Matrix 5239 of Study 10430
Matrices
Title: Pheidole 5 gene matrix
Description: 12S, cox1, cytb, H3, LR
Rows
Taxon Label | Row Segments | Characters 1?–30 |
---|---|---|
Pheidole biconstricta | (none) | TTGTAATAAAAA--TATTAATTATT-AAAA |
Pheidole vallicola | (none) | TTATAAAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole diversipilosa | (none) | TCAT-AAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole tetra | (none) | TTATAAAAAAAA---AATAATTAAT-AGAA |
Pheidole crassicornis | (none) | ????????????????????TTA?T-AAG? |
Pheidole boruca | (none) | TTATAATTAAAA--AATTAATTAAA-AAAA |
Pheidole laticornis | (none) | TTATAATAATAA--ATTTATTTAAT-AAAA |
Pheidole indistincta | (none) | TTAT-AATAAGG-AATGCAGTTAAT-AAGA |
Pheidole diana | (none) | TTATAATAAATA--TAAAAATTAAG-AAGA |
Pheidole sicaria | (none) | TTATAAATAAAT---ATTAATTGAT-AAAA |
Pheidole sensitiva | (none) | TTTTAATAAAAA---ATTAATTAAT-AAAA |
Pheidole violacea | (none) | TTAT-AAAAAAA---AATAATTAAT-AAGA |
Pheidole cocciphaga | (none) | TTAT-AATAAAA--ATTTAAATAAT-AAAA |
Pheidole innupta | (none) | TTATAATAAATA---TAAGGTTAAG-AAGA |
Pheidole prostrata | (none) | TTATAATTAAGA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole desertorum | (none) | TTATAAAAAGAA--ATTTGATTAGT-AAGA |
Pheidole dentata | (none) | TTATA-ATAAAA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole xanthogaster | (none) | TTGTAATAAAAA--TATTAATTATT-AAAA |
Pheidole astur | (none) | TTATAAAAAAAA-AAATTAATTAAT-AGAA |
Pheidole fissiceps | (none) | TTGTAAAAAAAG-ATATTTAATAAT-AAAA |
Pheidole obscurithorax | (none) | TTATAAAAAAAG--AGTTAATTAAT-AAAA |
Pheidole dossena | (none) | TTTTATAATAAA--AATTGGTTAAT-AAAA |
Pheidole caltrop | (none) | TTATAAATAAAA---TTTGATTAAA-TAGA |
Pheidole indagatrix | (none) | TTATA-GTAGAA--GATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole fiorii | (none) | TTAT-AATAAAA--AATTGATTAAT-AAGA |
Pheidole sciophila | (none) | TTATAAAAAAAA---ATT-ATTAAT-AAGA |
Pheidole vistana | (none) | TTGTAAAAAAAT----TAAATTAAT-AAGA |
Pheidole jelskii | (none) | TTATAAAAAAAA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole sitiens | (none) | TTATAAAAATAA----TTAATTAGT-AAGA |
Pheidole perpilosa | (none) | TTATAAAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole hyatti | (none) | TTATAAAAAAAA----ATAATTAAA-AGAA |
Pheidole cockerelli | (none) | TTATAAAAAAAA---ATTAATTGAT-AAGA |
Pheidole morrisi | (none) | TTATAAAAAAAA---ATTAAATAAT-AGGA |
Pheidole portalensis | (none) | ??????????????TCAA-ACTAAT-AAGA |
Pheidole sciara | (none) | ???????????A---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole amazonica | (none) | TTATAAATAAAG---TTTATTTGAG-TAGA |
Pheidole sospes | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-AAGA |
Pheidole moerens | (none) | ?????????????????????????????? |
Pheidole minutula | (none) | TTATAAATAAGT---TTTAATTAAA-AAGA |
Pheidole sagittaria | (none) | TTATAATTAAAA----AAGATTAAG-AAGA |
Pheidole anastasii | (none) | TTGTAAATAATA-AAATTTAATAAT-GAGA |
Pheidole bilimeki | (none) | TTATAAATAATA-ATATTTAATAAT-AAGA |
