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Matrix 4850 of Study 2372

About Citation title: "Phylogeny of the Cucurbitales based on DNA sequences of nine loci from three genomes: implications for morphological and sexual system evolution".
About This study was previously identified under the legacy study ID S1392 (Status: Published).

Matrices

Title: Paniceae ndhF

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M5056

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Cymbopogon jwarancusa  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Cymbopogon pospischilii  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Cyphonanthus discrepans  (none) ??????????????????????????????
Cyrtococcum patens  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Dichanthelium acuminatum  (none) ??????????????????????????????
Dichanthelium clandestinum  (none) ??????????????????????????????
Dichanthelium koolauense  (none) ??????????????????????????????
Dichanthelium lanuginosum  (none) ??????????????????????????????
Dichanthelium sabulorum  (none) ??????????????????????????????
Dichanthium aristatum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Digitaria ciliaris  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Digitaria didactyla  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Digitaria radicosa  (none) ??????????????????????????????
Digitaria sanguinalis  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Digitaria setigera  (none) ??????????????????????????????
Echinochloa chacoensis  (none) ??????????????????????????????
Echinochloa colona  (none) ??????????????????????????????
Echinochloa crus galli  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Echinochloa crus pavonis  (none) ??????????????????????????????
Echinochloa frumentacea  (none) ??????????????????????????????
Echinochloa utilis  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Echinolaena inflexa  (none) ??????????????????????????????
Elionurus muticus  (none) ???????????????????????????GTA
Eulalia aurea  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Gynerium sagittatum  (none) ??????????????????????????????
Heteropogon contortus  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Homolepis glutinosa  (none) ??????????????????????????????
Homolepis isocalycia  (none) ??????????????????????????????
Hopia obtusa  (none) ??????????????????????????????
Hymenachne amplexicaulis  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Hymenachne donacifolia  (none) ??????????????????????????????
Hyparrhenia hirta  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Ichnanthus pallens  (none) ??????????????????????????????
Ichnanthus panicoides  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Ichnanthus vicinus  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Imperata cylindrica  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Ischaemum afrum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Ischaemum koleostachys  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Ischaemum santapaui  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Ixophorus unisetus  (none) ??????????????????????????????
Lasiacis divaricata  (none) ??????????????????????????????
Lasiacis ligulata  (none) ??????????????????????????????
Lasiacis rugelii  (none) ??????????????????????????????
Lasiacis ruscifolia  (none) ??????????????????????????????
Lasiacis sorghoidea  (none) ??????????????????????????????
Mesosetum chaseae  (none) ??????????????????????????????
Microstegium nudum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Microstegium vimineum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Miscanthus japonicus  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Neurachne alopecuroides  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Ophiochloa hydrolithica  (none) ??????????????????????????????
Oplismenopsis najada  (none) ??????????????????????????????
Oplismenus burmannii  (none) ??????????????????????????????
Oplismenus compositus  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Oplismenus hirtellus  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Oplismenus undulatifolius  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Urochloa texana  (none) ??????????????????????????????
Urochloa foliosa  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa oblita  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa adspersa  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Yvesia madagascariensis  (none) ??????????????????????????????
Urochloa comata  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCATGGGTA
Brachiaria longiflora  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCATGGGTA
Urochloa venosa  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Eriochloa meyeriana  (none) ATGGAACAGACATAT{CG}AATATGCCTGG
Urochloa distachya  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Thuarea involuta  (none) ATGGAACATACATATGAATATGCCTGGGTA
Eriochloa setosa  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Chaetium bromoides  (none) ??????????????????????????????
Urochloa glumaris  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa platyphylla  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Brachiaria pseudodichotoma  (none) ??????????????????????????????
Leucophrys mesocoma  (none) ??????????????????????????????
