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Matrix 43739 of Study 17936

About Citation title: "Molecular systematics of teioid lizards (Teioidea/Gymnophthalmoidea: Squamata) based on the analysis of 48 loci under tree-alignment and similarity-alignment".
About Study name: "Molecular systematics of teioid lizards (Teioidea/Gymnophthalmoidea: Squamata) based on the analysis of 48 loci under tree-alignment and similarity-alignment".
About This study is part of submission 17936 (Status: Published).

Matrices

Title: Teloids TA + PA

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Acratosaura mentalis  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Acratosaura spinosa  (none) ??????????????????????????????
Adolfus jacksoni  (none) ??????????????????????????????
Alexandresaurus camacan  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Alexandresaurus camacan G  (none) ??????????????????????????????
Alopoglossus angulatus  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Alopoglossus atriventris  (none) AAGATTAC---GGG-------T-----T--
Alopoglossus buckleyi  (none) ??????????????????????????????
Alopoglossus copii  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Alopoglossus copii G  (none) ??????????????????????????????
Alopoglossus festae  (none) ??????????????????????????????
Alopoglossus viridiceps  (none) ??????????????????????????????
Ameiva aggerecusans  (none) AGGATTAC---GGG-------C-----G--
Ameiva ameiva  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Ameiva bifrontata  (none) AGGATTAC---GGG-------C-----G--
Ameiva concolor  (none) AGGATTAC---GGG-------C-----G--
Ameiva festiva  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Ameiva jacuba  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Ameiva nodam  (none) AGGATTAC---GGG-------C-----G--
Ameiva parecis  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Ameiva quadrilineata  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Ameiva undulata  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Ameivula abaetensis  (none) ??????????????????????????????
Amphiglossus astrolabi  (none) AGAACTAC---AAG-------T-----G--
Amphisbaena fuliginosa  (none) ??????????????????????????????
Amphisbaena fuliginosa G  (none) ??????????????????????????????
Amphisbaena silvestri  (none) ??????????????????????????????
Anadia mcdiarmidi  (none) ??????????????????????????????
Anniella pulchra  (none) ??????????????????????????????
Anolis carolinensis  (none) ??????????????????????????????
Anotosaura collaris  (none) AAAATTAC---GGG-------C-C---T--
Anotosaura vanzolinia  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A---T--
Arthrosaura aff reticulata  (none) ??????????????????????????????
Arthrosaura guianensis  (none) ??????????????????????????????
Arthrosaura hoogmoedi  (none) ??????????????????????????????
Arthrosaura kockii  (none) AAAATTAC---GGG-------T-A---C--
Arthrosaura kockii G  (none) ??????????????????????????????
Arthrosaura kockii T  (none) ??????????????????????????????
Arthrosaura reticulata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A--CC-T
Arthrosaura sp  (none) ??????????????????????????????
Aspidoscelis burti burti  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis burti griseocephala  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis burti stictogrammus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis comumnis  (none) ??????????????????????????????
Aspidoscelis costata costata  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis deppei  (none) AGGATTAC---GGG-------T-----G--
Aspidoscelis gularis scalaris  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis guttata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis hyperythra  (none) AAGATTAC---GGG-------T-----G--
Aspidoscelis inornata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis lineattissima  (none) ??????????????????????????????
Aspidoscelis septemvittata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis sexlineata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis sexlineata sexlineata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis sexlineata viridis  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis tigris aethiops  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis tigris marmoratus  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis tigris maximus  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis tigris punctilinealis  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis tigris septentrionalis  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aspidoscelis tigris tigris  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Aurivela longicauda  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Bachia barbouri  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia bicolor  (none) ??????????????????????????????
Bachia bresslaui  (none) ??????????????????????????????
Bachia dorbignyi  (none) ATAATTAC---GGG-------C-----G--
Bachia flavescens  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia flavescens G  (none) ??????????????????????????????
Bachia heteropa alleni  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia heteropa trinitatis  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia huallagana  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia intermedia  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia monodactylus monodactylus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia monodactylus parkerii  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia panoplia  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia peruana  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia scolecoides  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bachia trisanale  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Bungarus ceylonicus  (none) ATAACTAC---GAG-------------T--
Bungarus fasciatus  (none) ATAACTAC---GAG-------------T--
Callopistes flavipunctatus  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Callopistes maculatus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Calyptommatus confusionibus  (none) ??????????????????????????????
Calyptommatus confusionibus G  (none) ??????????-GAG-------C-----G--
Calyptommatus leiolepis  (none) AAAACTAC---GAG-------C-----G--
Calyptommatus nicterus  (none) ??????????????????????????????
Calyptommatus nicterus G  (none) ??????????-GAG-------C-----G--
Calyptommatus sinebrachiatus  (none) AAAACTAC---GAG-------C-----G--
Calyptommatus sinebrachiatus G  (none) ??????????-GAG-------C-----G--
Caparaonia itaiquara  (none) ??????????????????????????????
Caparaonia itaiquara G  (none) ??????????????????????????????
Cercosaura argulus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Cercosaura eigenmanni  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Cercosaura ocellata  (none) ??????????????????????????????
