#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on December 28, 2025; 20:49 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Ksepka D., Fordyce R., Ando Y., & Jones C.M. 2012. New fossil penguins (Aves, Sphenisciformes) from the Oligocene of New Zealand reveal the skeletal plan of stem penguins. Journal of Vertebrate Paleontology, 32(2): 235-254. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12832] [ The following blocks are input data for analysis step 9353 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep9353; DIMENSIONS NTAX=71; TAXLABELS Anthropornis_grandis Anthropornis_nordenskjoeldi Anthropornis_sp._UCMP_321023 Aptenodytes_forsteri Aptenodytes_patagonicus Archaeospheniscus__lowei Archaeospheniscus_lopdelli 'Burnside "Palaeudyptes"' Daption_capense Delphinornis_arctowskii Delphinornis_gracilis Delphinornis_larseni Delphinornis_wimani Diomedea_exulans Duntroonornis_parvus Eretiscus_tonnii Eudyptes_chrysocome Eudyptes_chrysolophus Eudyptes_filholi Eudyptes_moseleyi Eudyptes_pachyrhynchus Eudyptes_robustus Eudyptes_schlegeli Eudyptes_sclateri Eudyptula_minor Gavia_immer Gavia_stellata Icadyptes_salasi Inkayacu_paracasensis Kairuku_grebneffi Kairuku_waitaki Macronectes_giganteus Madrynornis_mirandus Marambiornis_exilis Marplesornis_novaezealandiae Megadyptes_antipodes Mesetaornis_polaris Oceanites_oceanicus Oceanodroma_leucorhoa Pachydyptes_ponderosus Pachyptila_desolata Palaeeudyptes_antarcticus Palaeeudyptes_gunnari Palaeeudyptes_klekowskii Palaeospheniscus_bergi Palaeospheniscus_biloculata Palaeospheniscus_patagonicus Paraptenodytes_antarcticus Pelecanoides_urinatrix Perudyptes_devriesi Phoebastria_immutabilis Phoebetria_palpebrata Platydyptes_marplesi Platydyptes_novaezealandiae Procellaria_cinerea Pterodroma_brevirostris Puffinus_gravis Pygoscelis_adeliae Pygoscelis_antarctica Pygoscelis_grandis Pygoscelis_papua Spheniscus_demersus Spheniscus_humboldti Spheniscus_magellanicus Spheniscus_megaramphus Spheniscus_mendiculus Spheniscus_muizoni Spheniscus_urbinai Thalassarche_melanophrys Waimanu_manneringi Waimanu_tuatahi ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M13246] TITLE Kairuku_JVP_DNA; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep9353; DIMENSIONS NCHAR=8145; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Anthropornis_nordenskjoeldi ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Anthropornis_sp._UCMP_321023 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'Burnside "Palaeudyptes"' 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Daption_capense 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Delphinornis_arctowskii ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Delphinornis_gracilis ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Delphinornis_larseni 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Delphinornis_wimani 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Duntroonornis_parvus 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Eudyptes_chrysolophus 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Eudyptes_moseleyi 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Eudyptes_pachyrhynchus 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Eudyptes_robustus 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Eudyptes_schlegeli 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Eudyptes_sclateri 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Gavia_stellata 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Icadyptes_salasi 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Kairuku_waitaki 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Macronectes_giganteus 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Madrynornis_mirandus 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Oceanodroma_leucorhoa 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Pachydyptes_ponderosus 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Pachyptila_desolata 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Palaeeudyptes_antarcticus 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Palaeeudyptes_gunnari 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Palaeeudyptes_klekowskii 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Palaeospheniscus_bergi 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Palaeospheniscus_biloculata 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Palaeospheniscus_patagonicus 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Perudyptes_devriesi 