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Matrix 299 of Study 849

About Citation title: "Seed plant relationships and the systematic position of Gnetales based on nuclear and chloroplast DNA: conflicting data, rooting problems, and the monophyly of conifers.".
About This study was previously identified under the legacy study ID S709 (Status: Published).

Matrices

Title: rbcL atpB 18SrDNA 26SrDNA

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M1131

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Zingiber  (none) ??????????????????????????????
Zamia pumila  (none) ------------------------------
Zamia hybrid  (none) ------------------------------
Welwitschia  (none) ------------------------------
Vandenboschia  (none) ??????????????????????????????
Tsuga canadensis  (none) -----------------ACACCCGCTGAGT
Trochodendron  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCGCTGAAT
Tragopogon  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCGCTGAGT
Tmesipteris  (none) ??????????????????????????????
Thujopsis dolabrata  (none) -----------------------------T
Thuja plicata  (none) -----------------------------T
Tetraphis  (none) ??????????????????????????????
Tetracentron  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCGCTGAAT
Tetracarpaea  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCGCTGAGT
Taxus baccata  (none) ------------------------------
Taxodium distichum  (none) ------------------------CTGAAT
Sequoiadendron giganteum  (none) ??????????????????????????????
Sequoia sempervirens  (none) ------------------------------
Sciadopitys  (none) -----------------------GAATTTA
Sassafras  (none) ??????????????????????????????
Ribes  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCGCTGAGT
Pteridium  (none) ??????????????????????????????
Psilotum  (none) ??????????????????????????????
Pseudotsuga menziesii  (none) ------------------------------
Polypodium  (none) ------------------------------
Polemonium  (none) ------------------------------
Podocarpus  (none) ------------------------------
Plumbago  (none) ??????????????????????????????
Platanus  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGGCCACCCGCTGAGT
Piper  (none) ??????????????????????????????
Pinus wallichiana  (none) ??????????????????????????????
Pinus strobus  (none) ------------------------------
Pinus peuce  (none) --------------TACACACCCGCTGAGT
Pinus mugo  (none) ---CAGGTCAGGCGAGAACACCCGTTGAGT
Pinus hybrid  (none) ??????????????????????????????
Pinus cembra  (none) ------------------------------
Picea hybrid  (none) ??????????????????????????????
Picea breweriana  (none) -------------------------TGAGT
Picea asperata  (none) ------GTCAGGCGAGAACACCCGTTGAGT
Phyllocladus  (none) ??????????????????????????????
Paeonia  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCG?TGAAT
Osmunda  (none) ??????????????????????????????
Ophioglossum  (none) ??????????????????????????????
Nymphaea  (none) ????????????????????????????AT
Nuphar  (none) CCCAG{GT}TCAGGCGG{GT}ATTCACCCG
Myriophyllum  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCGCTGAGT
Metasequoia  (none) ------------------------------
Marchantia  (none) ------------------------------
Magnolia  (none) ??????????????????????????????
Lysimachia  (none) ------------------------------
Liriodendron  (none) ??????????????????????????????
Liquidambar  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGT
Larix leptolepis  (none) -------------GAGAACACCCGTTGAGT
Lactoris  (none) ??????????????????????????????
Juniperus  (none) ------------------------------
Impatiens  (none) ----------------------------GT
Illicium  (none) ??????????????????????????????
Huperzia  (none) ??????????????????????????????
Hamamelis  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGACTACCCGCTGAGT
Gunnera  (none) -----------------------GCTGAGC
Gnetum urens  (none) ??????????????????????????????
Gnetum parvifolium  (none) ??????????????????????????????
Gnetum nodiflorum  (none) ??????????????????????????????
Gnetum montanum  (none) -----------------------------T
Gnetum leyboldii  (none) ??????????????????????????????
Gnetum indicum  (none) ------------------------------
Gnetum gnemon  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGGATACCCGCTGAGT
Gnetum costatum  (none) -----------------------------T
Gnetum africanum  (none) ??????????????????????????????
Ginkgo  (none) ------------------------------
Eucryphia  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAAT
Equisetum  (none) -----------------------GCTGAAT
Ephedra viridis  (none) ------------------------------
Ephedra tweediana  (none) ??????????????????????????????
Ephedra torreyana  (none) ??????????????????????????????
Ephedra spKina  (none) ------------------------------
Ephedra spChile  (none) ??????????????????????????????
Ephedra sinica  (none) ---CAGGTCAGGCGAGATCACCCGTTGAGT
Ephedra saxatilis  (none) ??????????????????????????????
Ephedra monosperma  (none) ----AGGTCAGGCGAGATCACCCGCTGAGT
Ephedra minuta  (none) ------------------------------
Ephedra major  (none) ??????????????????????????????
Ephedra intermedia  (none) ----------------ATCACCCGTTGAGT
Ephedra gerardiana  (none) ----AGGTCAGGCGAGATCACCCGTTGAGT
Ephedra frustillata  (none) ----AGGTCAGGCGAGATCACCCGTTGAGT
Ephedra fragilis  (none) ------------------------------
Ephedra equisetina  (none) ??????????????????????????????
Ephedra distachya  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGATCACCCGCTGAGT
Ephedra californica  (none) ??????????????????????????????
Ephedra antisyphilitica  (none) ??????????????????????????????
Ephedra andina  (none) ??????????????????????????????
Ephedra americana  (none) ------------------CACCCGCTGAGT
Encephalartos villosus  (none) ------------------------------
Drimys  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGGCCACCCGCTGAAT
Dioon sp  (none) ------------------------------
Dicksonia  (none) ??????????????????????????????
Cycas revoluta  (none) ------------------------------
Cycas hybrid  (none) ------------------------------
Cupressus  (none) ??????????????????????????????
Cinnamomum  (none) ??????????????????????????????
Chloranthus  (none) ??????????????????????????????
Chamaecyparis pisifera  (none) --------------TTGATACCCGCTG??T
Ceratozamia mexicana  (none) -------TCAGGCGAGAGTACCCGTTGAGT
Cephalotaxus  (none) ------------------------------
Cedrus libanii  (none) -------TCAGGCGAGAACACCCGCTGAGT
Calocedrus  (none) ??????????????????????????????
Bowenia serrulata  (none) -----------------ACACCCGCTGAGT
Botrychium  (none) ??????????????????????????????
Blechnum  (none) ??????????????????????????????
Austrobaileya  (none) ??????????????????????????????
Asplenium  (none) ??????????????????????????????
Araucaria araucana  (none) ??????????????????????????????
Anthoceros  (none) ??????????????????????????????
Angiopteris  (none) ??????????????????????????????
Amborella  (none) ??????????????????????????????
Agave  (none) ??????????????????????????????
Adiantum  (none) ??????????????????????????????
Acorus  (none) CCCCAGGTCAGGCGGGGCCACCCGCTGAGT
Abies grandis  (none) -----------------------------T

Columns

None of the columns has a description.