CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 10272 of Study 386

About Citation title: "The genus Oidiodendron: species delimitation and phylogenetic relationships based on nuclear ribosomal DNA analysis.".
About This study was previously identified under the legacy study ID S330 (Status: Published).

Matrices

Title: Mammal DNA

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Abrocoma bennettii  (none) ???AAGTATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Acrobates pygmaeus  (none) ?GGGAAATACACTCTCACCTTAGAAATAGT
Aepyprymnus rufescens  (none) ??????????????????????????????
Cuniculus taczanowskii  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Ailuropoda melanoleuca  (none) GGAAAATATACGCTCACATT???AAACAGC
Ailurus fulgens  (none) ??????????????????????????????
Amblysomus hottentotus  (none) GGAAAATACACTCTGACATTAGAAAACAGC
Anolis carolinensis  (none) GGAAAGTACACTCTCACTTTAGAAAATAGC
Anomalurus beecrofti  (none) ???AAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Antilocapra americana  (none) GGAAAATACACTCTCACACTAGAAAACAGC
Aplodontia rufa  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Arctocephalus forsteri  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGTAAACAGC
Artibeus jamaicensis  (none) ??????TACACTCTCACCTTAGAAAACAGC
Ateles fusciceps  (none) GGAAAATATACGCTTACATTAGAAAACAGC
Bos taurus  (none) ???AAATACACTCTCACCTTAGAAAACAGC
Bradypus tridactylus  (none) ????????????CTGACATTAGAAAACAGC
Caenolestes fuliginosus  (none) ??????????????????????????????
Callithrix jacchus  (none) GGAAAATATACGCTTACATTAGAAAACAGC
Calomyscus sp.  (none) ??????????????????????????????
Caluromys philander  (none) ??????????????????????????????
Canis familiaris  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Caperea marginata  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Capromys pilorides  (none) TGGAAGTACACTCTCACATTAGAGAATAGC
Castor canadensis  (none) GGAAAATATACCCTCACCTTAGAAAACAGC
Cavia porcellus  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Cebus albifrons  (none) GGAAAATATACGCTTACATTAGAAAACAGC
Ceratotherium simum  (none) ??????TATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Cercartetus nanus  (none) ??????????????????????????????
Cervus nippon  (none) GGAAAATACACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Chinchilla lanigera  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Choloepus sp.  (none) GGAAAGTACACTCTGACATTAGAAAATAGC
Chrysochloris asiatica  (none) GGAAAATATACTTTGACATTAGAAAACAGC
Craseonycteris thonglongyai  (none) ??????????????????????????????
Cricetus cricetus  (none) GGAAAATACACTCTCACATTGGAAAACAGC
Crocuta crocuta  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGCAAACAGC
Ctenodactylus gundi  (none) GCAAAATACACTCTCACAGCACTAAACAGC
Ctenomys boliviensis  (none) GGAAAGTATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Cyclopes didactylus  (none) ????????TACTCTGACATTAGAAAACAGC
Cynocephalus volans  (none) GGAAAATATACACTCACATTAGAAAACAGC
Danio rerio  (none) GGAAAATACACTTTGACCCTGGAAAATGCT
Dasyprocta punctata  (none) ????AATATACCCTCACATTAGAGAACAGC
Dasypus novemcinctus  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Dasyurus albopunctatus  (none) ??????????????????????????????
Daubentonia madagascariensis  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGGAAACAGC
Delphinapterus leucas  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGATAACAGC
Didelphis virginiana  (none) ????????????????????????????GT
Dinomys branickii  (none) GGAAAGTATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Dipodomys heermanni  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Dromiciops gliroides  (none) ???????????????????????AAATAGT
Dugong dugon  (none) GGGAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Echinops telfairi  (none) GGGAAATACACTCTCACCCTAGAAAACAGC
