CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 8454 of Study 20306

About Citation title: "Evolutionary phylogeography and transmission pattern of echovirus 14: an exploration of spatiotemporal dynamics based on the 26-year acute flaccid paralysis surveillance in Shandong, China".
About Study name: "Evolutionary phylogeography and transmission pattern of echovirus 14: an exploration of spatiotemporal dynamics based on the 26-year acute flaccid paralysis surveillance in Shandong, China".
About This study is part of submission 20306 (Status: Published).

Matrices

Title: SSU-Mask Deleted

Description: 492 taxon SSU alignment with ambiguous bases removed

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Acanthamoeba castellanii  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Acanthocystis nichollsi  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Acanthometra sp  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Acetabularia acetabulum  (none) CTTGCATTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Acrasis rosea  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCACATGT
Acrosphaera sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Adelina dimidiata  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Alexandrium tamarense  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Allantion sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Allas diplophysa  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Allogromia sp  (none) TTGAGCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGG
Allomyces macrogynus  (none) CTTGTCTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Amastigomonas sp 50062  (none) CTTGTCTCAGG-ACTAAGCCATGCACGTAT
Amastigomonas bermudensis AY050178  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Amastigomonas debruynei AY050180  (none) CTTGTCTCTAGGACTAAGCCATGCACGTAT
Amastigomonas mutabilis AY050182  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Amastigomonas sp. Millport AY050181  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Amastigomonas sp AY268039  (none) -----------------GCCATGCATGTCT
Ammonia beccarii  (none) ------------------------------
Amoeba leningradensis  (none) CTTGACTCAAAGATTAAGCCATGCACGTCT
Amoeba proteus  (none) CTTGACTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Amoebidium parasiticum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Amoebophrya sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Amphiacon denticulatus  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Amphibelone anomala  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Amphibiothecum penneri  (none) ---------------TAGCCATGCATGTCT
Amphisorus hemprichii  (none) -----------TACTAA-------------
Amastigomonas sp AY050179  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Ancyromonas sigmoides AF174363  (none) ---------------AAGCCATGC-TGTCT
Ancyromonas sigmoides AY827843  (none) CTTGTCTAAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Ancyromonas sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Andalucia godoyi  (none) --------AAAGATTA-GCCATGCATGTCT
Andalucia incarcerata  (none) -------------------------TGTCT
Aphrocallistes vastus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Aplysia californica  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Apodachlya brachynema  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Apusomonadidae sp. limnaEU349232  (none) --------------------ATGCAAGTCT
Apusomonadidae sp. mylnikovi EU349231  (none) CTTGTCTAAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Apusomonas proboscidea L37037  (none) CTTGTCTCAGAGATTAAGCCATGCATGTCT
Arabidopsis thaliana  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Arachnula sp  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Araucaria heterophylla  (none) ----------AAAGTTAAGAAAGTATATCT
Arcella hemisphaerica  (none) ------------------------------
Arcyria denudata  (none) --------AA-GATTAAGCCATGCATGCGA
Arthracanthid 206  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Artostrobus sp  (none) ------------------------------
Assulina seminulum  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Astasia curvata  (none) CACGTCTCAGAGAAACG-----GTGCCTAC
Astrammina rara  (none) -----CTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGG
Aulacantha scolymantha  (none) CTTGCCTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Aulosphaera trigonopa  (none) CTCGCCTCAAGGGTTAAGCCATGCAAGTCT
Aureococcus anophagefferens  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Aurigamonas solis  (none) ------------------------------
Balamuthia mandrillaris  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Bangiopsis sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Bangiopsis subsimplex  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Batrachochytrium sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCC
Bigelowiella natans  (none) ------------------CCATGCATGTCT
Blastocrithidia culicis  (none) CTTGTTTCAAGGACTAAGCCATGCATGCCT
Blastocystis hominis  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Blastocystis sp H11  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Blastodinium navicula  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Blepharisma japonicum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Bodo saltans  (none) CTTTGTTCAAGGGCTAAGCCATGCATGCCT
