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Matrix 10467 of Study 11988

About Citation title: "The Great American Biotic Interchange in frogs: multiple and early colonization of Central America by the South American genus Pristimantis (Anura: Craugastoridae)".
About Study name: "The Great American Biotic Interchange in frogs: multiple and early colonization of Central America by the South American genus Pristimantis (Anura: Craugastoridae)".
About This study is part of submission 11988 (Status: Published).

Matrices

Title: Pristimantis Allgenes

Description: COI,16S,12S,Rag1,Tyr

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Agalychnis callidryas  (none) ??????????????????????????????
Craugastor daryi UTA A57940  (none) ??????????????????????????????
Diasporus hylaeformis UCR 16264  (none) ??????????TCTTTGGGGCCTGAGCCGCA
Diasporus vocator FMNH 257769  (none) ??????????????????ACATGAGCTGCA
Pristimantis ockendeni QCAZ 25428  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis miyatai RC 610  (none) ????????????TTTGGCGCTTGAGCTGGG
Pristimantis taeniatus ANDES-A 480  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis viejas ANDES-A 470  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis paisa ANDES-A 466  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis viejas ANDES-A 637  (none) CTATAT?TTATTTTTGGGGCCTGAGCTGGC
Pristimantis aff. taeniatus 3 ANDES-A638  (none) CTTTACTTAGTATTCGGAGCTTGAGCTGGC
Pristimantis suetus MHUA 0440  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis gaigei ANDES-A 639  (none) CTATATTTAGTATTTGGGGCCTGGGCAGGC
Pristimantis aff. taeniatus 3 ANDES-A 640  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis zophus ANDES-A 65  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ockendeni QCAZ 25766  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis savagei ANDES-A 79  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis savagei ANDES-A 81  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis frater ANDES-A 84  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis taeniatus ANDES-A 501  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis martiae QCAZ17998  (none) CTTTACCTATTATTTGGAGCATGGGCCGGC
Pristimantis affinis ANDES-A 0026  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis bogotensis ANDES-A 28  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis nervicus ANDES-A 42  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. taeniatus 3 ANDES-A 48  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis erythropleura ANDES-A 49  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis erythropleura ANDES-A 51  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ptochus ANDES-A 52  (none) CTTTATTTACTATTCGGGGCATGAGCTGGC
Pristimantis brevifrons ANDES-A 53  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis librarius QCAZ 25852  (none) CTCTACCTGCTATTCGGAGCATGGGCTGGT
Pristimantis zophus ANDES-A 54  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. taeniatus 3 ANDES-A 61  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. taeniatus 3 ANDES-A 485  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis viejas ANDES-A 496  (none) TTATATCTTATTTTTGGGGCCTGGGCCGGC
Pristimantis aff. taeniatus 2 ANDES-A 0486  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis gaigei ANDES-A 0494  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis quaquaversus QCAZ16150  (none) CTCTACATAATATTCGGAGCTTGAGCTGGT
Pristimantis taeniatus ANDES-A 641  (none) ?????????????????????TGAGCCGGC
Pristimantis zophus ANDES-A 0066  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. taeniatus 1 ANDES-A 635  (none) CTATATCTTGTATTTGGAGCTTGAGCTGGC
Craugastor longirostris MVUP 2019  (none) ??????????????????????????????
Craugastor longirostris ANDES-A 636  (none) TTGTACCTTCTCTTTGGGGCCTGAGCGGGC
Pristimantis gaigei MHUA 4812  (none) CTATATTTAGTATTTGGGGCCTGGGCCGGC
Pristimantis quaquaversus QCAZ 25676  (none) ????????????????????????GCTGGC
Pristimantis paisa MHUA 4811  (none) CTATACCTTGTATTTGGGGCCTGGGCCGGC
Pristimantis martiae QCAZ 18018  (none) CTTTACCTATTATTTGGAGCATGGGCCGGC
Litoria caerulea  (none) ??????????????????????????????
Lynchius flavomaculatus KU 218210  (none) ??????????????????????????????
Lynchius nebulanastes KU 181408  (none) ??????????????????????????????
Oreobates cruralis KU 215462  (none) ??????????????????????????????
Oreobates saxatilis KU 212327  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis acerus KU217786  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis achatinus MVUP 1859  (none) TTATACCTGGTATTCGGAGCCTGGGCGGGT
Pristimantis achatinus KU 217809  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis actites KU 217830  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis acuminatus QCAZ 19664  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis albertus KU 291675  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis altae UCR 16472  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis altamazonicus KU 215460  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aniptopalmatus KU 291627  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis appendiculatus KU 177637  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ardalonychus KU 212301  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis bipunctatus KU 291638  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis bromeliaceus KU 291702  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis buckleyi KU 217836  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cajamarcensis KU 217845  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis calcarulatus KU 177658  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis caprifer KU 177680  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis caryophyllaceus UCR 16434  (none) CTTTACCTTGTGTTTGGGGCATGAGCTAGC
Pristimantis caryophyllaceus AJC 1138  (none) CTTTACCTCATGTTTGGAGTATGAGCTAGT
Pristimantis caryophyllaceus  (none) CTTTACTTTGTATTTGGGGCATGAGCTAGC
Pristimantis celator KU 177684  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cerasinus UCR 16429  (none) CTATACCTAGTATTCGGAGCCTGAGCTGGC
Pristimantis cerasinus AJC 1142  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ceuthospilus KU 212216  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. cruentus FMNH 257553  (none) CTAT?TTTTGTATTTGGGACCTGAGCCGGC
Pristimantis cf mendax MTD 45080  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cf. laemus MTD 45073  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. taeniatus 1 AJC 1683  (none) CTATATCTTGTATTTGGAGCTTGAGCTGGC
Pristimantis chalceus KU 177638  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis chiastonotus 162AF  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis chloronotus KU 202325  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis citriogaster KU 212278  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis colomai QCAZ 17101  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis condor KU 217857  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis conspicillatus QCAZ 28448  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cremnobates KU 177252  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis crenunguis KU 177730  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis croceoinguinis KU 217862  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis crucifer KU 177733  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cruciocularis KU 291673  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cruentus UCR 16447  (none) ATAT?CCTTATTTTCGGGGCCTTGGCCGGG
Pristimantis cruentus UCR 16438  (none) ATATACCTTGTTTT?GGGGCCTTAGCTGGG
Pristimantis cruentus AJC 0581  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cruentus AJC 1128  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cruentus MVUP 1781  (none) ATATACCTTATTTTCGGGGCCTT?GCCGGG
Pristimantis cruentus CH 6721  (none) ATATACCTTATTTTCGGGGCCTTTGCTGGG