Urochloa fusca  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Acroceras excavatum  (none) ??????????????????????????????
Acroceras tonkinense  (none) GGAACAATCACAATCCAATATGCCTGGGTA
Acroceras zizanioides  (none) ??????????????????????????????
Alloteropsis angusta  (none) ????????????????AATATGCCTGGGTA
Alloteropsis cimicina  (none) ????????????????AATATGCCTGGGTA
Alloteropsis paniculata  (none) ????????????????AATATGCCTGGGTA
Alloteropsis papillosa  (none) ????????????????AATATGCCTGGGTA
Alloteropsis semialata subsp eckloniana  (none) ????????????????AATATGCCTGGGTA
Alloteropsis semialata subsp semialata  (none) ?????????????????ATATGCCTGGGTA
Altoparadisium chapadense  (none) ??????????????????????????????
Andropogon gerardii  (none) ?????????????????????????GGGTA
Anthaenantia lanata  (none) ??????????????????????????????
Anthaenantiopsis rojasiana  (none) ??????????????????????????????
Apluda mutica  (none) ??????????????????????????????
Apochloa animarum  (none) ??????????????????????????????
Apochloa chnoodes  (none) ??????????????????????????????
Apochloa cipoensis  (none) ??????????????????????????????
Apochloa euprepes  (none) ??????????????????????????????
Apochloa lorea  (none) ??????????????????????????????
Apochloa molinioides  (none) ??????????????????????????????
Apochloa poliophylla  (none) ??????????????????????????????
Apochloa steyermarkii  (none) ??????????????????????????????
Arthraxon lanceolatus  (none) ????????????????????TGCCTGGATA
Arthropogon villosus  (none) ??????????????????????????????
Arundinella deppeana  (none) ??????????????????????????????
Arundinella hirta  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Arundinella nepalensis  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Axonopus anceps  (none) ??????????????????????????????
Axonopus fissifolius  (none) ??????????????????????????????
Bothriochloa bladhii  (none) ??????????????????????????GGTA
Bothriochloa ischaemum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Bothriochloa saccharoides  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Urochloa villosa  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Canastra aristella  (none) ??????????????????????????????
Canastra lanceolata  (none) ??????????????????????????????
Capillipedium parviflorum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Cenchrus agrimonioides  (none) ??????????????????????????????
Cenchrus calyculatus  (none) ??????????????????????????????
Cenchrus ciliaris  (none) ??????????????????????????????
Cenchrus echinatus  (none) ?????CCAGACATATCAATATGCCTGGGTA
Cenchrus myosuroides  (none) ??????CAGACATATCAATATGCCTGGGTA
Cenchrus pilosus  (none) ??????????????????????????????
Cenchrus setigerus  (none) ?????CCAGACATATCAATATGCCTGGGTA
Chionachne koenigii  (none) ??????????????????????????????
Chrysopogon fulvus  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Chrysopogon gryllus  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Coelorachis selloana  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Coix aquatica  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Coix lacryma jobi  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Cymbopogon citratus  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Cymbopogon commutatus  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Cymbopogon flexuosus  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Chasmanthium latifolium  (none) ?????????????????????????GGGTA
Eriochloa polystachya  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa holosericea  (none) ??????????????????????????????
Panicum deustum  (none) ??????????????????????????????
Urochloa echinolaenoides  (none) ??????????????????????????????
Urochloa rudis  (none) ????????????TATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa meziana  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Eriochloa acuminata  (none) ???????????ATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa panicoides  (none) ??????????????????????????????
Eriochloa sericea  (none) ATGGAACAGACATATCAATATGCCTGGTTA
Urochloa brizantha  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa mutica  (none) ??????????????????????????????
Urochloa ruziziensis  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa humidicola  (none) ??????????????????????????????
Urochloa lorentziana  (none) ??????????????????????????????
Urochloa dyctioneura  (none) ??????????CATATGAATATGCCTGGGTA
Megathyrsus maximus  (none) ??????????????????????????????
Urochloa discifera  (none) ?????????ACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa mosambicensis  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Melinis minutiflora  (none) ?????????ACATATGAATATGCCTGGGTA
Moorochloa eruciformis  (none) ?????????ACATATGAATATGCCTGGGTA
Rupichloa decidua  (none) ??????????????????????????????
Urochloa paucispicata  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCTTGGGTA
Eriochloa nana  (none) ??????????????????????????????
Eriochloa punctata  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa decumbens  (none) ??????????????????????????????
Urochloa nigropedata  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa bovonei  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Brachiaria serrata  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa plantaginea  (none) ??????????????????????????????