Bodomorpha minima  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Bolidomonas pacifica  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Bonamia ostreae  (none) ------------------------------
Boothiomyces macroporosum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Borelis schlumbergeri  (none) ------------------------------
Branchiostoma floridae  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCACGTGC
Breviata anathema  (none) CTTGTCTGAAGGACTAAGCCATGCATGTCT
Bursaria truncatella  (none) CTTGTCTTAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Candida albicans  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chondrus crispus  (none) CTTGTCTCAAGGACTAAGCCATGCAAGTGT
Cryptosporidium parvum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chlamydomonas reinhardtii  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Cypria reptans  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Caenorhabditis elegans  (none) ------TTGATCATCAA-------------
Cafeteria roenbergensis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Calcidiscus leptoporus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Calonympha grassii  (none) -TTAGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Capitella capitata  (none) -----CTCAAAGATTAAGCCATGCACGTGT
Capsaspora owczarzaki  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Capsellina sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Carpediemonas membranifera  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Cercomonas agilis  (none) ----------------------------CT
Cercomonas sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Challengeron diodon  (none) ------------------------------
Chaos carolinense  (none) CTTGACTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chaos nobile  (none) CTTGACTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chaunacanthid 217  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chilodonella uncinata  (none) TTCCTCCTGGAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chilomonas paramecium  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chlamydaster sterni  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chlamydomyxa labyrinthuloides  (none) ------------------------------
Chlorarachnion CCMP621  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Chlorella vulgaris  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chlorokybus atmophyticus  (none) --------AAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Choanocystis rotundata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCGTGTCT
Cholamonas cyrtodiopsidis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCC
Chromera velia  (none) ----------AGATTAAGCCATGCATGTCT
Chroomonas mesostigmatica  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chrysocapsa paludosa  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Chrysochromulina polylepis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Ciliophrys infusionum  (none) ---------------------------TCT
Ciona intestinalis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Clathrulina elegans  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Closterium ehrenbergii  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Clydonella sp  (none) CTTGTTATAAAAATTAAGCCATGCAGATGT
Coelodendrum ramosissimum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Coleochaete scutata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Collozoum inerme  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Colpodella sp  (none) CTTGTCTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Colpodidium caudatum  (none) CTTGTCTTAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Comandonia operculata  (none) CTTGT?TCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Conchellium capsula  (none) ------------------------------
Corallochytrium limacisporum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Corallomyxa tenera  (none) --------CAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Corcontochrysis noctivaga  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Corythion dubium  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Corythionella sp  (none) ------------------------------
Costaria costata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Cribrothalammina alba  (none) -----CTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGG
Cryothecomonas longipes  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Crypthecodinium cohnii  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Cryptobia helicis  (none) CTTGTTTCAAGGACTAAGCCATGCATGCCT
Cryptoglena pigra  (none) --------------------ATGCATGTCT
Cyanidioschyzon merolae  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Cyanophora paradoxa Gene  (none) --------AAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Cyanoptyche gloeocystis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Cycas taitungensis  (none) ------TCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Cyphoderia ampulla  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Deltotrichonympha operculata  (none) CTAAGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Dermamoeba algensis  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Dermocystidium percae  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCC
Diaphanoeca grandis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Dictyostelium discoideum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Didymium dubium  (none) CTTCTCCTAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Didymium iridis  (none) -----------GACTAAGCC-TGCATGCCT
Didymium nigripes  (none) CTTCTCCTAAAGACTAAGCCATGCATGCCT
Didymocyrtis tetrathalamus  (none) ------------------------------
Dimorpha sp  (none) CTTGTCTCACAGATTAAGCCATGCATGTCT
Dinenympha exilis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Dinophyceae sp  (none) -------------TTAAGCCATGCATGTCT
Dinophysis acuminata  (none) ------TCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Diphylleia rotans  (none) ------------------------------
Diplomonad ATCC50330  (none) CTTCTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Diplonema papillatum  (none) CTTGTTTCAAGGACTAATCCATGCAAGTCT
Distigma gracile  (none) CTTCTTTCAAGGACTAAGCCATGCACGTGT
Drosophila melanogaster  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Dysnectes brevis  (none) CTAATCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Entamoeba histolytica  (none) CTGATGTTAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Ebria tripartita  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Eccrinidus flexilis  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCC
Echinamoeba exundans  (none) CTTGTCACAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Eggerelloides scabrum  (none) -----CTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGG
Eimeria tenella  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Elliptochloris sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Emiliania huxleyi  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Endolimax nana  (none) CTTGTGTTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Enteromonas hominis  (none) CTGACCTAAAGGATTAAGCCATGCATGCCG
Entodinium caudatum  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Eucyrtidium hexastichum  (none) ------------------------------
Euglena gracilis  (none) --------------------ATGCACGTCT
Euglena longa  (none) --------------------ATGCACGTCT
Euglypha rotunda  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Euplotes octocarinatus  (none) CTTGTCTCAAGGATTAAGCCATGCATGTCT
Eutreptia viridis  (none) CTTCTCTCAAGGACTAAGCCATGCATGTGT
Filamoeba nolandi  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Fucus distichus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Giardia lamblia  (none) CTCTCCCCAAGGACGAAGCCATGCATGCCC
Glaucocystis nostochinearum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Gallus gallus  (none) ------------------------------
Geleia fossata  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTGT
Geminella minor  (none) ------------------CCATGCATGTCT
Gephyramoeba sp  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Ginkgo biloba  (none) ------TCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Glaeseria mira  (none) CTTGTTTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Glaucosphaera vacuolata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Globobulimina turgida  (none) ------------------------------
Gloeodinium viscum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Glomus intraradices  (none) -CTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Goniomonas truncata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Gregarina niphandrodes  (none) CTTGTTTGAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Gromia oviformis  (none) CTTGCCTAGAGGACTAAGCCATGCACGTGT
Gromia oviformis2  (none) CTTGCCTAGAGGACTAAGCCATGCACGTGT
Guillardia theta  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Gymnochlora stellata  (none) TTTGTCTTCAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Gymnophrys cometa  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Gyropaigne lefevrei  (none) CTTCTCTCAAGGGCTAAGCCATGCACGCGT
Hyphochytrium catenoides  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Halimeda macrophysa  (none) ------------------------------
Haplosporidium costale  (none) CTTAGCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Haplosporidium louisiana  (none) CTTTTCTCGAAGATTAAGCCATGCAAGTGC
Haplosporidium nelsoni  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCC
Hartmannella cantabrigiensis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Hartmannella vermiformis  (none) CTTG{CT}CTCAGAGATTAAGCCATGCATG
Hatena arenicola  (none) ------------------------------
Hedriocystis reticulata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Heleopera sphagni  (none) CTTGTCTTAAGGATTAAGCCATGCATGTCT
Hemidinium nasutum  (none) CTTGTTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Hemiselmis rufescens  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Herpetomonas roitmani  (none) CTTGTTTCAAGGGCTTAGCCATGCATGCCT
Heteramoeba clara  (none) CTCACGTCAAGGACTAAGCCATGCATGTGT