Echymipera kalubu  (none) ??????????????????????????????
Elephantulus rufescens  (none) GGAAAATACACTCTCACACTGGAGAACAGC
Elephas maximus  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Emballonuridae  (none) ??????TATACTCTCACCTTAGAAAACAGC
Equus caballus  (none) GGAAAGTACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Erethizon dorsatum  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAGAACAGC
Erinaceus sp.  (none) ??????????????????????????????
Eschrichtius robustus  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Eubalaena australis  (none) GGAAAATATACTCTAACGTTAGAAAACAGC
Felis catus  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Fossa fossana  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Furipterus horrens  (none) ??????????????????TTAGAAAACAGC
Galeopterus variegatus  (none) GGAAAATATACACTCACATTAGAAAACAGC
Gallus gallus  (none) GGAAAGTATACCCTGACTTTAGAAAACAGC
Genetta genetta  (none) ????????????CTCACATTAGAAAACAGC
Geomyidae  (none) GGAAAATATACCCTCACATTAGAAAACAGC
Gliridae  (none) ???AAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Glironia venusta  (none) ???????ACACTCTCACCTTAGAAAATAGT
Heterocephalus glaber  (none) ??GAAATATACTCTAACATTAGAGAACAGC
Heterohyrax brucei  (none) GGGAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Hippopotamidae  (none) ???????????????????????????AGC
Hipposideros commersoni  (none) ???????????????????TAGAAAACAGC
Homo sapiens  (none) GGAAAATATACGCTTACATTAGAAAACAGC
Hoplomys gymnurus  (none) ????AGTATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Hydrochoerus hydrochaeris  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Hypsiprymnodon moschatus  (none) ?????????????????????????????T
Hystrix sp.  (none) GGAAAATATACTCTTACATTAGAGAACAGC
Inia geoffrensis  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGATAACAGC
Isoodon macrourus  (none) ??????????????????????????????
Jaculus jaculus  (none) GGTAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Kogia breviceps  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Lama glama  (none) ??????TATACTCTCACGTTGGAAAACAGC
Laonastes aenigmamus  (none) ??GGAATACACTCTCACACTAGAAAACAGC
Lemur catta  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Oryctolagus cuniculus  (none) GGAAAATACACGCTCACATTAGAAAACAGC
Loxodonta africanus  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Macaca mulatta  (none) GGAAAATATACACTTACATTAGAAAACAGC
Macropus eugenii  (none) ???????????????????????AAACAGC
Macrotis lagotis  (none) ??????????????????????????????
Manis pentadactyla  (none) ??????TATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Manis tricuspis  (none) ???AAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Megaderma lyra  (none) ??????TATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Megaptera novaeangliae  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Meles meles  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGTAAACAGC
Mephitis mephitis  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGTAAACAGC
Mesoplodon bidens  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGATAACAGC
Microcebus murinus  (none) GTGGAATATACTCTCACACTAGAAAACAGC
Miniopterus sp.  (none) ??????????????????????????????
Monodelphis domestica  (none) ???AAATACACTCTCACCTTGGAAAATAGT
Moschus sp.  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Mus musculus  (none) GGAAAATACACTCTCACACTAGAAAACAGC
Myocastor coypus  (none) GGAAAGTATACTCTCACCTTAGAAAACAGC
Myotis lucifugus  (none) GGAAAATATACACTCACCTTAGAAAACAGC
Myrmecobius fasciatus  (none) ????????????????????????AATAGT
Myrmecophaga tridactyla  (none) GGAAAATATACTTTGACATTAGAAAACAGC
Mystacina tuberculata  (none) ??????TATACTCTCACCTTAGAAAACAGC
Myzopoda aurita  (none) ??????TACACTCTCACTTTAGAAAACAGC
Nandinia binotata  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Natalus stramineus  (none) ??????????????????????AAAACAGC