Urochloa jubata  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa leersioides  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Melinis repens  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Rupichloa acuminata  (none) ??????????????????????????????
Urochloa platynota  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa dura  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa subulifolia  (none) ??????????????????????????????
Urochloa subquadripara  (none) ??????????????????????????????
Urochloa lata  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa setigera  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa mollis  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa arizonica  (none) ??????????????????????????????
Urochloa lachnantha  (none) ??????????????????????????????
Urochloa deflexa  (none) ??????????????????????????????
Eriochloa montevidensis  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Scutachne dura  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Eriochloa distachya  (none) ??????????????????????????????
Tricholaena monachne  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Megathyrsus infestus  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Moorochloa malacodes  (none) ATGGAACAGACATATGAATATGCCTGGGTA
Urochloa arrecta  (none) ????????GACATATGAATATGCCTGGGTA
Panicum cordovense  (none) ??????????????????????????????
Panicum cumbucana  (none) ??????????????????????????????
Panicum cyanescens  (none) ??????????????????????????????
Panicum dichotomiflorum  (none) ??????????????????????????????
Panicum elephantipes  (none) ??????????????????????????????
Panicum fauriei  (none) ??????????????????????????????
Panicum grumosum  (none) ??????????????????????????????
Panicum hylaeicum  (none) ??????????????????????????????
Panicum laetum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Panicum longipedicellatum  (none) ??????????????????????????????
Panicum mertensii  (none) ??????????????????????????????
Panicum miliaceum  (none) ??????????????????????????????
Panicum millegrana  (none) ??????????????????????????????
Panicum missionum  (none) ??????????????????????????????
Panicum mystasipum  (none) ??????????????????????????????
Panicum nephelophilum  (none) ??????????????????????????????
Panicum olyroides  (none) ??????????????????????????????
Panicum ovuliferum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Panicum pantrichum  (none) ??????????????????????????????
Panicum parvifolium  (none) ??????????????????????????????
Panicum pedersenii  (none) ??????????????????????????????
Panicum penicillatum  (none) ??????????????????????????????
Panicum pernambucense  (none) ??????????????????????????????
Panicum petersonii  (none) ??????????????????????????????
Panicum piauiense  (none) ??????????????????????????????
Panicum pilosum  (none) ??????????????????????????????
Panicum prionitis  (none) ??????????????????????????????
Panicum racemosum  (none) ??????????????????????????????
Panicum repens  (none) ??????????????????????????????
Panicum rhizogonum  (none) ????????????????????TG????????
Panicum rigidulum  (none) ??????????????????????????????
Panicum rudgei  (none) ??????????????????????????????
Panicum schwackeanum  (none) ??????????????????????????????
Panicum sellowii  (none) ??????????????????????????????
Panicum stenodes  (none) ??????????????????????????????
Panicum stoloniferum  (none) ??????????????????????????????
Panicum stramineum  (none) ??????????????????????????????
Panicum subtiramulosum  (none) ??????????????????????????????
Panicum tenerum  (none) ??????????????????????????????
Panicum trichanthum  (none) ??????????????????????????????
Panicum tricholaenoides  (none) ??????????????????????????????
Panicum tuerckheimii  (none) ??????????????????????????????
Panicum validum  (none) ??????????????????????????????
Panicum verrucosum  (none) ??????????????????????????????
Panicum virgatum  (none) ???????????????????????ATGGGTA
Panicum wettsteinii  (none) ??????????????????????????????
Paspalidium aversum  (none) ??????????????????????????????
Paspalidium distans  (none) ??????????????????????????????
Paspalidium geminatum  (none) ??????????????????????????????
Paspalidium jubiflorum  (none) ??????????????????????????????
Paspalum arundinellum  (none) ??????????????????????????????
Paspalum conjugatum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Paspalum conspersum  (none) ??????????????????????????????
Paspalum dilatatum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Paspalum haumanii  (none) ??????????????????????????????
Paspalum malacophyllum  (none) ??????????????????????????????
Paspalum nutans  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Paspalum paniculatum  (none) ??????????????????????????????
Paspalum quadrifarium  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Paspalum remotum  (none) ??????????????????????????????
Paspalum vaginatum  (none) ??????????????????????????????
Paspalum wettsteinii  (none) ??????????????????????????????
Pennisetum alopecuroides  (none) ??????????????????????????????
Pennisetum flaccidum  (none) ??????????CATATCAATATGCCTGGGTA
Pennisetum glaucum  (none) ????????????????AATATGCCTGGGTA
Pennisetum longissimum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Pennisetum montanum  (none) ??????????????????????????????
Pennisetum setaceum  (none) ??????????????????????????????
