#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on December 02, 2023; 9:50 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Kvicerova J., & Hypsa V. 2012. Host-parasite incongruences within multiple lineages of rodent-specific Eimeria suggest significant role of adaptation rather than cophylogeny in maintenance of host specificity. Molecular Ecology , . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12861] [ The following blocks are input data for analysis step 9587 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep9587; DIMENSIONS NTAX=40; TAXLABELS Eimeria_acervulina Eimeria_burdai Eimeria_cahirinensis_NFS Eimeria_cahirinensis_WR Eimeria_callospermophili Eimeria_caviae Eimeria_cf._mivati Eimeria_coecicola Eimeria_exigua Eimeria_flavescens Eimeria_intestinalis Eimeria_irresidua Eimeria_magna Eimeria_maxima Eimeria_mivati Eimeria_myoxi Eimeria_necatrix Eimeria_piriformis Eimeria_ranae Eimeria_sp._ex._Apodemus_agrarius_21617 Eimeria_sp._ex._Apodemus_agrarius_21668 Eimeria_sp._ex._Apodemus_flavicollis_1 Eimeria_sp._ex._Apodemus_flavicollis_12 Eimeria_sp._ex._Apodemus_flavicollis_4 Eimeria_sp._ex._Apodemus_sylvaticus_0850 Eimeria_sp._ex._Apodemus_sylvaticus_0853 Eimeria_sp._ex._Phataginus_tricuspis_1 Eimeria_sp._ex._Phataginus_tricuspis_2 Eimeria_sp._ex._Sorex_araneus_136 Eimeria_tenella Eimeria_vejdovskyi Isospora_hypoleucae Isospora_sp._ex._Apodemus_flavicollis_B13 Isospora_sp._ex._Sylvia_atricapilla_iSAT1 Isospora_sp._ex._Sylvia_atricapilla_iSAT2 Isospora_sp._ex._Sylvia_atricapilla_iSAT3 Isospora_sp._ex._Sylvia_atricapilla_iSAT4 Isospora_sp._ex._Sylvia_atricapilla_iSAT5 Isospora_sp._ex._Talpa_europaea_106 Isospora_sp._ex._Talpa_europaea_218 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M13550] TITLE Eimerian_COI_Alignment; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep9587; DIMENSIONS NCHAR=808; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=- GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Eimeria_acervulina 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