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Matrix 326 of Study 867

About Citation title: "Tracing the evolution of RNA in ribosomes.".
About This study was previously identified under the legacy study ID S730 (Status: Published).

Matrices

Title: LSU-SSU rRNA

Description: Legacy TreeBASE Matrix ID = M1162

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Encephalitozoon cuniculi  (none) 004A04429009330083560460003350
Entamoeba histolytica  (none) 003905329009340064763663006342
Trepomonas agilis  (none) 00973337611C341274864565116322
Prorocentrum micans  (none) 004A44029009340064853459007342
Dictyostelium discoideum  (none) 004A44029009340064743848006341
Tetrahymena thermophila  (none) 006944029009340064754558006342
Arabidopsis thaliana  (none) 007A44029009340064763469006333
Oryza sativa  (none) 007A44029009340064763469006333
Schizosaccharomyces pombe  (none) 00BA43129009340064763469006333
Saccharomyces cerevisiae  (none) 003A43129009340064763469006333
Homo sapiens  (none) 003A43129009340064754449006333
Xenopus laevis  (none) 006A43129009340064754469006333
Aquifex aeolicus  (none) 086A0442A0083400645936A5003343
Thermotoga maritima  (none) 086A0442A0083400645A27A5003343
Borrelia burgdorferi  (none) 086A0442A1083400645A27A5003343
Thermus thermophilus  (none) 086A0442A0083400645A27A5003343
Escherichia coli  (none) 086A0442B0083400645A27A6003343
Helicobacter pylori  (none) 086A0442B0083400645A27A5003343
Pseudomonas sp  (none) 086A0442B0083400645A27A5003343
Bradyrhizobium japonicum  (none) 086A0442B0083400645A27A5003343
Bacillus subtilis  (none) 086A0442B0083300835A27A5003343
Mycobacterium tuberculosis  (none) 086A0442B0083300835A28A5003343
Synechocystis sp  (none) 086A0442B0083300835A27A5003343
Chlamydia sp  (none) P86A0442B008330083593796003343
Methanobacterium thermoautotrophicum  (none) C00A0442A108330083593796003343
Haloferax volcanii  (none) 954A0442A008330083593796003343
Halobacterium halobium  (none) 174A04429108330083593796003343
Sulfolobus solfataricus  (none) 65590442A008330083593796004343
Desulfurococcus mobilis  (none) 17590442A008330083593796003343

