CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 5239 of Study 10430

About Citation title: "Unraveling the evolutionary history of the ?hyperdiverse? ant genus Pheidole (Hymenoptera: Formicidae)".
About Study name: "Unraveling the evolutionary history of the ?hyperdiverse? ant genus Pheidole (Hymenoptera: Formicidae)".
About This study is part of submission 10420 (Status: Published).

Matrices

Title: Pheidole 5 gene matrix

Description: 12S, cox1, cytb, H3, LR

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Pheidole biconstricta  (none) TTGTAATAAAAA--TATTAATTATT-AAAA
Pheidole vallicola  (none) TTATAAAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole diversipilosa  (none) TCAT-AAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole tetra  (none) TTATAAAAAAAA---AATAATTAAT-AGAA
Pheidole crassicornis  (none) ????????????????????TTA?T-AAG?
Pheidole boruca  (none) TTATAATTAAAA--AATTAATTAAA-AAAA
Pheidole laticornis  (none) TTATAATAATAA--ATTTATTTAAT-AAAA
Pheidole indistincta  (none) TTAT-AATAAGG-AATGCAGTTAAT-AAGA
Pheidole diana  (none) TTATAATAAATA--TAAAAATTAAG-AAGA
Pheidole sicaria  (none) TTATAAATAAAT---ATTAATTGAT-AAAA
Pheidole sensitiva  (none) TTTTAATAAAAA---ATTAATTAAT-AAAA
Pheidole violacea  (none) TTAT-AAAAAAA---AATAATTAAT-AAGA
Pheidole cocciphaga  (none) TTAT-AATAAAA--ATTTAAATAAT-AAAA
Pheidole innupta  (none) TTATAATAAATA---TAAGGTTAAG-AAGA
Pheidole prostrata  (none) TTATAATTAAGA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole desertorum  (none) TTATAAAAAGAA--ATTTGATTAGT-AAGA
Pheidole dentata  (none) TTATA-ATAAAA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole xanthogaster  (none) TTGTAATAAAAA--TATTAATTATT-AAAA
Pheidole astur  (none) TTATAAAAAAAA-AAATTAATTAAT-AGAA
Pheidole fissiceps  (none) TTGTAAAAAAAG-ATATTTAATAAT-AAAA
Pheidole obscurithorax  (none) TTATAAAAAAAG--AGTTAATTAAT-AAAA
Pheidole dossena  (none) TTTTATAATAAA--AATTGGTTAAT-AAAA
Pheidole caltrop  (none) TTATAAATAAAA---TTTGATTAAA-TAGA
Pheidole indagatrix  (none) TTATA-GTAGAA--GATTAATTAAT-AAGA
Pheidole fiorii  (none) TTAT-AATAAAA--AATTGATTAAT-AAGA
Pheidole sciophila  (none) TTATAAAAAAAA---ATT-ATTAAT-AAGA
Pheidole vistana  (none) TTGTAAAAAAAT----TAAATTAAT-AAGA
Pheidole jelskii  (none) TTATAAAAAAAA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole sitiens  (none) TTATAAAAATAA----TTAATTAGT-AAGA
Pheidole perpilosa  (none) TTATAAAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole hyatti  (none) TTATAAAAAAAA----ATAATTAAA-AGAA
Pheidole cockerelli  (none) TTATAAAAAAAA---ATTAATTGAT-AAGA
Pheidole morrisi  (none) TTATAAAAAAAA---ATTAAATAAT-AGGA
Pheidole portalensis  (none) ??????????????TCAA-ACTAAT-AAGA
Pheidole sciara  (none) ???????????A---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole amazonica  (none) TTATAAATAAAG---TTTATTTGAG-TAGA
Pheidole sospes  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-AAGA
Pheidole moerens  (none) ??????????????????????????????
Pheidole minutula  (none) TTATAAATAAGT---TTTAATTAAA-AAGA
Pheidole sagittaria  (none) TTATAATTAAAA----AAGATTAAG-AAGA
Pheidole anastasii  (none) TTGTAAATAATA-AAATTTAATAAT-GAGA
Pheidole bilimeki  (none) TTATAAATAATA-ATATTTAATAAT-AAGA
Pheidole erratilis  (none) TTATAAATAAAA---TTTAATTAAG-TAAA
Pheidole browni  (none) TTATAATTAAGA---ATTAATTAAA-AAAA
Pheidole umphreyi  (none) TTATAATTAAAA--AATTAATTAAA-GAGA
Pheidole striaticeps  (none) TTATAATTAAAA--AATTAATTAAT-AAGA
Pheidole nitella  (none) TTA??AATAAAA---AAAAATTAAG-AAGA
Pheidole flavens  (none) TTATATTTAAAT---ATAAATTAAG-AAGA
Pheidole nitidicollis  (none) TTATAAATAAAA---TTTAGTTAAA-TAGA
Pheidole laselva  (none) TTATAATTAAGA---AAAATTTAAA-AAGA
Pheidole floridana  (none) TTATAAATAATA-ATATTTAATAAT-AAGA
Pheidole tysoni  (none) TTATAAGTAAAA---ATTAGGTAAT-AAAA
Pheidole metallescens  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole juniperae  (none) TTATAAATAAA----ATTAGTTAAT-AAAA
