTGAA-TGA-TTTGAT-------GAAGGAA-------------TATTCGATTTTTT--CTTCAATGTGGAATCAA------TTCACACCAATTCTTCCATTTTT-------CATAT------------------AAAAAAATACAGA-------TACAGATTCGGGCCATCATT---------AATCATTT------------GATATAGTATTCAATA-------------GATAC-GTTTATCC-TTCATCTTTTC-------------TGA----AGTTTCGATGGAAA----GATTCCTCT-----ACCAAC------GCAGTCAACTCCATTTGTT-----AGAACAGCTTCCATTGAGTCTCTGCACCTATCCCTTTTTGT-------CGTTTTC-------TGAACC------TTTGTTTTGAGAAAACG-----------------GGATTTGGCTCAGGATTGCCCATTTTTATTAATTCCGGGGTTTCTCTGAATTTGAAAGTTATCACTTAGTAGGTTTCCATACCAAGGCTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTGGATCATACCTTTCGTTCCACTTCCAGTTCCTATGTTAATAGGAGTGGGACTTCTTCTTTTTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGTATGTGGGCTTTGCCGAGTATTTTATTGTTAAGTATAGTCAT{AG}ATTTTTTCA???AATCTGTCTATT???????????TAGCAGTTCTATCTATCAATATGTAGGGTCTTGCACTCTCGATAATG{AC}TTTTTCTTTAGAATTCGGCTACTTGATCGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATGCTAATCACTACTGTTG{GT}{AT}?TT?TGGTTCTT?TTT{AT}T??????????ATATGGCTTACGATCAAGGATACTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTCAGTACTTCTATGTTGGGATTAGTTACTAGTTCGAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTAGTTGGAATGTGTTCCTATCTATTAATAGGGTTTTGGTTCACACGACCTACTGCAGCAAATGCTTGTCAAAAAGCGTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGTTTTTATTGGATAACGGGTAGTTTTGAATTTCGGGATTTATTCGAAATATTCAATAACATGATTTATAGTAAT------GAAGTAAATTCTCCATTTGTTACTTTGTGTGCTGTTCTATTATTTGCCGGTGCAGTTGCTAAATCTGCCCAATTTCCCCTTCATGTATGGTTACCCGATGCTATGGAGGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACGTGCTGCTACTA?GGTA???GCAGGTATTTTTCTTGTAGCTCGCCTTCTTCCTCTTTTCATAGTTATACCTTATATAATGAATTTAATCTCGTTGATAGGCATAATCACAGTATTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGAGGGGTTTAGCCTATTCGACAATGTCTCAACTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGAATGGGATCTTATCGAAGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTATTTTTAGGGTCTGGATCTGTTATTCATTCAATGGAGACTATTGTTGGCTATTCTCCGGATAAAAGTCAGGATATGGTTCTTATGGGCGGTTTAACAAAACATGTACCGATTACCAAAACCTCTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCGCCTCTTGCTTGTTTTTGGTCAAAAGATGAAATTCTTAACGATAGTTGGTCGTATTCGCCGATTTTCGCAATAATAGCTTGGGCCACGGCAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATCTATTTACTTACTTTTGAAGGGCATTTAAACGTTCATTTTCAAAATTACAGCGGCAACCAAAATACCTCTTTATATTCAATATCTCTATGGGGTAAAGGGTGTTCAA------AAAGAA---TTAACAACAATTTTCGTTTA---------------TTAAGAATGAAATTAAGAATGAA------TAATAATAAAAGTTCTTCTTTTTTTT------CGAAAAAGA------CATATCGAAATGATGAGAATGTAA------------------GAAAAAGAGATAGGGGACGGCCTTTTATTAATATT------------GCTCATTTTTATAA---TAAAAAG---------CCTTTTTCCTATCCTTATGAATCGGACAATACTATGTTATTTCCTTTACTTGTATTAGTCCTATTTACTTTGTTTGTTGGATCTCTAGGAATTCCT---------TTTAATCAAGA------AGGAACAGA------TTTTGATATATTATCAAAATGGTTAGCCCCGTCTATTAACCTTTTACATCAAAAGTCCACGGATTCGACGCATTGGGAT------GAATTTTTGAAAGATGCAATTTTTTCAGTCAGCATAGCGTATTTTGGCATATTTCTAGCGTCCTTTTTATATAAACCCA?TTATTCCTCTTTCAAAAATTTTGACTTAATTAATTCATTTGT------TAAAAGAGGTCCGAAGAGAAGCCGTTGGGACAAAAC{GT}CTAAACGTCCTATATGATTGGTCATATAA?CGCGCTTATATAGATGCTTTTTATGCAACATTCTT{AT}ACTGGGGCGA-TAAGAGTATCGGCTCAATTAACGT?????????ATAGACGAATAAT-------------------------------------------TTTTTT