Heterocapsa rotundata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Heterococcus pleurococcoides  (none) --TGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Heteromita sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAACCATGCATGTCT
Heteromita globosa  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Heterophrys marina  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Heterosigma akashiwo  (none) ------------ATTAAGCCATGCATGTCT
Hexaconus serratus  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Hexamita inflata  (none) CTAAGATTAAGGATTAAGCCATGCATGCCA
Histomonas meleagridis  (none) --------------TAAGCCATGCAAGTGT
Holomastigotoides mirabile  (none) CTAAGGCCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Homo sapiens  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Hoplonympha sp  (none) CTTCGGTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Hyperamoeba dachnaya  (none) ----TTTCAAGGGCTAACCCATGCATGTCT
Hyperamoeba flagellata  (none) CTTCTCCTAAAGACTAAGCCATGCATGCCT
Hyperamoeba sp. EF45771  (none) ------------------------------
Ichthyodinium chabelardi  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Isochrysis galbana  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Jakoba libera  (none) CTTGTCTCAAGGATTAAGCCATGCATGTCT
Joenia sp  (none) CTCCGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Karena brevis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Kathablepharis remigera  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Kirchneriella aperta  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Koliella planctonica  (none) --TGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Korotnevella stella  (none) CTTGTCTTAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Koruga bonita  (none) ------------------------------
Kryptoperidinium foliaceum  (none) CTCGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Labyrinthula sp N12  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Larcopyle butschlii  (none) ------------------------------
Lecythium sp  (none) -------------TTAAGTCATGCATGTGT
Leishmania major  (none) CTTGTTTCAAGGACTTAGCCATGCATGCCT
Lepidoderma carestianum  (none) CTTCTCCTAAAGACTAAGCCATGCATGCCT
Lepocinclis spirogyroides  (none) CTTCGTTCAAGGACTAAGCCATGCATGTCT
Leptomyxa reticulata  (none) CTTGTCTGAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Leucocryptos marina  (none) ---GTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Leukarachnion sp  (none) CTTGTCTCAAGA---TAGCCATGCTTGCCT
Lingulamoeba leei  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Lithomelissa sp  (none) ------------------------------
Lotharella globosa  (none) -------------CTAAGCCATGCATGTCT
Loxodes striatus  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTGT
Lunularia cruciata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Lycopodium tristachyum  (none) ------------------------------
Malawimonas jakobiformis  (none) CTTGTCTCGAAGATTAAGCCATGCAAGCCC
Mallomonas rasilis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Massisteria marina  (none) -------------------------TGTCT
Mastigamoeba simplex  (none) CTTGTGTTCAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Mastigamomeba sp  (none) CTTGTGTTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Mastigella commutans  (none) CTCGTGTTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Maullinia ectocarpii  (none) TTCGCTTCAAGGACTAAGCCATGCATGTTT
Mayorella sp  (none) -----------G-----CGCATGC{AT}{A
Mesostigma viride  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Metopion fluens  (none) ------------------------------
Metopus palaeformis  (none) CTTGTCTTAAAGATTAACCCATGCATGTGT
Metromonas simplex  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Micromonas pusilla  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Micronuclearia podoventralis  (none) -----------------GCCATGCATGTCT
Minchinia chitonis  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Ministeria vibrans  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAATGC
Mnemiopsis leidyi  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Monoblepharis macrandra  (none) --------AAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Monocercomonas sp  (none) CTTCGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Monocercomonoides sp  (none) ----------AGATTAAGCCATGCATGTGT
Monocystis agilis  (none) CTCATTTCGAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Monopylocystis visvesvarai  (none) CTTATTTCGAAGATTAAGCCATGCAAATGT
Monosiga brevicollis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Multicilia marina  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Naegleria gruberi  (none) CTTGTCTCAAAGCCTAAGCCATGCAAATGT
Nannochloropsis maritima  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCACGTCT
Nemalionopsis shawii  (none) CTTGTCTCAAGGACTAAGCCATGCAAGTGT
Nematostella vectensis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCC-TGCATGTCT
Neocercomonas jutlandica  (none) ------------------------------
Neoparamoeba perurans  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Nitzschia thermalis  (none) -TCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Noctiluca scintillans  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Nolandella sp  (none) CTTGTCTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Nuclearia simplex  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Nucleariidae environmental  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Nyctotherus ovalis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAACCCATGCATGTGT
Ochromonas danica  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Octomitus intestinalis  (none) CTTACCTCAAAGACTAAGCCATGCATGCCC
Oltmannsiellopsis geminata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Ophriocystis elektroscirrha  (none) CTTGTCTCAAAGATGTAGCCATGCAAGTCT
Oreochromis esculentus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAGGTCT
Oryza sativa  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGC
Oscarella carmela  (none) ---------------------TGCATGTCT
Ovaminna opaca  (none) ------------------------------
Oxymonas sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Oxyrrhis marina  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTGT
Palavascia patagonica  (none) ------------------------------
Paradinium poucheti  (none) CTTTGTTCGAGGATTAAGCCATGCATGTCT
Paradinium sp  (none) CTTTGTTCGAGGATTAAGCCATGCATGTCT
Paraflabellula hoguae  (none) CTTGTCTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Paraflabellula sp.  (none) ------------------------------
Paraflabellula reniformis  (none) ------TAAAAGATTAAGCCT-GCATGTCT
Paramecium caudatum  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Paramonas globosa  (none) CTTGTCTC-AAGATTAAGCC-TGCATGTCT
Paravahlkampfia ustiana  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pavlova lutheri  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pelagomonas calceolata  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pelomyxa palustris  (none) CTCATGCCAAAGATTAAGCCATGCACGTGC
Pentatrichomonoides scroa  (none) CTTCGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Percolomonas cosmopolitus  (none) CTCGTCTCGAAGACTAAGCCATGCACGTGT
Peridinium willei  (none) CTTGCCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Perkinsus marinus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pessonella sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAACCATGCAAGTCT
Petalomonas cantuscygni  (none) CTTCTTTCAAGGACTAAGCCATGCAAATGT
Phaeocystis pouchetii  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Phaeodactylum tricornutum  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCC-TGCATGTCT
Phaeomonas parva  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Phaeothamnion confervicola  (none) ------------------------------
Phagomyxa odontellae  (none) CTTGTTTAAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Phalansterium solitarium  (none) CTTGTCGCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Phanerochaete chrysosporium  (none) C?TGTCTCAAAGA?TAAGCCATGCATGTCT
Phreatamoeba balamuthi  (none) CTTGTGTTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Physarum polycephalum  (none) CTTCTCCTAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Physcomitrella patens  (none) --------AAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Phytophthora infestans  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCTTGCATGTCT
Phytophthora palmivora  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Picophagus flagellatus  (none) CTTGTCTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pinguiochrysis pyriformis  (none) CTCGTCTCACAGATTAAGCCATGCATGTCT
Ancyromonas micra strain ATCC 50267  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Plasmodiophora brassicae  (none) CTTGTTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Plasmodium berghei  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGA
Platyamoeba placida  (none) ------TCAAAGGCTAAGCCATGCAAGTGT
Platyamoeba plurinucleolus  (none) CTTGTCTCAAAGGCTAAGCCATGCAAGTGT
Platyamoeba stenopodia  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pleurochrysis carterae  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pleurostomum flabellatum  (none) CTCGTCTCAAGGACTAAGCCATGCAAATCT
Polymyxa betae  (none) CTTGTTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Polyplacocystis symmetrica  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Polysphondylium violaceum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Porphyra capensis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Proleptomonas faecicola  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Prorocentrum minimum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Prorodon viridis  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCAT-CCT
Protacanthamoeba bohemica  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Protaspis grandis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Proterospongia choanojuncta  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Protocystis xiphodon  (none) ------------------------------
Protophysarum phloiogenum  (none) CTTCTCCTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Prymnesium parvum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Psalteriomonas lanterna  (none) CTTATTTCGAAGATTAAGCCATGTAAATGT
Pseudocubus obeliscus  (none) ------------------------------
Pseudodidymium cryptomastigophorum  (none) CTTCTCCTAAAGACTAAGCCATGCATGCCT