Columns

Column Character Description
1 u
2 A1
3 b
4 B1
5 b
6 u
7 B2
8 u
9 B3
10 b
11 b
12 u
13 B4
14 B5
15 b
16 b
17 h
18 B5"
19 u
20 B6
21 b
22 h
23 B6"
24 b
25 b
26 b
27 u
28 B4"
29 u
30 B7
31 h
32 B7"
33 B8
34 b
35 b
36 b
37 b
38 u
39 h
40 B8"
41 b
42 b
43 b
44 u
45 B9
46 b
47 b
48 h
49 B9"
50 b
51 b
52 b
53 u
54 B10
55 b
56 h E
57 B10"
58 b
59 b
60 u
61 B11
62 h
63 B11"
64 u
65 B12
66 b
67 h
68 B12"
69 b
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73 u
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75 b
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81 b
82 b
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84 B14
85 b
86 b
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88 B14 1
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95 b
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97 b
98 u
99 B16
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102 B16"
103 b
104 u
105 B17
106 h
107 B17"
108 u
109 B15"
110 b
111 b
112 u
113 B14"
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116 u
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118 b
119 h
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122 u
123 B19
124 h
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127 u
128 B13"
129 u
130 B3"
131 b
132 b
133 u
134 B20
135 h
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137 u
138 B2"
139 b
140 u
141 B21
142 h
143 B21"
144 u
145 B1"
146 b
147 u
148 C1
149 b
150 b
151 b
152 b
153 u
154 C1 1
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156 h
157 C1 1"
158 b
159 u
160 C1 2
161 b
162 b
163 b
164 b
165 b
166 b
167 b
168 b
169 b
170 h
171 C1 2"
172 b
173 b
174 b
175 b
176 b
177 b
178 b
179 b
180 b
181 u
182 C1 3
183 b
184 h
185 C1 3"
186 b
187 u
188 C1"
189 b
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191 b
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194 u
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196 b
197 b
198 b
199 u
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201 b
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207 h
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217 h
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233 b
234 b
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237 b
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241 b
242 u
243 D8
244 b
245 b
246 h B4
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248 b
249 b
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251 D9
252 b
253 b
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256 b
257 u
258 D7"
259 b
260 b
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263 h
264 D10"
265 u
266 D6"
267 b
268 u
269 D11
270 b
271 u
272 D12
273 b
274 h
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276 b
277 u
278 D13
279 b
280 b
281 u
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283 b
284 b
285 b
286 b
287 b
288 b
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291 b
292 b A
293 b
294 b
295 b
296 b
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299 b
300 b
301 b
302 h
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304 b
305 b
306 b
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309 b
310 b
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313 b
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316 b
317 b
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320 h
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323 D17
324 b
325 b
326 b
327 b
328 b
329 b
330 b
331 b
332 b
333 b
334 b
335 u
336 D18
337 b
338 b
339 h
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341 b
342 b
343 u
344 D19
345 b
346 h
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348 b
349 u
350 D17"
351 b
352 b
353 b
354 b
355 b
356 b
357 b
358 b
359 b
360 u
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362 b
363 b
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366 b
367 b
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374 b
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377 b
378 b
379 b
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383 b
384 b
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389 b
390 u
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403 u
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405 b
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408 b
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428 b
429 b
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434 u
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446 b
447 b
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450 b
451 b
452 h
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454 b