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Phoebastria_immutabilis 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Phoebetria_palpebrata 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Platydyptes_marplesi 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Pygoscelis_antarctica 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Spheniscus_demersus 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Spheniscus_humboldti 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Spheniscus_magellanicus 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Spheniscus_megaramphus ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Spheniscus_mendiculus 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Spheniscus_muizoni 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Spheniscus_urbinai 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Thalassarche_melanophrys ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATGGCCCCCAACCTCCGAAAATCTCACCCTCTACTAAAAATAATCAATAACTCCCTAATCGACCTACCCACTCCCTCAAACATCTCTGCTTGATGGAACTTCGGATCCCTCCTAGGCATCTGCCTAATAACACAAATCCTAACCGGTCTACTACTAGCCATACACTACACAGCAGATACAACTCTAGCCTTCTCATCCATTGCCCATACATGCCGAAACGTACAGTACGGTTGATTAATCCGAAACCTTCACGCAAACGGAGCATCATTCTTCTTCATCTGTATCTACCTTCACATCGGCCGTGGATTCTACTACGGCTCCTACTTGAACAAAGAAACCTGAAACACAGGAATCCTACTCCTACTCACTCTCATAGCAACTGCCTTCGTAGGGTACGTCCTACCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGAGCCACAGTCATTACCAACCTATTCTCAGCTATCCCATATATCGGCCAGACCCTCGTAGAATGAGCTTGAGGAGGATTTTCAGTAGATAACCCCACCTTAACTCGATTCTTCGCCCTACACTTCCTCCTTCCATTCATAATCGCAGGCCTTACCCTCATCCACCTCACCTTCCTTCATGAATCAGGGTCCAACAATCCCCTAGGAATCCTATCAAACTGCGACAAAATTCCCTTCCACCCCTACTTTACCCTAAAAGATATCCTAGGGTTCACACTCATATTCCTACCACTAACAGCCCTAGCCCTATTCTCACCCACCCTGCTAGGCGACCCAGAAAACTTCACTCCAGCAAACCCATTAGTCACCCCTCCCCACATCAAACCAGAATGATATTTCCTATTTGCATACGCCATCCTACGCTCAATCCCCAACAAACTAGGTGGCGTACTGGCCCTGGCTGCATCCGTCCTAGTCCTGTTCCTAAGCCCCCTTCTCCACAAATCCAAACAACGTACACTAACTTTCCGCCCACTTTCCCAACTCCTATTTTGACTCCTAGTCACTAACCTATTCATTCTGACATGAATCGGCAGCCAACCAGTAGAACACCCATTCATTATCATTGGCCAACTAGCCTCTATCACCTACTTCACCATCCTCCTTATCCTCTTCCCCACCATCGCAGCCCTAGAAAACAAGATACTTAACTACTAAGTGACCTTCATTAACCGATGACTGTTTTCAACCAACCATAAAGATATCGGCACACTATACTTAATTTTTGGTGCATGAGCCGGCATAGTCGGAACCGCACTCAGCTTACTTATCCGTGCAGAACTTGGTCAGCCAGGAACCCTCCTGGGAGACGACCAAATCTACAATGTAATCGTCACCGCTCATGCCTTCGTAATAATCTTCTTTATAGTAATACCAATCATGATTGGAGGATTTGGAAACTGACTAGTACCACTTATAATTGGTGCACCTGACATAGCATTTCCACGTATAAATAATATAAGCTTTTGATTACTACCCCCATCCTTCCTCCTCCTACTAGCATCCTCCACAGTAGAAGCAGGAGCAGGTACAGGATGAACTGTGTACCCGCCTCTAGCTGGCAACCTTGCCCACGCAGGGGCTTCAGTAGACCTGGCTATCTTCTCCCTCCACCTAGCAGGTGTTTCATCAATCCTAGGAGCAATTAACTTCATCACAACTGCCATCAATATAAAACCCCCAGCCCTCTCACAATACCAAACCCCCCTATTCGTATGATCCGTACTCATTACTGCCGTCTTACTCTTACTTTCACTACCAGTCCTTGCCGCCGGTATTACCATACTACTAACAGATCGAAACCTAAATACTACATTCTTCGACCCAGCTGGAGGAGGGGACCCAGTCCTATATCAACATCTTTTCTGATTCTTTGGTCACCCAGAAGTCTACATTTTAATTTTACCTGGCTTTGGAATCATCTCGCATGTAGTAACATACTACGCAGGTAAAAAAGAACCGTTCGGCTACATAGGAATAGTATGAGCCATACTCTCCATTGGATTCCTAGGCTTCATCGTATGGGCCCACCATATATTTACAGTAGGAATAGACGTAGACACTCGAGCATACTTCACATCTGCCACTATAATCATTGCCATTCCCACTGGAATCAAAGTCTTCAGCTGGTTAGCCACCCTACACGGAGGAGCCATTAAATGAGATCCACCCATACTATGGGCCCTAGGGTTTATCTTCCTCTTCACCATCGGAGGACTTACAGGTATCGTCCTGGCAAATTCCTCACTAGATATTGCCCTTCATGACACATACTATGTAGTTGCTCACTTCCACTATGTCCTCTCAATAGGGGCTGTCTTCGCTATCCTAGCAGGATTCACCCACTGATTCCCGCTATTCACAGGGTACACCCTACACCCTACATGAGCTAAAGCCCACTTCGGAGTTATATTTACAGGCGTAAACCTAACCTTCTTCCCACAACACTTCCTAGGCTTAGCCGGTATACCACGACGATACTCCGATTACCCAGATGCTTACACCCTATGAAACACCATATCCTCCATCGGCTCACTAATCTCAATAACCGCCGTAATTATACTAATATTCATTATCTGAGAAGCCTTTGTATCAAAACGAAAAGTCCTACAACCAGAACTAATCTCCACTAACATTGAATGAATCCACGGCTGCCCACCCCCATATCACACCTTCGAAGAGCCAGCCTTCGTTCAAGTACAAGAAAGGAAAGACTTAGTCCTAACCTTACCGTTAACTCTTGCTAGACATATACATGCAAGTATCCGCGCCCCAGTGTAAATGCCCTTGA--TTTTCTTACCAAGATGAGAGGAGCGGGCATCAGGCACACACCTA-AA----CGTAGCCCAAGACGCCTTGCTTAGCCACACCCCCATGGGTACTCAGCAGTAATTAACCTTAAGCAATAAGCGAAAGCTTGACTTAGTTATAGCAATACCTTAGGGTTGGTAAATCTTGTGCCAGCCACCGCGGTCACACAAGAGACCCAAGTTAACCGTG-ATACGGCGTAAAGAGTGGTATCATGCTATCAAA-CCAGCTAAGATCAAAATACAGCTGAGCTGTCATAAGCATAAGATGTACGTAAGATCACCCTCAAAACGATCTTAGCACCTAC-GATCAATTAGCCGCCACGAAAGCTAGGGCACAAACTGGGATTAGATACCCCACTATGCCTAGCCCTAAATCTTGATACTTACC-CCACCAAAGTATCCGCCCGAGAACTACGAGCGCAAACGCTTAAAACTCTAAGGACTTGGCGGTGTCCCAAATCCACCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAACCCACGATACACCCAACCGTTCCTTGCC-AAAACAGCCTACATACCGCCGTCGCCAGCCCACCT-CCCCTGAGAGCTCAACAGTGGACACAATAGCCTAC-----CCCGCTAGCAAGACAGGTCAAGGTATAGCCCATGGAGCGGAAGAAATGGGCTACATTTTCTAAAATAGAAAACTTCTACGGAAGGGGGT-ATGAAAC-AACCCCTAGAAGGCGGATTTAGCAGTAAAGCGGGATAATATAA-GCCTCCTTTAAACCGGCCCTGGGACACGTACATACCGCCCGTCACCCTCCTCACAAGCTACAAGTCTCTAATAA-CTAATAC----ACTCATTAGC--CAAAGATGAGGTAAGTCGTAACAACACGTACATACCGCCCGTCACCCTCCTCACAAGCTACAAGTCTCTAATAA-CTAATACAC----TCATTAGC--CAAAGATGAGGTAAGTCGTAACAAGGTAAGTGTACCGGAAGGTGCGCTTAGCATAC?????AGCCAACATCTAGCCCAACCACACTAAATAAAGAACTA----TTAAGAACCCACTTCACTGCTAAACTAAAACATTTTCT--AAACTTAGTATAGGTGATAGAAAAGT--ATACTTGGCGCAATAGAAGTTTGTACCGTAAGGGAAAGATGAAATAATAATGAAAC-CCCAAGCGATAAATAGCAAAGATAAACCCTTGTACCTCTTGCATCATGATTTAGCGAGAACAACCAAGCAAAACGAATTTAAGCTTGCCACCCCGAAACCCAAGCGAGCTACTTGCAAGCAGCTACCAATGAGCGAACCCGTCTCTGTTGCAAAAGAGTGGGATGACTTGCTAGTAGAGGTGAAAAGCCAATCGAGCTGGGTGATAGCTGGTTGCCTGTGAAACGAATCTAAGTTCGCCCTTAAT----------TTTCCTCCATGG-CATTT---AACC-AACCACTTTGTAGCAAATTAAGAGTAATTTAAAGGAGGTACAGCTCCTTT-AAGAAAGAATACAACCTTCCCTAGCGGATAA-CTGCTCAATTATA-CCCCCCCCCCAAACTGTGGGCCCTTAAGCAGCCACCAACAAAGAGTGCGTCAAAGCTCTACACCTAAAAA---TCTTAGAACAGTATGACTCCCTTA-TCACCAACAGGCCAACCTATGATAATAGGAGGATCAATGCTAAAATGAGTAACTAGGGAA-------CCTCCCTCTCAA-GCGCAGGCTTACAT--CCACACATTATTAACAGAC?TACAGCTAATACTACAACCATCAAACAAGATTAAATATTA--CTCACCCTGTTAACCCAACTCAGGAGCGCCCA-CTAGAAAGATTAGAATCTGTAAAAGGAACTAGGCAAGCCTAAGGCCCGACTGTTTACCAAAAACATAGCCTTCAGCCGGCCAAGTATTGAAGGTGATGCCTGCCCAGTGACACA-ACGTTTAACGGCCGCGGTATCCTAACCGTGCGAAGGTAGCGCAATCAATTGTCCCATAAATCGAGACTTGTATGAATGGCTAAACGAGGTCTTAACTGTCTCTTACAGATAATCAGTGAAATTGATCTTCTTGTGCAAAAGCGAGAATACCCACATAAGACGAGAAGACCCTGTGGAACTTAAAAATCAGCGACCACTACCTATG--AATGACAGACCTACTAGGCTT-CA--CCACCCTTAAAACGCTGGCCCGCATTTTTCGGTTGGGGCGACCTTGGAGAAAGACAGATCCTCCAAAAATAAGACCATACTTTCTTAACTGAGAGAGGCCACTCAACGTACTAATAGTGACCAGACCCAATACAA--TTGACCAATGGACCAAGCTACCCCAGGGATAACAGCGCAATCTCCTCCAAGAGCCCATATCGACGAGGAGGTTT-ACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCTAGTGGTGCAGCCGCTACT-AAGGGTTCGTTTGTTCAACGATTAACAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTATGACGAACTTTCCCCAGTACGAAAGGACCGGAAAAGTAGGGCCAATACCTCAAGCACGCCCTCCCTCCTAAACAATGAACCCAACTAAATTATCAAAGGAGCACCCA--------AACACCACTAATCCTAGAAAAGGACT-- Waimanu_manneringi ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Waimanu_tuatahi ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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; END; BEGIN SETS; CHARSET COI (CHARACTERS = Kairuku_JVP_DNA) = 3826-5376; CHARSET RAG (CHARACTERS = Kairuku_JVP_DNA) = 823-2682; CHARSET ST_RAG1 (CHARACTERS = Kairuku_JVP_DNA) = 1-822; CHARSET CYT_B (CHARACTERS = Kairuku_JVP_DNA) = 2683-3825; CHARSET sRNA (CHARACTERS = Kairuku_JVP_DNA) = 5377-8008; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M13247] TITLE Kairuku_JVP_Morphology; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep9353; DIMENSIONS NCHAR=245; FORMAT DATATYPE=Standard SYMBOLS= "0 1 2 3 4 5 6 7" MISSING=? GAP= -; CHARSTATELABELS 1 'Tip of mandibular rhamphotheca, profile in lateral view' / pointed slightly_truncated 'strongly truncated, squared-off' 'truncated but with a rounded margin (e.g., as seen in Procellariiformes) GB1', 2 Longitudinal_grooves_on_the_base_of_the_culmen / absent present_GB2, 3 Longitudinal_grooves_on_the_base_of_latericorn_and_ramicorn / absent present_GB3, 4 'Feathering of maxilla, extent' / totally_unfeathered 'slightly feathered, less than half the length of maxilla' feathering_that_reaches_half_the_length_of_maxilla feathering_surpassing_half_the_length_of_maxilla_Ordered., 5 'Ramicorn, inner groove at tip' / absent present_and_single present_and_double_Ordered._GB5, 6 Orange_or_pink_plate_on_ramicorn / absent present_GB6, 7 'Plates of rhamphotheca, inflated aspect' / absent present_GB7, 8 Gape / not_fleshy margin_narrowly_fleshy margin_markedly_fleshy_Ordered._GB8, 9 Ramicorn_color_pattern / black red pink yellow orange green blue_GB9, 10 'Latericorn and ramicorn, light distal mark' / absent present_GB10, 11 Latericorn_color / black red orange yellow green blue_GB11, 12 Culminicorn_color / black red orange_GB12, 13 'Maxillary and mandibulary unguis, color' / black red yellow green 'blue-gray GB13', 14 'Ramicorn, ultraviolet color spot (reflectance peak)' / absent present_KC14, 15 'Bill of downy chick, color' / dark reddish 'pale, variably horn to yellow' blue_GB14, 16 'Bill of immature, color' / dark bicolored_red_and_black red yellow gray_GB15, 17 External_nares / present absent_GB17, 18 Nostril_tubes / absent_in_adult present_in_adult_GB16, 19 Nostril_tubes / absent_in_hatchling present_in_hatchling_GB16, 20 External_nares / 'well-separated' fused_at_midline_KC19, 21 Iris_color / dark 'reddish-brown' claret_red