Staurogyne_trinitensis 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Synapsis_ilicifolia 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Utricularia_striatula 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Utricularia_vulgaris -------------------------------------GACT-ATTCCCGGCGTAGTA------TCCCA------TACTCAATATACTC-ATTTTATTA------TTTTAGTT------GATGACTGGGT-----TCTATGTCAATT------------AAAGGG-------------AAAGGAGAG----ATTA-CAAATTTTT-CTCCAAGTCCTTT-------------------AATTTCTTTAATCTTCAAAA-------AGACCACTTTTT-CAG------------TTTCAGTA----TTCGTAAAGCT------ATTGATTGTGAATGATTT----------------------------------------------------AAATCGGGATT-----CTTTGC-------TCAATTT-----------------GGATGTGCATT------CTATAT------------CAC-----------ACG-----GGAGAAGAGAAAGT-----C-----------------------------------------------GTCCATCTG-------------CGTTTGTCAAA-------GAATCAG---------AAAAAGAAAGAAATTTTTAACTG------------------------AAAGATAGAGGGTAGGACAAAGA--------TTTTGGGAGTCAAA----TAGACTTGTTT--------------GGGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTCTAAAGTCGACGGATTTTCCGTGGGATAGAGGGACTTGAACCCTCCCGATTTTTAAAGTCAACGGATTTTCCTCTTACTTTAAATTTCATTGTTGTCGG-TATTGACATGTAGAAGGGGACTCTATCTTTATTCTTGTCCGATTGATC--AGTTCTTGA-----AAAGATTTA-TCGGACTCT-----GGAGTGAA-TGA-TTTGAT-------GAATAAA-------------AATTCTATTTTTT--------TTTTCAATGAA------TTCACACCAATTCTTATATTTTTTATTTTTCATATAG----------------AAAAATACATCTA-------TAG--ATTCGGGTCATCGTT---------AATCATTT------------GTTATAGTATTCAATA-------------GATAG-GTTTATCC-TTGACCCTTTC-------------TGA----CGTTTCGGTGGAAA----GATTCCTTTTA----------------CCGTG-CCTCCATTTGCT-----AGAACAGCTTCCATTGAGTCTCTGTACCTATCCCTTTTT---------CGGTTTA-------TGAACC------TTTCTTTTGATAAAAGA----------TAAAACAGGATTTGGCTCAGGATAGCCC-T{CT}TTTTTGAATTCCGGGGTTTCCCTGAATT-GGAAG-----------------------------------GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGATCTGTCTATTCATCAAATCAATAACAGTTCTATCTATCAATATGTATGGTCTTGGACTATAAATAATGATCTTTCTTTAGAGTTTGGCTACTTGATCGATTCACTTACTTCTATTATGTCAATATTGATTACTACTGTTGGGATTCTGGTTCTTATTTACAGTGACAATTATATGTCTCATGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTTAATACTTCAATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCGAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTGGTTGGAATGTGTTCTTATTTATTAATAGGTTTTTGGTTCACACGTCCTATTGCGGCAAATGCTTGTCAAAAAGCGTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTATTGGGAATTTTGGGTCTTTATTGGATAACAGGTAGTTTGGAATTTCGGGATTTGTTTGAAATATTCAATAACTTGATTTCTAATAAT------GAGGTTAATCTTTCATTAGTTACTTTGTGCGCCTTCCTGTTATTTGGCGGTGCAGTTGCTAAGTCTGCCCAATTCCCCCTTCATGTATGGTTACCGGATGCTATGGAGGGACCTACACCTATTTCCGCTCTTATCCACGCTGCTACTATGGTAGCAGCGGGAATTTTTCTTGTAGCTCGCCTTCTTCCTCTTTTCATAGTTATACCTTATATAATGAATTTAATCTCTTTGATAGGCATAATTACAGTATTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGAGGGGTTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGAATGGGGTCTTATCGAAGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTATTTTTAGGGTCTGGATCCGTTATTCATTCAATGGAA?CTATTGTTGGATATTCTCCAGATAAAAGTCAAAATATGGTTCTTATGGGCGGTTTAACAAAACATGTACCAATTACAAAAACCGCTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGCGGTATTCCGCCGCTTGCTTGTTTTTGGTCAAAAGATGAAATTCTTAA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T----- Verbena_bracteata --------------------CAGCT-GAGCTATCCC-GACC-ATTTCCAATGTAGCA------TCCCA---------------TGCTC-ATTTTATTA--------------------GATGACTGGGG-----TCTATGTCAATT------------AAAGGGAC------------AAGGGGG-----ATTA-CAAAG-TTT-CTGTAAGTCCGGT-------------------AATTTCTTGGATCTTCCAAAA------GACGA-CTTTAT-AAG------------TTTCAGTA----TGAGTAATGCT------ATTGATTGGGAATCGTTC----------------------------------------------------AAGTAGGG-----------TGC-------TTAATTT-----------------GGACGTATATT------CTATAT------------CAC-----------ATG-----TGATAAGAGAAAG----------T-AC----------------------------------------GCCCCAAGG-------------CGTTTGTCAAA-------CAATCCGA---------AAGAGAAAGGAATTTGAAACCGCTAACG--------------------AAAAGGGGGATAGGATAAAAA--------GTTTGAGAGGCAAA----TAGGCTTTTTT--------------GGGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTTTAAAGTCGACGGATTTTCC----------------------------------------------------TCTTACAATAAATTTCATTCTTGCCGG-TATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCGATTAATC--AGTTCTTTC-----AAAGATTTA-TCGGACTAT-----GGAGTGAA-TGA-TTTGAT-------CAAGGAA-------------TATTCGATTCTTT--CTTCAATGTGGAATCAA------TTCACACCAATTCTTCCATTTTT-------CATAT------------------CAAAAAATACAGA-------TACA--------CC-TCATT---------AATCATTT------------GATAGAGTATTCAATA-------------GATAC-GTTTATCC-TTCATCCTTTC-------------GGA----AGTTTCGATGGAAA----GATTCCTCT-----ACCCAC------GCAGTCAACTCCATTTGTT-----AGAACAGCTTCCATTGAGTCTCTGCACCTATCCCTCTTTGT-------CGTTTTC-------TGAACC------TTTGTTTTGAGAAAACA-----------------GGATTTGGCTCAGGATTGCCCATTTTTATTAATTCCGGGGTTTCTCTGAATTTGAAAGTTCTCACTTAGTA----------------------TTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Verbena_urticifolia ?????????????????????AGCT-GAGCTATCCC-GACC-ATTCCCAATGTAGCA------TCCCA---------------TGCTC-ATTTTATTA--------------------GATGACTGGGG-----TCTATGTCTATT------------AAAGGGAC------------AAGGGGG-----ATTA-CAAAG-TTT-CTGTAAGTCCGGT-------------------AATTTCTTGGATCTTCCAAAA------GACTA-CTTTCT-AAG------------TTTCAGT-------AG--ATGCT------ATTGATTGGGAATCGTTC----------------------------------------------------AAGTAGGG-----------TGC-------TTAATTT-----------------GGACGTATATT------CTATAT------------CAC-----------ATG-----TGATAAGAGAAAG----------T-AC----------------------------------------GCCCCAAGG-------------CGTTTGTCAAA-------CAATCCGA---------AAGAGAAAGGAATTTGAAACCGCTAACG--------------------AAAAGGGGGATAGGATAAAAA--------GTTTGAGAGGCAAA----TAGGCTTTTTT--------------GGGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTTTAAAGTCGACGGATTTTCC----------------------------------------------------TCTTACAATAAATTTCATTCTTGCCGG-TATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCGTCCGATTAATC--AGTTCTTTC-----AAAGATTTA-