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Matrix 3169 of Study 2048

About Citation title: "Phylogenetic relationships of glassfrogs (Centrolenidae) based on mitochondrial and nuclear genes".
About This study was previously identified under the legacy study ID S2047 (Status: Published).

Matrices

Title: Mitochondrial Dataset

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M3831

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Hyalinobatrachium antisthenesi MHNLS 17909  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Hyalinobatrachium aff munozorum CBG 1099  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium aff mondolfii  (none) -----ATTTGGTCCTAATCTTGAAGTCAAT
Hyalinobatrachium aff ignioculus SMNS 12251  (none) --A-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium aff iaspidiense MB 247  (none) --A-GGTTTGGTCCTAGCCTTG?AATCAA?
Hyalinobatrachium aff bergeri MTDD 46305  (none) ------------CCTA-CCTTGAA-TCAAT
Hemiphractus proboscideus  (none) TAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTGAAATCAAC
Gastrotheca marsupiata  (none) CAAAGGTTCGGTCCCAGCCTTAAAATCAGT
Gastrophryne carolinensis  (none) TAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTTTCATCAAC
Flectonotus fitzgeraldi  (none) ------------------------------
Duellmanohyla soralia  (none) CAAAGATTTGGTCCCGGTCTTAAAATCAGT
Dendropsophus nanus  (none) CAAAGGTTTGGTCCCAGCCTTGAGATCAGT
Dendrophryniscus minutus  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGACCTTAAAGTCAAT
Cochranella vozmedianoi MHNLS 17877  (none) -------TTGGTCCTAGCCTTGAAATCAAT
Cochranella susatamai MAR 337  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Cochranella spinosa USNM 538863  (none) -------------------TTGAAGTCAGT
Cochranella spiculata MHNSM 24867  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Cochranella sp CBG 1096  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Cochranella savagei MHUA 4094  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Cochranella revocata MHNLS 17319  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAGCCTTGAAATCAAT
Cochranella punctulata MHUA 4071  (none) -------TTGGTCCTGGTCTTGAAATCAGT
Cochranella oyampiensis  (none) ---------------GACCTTGAAATCAAT
Cochranella nola CBG 814  (none) ----------------ACCTTGAAATCAGT
Cochranella nola CBG 1094  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Cochranella midas  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGGAATCAGT
Cochranella mache QCAZ 27747  (none) -------CTGGTCCTGACCTTGAAGTCAGT
Cochranella helenae MHNLS 17139  (none) -----GTTTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Cochranella helenae MHNLS 17128  (none) -----GTTTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Cochranella granulosa  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAAATCAAT
Cochranella flavopunctata QCAZ 32265  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Cochranella euknemos CH 5109  (none) ---------------GACCTTGAAATCAGT
Cochranella daidalea MHUA 3271  (none) -------TTGGTCCTGACCTT--AATCAGT
Cochranella cf spiculata CBG 806  (none) ---------------GACCTTGGAATCAGT
Cochranella cf amelie MHNC 5646  (none) ------------------------ATCAGT
Cochranella castroviejoi MHNLS 16446  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Cochranella albomaculata USNM 534151  (none) CAA-GATTTGGTCCTGATCTTGAGATCAGT
Cochranella adiazeta MAR 483  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Ceratophrys cornuta  (none) CAAAGGTTTGGTCCCAGCCTTGAAGTCAAT
Centrolene venezuelense MHNLS 16497  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAGCCTTGTAATCAGT
Centrolene tayrona MAR 546  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Centrolene tayrona MAR 545  (none) ------TTTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Centrolene tayrona MAR 544  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Centrolene sp MHUA 4099  (none) ------------------------------
Centrolene prosoblepon  (none) -------------CTGACCTTG-AATCAGT
Centrolene pipilatum KU 178154  (none) --------------------TGAGATCAGT
Centrolene peristictum QCAZ 22312  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGGATTCAGT
Centrolene notostictum MAR 510  (none) ------------------------------
Centrolene mariaelenae QCAZ 31729  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAGATCAGT
Centrolene litorale QCAZ 27693  (none) -------TTGGTCCTGATCTTGAA-TCAGT
Centrolene lema KU 181128  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTCGCATCAGT
Centrolene ilex UCR 16861  (none) ------------------------------
Centrolene hybrida MAR 347  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Centrolene hesperium MHNSM 25802  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAGCCTTGTAATCAGT
Centrolene grandisonae QCAZ 22310  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAGATCAGT
Centrolene gorzulai MHNLS 16036  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTCAGATCAGT
Centrolene gorzulai BPN 1193  (none) ---------------GACCTTCAA-TCAGT
Centrolene geckoideum KU 178015  (none) ---------------GACCTTGAAATCAGT
Centrolene callistommum QCAZ 28555  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Centrolene buckleyi KU 178031  (none) ------------------------------
Centrolene bacatum QCAZ 22728  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Centrolene antioquiense NRPS 014  (none) -------------CTGACCTTGAATTCAGT
Centrolene andinum JMG 366  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Centrolene altitudinale  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAGCCTTGTAATCAGT
Centrolene aff buckleyi MAR 371  (none) -------TTGGTCCTAGCCTTGTAATCAGT