Cercosaura ocellata ocellata  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Cercosaura oshaughnessyi  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Cercosaura quadrilineatus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Cercosaura schreibersii albostrigatus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Cercosaura schreibersii schreibersii  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Cnemidophorus arenivagus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus gramivagus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus lemniscatus lemniscatus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus lemniscatus splendidus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus ocellifer  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus ocellifer G  (none) AGAATT-C---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus ruatanus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus vanzoi  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Cnemidophorus vanzoi G  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Coleonyx variegatus  (none) AGTACTAC---GAG-------C-----G--
Colobodactylus dalcyanus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Colobodactylus taunayi  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Colobosaura modesta  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Colobosauroides cearensis  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A---A--
Contomastix lacertoides  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Crocodilurus amazonicus  (none) AGAACTAC---GGG-------C-----G--
Dendrelaphis schokari  (none) ??????????????????????????????
Dicrodon guttulatum  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Dipsosaurus dorsalis  (none) ??????????????????????????????
Dipsosaurus dorsalis G  (none) ??????????????????????????????
Dracaena guianensis  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Dryadosaura nordestina  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A---C--
Echinosaura sulcarostrum  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Ecpleopus gaudichaudii  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A---A--
Emoia cyanura  (none) AGAACTAC---AAG-------C-----A--
Feylinia grandisquamis  (none) AGAACTAC---AAG-------T-----G--
Feylinia polylepis  (none) AGAACTAC---AAG-------T-----G--
Gambelia wislizenii  (none) ??????????????????????????????
Gambelia wislizenii G  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Gambelia wislizenii T  (none) ??????????????????????????????
Geocalamus acutus  (none) AGAACTAC---GAG-------C-----G--
Geocalamus acutus G  (none) ??????????????????????????????
Geocalamus acutus T  (none) ??????????????????????????????
Gymnophthalmus cryptus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Gymnophthalmus leucomystax  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Gymnophthalmus pleei  (none) AAGATTAC---GGG-------C-----G--
Gymnophthalmus speciosus  (none) AAAATTAC---GGA-------C-----G--
Gymnophthalmus underwoodi  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Gymnophthalmus underwoodi G  (none) ??????????????????????????????
Gymnophthalmus vanzoi  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Heterodactylus imbricatus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Iphisa elegans elegans  (none) AAAACTAC---GAG-------C-----G--
Iphisa elegans soinii  (none) ??????????????????????????????
Kaieteurosaurus hindsi  (none) ??????????????????????????????
Kentropyx altamazonica  (none) AATATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx altamazonica G  (none) AATATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx borkiana  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx calcarata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx paulensis  (none) AATATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx pelviceps  (none) AAAATTAC---GGG-------T-----G--
Kentropyx sp  (none) AATATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx sp G  (none) AATATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx striata  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx vanzoi  (none) AATATTAC---GGG-------C-----G--
Kentropyx viridistriga  (none) AATATTAC---GGG-------C-----G--
Lacerta viridis  (none) ??????????????????????????????
Lacerta viridis G  (none) ??????????????????????????????
Lacerta viridis T  (none) AGAACTAC---AAG-------T-----G--
Lanthanotus borneensis  (none) ??????????????????????????????
Lepidophyma flavimaculatum  (none) GGGATTAC---AAG-------------C--
Lepidophyma sylvaticum  (none) GGAACTAC---AAG-------------C--
Leposoma annectans  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A---C--
Leposoma baturitensis  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Leposoma nanodactylus  (none) AAAATTAC---GGG----CACC-A---C--
Leposoma puk  (none) AAAATTACG--GGG-------C-A---T--
Leposoma rugiceps  (none) AAAATTAC---GAGC-AT---CAA-C-CT-
Leposoma scincoides  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A---C--
Leposoma scincoides G  (none) AACATTAC---GGG-------C-A---C--
Leposoma sinepollex  (none) ??????????????????????????????
Leposoma sp  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A---C--
Leptodeira annulata  (none) ??????????????????????????????
Mabuya macularia  (none) AGAATTAC---AAG-------T-----G--
Macropholidus annectens  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Macropholidus huancabambae  (none) ??????????????????????????????
Macropholidus ruthveni  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Marinussaurus curupira  (none) AAAATTAC---GGG-------C-A------
Medopheos edracanthus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Mesalina guttulata  (none) AGAATTAC---GAG-------C-----A--
Micrablepharus atticolus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----A--
Micrablepharus maximiliani  (none) -AAATTAC---GAG-------T-----A--
Microlophus thoracicus  (none) AGAACTAC---AAG-------C-----G--
Mionyx guianense  (none) AAAATTAC---GGG-------CAA-T----
Mionyx hexapelis  (none) ??????????????????????????????
Mionyx oswaldoi  (none) AAAATTAC---GAG-------CAAGT-C--
Mionyx oswaldoi G  (none) AAAATTAC---GAG-------CAAGT-C--
Mionyx parietale  (none) AAGATTAC---GAGCTTT---TCA-C-C--
Mionyx percarinatum  (none) AAAATTAC---GAG-------CAA-T----
Mionyx percarinatum G  (none) AAAATTAC---GAG-------CAA-T----
Mionyx southi  (none) ??????????????????????????????
Naja kaouthia  (none) ??????????????????????????????
Namazonurus namaquensis  (none) AGAACTAC---?AG-------------C--
Namazonurus namaquensis G  (none) ??????????????????????????????
Neusticurus aff rudis  (none) ??????????????????????????????
Neusticurus bicarinatus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Neusticurus rudis  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Nothobachia ablephara  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Pantepuisaurus rodriguesi  (none) ??????????????????????????????
