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Matrix 4864 of Study 10264
Citation title: "Primers for mating-type diagnosis in Diaporthe and Phomopsis: their use in teleomorph induction in vitro and biological species definition.".
This study was previously identified under the legacy study ID S2623
(Status: Published).
Matrices
Title: EF1-a
Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M5021
Rows
| Taxon Label | Row Segments | Characters 1?–30 |
|---|---|---|
| Diaporthe aspalathi DQ286249 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe aspalathi DQ286250 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe phaseolorum var meridionalis AF398893 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe crotalariae CBS 162 33 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe angelicae Ph C121 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp FJ389009 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe angelicae CBS 111592 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe angelicae Ph C094 2 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe angelicae Ph C068 2 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis dauci CBS 315 49 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe angelicae Ph C032 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe stewartii CBS 193 36 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe lusitanicae CBS 123212 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe lusitanicae Di C001 7 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe lusitanicae CBS 123213 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe lusitanicae Ph C170 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe cynaroidis EU552093 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C169 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Leucostoma niveum DQ862035 | (none) | ttcatcaagaacatgatcactggtacttcc |
| Valsa ambiens DQ862041 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis viticola AY745081 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis viticola AY745083 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis viticola AY745082 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis viticola 115 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis viticola CBS114016 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis viticola 114 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe W type P Pt 16 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe W type P Pt 19 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp 439B4 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp 152 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cotoneastri Di C005 7 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp 151 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe sp Di C005 8 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cotoneastri Di C005 6 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cotoneastri Di C005 9 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cotoneastri Di C005 5 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cotoneastri Di C005 4 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe sp Di C005 3 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe sp Di C005 2 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe sp Di C005 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cotoneastri Di C005 10 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cotoneastri CBS 439 82 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp AY745054 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe vaccinii CBS 160 32 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe alleghaniensis CBS 495 72 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis phoenicicola CBS 161 64 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp EU259179 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola Di C004 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis theicola DQ286260 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola CBS 123209 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola Ph C196 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola CBS 123208 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola Ph C195 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola Di C004 6 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola Ph C190 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe neotheicola Ph C182 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C173 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe hickoriae CBS 145 26 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe viticola CBS 113201 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe viticola Di C006 2 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe viticola 111 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cuppatea AY339354 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis cuppatea DQ286258 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C194 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp 9 DQ286259 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C188 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe melonis CBS 507 78 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe helianthi CBS 592 81 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe sp Di C007 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C189 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C180 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C174 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph AC002 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph AC003 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sp Ph C192 1 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe strumella var longispora CBS 194 36 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis sclerotioides CBS 296 67 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe ambigua CBS 114015 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe ambigua DQ286242 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe ambigua CBS 123211 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe ambigua CBS 123210 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis amygdali 11A | (none) | ?????????????????????????????? |
| Phomopsis amygdali 16A | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe G type 930811 17 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe G type 930811 14 | (none) | ?????????????????????????????? |
| Diaporthe perjuncta CBS 109745 | (none) | ?????????????????????????????? |
Columns
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