Pheidole erratilis | (none) | TTATAAATAAAA---TTTAATTAAG-TAAA |
Pheidole browni | (none) | TTATAATTAAGA---ATTAATTAAA-AAAA |
Pheidole umphreyi | (none) | TTATAATTAAAA--AATTAATTAAA-GAGA |
Pheidole striaticeps | (none) | TTATAATTAAAA--AATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole nitella | (none) | TTA??AATAAAA---AAAAATTAAG-AAGA |
Pheidole flavens | (none) | TTATATTTAAAT---ATAAATTAAG-AAGA |
Pheidole nitidicollis | (none) | TTATAAATAAAA---TTTAGTTAAA-TAGA |
Pheidole laselva | (none) | TTATAATTAAGA---AAAATTTAAA-AAGA |
Pheidole floridana | (none) | TTATAAATAATA-ATATTTAATAAT-AAGA |
Pheidole tysoni | (none) | TTATAAGTAAAA---ATTAGGTAAT-AAAA |
Pheidole metallescens | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole juniperae | (none) | TTATAAATAAA----ATTAGTTAAT-AAAA |
Pheidole casta | (none) | TTATAAGTAAG----TTTAATTAAT-TAGA |
Pheidole harlequina | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-GAGA |
Pheidole constipata | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole furtiva | (none) | TTATAAAAATAA--AGTTAATTGAT-AAGA |
Pheidole clydei | (none) | TTATAGGTAATA-AAATAAAATAAT-AAGA |
Pheidole granulata | (none) | TTATAAAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole truncula | (none) | TTATAATTAAAA---GTTAATTAAA-AAGA |
Pheidole pelor | (none) | TTATAGATAAAA--AATTAATTAAT-GAGA |
Pheidole sp.1Madg | (none) | TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole megacephala Aust | (none) | TTAT-AATTAAA---ATTAGTTAAT-AAAA |
Pheidole sp. Aust | (none) | TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA |
Pheidole ampla Aust | (none) | TTAT-AATTAAA---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole variabilis Aust | (none) | TTTTAAATAAAG----TTAATTAAT-AAGA |
Pheidole quadrensis Borneo | (none) | TTATAATAAAGA----TTAGTTAAT-AAAA |
Pheidole comata Borneo | (none) | TTTTAAATAAG----AATAATTAAT-AAGA |
Pheidole quadricuspis Borneo | (none) | TTATAATTAAGA----TTAGTTAAT-AAAA |
Pheidole pallidula France | (none) | TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-TAAA |
Pheidole sp.a Ghana | (none) | TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole sp.b Ghana | (none) | TTAT-TGTAATTAAAATTAATTAAT-TAAA |
Pheidole sp.c Ghana | (none) | TTAT-AATTAAA---ATAAATTAAT-AAAA |
Pheidole sp.d Ghana | (none) | TTATAAATTAAA---ATTGAATAAT-TAAG |
Pheidole sp.a Indonesia | (none) | TTATATATCTAA--AATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole sp.b Indonesia | (none) | TTATAATTAAAG----TTGATTAAT-AAGA |
Pheidole sp.5 Ivory Coast | (none) | ????????TAAG---ATTGAATAAT-TAAG |
Pheidole sp.8 Ivory Coast | (none) | TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole sp.a Madg | (none) | TTATAAATAAAA---TTTAATTAAT-AAGA |
Pheidole sp.b Madg | (none) | TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole sp.c Madg | (none) | TTATAAATAAAA---TTTAATTAAT-AAGA |
Pheidole sp.d Madg | (none) | TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole sexspinosa Palau | (none) | TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA |
Pheidole oceanica Palau | (none) | TTTTAATTAAAG----TTAGTTAAT-AAGA |
Pheidole sp.a PNG | (none) | TTATAAATAAAA--ATTTAATTAAT-AAGA |
Pheidole sp.b PNG | (none) | TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AGGA |
Pheidole sp.c PNG | (none) | TTTT-AATAAAA---ATTAATTAAT-AAAA |
Pheidole sp.d PNG | (none) | TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA |
Pheidole sp.e PNG | (none) | TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AGGA |
Pheidole sp. Sumatra | (none) | TTAT-TATAATTAAAATTAATTAAT-AAAA |
Pheidole dugasi Thailand | (none) | TTATAAATAAAA---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole protea Thailand | (none) | TTATAATTAAG----GTTAATTAAT-AAGA |
Pheidole tandjongensis Thailand | (none) | TTATAATTAAAG---TTAAATTAAT-AAGA |
Pheidole gatesi Vietnam | (none) | TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA |
Pheidole noda Vietnam | (none) | TTATAAATAAGA----TTAATTTAT-AAGA |
Pheidole plagiara Vietnam | (none) | TTATAAT-TAAG---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole mamore | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAT-AAAA |
Pheidole scrobifera | (none) | TTGCAATTAAAG---ATTAATTAAG-AAGA |
Pheidole tristicula | (none) | TTGT-AATAAAA-TTGTTGATTGAT-AAAA |
Pheidole cephalica | (none) | TTATAAAATAAA---ATTAATTAAT-AAAA |
Pheidole cramptoni | (none) | TTATAAATAAAG---TTTAATTAAA-TAGA |
Pheidole allarmata | (none) | TTTT-AAT-GAA--GATTAATTAAT-GAGA |
Pheidole subarmata | (none) | TTATAAATAAA----GTTAATTAAA-AAAA |
Pheidole absurda | (none) | TTATAATTAAAT---ATTAATTAAA-TAAA |
Pheidole fimbriata | (none) | TTTT-AATAAAA---GTTAATTAAT-GAGA |
Pheidole boltoni | (none) | TTATAATTAAAA--AATTAATTAAA-GAGA |
Pheidole rhinoceros | (none) | TTATAATTAAAA----TTAATTAAT-AAAA |
Pheidole bobjohnsoni | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole tucsonica | (none) | TTATAATTAAAA----TTAATTAAT-AAGA |
Pheidole ceres | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole gilvescens | (none) | TTAT-AATTAAA---ATTAATTAAT-AAGA |
Pheidole barbata | (none) | TTATAAATAATA---ATTAATTAAG-AAGA |
Pheidole californica | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-GAGA |
Pheidole rugulosa | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAAA |
Pheidole bicarinata | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole pacifica A | (none) | TTATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AAGA |
Pheidole obtusospinosa A | (none) | TTATAAA-AAGT--AATAGATTAAT-AAAA |
Pheidole adrianoi | (none) | TTATAATTAAAA---GTTAATTAAA-AAGA |
Pheidole coloradensis A | (none) | TTATAAATAAAA---ATT-ATTAAT-AAGA |
Pheidole spadonia | (none) | TTATAAGTAAATTTAATT-ATTAAT-AAGA |
Pheidole cerebrosior | (none) | TTATAATTAAGA--ATTTTATTAAT-AAGA |
Pheidole tepicana | (none) | TTATAATTAAGA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole cavigenis | (none) | TTATAAATAAAA--AGTT-GTTAAT-AAGA |
Pheidole senex | (none) | TTATAATTAAAA--AATT-ATTAAT-AAGA |
Pheidole artemisia | (none) | TTATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AAGA |
