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Connotea Connotea

Matrix 2095 of Study 2171

About Citation title: "Species of Botryosphaeriaceae occurring on Proteaceae.".
About This study was previously identified under the legacy study ID S2177 (Status: Published).

Matrices

Title: Figure 2 and 3

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M468

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Bulweria bulwerii U74351  (none) -ATGGCCCCAAACCTCCGAAAATCTCACCC
Calonectris diomedea U74356  (none) CA--?-CT{AG}-{CG}-{AGT}--{AC}-
Calonectris leucomelas AF076045  (none) CA--?-CT{AG}-{CG}---TC-{AC}--A
Daption capense AF076046  (none) {AGT}A-T--?-CA--?{CG}--A-A--A-
Diomedea amsterdamensis U48948  (none) {AGT}--{AC}-{AGT}-A-A{AC}{CG}T
Diomedea epomophora AF076049  (none) {AGT}--{AC}-{AGT}-A----{AC}--{
Diomedea sanfordi U48946  (none) {AGT}--{AC}-{AGT}-A-{CG}A?--{A
Diomedea antipodensis AF076047  (none) {AGT}--{AC}-{AGT}-A-A?T---{AGT
Diomedea chionoptera AF076048  (none) {AGT}--{AC}-{AGT}-A-C{ACT}--?-
Diomedea dabbenena U48947  (none) {AGT}--{AC}-{AGT}-A-{AGT}A{CGT
Diomedea gibsoni AF076050  (none) {AGT}--{AC}-{AGT}-A-G-{CGT}{CG
Fregetta grallaria AF076054  (none) -{AG}-G-TTA-G{AG}A--A{AG}-A-A-
Fregetta tropica AF076053  (none) -{AG}-G-TTA-T{AG}---CA-A-A--A-
Fulmarus glacialis U74348  (none) -T-{AC}A{AG}T{CG}-G-AC-A--{CG}
Fulmarus glacialoides AF076055  (none) -T-{AC}A{AG}T{CG}-G-AC-A---{AG
Garrodia nereis AF076056  (none) GA{AG}{AG}-{AGT}-A-?-{AG}--{CG
Halobaena caerulea AF076057  (none) {ACT}A--{CGT}A-?A-CA-{AG}T--A-
Halocyptena microsoma AF076058  (none) {ACT}A--C{CT}-T-?A-{AC}-C{AG}-
Hydrobates pelagicus AF076059  (none) {ACT}{CT}{AGT}{AG}-{CGT}AT-{CG
Lugensa brevirostris U74357  (none) -TG-?{CG}A-{CGT}{AG}-{ACG}-{AG
Macronectes giganteus AF076060  (none) {AC}AC{AG}-?-CT-{CG}-G-GA?T-T{
Macronectes hallii AF076061  (none) {AC}AC{AG}-?-CT-{CG}-{ACT}A---
Oceanites oceanicus AF076062  (none) -C-A?-T-{CG}--C-A?-CT{CG}-A-A-
Oceanodroma furcata AF076063  (none) -C-A?-{AGT}{AG}-{AC}A--T{AG}CA
Oceanodroma leucorhoa AF076064  (none) -C-A?-{AGT}{AG}-{AC}A---TC-{AG
Oceanodroma melania AF076065  (none) -C-A?-{AGT}{AG}-{AC}A-{AC}--A?
Oceanodroma tethys AF076066  (none) -C-A?-{AGT}{AG}-{AC}A-T-T{ACT}
Oceanodroma tristrami AF076067  (none) -C-A?-{AGT}{AG}-{AC}A-T{AG}-{C
Pachyptila desolata AF076068  (none) -AC{ACT}{CT}-T--A-{AGT}-{CG}--
Pachyptila salvini AF076069  (none) -AC{ACT}{CT}-T--A-{CG}A-{ACG}-
Pachyptila turtur AF076070  (none) -AC{ACT}{CT}-T--A-TT{AG}TT{AG}
Pachyptila vittata U74349  (none) -AC{ACT}{CT}-T--A-{ACG}-TTATA-
Pagodroma nivea AF076071  (none) -AG-{AGT}{AG}-{AC}A-?-{ACG}-A-
Pelagodroma marina AF076072  (none) ---AG-{AGT}{AG}-{AC}A-{AC}A{AG
Pelecanoides garnoti AF076073  (none) ----CA?--{AGT}-{CG}-GA{AG}?-T-
Pelecanoides georgicus AF076074  (none) ----CA?--{AGT}-{CG}-G--{AG}G-C
Pelecanoides magellanicus AF076075  (none) ----CA?--{AGT}-{CG}-{AC}AG---A
Pelecanoides urinatrix AF076076  (none) ----CA?--{AGT}-{CG}-T{AG}-?AT{
Phoebastria albatrus U48952  (none) -{ACT}--{CGT}A{CG}T{AG}-A-A-{C
Phoebastria immutabilis U48949  (none) -{ACT}--{CGT}A{CG}T{AG}-A--{AC
Phoebastria irrorata U48951  (none) -{ACT}--{CGT}A{CG}T{AG}-A--{AG
Phoebastria nigripes U48950  (none) -{ACT}--{CGT}A{CG}T{AG}-A-?-G{
Phoebetria fusca U48942  (none) -{ACT}--{CGT}-T{AG}-A--T{CG}CA
Phoebetria palpebrata U48943  (none) -{ACT}--{CGT}-T{AG}-A--A---{CG
Procellaria aequinoctialis U74350  (none) -{AG}-C---A{AG}-A-A--T-?-CT-A-