Pristimantis cryophilius KU 217863  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis curtipes KU 217871  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis danae IDLR 4815  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis dendrobatoides ROM 43318  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis devillei KU 217991  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis diadematus KU 221999  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis dissimulatus KU 179090  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis duellmani KU 217998  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis eriphus QCAZ 32705  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis euphronides BWMC 6918  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis danae UTA-A 60915  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis fenestratus MHNSM 9298  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis festae KU 218234  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis gaigei CH 6471  (none) CTATATCTGGTGTTTGGGGCCTGAGCAGGC
Pristimantis gaigei KRL 8880  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis galdi QCAZ 32368  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis gentryi KU 218109  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis glandulosus KU 218002  (none) ??????????????????????????????
Phrynopus auriculatus KU 291634  (none) ??????????????????????????????
Phrynopus bracki USNM 286919  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis imitatrix KU 215476  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis inguinalis ROM 40164  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis inusitatus KU 218015  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis jester ROM 43302  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis koehleri MNCN 42990  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis labiosus QCAZ 19771  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis lanthanites KU 222001  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis latidiscus KU 218016  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis leoni KU 218227  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis lirellus KU 212226  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis luteolateralis KU 177807  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis lymani KU 218019  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis malkini QCAZ 28296  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis marmoratus 77mc  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis marmoratus ROM 43913  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis melanogaster MHNSM-WED 56846  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis minutulus EU 186657  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis moro AJC 1753  (none) TTATACTTAATCTTTGGCGCCTGAGCAGGG
Pristimantis moro AJC 1860  (none) TTGTACTTAATCTTTGGTGCCTGAGCAGGA
Pristimantis museosus AJC1210  (none) CTAT?CCTGGTATTTGGGGCCTGGGCTGGT
Pristimantis nyctophylax KU 177812  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ockendeni KU 222023  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ocreatus KU 208508  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis orcesi KU 218021  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis orestes KU 218257  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis pardalis FMNH 257675  (none) ?????????????????????TGGGCCGGA
Pristimantis pardalis CH 6284  (none) CTTTACTTATTGTTCGGAGCTTGAGCTGGA
Pristimantis pardalis KRL 0690  (none) ?????????????????????TGAGCTGGG
Pristimantis parvillus KU 177821  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis peruvianus MUSM 26931  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis peruvianus MHNSM 9267  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis petrobardus KU 212293  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis phoxocephalus KU 218025  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis pirrensis CH 5641  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis platydactylus UTA-A 60902  (none) ???????????????GGAGCTTGAGCCGGC
Pristimantis pluvicanorus AMNHA 165195  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis prolatus KU 177433  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis pulvinatus KU 181015  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis pycnodermis KU 218028  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis pyrrhomerus KU 218030  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis quinquagesimus KU 179374  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis reichlei MNCN 43249  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis rhabdocnemus KU 291651  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis rhabdolaemus KU173492  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis rhodoplichus KU 219788  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ridens FMNH257768  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis ridens FMNH 257697  (none) CTATACCTCATCTTTGGTGCCTGAGCTGGC
Pristimantis ridens UTA-A 57014  (none) CTGTACCTCGTATTCGGGGCTTGAGCTGGT
Pristimantis riveti KU 218035  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis rozei 102308  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis sagittulus KU 291635  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis saltissimus ROM 43310  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis samaipatae MNKA 6626  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis schultei KU 212220  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis shrevei 266036  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis simonbolivari KU 218254  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis simonsii KU 212350  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis skydmainos MHNSM 10071  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. altamazonicus MUSM 26912  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis cf. toftae 26791  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. altamazonicus MUSM 26911  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis aff. altamazonicus MUSM26912  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis spinosus KU 218052  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis stictogaster KU 291659  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis subsigillatus KU 218147  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis supernatis AY326005  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis supernatis KU 202432  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis surdus KU 177847  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis taeniatus AJC 1126  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis taeniatus AJC 1839  (none) CTTTACTTAGTCTTTGGGGCCTGAGCCGGT
Pristimantis taeniatus CH 4999  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis terraebolivaris EU 186650  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis thymalopsoides KU 177861  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis thymelensis QCAZ 16428  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis toftae KU 215493  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis truebae KU 218013  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis unistrigatus KU 218057  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis urichi USNM 336098  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis verecundus QCAZ 12410  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis versicolor KU 218096  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis vertebralis KU 177972  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis walkeri KU 218116  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis wiensi KU 219796  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis wnigrum AY 326004  (none) ??????????????????????????????
Pristimantis zeuctotylus ROM 43978  (none) ??????????????????????????????

Columns

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