Matrix 13553 of Study 93
Matrices
Title: Eimerian Combined Alignment
Description: Matrix for Eimerian 18S COI ORF470
Rows
| Taxon Label | Row Segments | Characters 1?–30 |
|---|---|---|
| Caryospora bigenetica | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Choleoeimeria sp. | (none) | ------------------------------ |
| Coccidium ex. Cricetus cricetus K4 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| Cyclospora cayetanensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAG |
| Cyclospora cercopitheci | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAG |
| Cyclospora colobi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAG |
| Cyclospora papionis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAG |
| Cystoisispora ohioensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCACACGT |
| Cystoisospora belli | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACGT |
| Cystoisospora felis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| Cystoisospora orlovi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACGT |
| Cystoisospora suis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACGT |
| Cystoisospora timoni | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| Eimeria acervulina | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAGG |
| Eimeria adenoeides | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATG |
| Eimeria ahsata | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria alabamensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria albigulae | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria antrozoi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria arizonensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria arnyi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTT |
| Eimeria attwateri | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria auburnensis | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria auritusi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria banffensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria bovis | (none) | -GTAATTCTATG--CTATACATGCGCAAAT |
| Eimeria brunetti | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCATAG |
| Eimeria burdai | (none) | -GTAATTCTATGGTTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria cahirinensis NFS | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria cahirinensis SFS | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria cahirinensis WR | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria callospermophili | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria catronensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTA |
| Eimeria caviae | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria cf. mivati | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCATAG |
| Eimeria chaetodipi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria chinchillae | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria chobotari | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria coecicola | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATT |
| Eimeria crandallis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria cylindrica | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria dipodomysis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria ellipsoidalis | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria exigua | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria falciformis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria faurei | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAG |
| Eimeria flavescens | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATG |
| Eimeria furonis | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria gruis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria intestinalis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria irresidua | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATG |
| Eimeria langebarteli | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria leucopi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria magna | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria maxima | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAG |
| Eimeria media | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria meleagrimitis | (none) | -GTAATTCTA-GGCTAATACATGCGCAACT |
| Eimeria mitis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCATAG |
| Eimeria mivati | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCATAG |
| Eimeria myoxi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria nafuko | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria necatrix | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAG |
| Eimeria nieschulzi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria onychomysis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria ovinoidalis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria papillata | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria perforans | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria peromysci | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria phalacrocoraxae | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria pilarensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTA |
| Eimeria piriformis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATG |
| Eimeria polita | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTG |
| Eimeria porci | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTG |
| Eimeria praecox | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATACGCAAAG |
| Eimeria ranae | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCATTT |
| Eimeria reedi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria reichenowi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria rioarribaensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria scabra | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTG |
| Eimeria scholtysecki | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAACT |
| Eimeria separata | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sevilletensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Acomys sp. K2 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Apodemus agrarius 21439 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Apodemus agrarius 21455 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Apodemus agrarius 21615 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTG |
| Eimeria sp. ex. Apodemus agrarius 21617 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Apodemus agrarius 21655 | (none) | --------------TAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Apodemus agrarius 21668 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Apodemus flavicollis 1 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria sp. ex. Apodemus flavicollis 12 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria sp. ex. Apodemus flavicollis 4 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria sp. ex. Apodemus sylvaticus 0850 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Apodemus sylvaticus 0853 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCATTC |
| Eimeria sp. ex. Cricetus cricetus K7 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Dendrocopos leucotos DAM2009 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAGAG |
| Eimeria sp. ex. Gerbillus dasyurus | (none) | -GTGATCCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Lissemys punctata TKC 1 2005 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria sp. ex. Lissemys punctata TKC 2 2005 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria sp. ex. Mastomys natalensis | (none) | -GTGATCCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Phataginus tricuspis 1 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria sp. ex. Phataginus tricuspis 2 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria sp. ex. Sciurus carolinensis ESP181 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria sp. ex. Sorex araneus 136 | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria stiedai | (none) | -GTTATTCTACGGCTAATATGTGCGCAATG |
| Eimeria subspherica | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria synaptomysis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCA{AC |
| Eimeria telekii | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTC |
| Eimeria tenella | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAG |
| Eimeria trichosuri | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria tropidura | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria vejdovskyi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Eimeria vilasi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACTG |
| Eimeria weybridgensis | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAT |
| Eimeria wyomingensis | (none) | ------------------------------ |
| Eimeria zuernii | (none) | ------------------------------ |
| Goussia janae | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAAAG |
| Goussia metchnikovi | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| Goussia neglecta | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| Goussia noelleri | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| Goussia sp. ex. Bufo bufo | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| intranuclear coccidium ex. Indotestudo forsteni | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
| Isospora gryphoni | (none) | ------------------------------ |
| Isospora hypoleucae | (none) | ------------------------------ |
| Isospora rivolta | (none) | -GTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAA |
| Isospora robini | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Isospora sp. ex. Apodemus flavicollis B13 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Sylvia atricapilla iSAT1 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Sylvia atricapilla iSAT2 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Sylvia atricapilla iSAT3 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Sylvia atricapilla iSAT4 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Sylvia atricapilla iSAT5 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Talpa europaea 106 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Talpa europaea 151 | (none) | ------------------------------ |
| Isospora sp. ex. Talpa europaea 158 | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCAATC |
| Isospora sp. ex. Talpa europaea 218 | (none) | ------------------------------ |
| Toxoplasma gondii | (none) | -GTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACAT |
Columns
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