Pennisetum villosum  (none) ??????????????????????????????
Phacelurus digitatus  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Otachyrium versicolor  (none) ??????????????????????????????
Ottochloa nodosa  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Panicum adenophorum  (none) ??????????????????????????????
Panicum anceps  (none) ??????????????????????????????
Panicum antidotale  (none) ??????????????????????????????
Panicum aquaticum  (none) ??????????????????????????????
Panicum bergii  (none) ??????????????????????????????
Panicum capillare  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Panicum caricoides  (none) ??????????????????????????????
Panicum cervicatum  (none) ??????????????????????????????
Panicum chapadense  (none) ??????????????????????????????
Panicum chloroleucum  (none) ??????????????????????????????
Panicum claytonii  (none) ??????????????????????????????
Panicum coloratum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Phanopyrum gymnocarpon  (none) ??????????????????????????????
Plagiantha tenella  (none) ??????????????????????????????
Poecilostachys bromoides  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Pogonatherum paniceum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Pseudechinolaena polystachya  (none) ??????????????????????????????
Pseudoraphis paradoxa  (none) ??????????????????????????????
Renvoizea acicularifolia  (none) ??????????????????????????????
Renvoizea durifolia  (none) ??????????????????????????????
Renvoizea marauensis  (none) ??????????????????????????????
Renvoizea restingae  (none) ??????????????????????????????
Renvoizea sacciolepoides  (none) ??????????????????????????????
Renvoizea trinii  (none) ??????????????????????????????
Renvoizea vaginiviscosa  (none) ??????????????????????????????
Saccharum officinarum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sacciolepis indica  (none) ??????????????????????????????
Schizachyrium scoparium  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Setaria barbata  (none) ?????????????ATCAATATGCCTGGGTA
Setaria geniculata  (none) ?????????ACATATCAATATGCCTGGGTA
Setaria grisebachii  (none) ????CCCAGACATATCAATATGCCTGGGTA
Setaria italica  (none) ??????????CATATCAATATGCCTGGGTA
Setaria lachnea  (none) ??????????????????????????????
Setaria palmifolia  (none) ?????????????ATCAATATGCCTGGGTA
Setaria parviflora  (none) ??????????????????????????????
Setaria plicata  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Setaria poiretiana  (none) ???????????ATATCAATATGCCTGGGTA
Setaria pumila  (none) ??????????????????????????????
Setaria sphacelata  (none) ??????????????????????????????
Setaria verticillata  (none) ????????????TATCAATATGCCTGGGTA
Setaria viridis  (none) ????????????????????????TGGGTA
Sorghastrum nutans  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum amplum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum angustum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum arundinaceum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum bicolor  (none) ???????????????????????ATGGGTA
Sorghum bulbosum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum ecarinatum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum exstans  (none) ??????????????????????????????
Sorghum grande  (none) ??????????????????????????????
Sorghum halepense  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum interjectum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum intrans  (none) ??????????????????????????????
Sorghum laxiflorum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum leiocladum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum macrospermum  (none) ????????????????????????TGGGTA
Sorghum matarankense  (none) ??????????????????????????????
Sorghum nitidum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum plumosum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum propinquum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum purpureosericeum  (none) ??????????????????????????????
Sorghum stipoideum  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum timorense  (none) ???????????????????????CTGGGTA
Sorghum versicolor  (none) ??????????????????????????????
Spinifex littoreus  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Spinifex sericeus  (none) ??????????????????????????????
Steinchisma decipiens  (none) ??????????????????????????????
Steinchisma hians  (none) ??????????????????????????????
Steinchisma laxa  (none) ??????????????????????????????
Steinchisma spathellosa  (none) ??????????????????????????????
Stenotaphrum dimidiatum  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Stenotaphrum secundatum  (none) ??????????????????????????????
Streptostachys asperifolia  (none) ??????????????????????????????
Streptostachys ramosa  (none) ??????????????????????????????
Tatianyx arnacites  (none) ??????????????????????????????
Thrasya glaziovii  (none) ??????????????????????????????
Thrasya petrosa  (none) ??????????????????????????????
Tripsacum dactyloides  (none) ??????????????????????????????
Vetiveria zizanioides  (none) ????????????????????TGCCTGGGTA
Zea mays  (none) ????????????????????????TGGGTA
Zuloagaea bulbosa  (none) ??????????????????????????????
Zygochloa paradoxa  (none) ??????????????????????????????

Columns

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