Pheidole casta  (none) TTATAAGTAAG----TTTAATTAAT-TAGA
Pheidole harlequina  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-GAGA
Pheidole constipata  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole furtiva  (none) TTATAAAAATAA--AGTTAATTGAT-AAGA
Pheidole clydei  (none) TTATAGGTAATA-AAATAAAATAAT-AAGA
Pheidole granulata  (none) TTATAAAAAAAA---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole truncula  (none) TTATAATTAAAA---GTTAATTAAA-AAGA
Pheidole pelor  (none) TTATAGATAAAA--AATTAATTAAT-GAGA
Pheidole sp.1Madg  (none) TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole megacephala Aust  (none) TTAT-AATTAAA---ATTAGTTAAT-AAAA
Pheidole sp. Aust  (none) TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA
Pheidole ampla Aust  (none) TTAT-AATTAAA---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole variabilis Aust  (none) TTTTAAATAAAG----TTAATTAAT-AAGA
Pheidole quadrensis Borneo  (none) TTATAATAAAGA----TTAGTTAAT-AAAA
Pheidole comata Borneo  (none) TTTTAAATAAG----AATAATTAAT-AAGA
Pheidole quadricuspis Borneo  (none) TTATAATTAAGA----TTAGTTAAT-AAAA
Pheidole pallidula France  (none) TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-TAAA
Pheidole sp.a Ghana  (none) TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole sp.b Ghana  (none) TTAT-TGTAATTAAAATTAATTAAT-TAAA
Pheidole sp.c Ghana  (none) TTAT-AATTAAA---ATAAATTAAT-AAAA
Pheidole sp.d Ghana  (none) TTATAAATTAAA---ATTGAATAAT-TAAG
Pheidole sp.a Indonesia  (none) TTATATATCTAA--AATTAATTAAT-AAGA
Pheidole sp.b Indonesia  (none) TTATAATTAAAG----TTGATTAAT-AAGA
Pheidole sp.5 Ivory Coast  (none) ????????TAAG---ATTGAATAAT-TAAG
Pheidole sp.8 Ivory Coast  (none) TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole sp.a Madg  (none) TTATAAATAAAA---TTTAATTAAT-AAGA
Pheidole sp.b Madg  (none) TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole sp.c Madg  (none) TTATAAATAAAA---TTTAATTAAT-AAGA
Pheidole sp.d Madg  (none) TTATAATTAAGA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole sexspinosa Palau  (none) TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA
Pheidole oceanica Palau  (none) TTTTAATTAAAG----TTAGTTAAT-AAGA
Pheidole sp.a PNG  (none) TTATAAATAAAA--ATTTAATTAAT-AAGA
Pheidole sp.b PNG  (none) TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AGGA
Pheidole sp.c PNG  (none) TTTT-AATAAAA---ATTAATTAAT-AAAA
Pheidole sp.d PNG  (none) TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA
Pheidole sp.e PNG  (none) TTTTAAATAAAA----TTAATTAAT-AGGA
Pheidole sp. Sumatra  (none) TTAT-TATAATTAAAATTAATTAAT-AAAA
Pheidole dugasi Thailand  (none) TTATAAATAAAA---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole protea Thailand  (none) TTATAATTAAG----GTTAATTAAT-AAGA
Pheidole tandjongensis Thailand  (none) TTATAATTAAAG---TTAAATTAAT-AAGA
Pheidole gatesi Vietnam  (none) TTATAAATAAAA----TTAATTAAT-AAGA
Pheidole noda Vietnam  (none) TTATAAATAAGA----TTAATTTAT-AAGA
Pheidole plagiara Vietnam  (none) TTATAAT-TAAG---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole mamore  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAT-AAAA
Pheidole scrobifera  (none) TTGCAATTAAAG---ATTAATTAAG-AAGA
Pheidole tristicula  (none) TTGT-AATAAAA-TTGTTGATTGAT-AAAA
Pheidole cephalica  (none) TTATAAAATAAA---ATTAATTAAT-AAAA
Pheidole cramptoni  (none) TTATAAATAAAG---TTTAATTAAA-TAGA
Pheidole allarmata  (none) TTTT-AAT-GAA--GATTAATTAAT-GAGA
Pheidole subarmata  (none) TTATAAATAAA----GTTAATTAAA-AAAA
Pheidole absurda  (none) TTATAATTAAAT---ATTAATTAAA-TAAA
Pheidole fimbriata  (none) TTTT-AATAAAA---GTTAATTAAT-GAGA
Pheidole boltoni  (none) TTATAATTAAAA--AATTAATTAAA-GAGA
Pheidole rhinoceros  (none) TTATAATTAAAA----TTAATTAAT-AAAA
Pheidole bobjohnsoni  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole tucsonica  (none) TTATAATTAAAA----TTAATTAAT-AAGA