Noctilio sp.  (none) ??????????????????????????????
Nomascus leucogenys  (none) GGAAAATATACGCTTACATTAGAAAACAGC
Notoryctes typhlops  (none) ???????????????????????AAATAGT
Nycteris sp.  (none) ???????ATACTCTCATCTTAGAAAACAGC
Nycticebus coucang  (none) GGAAAATACACTCTCACTTTAGAAAACAGC
Nyctimene albiventer  (none) ??????TATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Ochotona sp.  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Octodontomys gliroides  (none) ???AAGTATACTCTCACATTAGAGAACAGC
Odobenus rosmarus  (none) ??????????????????????????????
Okapia johnstoni  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Ornithorhynchus anatinus  (none) GGGAAATACACTCTCACCTTAGAGAACAGC
Orycteropus afer  (none) GGGAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Otolemur garnettii  (none) GGAAAATACACTCTCACTTTAGAAAACAGC
Pecari tajacu  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Pedetes sp.  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Petaurus breviceps  (none) ??????????????????????????????
Petromus typicus  (none) GGGAAATACACTCTCACATTAGAGAACAGC
Petromyscus sp.  (none) GGGAAATACACTCTCACATTAGAAAAAAGC
Phascolarctos cinereus  (none) ??????????????????????????????
Phoca vitulina  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Phocoena phocoena  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGATAACAGC
Physeter macrocephalus  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Platanista gangetica  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Podogymnura truei  (none) ?????????ACTCTGACATTAGAAAACAGC
Pontoporia blainvillei  (none) GGAAAATATACTCTCGCTTTAAATAACAGC
Prionodon linsang  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAACAGCA
Procavia capensis  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Procyon lotor  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGTAAACAGC
Propithecus verreauxi  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Pseudochirops cupreus  (none) ????????????????????????AATAGT
Pteronotus parnellii  (none) ??????TATACTCTCACCTTAGAAAATAGC
Pteropus sp.  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Ptilocercus lowii  (none) ????????TACTCTCACTTTAGAAAACAGC
Rhinolophus creaghi  (none) TGGGAATACACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Rhinopoma hardwickii  (none) ?????????ACTCTCACATTAGAAAACAGC
Rhynchocyon petersi  (none) ??????????????????????????????
Rhyncholestes raphanurus  (none) ???????????????????????AAATAGT
Sciuridae  (none) GGAAAATATACTCTTACATTAGAAAACAGC
Solenodon paradoxus  (none) ?????ATATACTCTCACATTAGAAAATAGC
Sorex sp.  (none) ??????TATACTCTCACACTAGAAAACAGC
Spalax sp.  (none) ????AATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Suricata suricatta  (none) GGCAAATATACCCTCACATTAGTAAACAGC
Sus scrofa  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Tachyglossus aculeatus  (none) ????????CACTCTCACTTTAGAGAACAGC
Tadarida brasiliensis  (none) ???????????????ACCTTAGAAAACAGC
Taeniopygia guttata  (none) GGGAAATATACTCTGACCTTAGAAAACAGC
Talpa sp.  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Tapirus indicus  (none) ??????TATACTCTCACGTTAGAAAACAGC
Tarsipes rostratus  (none) ???????????????????????AAATAGC
Tarsius sp.  (none) GGAAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Thryonomys swinderianus  (none) ???AAATACACTCTCACATTAGAGAACAGC
Thyroptera tricolor  (none) ????????????????????????AACAGC
Tragulus napu  (none) GGGAAATACACTCTCACATTAGAAAACAGC
Trichechus manatus  (none) GGAAAATATACTCTCACATTAGAAAACAGC
Trichosurus vulpecula  (none) ???????????????????????????AGT
Tupaia sp.  (none) GGAAAATACACTCTCACATTGGAAAACAGC
Tursiops truncatus  (none) GGAAAATATACTCTCACGTTAGATAACAGC
Vombatus ursinus  (none) ??????????????????????????????
Xenopus laevis  (none) GGAAAATACACTTTGACACTAGAAAACAGC

Columns

None of the columns has a description.