yellow white silvery_gray_GB18, 22 'Scale-like feathers' / absent present_GB19, 23 Rhachis_of_contour_feathers / cylindrical flat_and_broad_GB20, 24 Rectrices / form_a_functional_fan do_not_form_a_fan_GB21, 25 Remiges / differentiated_from_contour_feathers indistinct_from_contour_feathers_GB22, 26 Apteria / present absent_GB23, 27 Molt_of_contour_feathers / gradual simultaneous_GB24, 28 'Yellow pigmentation in crown feathers (pileum)' / absent present_GB25, 29 'Head plumes (crista pennae)' / absent present_GB26, 30 'Head plumes (crista pennae), aspect' / compact sparse_GB27, 31 'Head plumes (crista pennae), aspect' / directed_dorsally 'directed posteriorly, not drooping' 'directed posteriorly, drooping GB28', 32 'Head plumes (crista pennae), position of origin' / at_base_of_bill_close_to_gape on_the_recess_between_latericorn_and_culminicorn on_forehead_Ordered._GB29, 33 'Head plumes (crista pennae), color' / yellow orange_GB30, 34 'Nape (occiput), crest development' / absent slight distinct_Ordered._GB31, 35 'Periocular area, color' / black white yellow 'bluish-gray GB32', 36 'Fleshy eye-ring' / absent present_GB33, 37 'White eye-ring' / absent present_GB34, 38 'White eyebrow (supercilium)' / absent 'narrow, from postocular area' 'narrow, from preocular area' 'wide, from preocular area Ordered. GB35', 39 'Loreal area (lorum), aspect' / feathered with_spot_of_bare_skin_in_the_recess_between_latericorn_and_culminicorn with_spot_of_bare_skin_contacting_eye bare_skin_extending_to_the_base_of_bill_Ordered._GB36, 40 'Auricular patch (regio auricularis)' / absent present_GB37, 41 Throat_pattern / black white yellow irregularly_streaked with_chinstrap_GB38, 42 Collar / absent at_most_slight_notch_present 'present, diffusely demarcated' 'black, strongly demarked Ordered. GB39', 43 'Breast, golden in color' / absent present_GB40, 44 Dorsum_color / black 'dark bluish-gray' 'light bluish-gray GB41', 45 'Black marginal edge of dorsum between lateral collar and axillary patch, contrasting with dorsum' / absent present_GB42, 46 Black_dots_irregularly_distributed_over_white_belly / absent present_GB43, 47 'Flanks, dark lateral band reaching the breast' / absent present_GB44, 48 Distinct_dark_axillary_patch_of_triangular_shape / absent present_GB45, 49 'Flanks, extent of dorsal dark cover into the leg' / 'incomplete, not reaching tarsus' 'complete, reaching tarsus GB46', 50 Rump / indistinct_in_color_from_dorsum distinct_white_patch_GB47, 51 Tail_length / 'short, the quills barely emerge from the rump' quills_distinctly_developed_GB48, 52 'Outer rectrices, color' / same_as_inner_rectrices lighter_than_inner_rectrices_GB49, 53 White_line_connecting_leading_edge_of_flipper_with_white_belly / absent present_GB50, 54 'Flipper, upper side, light notch at base' / absent present_GB51, 55 'Leading edge of flipper, pattern of upper side' / black white_GB52, 56 'Leading edge of flipper, pattern of underside' / white incompletely_dark completely_dark_and_wide_GB53, 57 'Flipper, underside, dark elbow patch' / absent present_GB54, 58 'Flipper, underside, tip pattern' / immaculate 'patchy, in variable extent' small_circular_dot_present_GB55, 59 'Immature plumage, white eyebrow (supercilium)' / absent or_present_GB56, 60 'Immature plumage, throat pattern (jugulum)' / black or_mottled or_white or_brown_GB57, 61 'Immature plumage, flanks, dark lateral band' / absent or_present_GB58, 62 Chicks_hatch_almost_naked / no yes_GB59, 63 Dominant_color_pattern_of_first_down / pale_gray distinctly_brown 'bicolored, dark above and whitish bellow' 'uniformly blackish gray (GB 60)', 64 Dominant_color_pattern_of_second_down / pale_grey distinctly_brown 'bicolored, dark above and whitish bellow' uniformly_blackish_gray_GB61, 65 'Chick, second down, collar' / absent present_GB62, 66 'Feet, dorsal color' / dark pink orange 'white-flesh' blue_GB63, 67 'Feet, soles distinctly darker than dorsal surface' / absent present_GB64, 68 'Feet, unguis digiti' / flat compressed_BG65, 69 Clutch_size / two_eggs one_egg_GB65, 70 Incubatory_sac / absent present_GB66, 71 Nest / 'no nest, incubation over the feet' 'nest placed underground, either burrowed in sand or inside natural hollow or crack' 'open nest, a shallow depression on bare ground or in midst of vegetation GB67', 72 Size_of_first_egg_relative_to_the_second_egg / similar 'dissimilar, first smaller' 'dissimilar, second smaller GB68', 73 Crèche / absent 'small, 3–6 birds' formed_by_dozens_to_hundreds_of_immatures_GB69, 