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Matrix 3236 of Study 13120
Citation title: "The higher-level phylogeny of Archosauria (Tetrapoda: Diapsida).".
Study name: "The higher-level phylogeny of Archosauria (Tetrapoda: Diapsida).".
This study is part of submission 13120
(Status: Published).
Matrices
Title: MYC
Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M3901
Rows
| Taxon Label | Row Segments | Characters 1?–30 |
|---|---|---|
| Alligator mississippiensis | (none) | ?????????????????????????????? |
| Gavialis gangeticus | (none) | ?????????????????????????????? |
| Acanthisitta chloris | (none) | CGCTGT---ACTGCCGACAACCGAGGTTAA |
| Aegotheles insignis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Aerodramus vanikorensis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Alcedo leucogaster | (none) | CACTGT---ACTGCTGACAAGCGAGGTTAA |
| Alectura lathami | (none) | CGCTGT---GCTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Alisterus scapularis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Anas platyrhynchos | (none) | TGCTTT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Anhinga anhinga | (none) | CGCTGC---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Anser erythropus | (none) | TGCTTT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Anseranas semipalmata | (none) | CGCTGT---GCTGCTGACAAACGAGGTTAA |
| Apteryx australis | (none) | CGCTGT---GCTGCTGACAATCGAGGTTAA |
| Aramus guarauna | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Ardea herodias | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Arenaria interpres | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Aythya americana | (none) | TGCTTT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Balaeniceps rex | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Batrachostomus septimus | (none) | TGCCGT---ACTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Biziura lobata | (none) | TGCTTT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Bombycilla garrulus | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Brachypteracias squamigera | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Bucco macrodactylus | (none) | TGCTGT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Bucorvus abyssinicus | (none) | ?????????????????????????????? |
| Burhinus bistriatus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Buteo jamaicensis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Cacatua sulphurea | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCAAGGTTAA |
| Capito niger | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Caprimulgus longirostris | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Cariama cristata | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Casuarius casuarius | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAATCGAGGTTAA |
| Cathartes aura | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Centropus viridis | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTGA |
| Chalcopsitta cardinalis | (none) | CACTGT---ACTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Charadrius vociferus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Chauna torquata | (none) | CGCTGT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Choriotis kori | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACGAGCGAGGTTAA |
| Ciconia ciconia | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Climacteris erythrops | (none) | CGCCGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Coccyzus americanus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Cochlearius cochlearius | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Colibri coruscans | (none) | CGGCGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Colinus cristatus | (none) | CGCTGC---{AG}CTGCTGACAGCCGAGGT |
| Colius colius | (none) | CCCTGT---ACTGCTGACAAGCGAGGTTAA |
| Columba livia | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Columbina passerina | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Coracias caudata | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Corvus corone | (none) | CGCCGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Corythaeola cristata | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Coturnix coturnix | (none) | CGCTGC---GCTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Coua cristata | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCTGAGGTTAA |
| Crax alector | (none) | CGCGGC---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Crotophaga sulcirostris | (none) | ?????????????????????????????? |
| Crypturellus soui | (none) | CGCTG-----------ACAGTCGAGGTTAG |
| Cuculus canorus | (none) | ?????????????????????????????? |
| Daptrius ater | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTTA |
| Dendrocolaptes certhia | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Diomedea nigripes | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Dromaius novaehollandiae | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAATCGAGGTTAA |
| Dromas ardeola | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Dryocopus pileatus | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Eudocimus albus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Eudromia elegans | (none) | CGCTG-----------ACGGTCGAGGTTAG |
| Eudyptula minor | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Eupodotis ruficrista | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACGAGCGAGGTTAA |
| Eurostopodus macrotis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Eurypyga helias | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Falco mexicanus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTTA |
| Fregata magnificens | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Fringilla montifringilla | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Galbula albirostris | (none) | CGCTGT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Gallus gallus | (none) | CGCTGC---GTTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Gampsonyx swainsonii | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Gavia immer | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Geococcyx californianus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Geotrygon montana | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Grallaria varia | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Grus canadensis | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Haematopus ostralegus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Heliornis fulica | (none) | GGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Hemiprocne mystacea | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Herpetotheres cachinnans | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Himantornis haematopus | (none) | GGCTGT---ACTGCTGACAAACGAGGTTAA |