455 b
456 u
457 E12
458 b
459 b
460 b
461 b
462 b
463 b
464 u
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466 b
467 h
468 E13"
469 b
470 u
471 E14
472 b
473 b
474 b
475 b
476 b
477 h
478 E14"
479 b
480 b
481 b
482 b
483 b
484 u
485 E15
486 b
487 h
488 E15"
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491 E12"
492 b
493 b
494 b
495 b
496 b
497 b
498 u
499 E11"
500 b
501 b
502 u
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504 u
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524 b
525 b
526 b
527 b
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530 b
531 b
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533 b
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537 b
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542 b
543 b
544 b
545 u
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547 b
548 b
549 b
550 b
551 b
552 b
553 h
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555 b
556 b
557 b
558 b
559 b
560 b
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563 h
564 E20 2"
565 u
566 E20"
567 b
568 b
569 b
570 b
571 b
572 b
573 b
574 u
575 E21 B5
576 b
577 u
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579 b
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584 E23
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586 b
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590 b
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596 b
597 b
598 b E
599 b
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603 b
604 b
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611 b
612 h B2b
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614 b
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616 h
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618 u
619 E24" B2c
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621 E21"
622 b
623 b
624 u B5
625 E18"
626 b
627 b
628 b
629 b
630 b
631 u
632 E1"
633 u
634 F1
635 b
636 h
637 F1"
638 b
639 u
640 G1
641 b
642 b
643 b
644 u
645 G2 E
646 b
647 u
648 G3 E
649 b
650 b
651 u
652 G4
653 b
654 b
655 b
656 b E
657 b
658 b
659 b
660 b
661 h
662 G4"
663 b
664 b
665 b
666 b
667 b
668 b
669 b
670 u
671 G5
672 b
673 b
674 u
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676 h
677 G5 1"
678 u
679 G5 2
680 b
681 h
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683 b
684 u
685 G5"
686 b
687 b
688 u
689 G3" E
690 b
691 b
692 u
693 G6 P
694 h P
695 G6" P
696 u
697 G7
698 b
699 h
700 G7"
701 b
702 u
703 G8
704 u
705 G9
706 u
707 G10
708 b
709 u
710 G11
711 b
712 b
713 h
714 G11"
715 b
716 b
717 u
718 G12
719 h
720 G12"
721 u
722 G10"
723 b
724 u
725 g13
726 b
727 h
728 G13"
729 b
730 u
731 G14
732 b
733 h
734 G14"
735 b
736 u
737 G9"
738 u
739 G15
740 b
741 h
742 G15"
743 b
744 u
745 G8"
746 u E
747 G2" E
748 b
749 b
750 u
751 G16 A
752 b A
753 b
754 b A
755 h
756 G16" A
757 b A
758 b
759 b A
760 u
761 G17
762 b
763 u
764 G18
765 b
766 h
767 G18"
768 b
769 b
770 u
771 G19
772 b
773 h A
774 G19"
775 b
776 u
777 G17"
778 b
779 b
780 u P
781 G20 P
782 u
783 G20" P
784 b P
785 u
786 G1"
787 b
788 b
789 b
790 u
791 G1 1
792 h
793 G1 1"
794 H1
795 b
796 b
797 b
798 u
799 H2
800 b
801 h
802 H2"
803 b
804 u
805 H3
806 b
807 b
808 b
809 h
810 H3"
811 b
812 b
813 b
814 b
815 u
816 H4
817 b
818 h
819 H4"
820 b
821 u
822 H1"
823 b
824 b
825 b
826 u
827 H1 1
828 b
829 b
830 u
831 H1 2
832 h
833 H1 2"
834 b
835 u
836 H1 3
837 b
838 b
839 b
840 h
841 H1 3"
842 b
843 b
844 b
845 u
846 H1 1"
847 b
848 b
849 u
850 I1
851 b
852 u
853 I2
854 b
855 h
856 I2"
857 b
858 u
859 I3
860 b
861 b
862 b
863 b
864 u
865 I3"
866 b
867 b
868 b
869 b
870 b
871 b
872 u
873 I1"
874 b
875 u
876 A11"
877 b
878 u
879 u
880 S1
881 u
882 S2
883 u
884 S1"
885 u
886 S3
887 b
888 b
889 u
890 S4
891 b
892 u
893 S5
894 b
895 u
896 S6
897 b
898 b
899 b
900 b
901 b
902 b
903 h
904 S6"
905 b
906 b
907 b
908 b
909 b
910 b
911 b
912 u
913 S7
914 u
915 S8
916 b
917 b
918 b
919 b
920 u
921 E8 1
922 h
923 E8 1"
924 u
925 S9
926 b
927 b
928 b
929 b
930 h
931 S9"
932 b
933 b
934 b
935 u
936 S10
937 b
938 b
939 b
940 h
941 S10"
942 b
943 b
944 u
945 S10 1
946 b
947 b
948 b
949 b
950 h
951 S10 1"
952 b
953 b
954 b
955 b
956 u
957 S11
958 b
959 b
960 b
961 b
962 b
963 h
964 S11"
965 b
966 b
967 b
968 b
969 b
970 b
971 u
972 S8"
973 b
974 b
975 b
976 b
977 u
978 S12
979 b
980 b
981 b
982 b
983 b
984 b
985 h
986 S12"
987 b
988 b
989 b
990 b
991 b
992 b
993 u
994 S13
995 b
996 h
997 S13"
998 b
999 u
1000 S7"
1001 u
1002 S14
1003 b
1004 b
1005 h
1006 S14"
1007 b
1008 b
1009 u
1010 S15 B8
1011 b
1012 h B8
1013 S15" B8
1014 b B8