74 'Eggs, shape' / oval conical spherical_BG71, 75 Ecstatic_display / absent present_BG72, 76 'Premaxilla, tip (rostrum maxillare)' / pointed weakly_hooked strongly_hooked_Ordered._GB0, 77 'Internarial bar (pila supranasalis) shape in cross-section' / suboval 'inverted ‘U’- shaped C75', 78 'Internarial bar (pila supranasalis), profile in lateral view' / dorsal_edge_curves_smoothly_to_tip_of_beak pronounced_step_in_dorsal_edge_KC78, 79 'Basioccipital, subcondylar fossa (fossa subcondylaris)' / absent_or_shallow deep_BG73, 80 'Supraoccipital, paired grooves for the exit of the v. occipitalis externae (sulcus vena occipitalis externae)' / poorly_developed deeply_excavated_BG74, 81 'Frontal, shelf of bone bounding salt-gland fossa (fossa glandulae nasalis) laterally' / absent present_OH10, 82 'Squamosal, temporal fossa (fossa temporalis), size' / 'fossae separated by considerable wide surface (at least the width of the cerebellar prominence)' 'more extensive, fossae meeting or nearly meeting at midline of the skull BG76', 83 'Squamosal, temporal fossa (fossa temporalis), depth of caudal region' / flat shallow greatly_deepened_Ordered._BG77, 84 'Squamosal, development of the opening that transmits the a. ophthalmica externa in the caudoventral area of the temporal fossa (near nuchal crest)' / small_or_vestigial 'well-developed BG78', 85 'Orbit, fonticuli orbitocraneales' / small_or_vestigial broad_and_conspicuous_openings_BG79, 86 Ectethmoid / absent 'weakly developed, widely separate from the lacrimal' 'well developed, contacting or fused to the lacrimal BG80', 87 Lacrimal / unperforated perforated_OH11, 88 Lacrimal / 'reduced, concealed in dorsal view' small_portion_exposed_in_dorsal_view 'well-exposed in dorsal view Ordered. BG82', 89 'Lacrimal, contact with frontal' / suture fusion_KT89, 90 'Lacrimal, dorsal process' / closely_applied_to_the_nasal 'rostral arm of dorsal process separated from the nasal by a slit-like rostrocaudally elongate opening This character originally referenced the frontal, however the actual separation occurs along the nasal-lacrimal contact. BG83', 91 'Nasal cavity, external naris (cavum nasi, apertura nasi ossea), caudal margin' / extended_caudal_to_the_rostral_margin_of_the_hiatus_orbitonasalis not_extended_caudal_to_the_rostral_margin_of_the_hiatus_orbitonasalis_OH5, 92 'Nasal cavity, internarial bar (pila supranasalis)' / 'slender, slightly constricted laterally' wide_throughout_its_length_OH6, 93 'Basitemporal plate (lamina parasphenoidalis), dorsoventral position with respect to the occipital condyle' / ventral_to_the_level_of_the_condyle at_the_level_of_the_condyle 'dorsal to the level of the condyle, surface depressed Ordered. BG86', 94 'Basipterygoid process (proccessus basipterygoideus)' / absent vestigial_or_poorly_developed well_developed_Ordered._BG87, 95 'Eustachian tubes (tuba auditiva)' / open_or_very_little_bony_covering_near_the_caudal_end_of_the_tube mostly_enclosed_by_bone_BG88, 96 'Pterygoid, shape' / elongated slight_lateral_expansion_of_rostral_end 'rostral end broad, pterygoid sub-triangular Ordered. BG89', 97 'Palatine, lamella choanalis' / 'curved and smooth plate, slightly differentiated from main palatine blade' 'ridged, distinct from main blade by a low keel' extended_vertically_ventrally_forming_the_crista_ventralis_Ordered._BG90, 98 Vomer / 'laterally compressed, vertical laminae and free from palatines' horizontally_flattened_laminae_and_ankylosed_with_palatines absent_BG91, 99 'Facial foramen (foramen n. facialis)' / absent present_BG92, 100 'Jugal arch, bar shape in lateral view' / straight slightly_curved ventrally_bowed 'strongly curved, sigmoid shape Ordered. BG93', 101 'Jugal arch, dorsal process' / absent 'present This pointed process is located on the caudal end of the jugal, adjacent to the condyle for articulation with the quadrate. BG94', 102 'Premaxilla, frontal process, naso-premaxillary suture' / visible obliterated_BG95, 103 'Quadrate, relative lengths of otic and orbital processes (processus oticus and processus orbitalis)' / otic_process_longest orbital_process_longest_KC102, 104 'Quadrate, otic process (processus oticus), rostral border, tubercle for the m. adductor mandibulae externus, pars profunda' / absent 'present, as a ridge' 'presence, as a tubercle BG96', 105 'Quadrate, otic process (processus oticus), rostral border, tubercle for the m. adductor mandibulae externus, pars profunda' / contiguous_with_squamosal_capitulum