| Indicator maculatus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Jacana jacana | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Larus marinus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Leptosomus discolor | (none) | CGCTGT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Malacorhynchus membranaceus | (none) | TGCTTT---GCCGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Malurus melanocephalus | (none) | CGCCGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Megalaima virens | (none) | CCCTGT---ACTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Megapodius eremita | (none) | CACTGT---GCTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Menura novaehollandiae | (none) | CGCCGT---ACTGCTGACAAC{CT}GAGGT |
| Merops nubicus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGATAA |
| Mesitornis unicolor | (none) | TGCTGT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Micrastur semitorquatus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Micropsitta finschii | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Mionectes macconnelli | (none) | CGCTGT---ACTGCT{AG}ACAACCGAGGT |
| Momotus momota | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Monias benschi | (none) | TGCTGT---GCTGCTGACAACGGAGGTTAA |
| Morus bassanus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Nothoprocta perdicaria | (none) | CGCTG-----------ACAGTCGAGGTTAG |
| Numida meleagris | (none) | CGCTGC---GCTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Nyctibius bracteatus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Nyctibius grandis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Oceanites oceanicus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Oceanodroma tethys | (none) | CGCTGA---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Opisthocomus hoazin | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTCA |
| Otidiphaps nobilis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Oxyura jamaicensis | (none) | TGCTCT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pandion haliaetus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Passer montanus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pedionomus torquatus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pelecanoides urinatrix | (none) | CGCTGA---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pelecanus occidentalis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phaenicophaeus curvirostris | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Phaethon lepturus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phaethon rubricauda | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phaethornis griseogularis | (none) | CGGCGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phalacrocorax carbo | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pharomachrus auriceps | (none) | CGCTGT---TCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phegornis mitchellii | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phodilus badius | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phoenicopterus chilensis | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Phoeniculus purpureus | (none) | TGCTGTGCTGCTGCTGACATCTGAGGTTCA |
| Picathartes gymnocephalus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pipra coronata | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pitta guajana | (none) | CGCCGT---ACTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Platycercus elegans | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Ploceus cucullatus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCG{AG}GGT |
| Podargus strigoides | (none) | CGCCGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Podiceps auritus | (none) | CGCTGT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Psittacula alexandri | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Psittacus erithacus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAC |
| Psophia crepitans | (none) | AGCTTT---ATTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Pterocles namaqua | (none) | CGCTGT---TCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Puffinus griseus | (none) | CGCTGA---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Rallus limicola | (none) | GGCTGT---ACTGCTGACAAACGAGGTTAA |
| Regulus calendula | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAGCCGAGGTTAA |
| Rhea americana | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAATCGAGGTTAA |
| Rhynochetos jubatus | (none) | CTCTGT---CCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Rollulus rouloul | (none) | CGCTGC---GCTGCTGACAGCCGAGGTTCA |
| Rostratula benghalensis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Sagittarius serpentarius | (none) | AGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Sapayoa aenigma | (none) | CACCCT---GCTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Sarcoramphus papa | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Sarothrura elegans | (none) | GGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Scopus umbretta | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Scytalopus magellanicus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Smithornis rufolateralis | (none) | CGTGGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Speotyto cunicularia | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTGA |
| Steatornis caripensis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Streptoprocne zonaris | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Strix occidentalis | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Struthio camelus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAATCGAGGTTAA |
| Sylvia nana | (none) | CACTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Syrrhaptes paradoxus | (none) | CGCTGT---TCTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Tauraco erythrolophus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACTGAGGTTAA |
| Thamnophilus nigrocinereus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Thinocorus orbignyianus | (none) | CACTGT---ACGGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Tinamus guttatus | (none) | CGCTG-----------ACAGTCGAGGTTAG |
| Tockus camurus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGGGGCTGA |
| Todus angustirostris | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Treron vernans | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Trogon personatus | (none) | CGCTGT---TCTGCTGACA{AG}CTGAGGT |
| Turdus falklandii | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Turnix sylvatica | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Tyrannus tyrannus | (none) | CGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Tyto alba | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
| Upupa epops | (none) | CGCTGTGCTGCTGCTGACACCCGAGGTTCA |
| Urocolius indicus | (none) | CCCTGT---ACTGCTGACAAGCGAGGTTAA |
| Vidua chalybeata | (none) | TGCTGT---ACTGCTGACAACCGAGGTTAA |
Columns
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