TCGGACTAT----GGGAGTGAA-TGA-TTTGAT-------CAAGGAA-------------TATTCGATTCTTT--CTTCAATGTGGAATCAA------TTCACACCAATTCTTCCATTTTT-------CATAT------------------CAAAAAATACAGA-------TACA--------CCATCATT---------AATCATTT------------GATAGAGTATTCAATA-------------GATCC-GTTTATCC-TTCATCCTTTC-------------TGA----AGTTTCGATGGAAA----GATTCCTCT-----ACCCAC------GCAGTCAACTCCATTTGTT-----AGAACAGCTTCCATTGAGTCTCTGCACCTATCCCTTTTTGG-------CGTTTTC-------TGAACC------TTTGTTTTGAGAAACCA-----------------GGATTTGGCTCAGGATTGCCCATTTTTTTTAATTCCGGGGTTTCTCTGAATTTGAAGGTCATCACTTAGTGGGTTTCCATACCAAGGCTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTGTGGATCATACCTTTTGTTCCACTTCCGGTTTCTATGTTAATAGGAGTGGGACTTCTTCTTTTTCCGACAGCAACAAAAAA??TTCGTCGTATGTGGGCTTTTCCGAGTATTTTAGTGTTAAGCATAGTCATGATTTTTTCAACTAACCTTTCTATTCTGCAAATAAATAGCAGTTCTATCTATCAATATGTATGGTCTTGGACCCTCGATAATGATTTTTCTTTAG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATTATATGGCTCACTATCAAGGATACTTGAGATTTTTTGCTTATCTGAGTTTTTT?AGTACTTCTATGTTGGGATTAGTTACTAGTTCGAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTGGTTGGAATGTGTTCCTATCTATTAATAGGGTTTTGGTTCACACGACCTCCTGCGGCAAACGCTTGTCAAAAAGCGTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGTTTTTATTGGATAACAGGTAGTTTTGAATTTCGGGATTTATTCGAAATATTGAATAACTTGATTTATAATAAT------GAAGTCAATTTTCCATTTGTTACTTTATGTGCTGCTCTATTATTTGCCGGTGCAGTTGCTAAATCTGCACAATTTCCCCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGACCCACTCCTATTTCAGCTCTTATACATGCTGCTACTATGG?AGCA?CGGGGATTTTTCTTGTAGCTCGTCTTCTTCCTCTTTTCATACTTATACCTTATATAATGAATTTGATTTCGTTGATAGGCATAATCACAGTATTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGAAGGCTTT???CTATTCGACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGAATGGGGTCTTATCGAAGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTGTTCTTAGGGTCCGGATCTGTTATTCATTCAATGGAAACTCTTGTTGGCTATTCTCCGGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAACAAAACATGTACCGATTACCAAAACTTCTTTTTTATTAGGTACACTTTCGCTTTGTGGTATTCCGCCTCTTGCTTGTTTTTGGTCAAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCGCCAATTTTCGCAATAATCGCTTGGGGTACAGCAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATCTATTTACTTACTTTTGAAGGGCATTTAAACGTTCATTTTCAAAATTACAGTGGAAAGCAAAATACCTCTTTCTATTCAATATCTCTATGGGGTAAGGGGTGTTCAA------AAAGAA---TTAACAAAACTTTTCGTTTA---------------CTAACAATGAA------------------TGATAATGAAAGTTTTTCCTTTGTTT------CCAAAAAGA------CATATC---------AAAACATAA------------------GAAAAAGAAATAGGGGACGGCCTTTTATGAATATT------------GTTCATTTTGATAA---TAAAAAG---------CCTTTTTCCTATCCTTATGAATCGGACAATACTATGTTATTTCCTTTACTTGTATTAGTCCTATTTACTTTGTTTGTTGGCTCTCTAGGAATTCCT---------TTTAATCAACA------AGGA??AGA------TTTGGATATATTATCCAAATGGTTAGCTCCGTCTATTAACCTTTTACATCAAAACTCAAAGGAGTTGACGGGTTGGTCT------GAATTTTTGAAAGATGCAATTTTTTCAGTCAGCATAGCTTATTTTGGAATAGTTATAGCGTCCTTTTTATATAAGCCCATTTATTCCTCGTTCAAAAATTTCGACTTAATTAATTCATTTGT------TAAAACAGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-----------------------------------------------------------------------------------------------------TTTTTT Veronica_persica ---------------TCTACCAGCT-GAGCTATCCC-GACC-ATTTCCAATGGAACA------TTCCA---------------TCCCC-ATTTTATTA--------------------GATGACTGGGG-----TCTATGTCAATT------------AAAGGTAC------------AACGCGGA----ATTA-GAAAGTTTT-CTCAAAGTACTGTATGTAAATGT---------AATTTCTTGAATCTTCAAAAA------AAAAA----------------------------------------AAGGCT------GTTGATTGTGAATCATTC----------------------------------------------------ACATAAGAATT-----CCTTGC-------TTTATTT-----------------GGATGTGTATT------CTATAT------------CAAT-----ATCACATG-----TGATAAAAGAAAGT-----TATTT-AC----------------------------------------GTCCCAATA-------------CGTTTTAAAA--------GAATGAG---------AAAGATAAAGGAATTTTGAACCGCTAACG----------------AAAAAAGGGGGGGGTAGGATAAATA-----------------TAAAA----TAGGCCTTTTT--------------GGGGATAGAGGGACTT-GAACCCTCACGATTTTTAAATTCGACGGATTTTCC----------------------------------------------------TCTTACTATAAATTTCCTTTTTGTCGG-TATTGACATGTAGAATGGGACTCTATCTTTATTCTCATCCGATTAATC--AGTTCTTTA-----AAAGATCTA-TCAGACTTT-----GGAGTGGG-TGAATTTGAT-------GAA-----------------TATTCGATTCTTT--CTTGAATGTGGAATCAC------TTTACACCAAGTCTTT---------------------------------------------------------------------------TT------------TTTTT----------------TAGTATTCAATA-------------GATCC-GTTTATCC-TTCATCCTTTA-------------TGA----AGTTTCATAAAAAAAAAAGATTCGTCT-----ACTGAC------ACAGTCAACTCCATTTGTT-----AGAACAGCTTCCATCGAGTCTCTGCACCTATCCCCTTTT---------CACTTCC-------TGAAC---------------TAGAAGACA-----------------GGATTTGGCTCAGGATTGCCCATTTTTATTAATTCCGGGGTTTCTCTGAATTTGAAAGTTATCACTTAGTAGGTTTCCATACCAAGG------TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTGTGGATCATACCTT?CGTT?CACTTCCAGTTCCTATGTTAATAGGGGTAGGACTTCTTCTTTTTCCGACAG????AAAAATTTTT?GT{AC}G?ATGT?GTCTTTTCTAAGTATTTTATTGTTAAG?ATAGTCATGATTTTTGCAACTAATCTGTCTATTGAGCAAATAAATAGCAATTCTATCTATCAATATGTCTGGTCTTGGGCTCTCAATAATGATTTTTCTTTAGAATTCGGATACTTGATTGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATGTTAATCACTACTGTTGGAATTTTGGTTCTTATTTATAGTGATAATTATATGGCTCATGATCAAGGCTACTTGAGATTTTTTTCTTATATGAGTTTTTTCAGTACTTCAATGTTAGGATTAGTTACTAGTTCGAATTTGATACAAATTTATATTTTTTGGGAATTGGTTGGAGTCTGTTCCTATTTATTAATAGGTTTTTGGTTTACAAGACCTCTTGCAGCAAATGCTTGTCAAAAGGCATTTGTAACAAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTATAGGTTTTTATTGGGTAACTGGTAGTTTTGAATTTAGGGATTTATTTGAAATATTCAATAACTTGGTTTATAACAAC------CAAGTAAATTATCCCTTTGTTACATTGTGTGCTGCTCTATTATTTGCCGGTGCAGTTGCTAAATCTGCACAATTTCCTCTTCATATATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCAGCTCTTATAC?TGCTGCCACTATGGTGGC{AT}G{CT}GGGGATTTTTCTTGTAGCTCGCCTTCTTCCCCTTTTCGTAGTTATACCTTATATAATGAATATAATTTCGTTGATAGGTATAATAACACTATTATTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGAGAGGTTTAGCCTATTCGACCATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGAATGGGGTCTTATCGAGGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTATTTTTAGGATCCGGATCTGTTATTCATTCAATGGAAACTGTTGTTGGTTATTCTCCGGATAAAAGTCAGAATATGGCTCTTATGGGTGGTTTAACAAAATATGTACCGATTACCAAAACCTCTTTTTTAGTCGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCCCTTGCTTGTTTTTGGTCCAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCGCCTATTTTTGCAATAATCGCTTGGACCACAGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATTTATTTACTTACTTTTGAGGGGCATTTAAATATTTATTTTCAAAATTACAGTGGCAAAAAAAATACAGCTTTGTATTCAATATCTATATGGGGAAAAGGGTGTTCAA------AAATAA---TTAACAAAAATTTTAGTTTA---------------TTAAAAATTCA------------------TAA---------TTCTTCTTTTTTTT------CGAAAAAAA------CATATCGAAGTGATGAGAATCTAA------------------AAAAAATAAATAGAGGACAACCTTTTATCAATATT------------ATTCATTTTGAAAA---TAAAACA---------GTTCATCTCTACCCGCACGAATCGGACAATACTATGTTATTTCCTTTACTTGTATTGGTCCTATTTACTTTGTTTGTTGGAGCTCTAGGAATTCCT---------TTTAATCAAGA------CGGAAGAAA------TATCGATATATTATCGAAATGGTTAGCCCCATCTATTAATCTTTTACATCCAAATTCAAAGGATTTAACGGATTGGCAT------GAATTTTTGAAAGATGCAATTTCTTCCGTTAGTATATCTTATTTAGGAATACTTTTAGCGTCTTTTTTATATAAACCCATTTTTTCTTCTTTCAAGAATTTTGACTTAATTAATTCATTTAT------TAAAATGGGTCCCACAAGAA?CCGTTGGGACTCATTTTTAAATGTCTTGTATAACTGGTCGTATAATCGTGCCTATTTAGATGTTTTATATACAAGAATTTTGACCGGTTCAA-TAAGAGGATTGTCTCAATTAACTCATTTTTTT?ATA-----------------------------------------------------TTTTTT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Nelsonioideae_and_Lamiales_Fig_2) = N: 1-3791; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Nelsonioideae_and_Lamiales_Fig_2) = N: 1-3791; END; [ The following blocks are output data for analysis step 8826 ] BEGIN TREES; TITLE 'Nelsonioid-Lamiales Fig 2'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep8826; TREE Fig._2 = [&R] ((((((((((Ruellia_californica,(Barleria_lupulina,Phlogacanthus_thyrsiflorus)),Neuracanthus_africanus,Justicia_caudata),Aphelandra_leonardii),(Mendoncia_phytocrenoides,Avicennia_marina)),((((Staurogyne_trinitensis,Gynocraterium_guianense),Anisosepalum_lewallei_Fig2),Elytraria_imbricata_Fig2),Nelsonia_canescens)),(((Sesamum_indicum_Fig.2,Ceratotheca_triloba),Uncarina_grandidieri),(Martynia_annua_Fig2,Proboscidea_fragrans)),(((Lantana_camara,(Verbena_bracteata,Verbena_urticifolia)),Stachytarpheta_dichotoma),Petrea_volubilis),(Exarata_chocoensis,(Schlegelia_parviflora,Synapsis_ilicifolia)),((Tecoma_stans,Tecomaria_capensis),Tabebuia_striata_),(((((((((Agalinis_heterophylla,Pedicularis_foliosa),((Bartsia_alpina,Euphrasia_stricta),Melampyrum_lineare)),Cyclocheilon_somalense),Lindenbergia_sp.),Rehmannia_chingii),Paulownia_tomentosa),(Mimulus_aurantiacus,Phryma_leptostachya)),Mazus_spicatus),(Lamium_purpureum,Callicarpa_dichotoma)),(((Utricularia_striatula,Utricularia_vulgaris),Genlisea_hispidula),(Pinguicula_agnata,Pinguicula_grandiflora))),(((Lindernia_brevidens,Torenia_baillonii),Stemodiopsis_buchananii),((Buddleja_davidii,Scrophularia_arguta),(Leucophyllum_frutescens,Myoporum_parvifolium))),(Stilbe_albiflora,Halleria_lucida)),Thomandersia_hensii),(Byblis_liniflora,Byblis_gigantea),(Antirrhinum_majus,(Callitriche_verna,((Plantago_lanceolata,Veronica_persica),Globularia_cordifolia)))),Paliavana_prasinata,(Syringa_vulgaris,(Olea_europea,Fraxinus_chinensis))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr51576] END;