separated_from_squamosal_capitulum_KC014, 106 'Tomial edge (crista tomialis)' / 'plane of tomial edge approximately at the level of the basitemporal plate (lamina parasphenoidalis)' dorsal_to_the_level_of_the_basitemporal_plate_BG97, 107 'Mandible, symphysis' / extensive_bony_connection short_terminal_bony_connection_C101, 108 'Mandible, posteriorly projected midline spur from dentary underlying symphysis' / absent present_KC107, 109 'Mandible, coronoid process (processus coronoideus), position on the dorsal margin of the mandible with respect to caudal mandibular fenestra (fenestra mandibulae caudalis)' / markedly_rostral on_the_rostral_end_of_the_fenestra caudal_to_fenestra_Ordered._BG98, 110 'Mandible, rostral fenestra (fenestra mandibulae rostralis)' / imperforate_or_small_opening large_opening_OH8, 111 'Mandible, caudal fenestra (fenestra mandibulae caudalis)' / 'open, can be seen through from the medial or lateral aspects' 'nearly or completely concealed by the splenial medially (i.e., fenestra not visible in the medial aspect) OH9', 112 'Mandible, mandibular ramus' / depth_subequal_over_entire_ramus pronounced_deepening_at_midpoint_BG101, 113 'Mandible, mandibular ramus' / essentially_straight_or_gently_sloping pronounced_ventral_deflection_near_midpoint_KC112, 114 'Mandible, dentary, length of dorsal edge relative to mandibular ramus length in lateral view' / markedly_more_than_half_the_length_of_ramus approximately_half_the_length_of_ramus_BG103, 115 'Mandible, articular, medial process (processus medialis)' / not_hooked hooked_BG104, 116 'Mandible, angular, aspect in dorsal view' / sharply_truncated_caudally 'caudally projected, forming retroarticular process (processus retroarticularis) BG106', 117 'Mandible, angular, retroarticular process (processus retroarticularis), aspect in dorsal view in relation to the articular area for the quadrate between the lateral and medial condyles (condylus lateralis and condylus medialis)' / 'broad, approximately equal to the articular area' 'moderately long, narrower than the articular area' 'very long, longer and narrower than the articular area Ordered. BG105', 118 'Mandible, medial emargination between medial and retroarticular processes (processus retroarticularis and processus medialis)' / absent weak_concavity strong_concavity_Ordered._K108, 119 'Atlas, processus ventralis' / absent_or_slightly_developed 'well developed, high and prominent ridge on the dorsal surface of the arcus atlantis BG108', 120 Transition_to_free_cervicothoracic_ribs_begins_at / 'thirteenth cervical vertebrae:' fourteenth_cervical_vertebrae fifteenth_cervical_vertebrae_Ordered._BG109, 121 'Cervical vertebrae, transverse process (processus transversus) in last five cervical vertebrae' / not_elongated_laterally greatly_elongated_laterally_BG111, 122 'Thoracic vertebrae, posterior-most vertebrae' / heterocoelous 'weakly opisthocoelous;' strongly_opisthocoelous_Ordered._K114, 123 'Thoracic vertebrae, deep excavation on lateral face of posterior thoracic vertebrae' / absent present_KC124, 124 'Synsacrum, number of incorporated vertebrae' / nine 11 12 13 14 15_or_more_C117, 125 'Synsacrum, height of crista synsacri between acetabuli' / flat_or_weakly_projected strongly_projected_KC126, 126 Caudal_vertebrae / seven eight nine_Ordered._BG113, 127 'Thoracic ribs, uncinate processes (costae, processes uncinati)' / 'elongate, narrow' 'wide at base, spatulate' 'extremely wide at base Reference to bifurcation of the processes in state 2 from previous formulations of this character has been removed, as bifurcation shows individual variation in all species of Pygoscelis. BG114', 128 'Thoracic ribs, uncinate processes (costae, processes uncinati)' / fused_to_ribs unfused_KC129, 129 'Sternum, external spine (spina externa rostri)' / absent present_OH13, 130 'Sternum, facies articularis furculae projects as a distinctive process' / absent present_BG116, 131 'Sternum, articular facets for coracoids (sulcus articularis coracoideus)' / meet_or_overlap_one_another_at_midline 'separated by wide non-articulatory surface C122', 132 'Sternum, labrum internum' / continues_as_sharp_ridge_onto_the_base_of_the_spina_externa fades_away_without_continuing_onto_the_base_C123, 133 'Sternum, caudal incisurae' / absent two four_KC133, 134 'Furcula, hypocleidium (apophysis furculae)' / 'absent or low knob-like process' 'long, blade-like process BG117', 135 'Furcula, ramus' / 'sub-ovoid in cross-sectional omal