Procellaria parkinsoni AF076077  (none) -{AG}-C---A{AG}-A--A{AG}{GT}-?
Procellaria westlandica AF076078  (none) -{AG}-C---A{AG}-A-{AT}-{CG}T-A
Pterodroma cahow U74331  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-CA{ACT
Pterodroma cookii  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-C--{GT
Pterodroma externa U74339  (none) -ATGGCCCCAAACCTCCGAAAATCCCACCC
Pterodroma hasitata U74332  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-{ACT}A
Pterodroma hypoleuca AF076079  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-{ACT}{
Pterodroma incerta U74335  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A--?C-{A
Pterodroma inexpectata U74346  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A--?-?--
Pterodroma lessonii U74337  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A---{CG}
Pterodroma longirostris U74344  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A---?G-{
Pterodroma macroptera U74336  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-{AC}AC
Pterodroma magentae U74338  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-{AC}AG
Pterodroma deserta U74333  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-{AGT}-
Pterodroma mollis U74334  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-{AC}--
Pterodroma neglecta U74341  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-?-G--C
Pterodroma nigripennis U74343  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A-?-G{AG
Pterodroma phaeopygia U74340  (none) -T-{AG}-{AGT}{AG}-{AC}A--{ACT}
Puffinus assimilis AF076080  (none) -T---?T{CG}-A{CG}{CG}-{AC}---{
Puffinus bulleri AF076081  (none) -T---?T{CG}-{CGT}T---{AG}--A-A
Puffinus carneipes AF076082  (none) -T---?T{CG}-CA{AG}?----{CG}-A-
Puffinus creatopus AF076083  (none) -T---?T{CG}-C{AG}-AT--T{CG}-A-
Puffinus gravis U74354  (none) -T---?T{CG}-G{AG}A{ACG}-{CG}-T
Puffinus griseus U74353  (none) -T---?T{CG}-G{AG}-{CG}-T{CG}-T
Puffinus huttoni AF076084  (none) -T---?T{CG}-{ACT}TTT-?--A-A--A
Puffinus lherminieri AF076085  (none) -T---?T{CG}--{ACT}-{AG}{AC}-?-
Puffinus nativitatus AF076086  (none) -T---?T{CG}-?AT-{ACG}-TATT{CG}
Puffinus opisthomelas AF076087  (none) -T---?T{CG}----{CG}T{ACT}-{AC}
Puffinus pacificus AF076088  (none) -T---?T{CG}--AC---CT{CG}-A-A--
Puffinus puffinus U74355  (none) -T---?T{CG}--T---?T{CG}-T--T--
Thalassarche bulleri U48945  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche cauta U48953  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche eremita AF076092  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche salvini AF076094  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche bassi AF076091  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche chlororhynchus U48944  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche chrysostoma U48954  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche impavida AF076093  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassarche melanophris U48955  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}A{AG}C{ACT}--
Thalassoica antarctica AF076095  (none) T{ACT}A-A{CG}{CG}--CA-A?TA{AG}
Aptenodytes patagonicus AF076044  (none) A-T-?-{AGT}{CT}T-{CG}--ATAG-?-
Eudyptes chrysocome AF076051  (none) -T{AGT}{CT}-T-{CG}-C{ACT}{AG}{
Eudyptes chrysolophus AF076052  (none) -T{AGT}{CT}-T-{CG}-C{ACT}{AG}{
Pygoscelis antarctica AF076089  (none) -{CT}G-{CG}C---{CG}-A?TA{AG}CT
Pygoscelis papua AF076090  (none) -{CT}G-{CG}C---{CG}--A-TA-A-A-

Columns

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