Pseudodifflugia cf gracilis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pseudoparamoeba pagei  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pseudotrypanosoma giganteum  (none) CTTCGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Pterocanium trilobum  (none) ------------------------------
Pterocladiella nana  (none) CTTGTCTCAAGGACTAAGCCATGCAAGTGT
Pterocorys zancleus  (none) ------------------------------
Pterocystis foliacea  (none) ----TCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pyrocystis noctiluca  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Pyrsonympha grandis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Raineriophrys erinaceoides  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Raphidiophrys contractilis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Raphidonema nivale  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Reclinomonas americana  (none) CTTGTCTCAAGGATTAAGCCATGCATGTCT
Reticulamoeba sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Reticulomyxa filosa  (none) -----CTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGG
Rhabdammina cornuta  (none) ------------------------------
Rhizamoeba saxonica  (none) ------TAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Rhizamoeba sp  (none) ------------------------------
Rhizopus microsporus  (none) --------CAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Rhodosorus marinus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Rhynchobodo ATCC50359  (none) CTTGTTTCAAGGACTAAGCCATGCACGCCT
Rhynchopus sp  (none) --------GAAGGATAAGCCGTGCGAGTCT
Rhytidocystis polygordiae  (none) CTTGTCACAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Ripidomyxa sp  (none) -----CTGAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Saccamoeba limax  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCACGTCT
Saccharomyces cerevisiae  (none) -----------------GCCATGCATGTCT
Saccinobaculus ambloaxostylus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Sainouron mikroteron  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCC
Salpingoeca amphoridium  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Sappinia diploidea  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Sarcocystis neurona  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Sawyeria marylandensis  (none) CTTATTTCGAAGATTAAGCCATGTAAATGT
Schistosoma mansoni  (none) CTTGTCTCAGAGATTAAGCCATGCATGTCT
Schizocladia ischiensis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Schizosaccharomyces pombe  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Seculamonas ecuadoriensis  (none) CTCTCTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Siphonosphaera cyathina  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Soginia anisocystis  (none) --------------------AT--------
Sorosphaera veronicae  (none) CTTGTTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Sphaerastrum fockii  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Sphaeroforma arctica  (none) -----------GATTAAGCCATGCATGTCT
Sphaerozoum punctatum  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Spironucleus barkhanus  (none) CTTCTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Spironucleus vortens  (none) -----------------ATTAT--------
Spirotrichonymphella sp  (none) CTCAGGCCATAGATTAAGCCATGCAAGTGC
Spizellomyces punctatus  (none) --------AAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Spongaster tetras  (none) ------------------------------
Spongomonas minima  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Spongospora subterranea  (none) CTTGTTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Spumella elongata  (none) ------------------------------
Staurojoenina assimilis  (none) CTTCGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Stemonitis flavogenita  (none) CTTTTCCTAAAGATTAAGCCATGCATGCCT
Stephanoeca diplocostata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Stephanonympha nelumbium  (none) CTTCGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Stephanopogon minuta  (none) CTTGTTTCAAGGGTTAAGCCATGCATATAT
Stephanopogon SSU  (none) CTTGTTTCAAGGGTTTAGCCATGCATATAT
Sticholonche sp  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCGTGCAAGTCT
Storeatula major  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Streblomastix strix  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Strongylocentrotus purpuratus  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGT
Stygamoeba regulata  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Stylodictya sp  (none) ------------------------------
Stylonema alsidii  (none) ---------------AAGCCATGCATGTCT
Stylonychia lemnae  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Styptosphaera sp  (none) ------------------------------
Subulatomonas  (none) CTTGTCTAAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Sycon calcaravis  (none) ---------------------------TCT
Symbiodinium sp  (none) ------------------------------
Symphyacanthid 211  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Symphytocarpus impexus  (none) CTTTTCCCAAAGACTAAGCCATGCATGTCC