Pheidole ceres  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole gilvescens  (none) TTAT-AATTAAA---ATTAATTAAT-AAGA
Pheidole barbata  (none) TTATAAATAATA---ATTAATTAAG-AAGA
Pheidole californica  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-GAGA
Pheidole rugulosa  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAAA
Pheidole bicarinata  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole pacifica A  (none) TTATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AAGA
Pheidole obtusospinosa A  (none) TTATAAA-AAGT--AATAGATTAAT-AAAA
Pheidole adrianoi  (none) TTATAATTAAAA---GTTAATTAAA-AAGA
Pheidole coloradensis A  (none) TTATAAATAAAA---ATT-ATTAAT-AAGA
Pheidole spadonia  (none) TTATAAGTAAATTTAATT-ATTAAT-AAGA
Pheidole cerebrosior  (none) TTATAATTAAGA--ATTTTATTAAT-AAGA
Pheidole tepicana  (none) TTATAATTAAGA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole cavigenis  (none) TTATAAATAAAA--AGTT-GTTAAT-AAGA
Pheidole senex  (none) TTATAATTAAAA--AATT-ATTAAT-AAGA
Pheidole artemisia  (none) TTATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AAGA
Pheidole soritis  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole micula  (none) TTATAATTAAAG---ATTAATTAAA-AAAA
Pheidole militicida  (none) TTATAAATAAAA---ATTAATTAAG-AAAA
Pheidole xerophila  (none) TTATAATTAAAA----TTAATTAAT-AAGA
Pheidole davisi  (none) TTATAATTAAAA---GTTAATTAAA-AAGA
Pheidole titanis  (none) TTAT-AAAAAA---TTGTAATTAAT-AAAA
Pheidole hoplitica  (none) TTTTAATTAAAA---ATTGTTTAAT-TAGA
Pheidole polymorpha A  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole polymorpha B  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole psammophila  (none) TTGTAAAGTAAA--AATTAATTAAG-AAGA
Pheidole vinelandica  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAA-AAGA
Pheidole pacifica B  (none) ??????????????????????????????
Pheidole clementensis  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-GAGA
Pheidole macrops  (none) TTATAATTAAAA---ATTACTTAAA-GGGA
Pheidole yaqui  (none) TTATAATTAATA---ATTAATTAAA-GAGA
Pheidole coloradensis B  (none) TTATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AAGA
Pheidole inquilina  (none) TAATAAATAAA---AATT-GTTAAT-AATA
Pheidole rufescens  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-AAGA
Pheidole obtusospinosa B  (none) TTATAAA-AAGT--AATAGATTAAT-AAAA
Pheidole pilifera  (none) TTATAAATAAA---AATT-ATTAAT-AAGA
Pheidole carrolli  (none) TTATAAATAAA---AATT-ATTAAT-AAGA
Pheidole littoralis  (none) TTATAATTAAAA---ATTAATTAAG-AAGA
Pheidole rhea B  (none) ????????TAAT----TTAGTTAAT-AAGA
Pheidole rhea A  (none) TTTTAAATA-AT----TTAGTTAAT-AAGA
Cephalotes unimaculatus  (none) TTAT-AGTTAAA---ATTAATTAAT-TGGA
Cephalotes sp.  (none) ???????????????TTTTGTTAAA-AAAA
Myrmica incompleta  (none) TTGA-AATTAAA---TTAATTTAATTTATA
Tranopelta subterranea  (none) TTTAAATATAAA-TTATTTTTTAAT-TGAA
Procryptocerus batesi  (none) TTTTAAAATAAA-GTAAAAAATGCT-GAG-
Atta sp.  (none) TTGTAAGATAAA---ATTAGATAAT-TAAA
Trachymyrmex jamaicensis  (none) TTATTAT-AATGAAAAAGAATTAA--TAAA
Cyphomyrmex sp.  (none) TTATTTTTTATATGTCTAAGTAAAT-GAAG
Oxyopomyrmex insularis  (none) ???T--TTAAAATAAGTAGTGAAAT-TAAA
Goniomma hispanicum  (none) ??????????????????????????????
Aphaenogaster senilis  (none) TTATTGTAAGGT-GATTTAATTAATTTGAA
Aphaenogaster texana  (none) TTATTAT-AGTAAAAAAAAGTTAATTTCAA
Messor bouvieri  (none) TTATTATAAAAAAAAATAAATTGATTTAAA
Aphaenogaster sp.  (none) CTATTATTTAATTAAATTAATTAAATTAGA
Messor julianus  (none) TTTTA---GGAGATATATACTTAT--TAGA
Messor pergandei  (none) TTCTAAATGGATAATAAAATTTTAT-TAGA
Ocymyrmex picardi  (none) TTATTTTAATAAGGAGT--TGAGATT-AAA
Pogonomyrmex maricopa  (none) TTATTCAAAATAAGGATTAAAAGACT-GGT
Prenolepis imparis  (none) TTATTTAAATTAAGAATAATAAAATT-AAA
Lasius alienus  (none) TTATTTTAATG-ATAATAAATTAATT-AAA
Brachymyrmex sp.  (none) TTATTTAAATTTAAAATAAAAAAATT-AAA

Columns

None of the columns has a description.