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1016 S5"
1017 b
1018 u
1019 S16
1020 b
1021 b
1022 h
1023 S16"
1024 b
1025 u
1026 S4"
1027 b
1028 b
1029 u
1030 S17
1031 b
1032 b
1033 b
1034 h
1035 S17"
1036 b
1037 b
1038 b
1039 b
1040 u
1041 S18
1042 b
1043 b
1044 b
1045 b
1046 b
1047 h
1048 S18"
1049 b
1050 b
1051 b
1052 b
1053 b
1054 u
1055 S19
1056 u
1057 S20
1058 u
1059 S21 A
1060 b A
1061 b
1062 u A
1063 S20" A
1064 u A
1065 S21" A
1066 u
1067 S19"
1068 u
1069 S3"
1070 b
1071 b
1072 b
1073 b
1074 u
1075 S22
1076 b
1077 b
1078 u
1079 S23 B4
1080 b
1081 b
1082 u
1083 P23 1
1084 b
1085 b
1086 b
1087 h
1088 P23 1"
1089 b
1090 b
1091 b
1092 b
1093 E23 1 2
1094 b
1095 b
1096 b
1097 b
1098 h
1099 E23 1 2"
1100 b
1101 b
1102 b
1103 b
1104 b
1105 u
1106 E23 4
1107 b
1108 u
1109 E23 5
1110 h
1111 E23 5"
1112 u
1113 E23 6
1114 b
1115 b
1116 b
1117 h
1118 E23 6"
1119 b
1120 b
1121 u
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1123 b
1124 b
1125 h
1126 E23 7"
1127 b
1128 b
1129 u
1130 E23 4"
1131 b
1132 u
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1134 u
1135 E23 9
1136 u
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1138 u
1139 E23 11
1140 u
1141 E23 10"
1142 u
1143 E23 12
1144 h
1145 E23 12"
1146 b
1147 u
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1149 u
1150 E23 11"
1151 u
1152 E23 8"
1153 E23 13
1154 b
1155 b
1156 b
1157 b
1158 u
1159 E23 14
1160 b
1161 b
1162 u
1163 E23 13"
1164 b
1165 b
1166 u
1167 E23 14"
1168 b
1169 b
1170 b
1171 u
1172 E23 10
1173 b
1174 u
1175 E23 12
1176 b
1177 b
1178 h
1179 E23 12"
1180 b
1181 b
1182 b
1183 u
1184 E23 10"
1185 b
1186 b
1187 S24
1188 b
1189 b
1190 b
1191 b
1192 u
1193 S25 B7a
1194 b
1195 b
1196 b
1197 b
1198 h E
1199 S25" B7a
1200 b B7b
1201 b
1202 b B7b
1203 b
1204 u
1205 S26
1206 h
1207 S26"
1208 u
1209 S24"
1210 b
1211 b
1212 b
1213 b
1214 u
1215 S23" B4
1216 b
1217 b
1218 u B2c
1219 S27 B2b
1220 b B2b
1221 b B2b
1222 b
1223 b
1224 h B2bPE
1225 S27" B2b
1226 b
1227 b
1228 u
1229 S28
1230 b
1231 u
1232 S29
1233 b
1234 b
1235 b
1236 b
1237 b
1238 b
1239 b
1240 h
1241 S29"
1242 b
1243 b
1244 b
1245 b
1246 b
1247 b
1248 u
1249 S30
1250 h
1251 S30"
1252 u
1253 S28"
1254 b
1255 u
1256 S22"
1257 b
1258 b
1259 u
1260 S31
1261 b
1262 b
1263 b
1264 h B2c
1265 S31"
1266 b
1267 b
1268 u
1269 S2"
1270 b
1271 u
1272 S32 E
1273 b P
1274 b
1275 u
1276 S33 E
1277 b
1278 u
1279 S34 P
1280 b
1281 b
1282 u
1283 S35
1284 b
1285 h PA
1286 S35"
1287 b
1288 u
1289 S36
1290 b
1291 b
1292 u
1293 S37
1294 b
1295 b
1296 b
1297 b
1298 u
1299 P37 1
1300 h
1301 P37 1"
1302 u
1303 P37 2
1304 b
1305 h
1306 P37 2"
1307 b
1308 u
1309 S37"
1310 b
1311 b
1312 b
1313 b
1314 b
1315 u
1316 S38
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1318 b A
1319 b
1320 b
1321 b
1322 u
1323 S39
1324 u
1325 S40
1326 b
1327 h
1328 S40"
1329 b
1330 u
1331 S41
1332 b
1333 h
1334 S41"
1335 b
1336 u
1337 S39"
1338 u
1339 S42
1340 b
1341 b
1342 u
1343 S43
1344 b
1345 b
1346 b
1347 b
1348 b
1349 b
1350 b
1351 b
1352 b
1353 b
1354 h
1355 P43 1
1356 b
1357 b
1358 b
1359 b
1360 h
1361 P43 1"
1362 b
1363 b
1364 b
1365 b
1366 b
1367 u
1368 P43 2
1369 b
1370 b
1371 b
1372 b
1373 b
1374 b
1375 b
1376 b
1377 h
1378 P43 2"
1379 b
1380 b
1381 b
1382 b
1383 b
1384 b
1385 b
1386 b
1387 u
1388 P43 3
1389 b
1390 b
1391 b
1392 b
1393 b
1394 b
1395 b
1396 b
1397 h
1398 P43 3"
1399 b
1400 b
1401 b
1402 b
1403 b
1404 b
1405 b
1406 u
1407 S43"
1408 b
1409 b
1410 b
1411 b
1412 b
1413 b
1414 b
1415 b
1416 b
1417 b
1418 b
1419 b
1420 b
1421 u
1422 S44
1423 b
1424 h
1425 S44"
1426 b
1427 b
1428 u
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1430 u
1431 S38"
1432 b
1433 b
1434 b
1435 b
1436 b
1437 b
1438 u
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1440 b
1441 u
1442 S34" P
1443 b P
1444 b
1445 u
1446 S45
1447 b
1448 b
1449 b
1450 b
1451 u
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1453 b
1454 b
1455 b
1456 b
1457 h
1458 E45 1"
1459 b
1460 u
1461 S46
1462 b
1463 b
1464 h
1465 S46"
1466 b
1467 b
1468 b
1469 u
1470 S45
1471 b
1472 b
1473 b
1474 b
1475 u
1476 S47
1477 b
1478 h
1479 S47"
1480 b
1481 b
1482 u PE
1483 S33" E
1484 b
1485 u
1486 S48
1487 b
1488 h
1489 S48"
1490 b
1491 u E
1492 S32" E
1493 b
1494 b
1495 u P
1496 S49 B2aB5B6PA
1497 b
1498 b B2aA
1499 b B2aA
1500 b
1501 b
1502 b
1503 b
1504 b
1505 b B5
1506 b
1507 b
1508 b
1509 b B6
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1511 b
1512 b
1513 b
1514 h
1515 S49" B2aB5B6PA
1516 b
1517 b
1518 b
1519 b
1520 b
1521 b
1522 b
1523 b
1524 b
1525 b B3
1526 b
1527 b
1528 b
1529 b B2aA
1530 b B2aA
1531 b B2aA
1532 u
1533 S50
1534 b
1535 b
1536 h
1537 S50"
1538 b
1539 b
1540 u