Taeniella carcini  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Teleaulax acuta  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Telonema antarcticum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Telonema subtilis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Teranympha mirabilis  (none) CTTCAGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Tetrahymena thermophila  (none) CTTGTCTTAAATATTAACCCATGCATGTGC
Tetramitus thermacidophilus  (none) ----------------AGCCATGCATGTGT
Tetrapyle octacantha  (none) ------------------------------
Tetraselmis kochiensis  (none) ------------------------ATGTCT
Thalassicolla pellucida  (none) CTAATGTTAAAGATTAAGCCATGCATGTAC
Thalassiosira pseudonana  (none) CTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Thalassomyces fagei  (none) CTTGTTTCAATGATTAAGCCATGCATGTCT
Thaumatomastix sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Thaumatomonas seravini  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Thecamoeba similis  (none) CTTAGTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Thecamoebidae sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Theileria parva  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Theratromyxa weberi  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Thoracosphaera heimii  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Thraustochytrium striatum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Toxoplasma gondii  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Trepomonas agilis  (none) CTAAGATCAAAGACTAAGCCATGCATGCCC
Trichia persimilis  (none) CTTGTCCCGAAGCTTAAGCCATGCATGTCT
Trichomonas vaginalis  (none) CTTAGGTCATAGATTAAGCCATGCAAGTGT
Trichonympha agilis  (none) CTTCGGTCAGGGATTAAGCCATGCAAGTGC
Trimastix marina  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Trimastix pyriformis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Trimitus sp  (none) CTGAGATTAAGGATTAAGCCATGCATGCCA
Trinema lineare  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Trochammina hadai  (none) -----CTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTGG
Trypanosoma brucei  (none) CTTGTTTCAAGGACTTAGCCATGCATGCCT
Urosporidium crescens  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Ustilago maydis  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Vahlkampfia avara  (none) ------------------------------
Vahlkampfia damariscottae  (none) CTCATATCACAGATTTATCTTAGTTGACTT
Vampyrellidae sp  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Vannella aberdonica  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCT
Vannella miroides  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTGT
Vexillifera armata  (none) CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Vexillifera minutissima  (none) CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTGT
Volvox carteri  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Voromonas pontica  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Wallaceina brevicula  (none) ------------------------------
Welwitschia mirabilis  (none) ------TCAAAGATTAAGCCATGCACGTGT
Wobblia lunata  (none) -----------GATTAAGCCATGAAAGTCT
Xenophyophorea sp  (none) -----CTCAAAGATTAAGCCAAGCAAGTGG
Zygnema cylindricum  (none) CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Eukaryota sp. BOLA187 AF372745  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. BOLA366 AF372746  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. D1P01C8 EF100391  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. D1P02H06 EF100226  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. D3P05C09 EF100280  (none) CTTGTCTAAAAGACTAAGCCATGCATGTCT
Eukaryota sp. D4P07D12 EF100407  (none) --TGTCTAAAAGATTAAGCCATGCATGTCT
Eukaryota sp. WIM30 AM114802  (none) CTTGTCTAAAGGACTAAGCCATGCATGTCT
Eukaryota sp. SA2 2C8 EF527166  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. SA2 2G5 EF527173  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. Ma29 3E 43 HM103514  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. Ma29 3E 30 HM103503  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. Ma29 3E 18 HM103491  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. Ma29 1E 22 HM103458  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. Ma29 1E 30 HM103465  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. RM1SGM32 AB505489  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. RM1 SGM28 AB505485  (none) -------------------------TGTCT
Eukaryota sp. RM2 SGM71 AB505579  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. NAMAKO2 AB252741  (none) -------------------------TGTCT
Eukaryota sp. RM1SGM33 AB505490  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. RM1SGM31 AB505488  (none) -------------------------TGTCT
Eukaryota sp. RM1SGM37 AB505494  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. RM1SGM30 AB505487  (none) -------------------------TGTCT
Eukaryota sp. CYSGM24 AB275107  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. NAMAKO2 AB252742  (none) ------------------------------
Eukaryota sp. RM1SGM45 AB505553  (none) -------------------------TGTCT
Eukaryota sp. RM1SGM69 AB505577  (none) -------------------------TGTCT
Eukaryota sp. RM1SGM39 AB505547  (none) -------------------------TGTCT
Eukaryota sp. RM1SGM29 AB505486  (none) -------------------------TGTCT

Columns

None of the columns has a description.