end' mediolaterally_flattened_and_craniocaudally_expanded_at_omal_end_CL218, 136 'Scapula, acromion' / 'craniodorsally directed, nearly parallel to long axis of scapular shaft at apex' forms_a_blunt_triangular_projection_with_apex_directed_approximately_at_45_degree_angle_from_long_axis_of_scapular_shaft 'narrow and tapering, apex directed at a right angle to scapular shaft CL223', 137 'Scapula, blade, caudal half (corpus scapulae, extremitas caudalis)' / 'blade-like' slightly_expanded 'broadly expanded, paddle-shaped BG118', 138 'Coracoid, length' / shorter_than_humerus 'greatly elongated, longer than humerus KC137', 139 'Coracoid, scapular cotyle (scapula cotylaris)' / 'deep and socket-like' shallow_depression_CL217, 140 'Coracoid, medial margin, coracoidal fenestra' / complete incomplete absent_OH14, 141 'Coracoid, foramen nervi supracoracoidei' / absent present_Mayr_2005_cited_ontogenetic_evidence_that_this_foramen_is_not_homologous_to_the_coracoidal_fenestra_of_penguins._K122, 142 'Coracoid, sternal margin (extremitas sternalis coracoidei)' / greatly_expanded moderate_expansion_BG120, 143 'Coracoid, profile of the sternal margin (extremitas sternalis coracoidei) in ventral view' / convex concave flat_K124, 144 'Coracoid, lateral process (processus lateralis)' / absent_or_highly_reduced 'well- developed', 145 Forelimb_elements / 'subcircular in cross-section' flattened_BG121, 146 'Humerus, head' / 'very developed and reniform, continuous with tuberculum dorsale: absent' present_BG122, 147 'Humerus, head in posterior view' / apex_of_humeral_head_located_near_midline humeral_head_slopes_so_that_apex_of_humeral_head_located_ventrally_C132, 148 'Humerus, incisura captius' / essentially_confluent_with_sulcus_transversus clearly_separated_from_sulcus_transversus_K127, 149 'Humerus, capital incisure' / extends_to_secondary_tricipital_fossa separated_from_secondary_tricipital_fossa_CL222, 150 'Humerus, pit for ligament insertion on proximal surface adjacent to head' / absent_or_very_shallow deep_K128, 151 'Humerus, orientation of intumenscentia humeri and tuberculum ventrale' / 'intumenscentia projects ventrally from shaft, tuberculum oriented posteriorly' 'intumenscentia projects ventrally from shaft, tuberculum oriented ventrally' 'intumenscentia projected more anteroventrally (so as to be partially obscured in posterior view), tuberculum oriented anteroventrally K129', 152 'Humerus, proximal margin of tricipital fossa (fossa tricipitalis)' / weak_projection 'projects so as to be well-exposed in proximal view K135', 153 'Humerus, proximal border of tricipital fossa in ventral view' / concave_proximal_margin straight_border_KT153., 154 'Humerus, tricipital fossa (fossa tricipitalis), aspect' / small_with_penetrating_pneumatic_foramina moderate_fossa_without_pneumatic_foramen deep_fossa_without_pneumatic_foramen_BG123, 155 'Humerus, tricipital fossa (fossa tricipitalis)' / single 'bipartite (BG 124)', 156 'Humerus, deltoid crest, impressio m. pectoralis' / 'superficial poorly-defined groove' 'shallow, well-defined oblong fossa' 'deep, well-defined oblong fossa Ordered BG125', 157 'Humerus, impressio insertii m. supracoracoideus' / 'small, semicircular scar' greatly_elongated_with_long_axis_subparallel_to_main_axis_of_humeral_shaft_K133, 158 'Humerus, impressio insertii m. supracoracoideus and m. latissimus dorsi' / separated_by_a_wide_gap separated_by_a_moderate_gap separated_by_small_gap_or_confluent_Ordered._K134, 159 'Humerus, coracobrachialis caudalis scar' / clearly_separated_from_head scar_contacts_distal_margin_of_head_CL219, 160 'Humerus, coracobrachialis caudal scar' / 'deeply depressed, subcircular' 'flat, ovoid, oriented dorsoventrally' 'flat, elongate and oriented obliquely at approximately 45o angle to long axis of shaft CL220', 161 'Humerus, groove for coracobrachialis nerve' / absent_or_poorly_defined 'sharp, narrow sulcus CL221', 162 'Humerus, shaft, dorsoventral width' / shaft_thins_or_maintains_width_distally shaft_widens_distally_K136, 163 'Humerus, nutrient foramen (foramen nutricum)' / situated_on_ventral_face_of_shaft situated_on_anterior_face_of_shaft_C143, 164 'Humerus, anterior face of shaft elongate depression near ventral margin' / absent present_C144, 165 'Humerus, shaft, sigmoid curvature' / absent_or_weak strong_K137, 166 'Humerus, development of dorsal supracondylar tubercle (processus supracondylar dorsalis)' / absent compact_tubercle elongate_process_BG126, 167 'Humerus, demarcation of sulcus