Petracola ventrimaculatus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Pholidobolus affinis  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidobolus macbrydei  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidobolus macbrydei G  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidobolus montium  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidoscelis auberi  (none) AGGATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis auberi G  (none) AGGATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis auberi sabulicolor  (none) AGGATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema abbotti  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema alacris  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema boekeri  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema defendor  (none) AGAATTAC-G-GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema ficta  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema ficta G  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema jacta  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema parvoris  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema pocax  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema regularis  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema richardthomasi  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis chrysolaema umbratilis  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis corax  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidoscelis dorsalis  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis erithrocephala  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis exsul  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidoscelis fuscata  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis griswoldi  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis lineolata  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis maynardi  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis plei  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidoscelis pluvianotata  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Pholidoscelis polops  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidoscelis taeniura  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Pholidoscelis wetmorei  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Placosoma cordylinum  (none) AAAATTAC---GGA-------C-----G--
Placosoma glabellum  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Platysaurus pungweensis  (none) ??????????????????????????????
Platysaurus pungweensis G  (none) ??????????????????????????????
Plestiodon egregius  (none) AGAACTAC---AAG-------T-----G--
Plestiodon fasciatus  (none) ??????????????????????????????
Plestiodon laticeps  (none) ??????????????????????????????
Polychrus marmoratus  (none) ??????????????????????????????
Polychrus marmoratus G  (none) ??????????????????????????????
Potamites ecpleopus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Potamites juruazensis  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Potamites strangulatus  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Procellosaurinus erythrocercus  (none) AAAATTAC---AAG-------C-----G--
Procellosaurinus tetradactylus  (none) AAAATTAC---AAG-------C-----G--
Proctoporus bolivianus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus bolivianus Ca5  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus bolivianus Ca6  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus bolivianus Caa  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus bolivianus CaC  (none) AACATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus bolivianus CaG  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus bolivianus CaT  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus chasqui  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus guentheri  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus pachyurus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus sp  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus sucullucu  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus unsaacae  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Proctoporus xestus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Psammodromus algirus  (none) AGAACTAC---AAG-------T-----G--
Psammodromus algirus G  (none) ??????????????????????????????
Psilophthalmus paeminosus  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Ptychoglossus brevifrontalis  (none) AAAATTAC---GGG-------T-----G--
Rhachisaurus brachylepis  (none) AAAATTAC---AAG-------C-----G--
Rhineura floridana  (none) ??????????????????????????????
Rhineura floridana G  (none) AGAACTAC---AAG-------C--------
Riama cashcaensis  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Riama colomaromani  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Riama orcesi  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Riama simoterus  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Riama sp  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Riama unicolor  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Riolama leucosticta  (none) ??????????????????????????????
Riolama leucosticta G  (none) ??????????????????????????????
Riolama leucosticta T  (none) ??????????????????????????????
Scriptosaura catimbau  (none) ??????????????????????????????
Shinisaurus crocodilurus  (none) AGAATTAC---AAG-------T-----G--
Smaug warreni  (none) AGAACTAC---AAG-------------C--
Smaug warreni depressus  (none) ??????????????????????????????
Sphenomorphus simus  (none) ??????????????????????????????
Sphenomorphus solomonis  (none) ??????????????????????????????
Stenolepis ridleyi  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Stenolepis ridleyi G  (none) ??????????????????????????????
Takydromus sexilineatus ocellatus  (none) ??????????????????????????????
Teius teyou  (none) AGAATTAC---GGG-------C-----G--
Trachylepis capensis  (none) ??????????????????????????????
Trachylepis quinquetaeniata  (none) ??????????????????????????????
Trachylepis quinquetaeniata G  (none) ??????????????????????????????
Tretioscincus agilis  (none) AAAATTAC---GAG-------C-----G--
Tretioscincus oriximinensis  (none) AAGATTAC---GAG-------C-----G--
Tupinambis duseni  (none) ??????????????????????????????
Tupinambis longilineus  (none) ??????????????????????????????
Tupinambis merianae  (none) ??????????????????????????????
Tupinambis quadrilineatus  (none) ??????????????????????????????
Tupinambis rufescens  (none) ??????????????????????????????
Tupinambis teguixin  (none) AGAATTAC---GGG-------T-----G--
Vanzosaura rubricauda  (none) AAAATTAC---GGG-------C-----G--
Xantusia vigilis  (none) AGAACTAC---A?G-------------C--
Xantusia vigilis G  (none) GGAACTAC---AAG-------------C--
Xantusia vigilis T  (none) ??????????????????????????????

Columns

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