Pheidole soritis | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole micula | (none) | TTATAATTAAAG---ATTAATTAAA-AAAA |
Pheidole militicida | (none) | TTATAAATAAAA---ATTAATTAAG-AAAA |
Pheidole xerophila | (none) | TTATAATTAAAA----TTAATTAAT-AAGA |
Pheidole davisi | (none) | TTATAATTAAAA---GTTAATTAAA-AAGA |
Pheidole titanis | (none) | TTAT-AAAAAA---TTGTAATTAAT-AAAA |
Pheidole hoplitica | (none) | TTTTAATTAAAA---ATTGTTTAAT-TAGA |
Pheidole polymorpha A | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole polymorpha B | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole psammophila | (none) | TTGTAAAGTAAA--AATTAATTAAG-AAGA |
Pheidole vinelandica | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA |
Pheidole pacifica B | (none) | ?????????????????????????????? |
Pheidole clementensis | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-GAGA |
Pheidole macrops | (none) | TTATAATTAAAA---ATTACTTAAA-GGGA |
Pheidole yaqui | (none) | TTATAATTAATA---ATTAATTAAA-GAGA |
Pheidole coloradensis B | (none) | TTATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AAGA |
Pheidole inquilina | (none) | TAATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AATA |
Pheidole rufescens | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-AAGA |
Pheidole obtusospinosa B | (none) | TTATAAA-AAGT--AATAGATTAAT-AAAA |
Pheidole pilifera | (none) | TTATAAATAAA---AATT-ATTAAT-AAGA |
Pheidole carrolli | (none) | TTATAAATAAA---AATT-ATTAAT-AAGA |
Pheidole littoralis | (none) | TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-AAGA |
Pheidole rhea B | (none) | ????????TAAT----TTAGTTAAT-AAGA |
Pheidole rhea A | (none) | TTTTAAATA-AT----TTAGTTAAT-AAGA |
Cephalotes unimaculatus | (none) | TTAT-AGTTAAA---ATTAATTAAT-TGGA |
Cephalotes sp. | (none) | ???????????????TTTTGTTAAA-AAAA |
Myrmica incompleta | (none) | TTGA-AATTAAA---TTAATTTAATTTATA |
Tranopelta subterranea | (none) | TTTAAATATAAA-TTATTTTTTAAT-TGAA |
Procryptocerus batesi | (none) | TTTTAAAATAAA-GTAAAAAATGCT-GAG- |
Atta sp. | (none) | TTGTAAGATAAA---ATTAGATAAT-TAAA |
Trachymyrmex jamaicensis | (none) | TTATTAT-AATGAAAAAGAATTAA--TAAA |
Cyphomyrmex sp. | (none) | TTATTTTTTATATGTCTAAGTAAAT-GAAG |
Oxyopomyrmex insularis | (none) | ???T--TTAAAATAAGTAGTGAAAT-TAAA |
Goniomma hispanicum | (none) | ?????????????????????????????? |
Aphaenogaster senilis | (none) | TTATTGTAAGGT-GATTTAATTAATTTGAA |
Aphaenogaster texana | (none) | TTATTAT-AGTAAAAAAAAGTTAATTTCAA |
Messor bouvieri | (none) | TTATTATAAAAAAAAATAAATTGATTTAAA |
Aphaenogaster sp. | (none) | CTATTATTTAATTAAATTAATTAAATTAGA |
Messor julianus | (none) | TTTTA---GGAGATATATACTTAT--TAGA |
Messor pergandei | (none) | TTCTAAATGGATAATAAAATTTTAT-TAGA |
Ocymyrmex picardi | (none) | TTATTTTAATAAGGAGT--TGAGATT-AAA |
Pogonomyrmex maricopa | (none) | TTATTCAAAATAAGGATTAAAAGACT-GGT |
Prenolepis imparis | (none) | TTATTTAAATTAAGAATAATAAAATT-AAA |
Lasius alienus | (none) | TTATTTTAATG-ATAATAAATTAATT-AAA |
Brachymyrmex sp. | (none) | TTATTTAAATTTAAAATAAAAAAATT-AAA |
Columns
None of the columns has a description.