scapulotricipitalis' / not_demarcated 'passage a well-marked groove' development_of_trochlear_ridge_for_articulation_with_os_sesamoideum_m._scapulotricipitis_Ordered._BG127., 168 'Humerus, posterior trochlear ridge' / extends_beyond_ventral_margin_of_the_humeral_shaft does_not_extend_beyond_the_humeral_shaft_BG128, 169 'Humerus, angle between main axis of shaft and tangent of ulnar and radial condyles (condylus dorsalis and condylus ventralis)' / less_than_45o more_than_45o nearly_90o_K141, 170 'Humerus, ulnar condyle (condylus ventralis)' / condyle_projected_and_rounded condyle_flattened_K142, 171 'Humerus, shelf adjacent to condylus ventralis' / 'large, ratio of condyle width: shelf width >1.3' 'moderate, ratio of condyle width: shelf width 1.3–2.0' 'greatly reduced, less than half condyle width Ordered K143', 172 'Radius, shaft' / narrow broad_and_flattened_KC166, 173 'Ulna, olecranon position and shape of posterior ulnar margin' / 'olecranon arises at level of, or proximally surpassing, humeral cotylae' 'olecranon, a tab-like projection slightly distally displaced from cotylae creating a rounded posterior ulnar margin' 'olecranon a tab-like projection slightly distally displaced from cotylae creating a squared posterior margin' 'posterior margin is a smooth curve, apex located one-fourth of length to distal end' 'posterior margin with a distinct angle, apex located one-fourth of length to distal end K144', 174 'Ulna, distinct process extending toward sulcus humerotricipitalis of humerus' / absent present_K145, 175 Ulnare / '‘U’-shaped' 'triangular, fan-shaped wedge KC169', 176 'Carpometacarpus, pisiform process (processus pisiformis)' / 'well-projected round tubercle' reduced_to_a_low_ridge_C155, 177 'Carpometacarpus, distal facet on metacarpal I' / absent present_C156, 178 'Carpometacarpus, metacarpal II, distinct anterior bowing' / absent present_C157, 179 'Carpometacarpus, extension of metacarpals II and III' / subequal_or_III_slightly_shorter metacarpal_III_projects_markedly_distal_of_metacarpal_II._C158, 180 'Carpometacarpus, metacarpal III, distal articular surface (facies articularis digitalis major)' / wedge_shaped_or_broadens_anteriorly_in_distal_view slightly_depressed_ovoid_surface_C159, 181 'Carpometacarpus, extensor process (processus extensorius)' / present absent_KC175, 182 'Carpometacarpus, metacarpal II, distal expansion' / absent present_KC176, 183 'Phalanges of manus, phalanx digit III proximal process' / absent present_BG130, 184 'Phalanges of manus, relative length of phalanx III-1 and phalanx II-1' / 'phalanx III-1 shorter' subequal_C161, 185 'Phalanges of manus, length relative to carpometacarpus' / long short_BG131, 186 Fusion_of_ilia_to_synsacrum / unfused partially_fused 'well-fused Ordered. K149', 187 'Pelvis, preacetabular ilia' / 'flat, well-separated' 'approach one another, but do not contact at midline' contact_at_midline_forming_canalis_iliosynsacralis_KC181., 188 'Pelvis, foramina intervertebralia large, forming wide openings on dorsal surface of pelvis' / absent present_KC182, 189 'Ilium, projected postiliac spine' / absent present, 190 'Pelvis, size of foramen ilioischiadicum and foramen acetabuli' / foramen_ilioischiadicum_smaller_or_similar_in_size larger_OH16, 191 'Pelvis, fenestra ischiopubica' / very_wide_and_closed_at_its_caudal_end 'slit-like and open at its caudal end BG133', 192 'Ischium, most caudal extent in relation to postacetabular ilium' / ischium_shorter_than_ilium ischium_projects_slightly_beyond_the_ilium ischium_produced_far_caudal_to_ilium_BG134, 193 Patella / absent_or_unossified present_KC187, 194 'Patella, sulcus m. ambiens' / shallow_groove deep_groove perforated_BG135, 195 'Tibiotarsus, crista patellaris' / greatly_enlarged slightly_developed_BG136, 196 'Tibiotarsus, shaft, anteroposterior flattening' / 'weak, midshaft anteroposterior depth greater than 75% mediolateral width' 'strong, midshaft anteroposterior depth equal to or less than 75% mediolateral width C169', 197 'Tibiotarsus, notch in distal edge of medial condyle (condylus medialis)' / present absent_AH38, 198 'Tibiotarsus, lateral condyle (condylus lateralis) in lateral profile' / ovoid subcircular_AH37, 199 'Tibiotarsus, sulcus extensorius' / laterally_positioned close_to_midline medially_positioned_Variation_of_this_feature_in_penguins_was_noted_by_Clarke_et_al._KC193., 200 'Tarsometatarsus, elongation index (proximodistal length / mediolateral width at proximal end)' / 'slender, EI>3' 'shortened, 2.5