Caudiverbera caudiverbera  (none) CAAAGGTTTAGTCCTGACCTTACCATCAAG
Atelopus peruensis  (none) TAAAGGTTTGGTCCTGACCTTGAAGTCAAT
Anotheca spinosa  (none) CAAAGGCTTGGTCCCGACCTTATAATCAAT
Allophryne ruthveni  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGACCTTGGAATCAGT
Allobates trilineatus  (none) ---AGGTTTAGTCCT{AG}GCCTTGAAATC
Agalychnis spurrelli  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGACCTTAAAATCAAC
Acris crepitans  (none) CAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTGAAATCAGT
Xenopus laevis  (none) TAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTATTATCAAC
Telmatobius truebae  (none) CAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTGAGATCAAT
Stefania evansi  (none) TAAGGGCTTGGTCCTGACCCTAAGGTCTGT
Sphaenorhynchus lacteus  (none) CAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTGAAATCAGT
Spea bombifrons  (none) CAAAAGTTTGGTCCTGACTTTACTATCAAT
Smilisca fodiens  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGGCCTTGTAATCAAT
Scinax crospedospilus  (none) CAAAGGTCTGGTCCTGGCCTTGAAATCAGC
Scarthyla goinorum  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGACCTTACAGTCAGT
Pseudis paradoxa  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGGCCTTGAAATCAAT
Pristimantis curtipes  (none) CACAGGTTTGGTCCCAGCCTTAAAATCAAT
Physalaemus cuvieri  (none) CAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTGAAATCAAT
Phyllomedusa tomopterna  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGACCCTAAAGTCAAT
Oreobates quixensis  (none) ------------------------------
Nymphargus wileyi QCAZ 27435  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAGATCAGT
Nymphargus siren KU 179171  (none) -------TTGGTCCTGGCCTTGAGGTCAAT
Nymphargus rosada MHUA 4308  (none) -------TTGGTCCTAGCCTTGAGATCAAT
Nymphargus pluvialis KU 173224  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAA-TCAGT
Nymphargus mixomaculata MTD 45200  (none) ------------------------------
Nymphargus megacheira KU 143272  (none) --------TGGTCCTGGCCTTGAGATCAAT
Nymphargus griffithsi QCAZ 31768  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAGATCAGT
Nymphargus garciae  (none) ------------------------------
Nymphargus cochranae QCAZ 31113  (none) -------TTGGTCCTGACCCTGAGATCAGT
Nymphargus cf griffithsi  (none) ----GGTTTGGTCCTGGCCTTGAGATCAGT
Nymphargus bejaranoi CBG 1488  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGACCTTGAAATCAGT
Nymphargus aff posadae AVV 119  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAGGTCAAT
Nymphargus aff cochranae QCAZ 31340  (none) -------TTGGTCCTGACCTTGAGATCAAT
Litoria manya  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGGCCTTGAAGTCATC
Lithobates catesbeianus  (none) CAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTATTATCAAC
Leptodactylus didymus  (none) CAAAGGTTTGGTCCTGACCTTAAAGTCAAT
Lepidobatrachus laevis  (none) CAAAGGTTTGGTCCCAGCCTTGAAGTCAAT
Hypsiboas boans  (none) AAAAGGTCTGGTCCTAGCCTTGAAATCAAT
Hyloxalus nexipus  (none) CAAAGGTTTGGTCCTAGCCTTGAAGTCAAT
Hyla cinerea  (none) TAAAGGTTTGGTCCTAACCTTGTAATCATT
Hyalinobatrachium valerioi UCR 17418  (none) ------------------------------
Hyalinobatrachium taylori MHNLS 17141  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium tatayoi MHNLS 17174  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium talamancae CH 5330  (none) --------TGGTCC-A-CCTTGAA-TAAAT
Hyalinobatrachium sp MIZA 317  (none) --------------TAT-CTTGAACTCAAT
Hyalinobatrachium pulveratum USNM 538588  (none) CAA-GGTTTGGTCCTGGCCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium pallidum MHNLS 17238  (none) CAA-GGTTTGGTCCTA-CCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium orocostale MHNLS 17247  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium orientale MHNLS 17878  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium nouraguensis SNMS 12247  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAGCCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium mondolfii MHNLS 17119  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium ignioculus BPN 1315  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGA{AG}ATC
Hyalinobatrachium ibama MAR 503  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium iaspidiense MHNLS 17126  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAGCCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium fragile MHNLS 17161  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium fleischmanni USNM 559092  (none) ------------------------------
Hyalinobatrachium fleischmanni QCAZ 22303  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium eurygnathum CFBH 5729  (none) --------TGGTCCTGACCTTGAGATCAGT
Hyalinobatrachium eccentricum MHNLS 17335  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium duranti MHNLS 16493  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium crurifasciatum MHNLS 16475  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium colymbiphyllum UCR 17423  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAGATCAAT
Hyalinobatrachium chirripoi USNM 538586  (none) --------------------TGAAATCAAT
Hyalinobatrachium chirripoi UCR 17424  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium cf pellucidum QCAZ 29438  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium cf pallidum MHNLS 17881  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium cf munozorum QCAZ 31056  (none) -------TTGGTCCTAACCTTGAAATCAGT
Hyalinobatrachium bergeri MHNC 5676  (none) CAA-GGTTTGGTCCTAACCTTGAAATCAAT
Hyalinobatrachium aureoguttatum QCAZ 32105  (none) --------TGGTCCTAACCTCGAAATCAAT

Columns

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