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Matrix 7858 of Study 11235

About Citation title: "How the Worm Got its Pharynx: Phylogeny, Classification and Bayesian assessment of Character Evolution in Acoela".
About Study name: "How the Worm Got its Pharynx: Phylogeny, Classification and Bayesian assessment of Character Evolution in Acoela".
About This study is part of submission 11225 (Status: Published).

Matrices

Title: 18S + 28S + COI, Non-structural & unfiltered

Description: This dataset contains sequence data from many outgroup taxa.

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Actinoposthia beklemischevi  (none) ATGCAAGTTTAAGTTCTTCTG????TTGAT
Actinoposthia haplovata  (none) ATGCAAGTCCAAGTTCAACTA?????TAGA
Amphiscolops bermudensis  (none) ATGCATGTGCAAGTTCAACTT?????GAAA
Amphiscolops sp  (none) ??????????????????????????????
Amphiscolops sp Hendelberg  (none) ATGCATGTGCAAGTTCAACTT?????GGAA
Anaperus biaculeatus  (none) ??????????????????????????????
Anaperus gardineri  (none) CATGCTGTGCAAGTTCAACTA???TAACGA
Anaperus rubellus  (none) ????ATGTGTAAGTTCAGCTT?????GAAA
Anaperus singularis  (none) ??????????????????????????????
Anaperus tvaerminnensis  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT???TAAACA
Terebellides stroemi GB  (none) ATGCATGTCTAAGTACAAGCT???CGAACA
Aphanostoma bruscai  (none) ?TGCATGTGTGAGTTCAGCAT???TATTAA
Aphanostoma collinae  (none) ATGCATGTGTGAGTTTAGCAT???TA?TAA
Aphanostoma sp  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAG???AA?TAA
Aphanostoma virescens  (none) ??????????????????????????????
Archaphanostoma macrospiriferum  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT???TAAACA
Nephrops norvegicus GB  (none) ??????????????????????????TTTA
Ascoparia sp  (none) ATGCATGTCTGAGTACACACT???CTAGCA
Atriofronta polyvacuola  (none) ATGCATGTGTAA?TTCAGCTA????TTTTA
Avagina marci  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA????TTTTA
Avagina n.sp.  (none) ??GCATGTGTAAGTTCAGCTA????TTTTA
Terebratulina retusa GB  (none) ATGCATGTCTAAGTACGAACT???TTGACA
Childia brachyposthium  (none) ATGCAAGTACAAGTTCAGCTT?????GAAA
Childia crassum  (none) ??????????????????????????????
Childia cycloposthium  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACTG??AAGCAAT
Childia groenlandica  (none) ATGCAAGTACAAGTTCAGCTT?????TAAA
Childia macroposthium  (none) ATGCAAGTACAAGTTCAGCTT??????GAA
Childia nsp 1  (none) ?????????????????????????CCAAA
Childia nsp 2  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAGCTA????AATAA
Childia sp  (none) ATGCAAGTCTAAGTTCAACAA??????AAA
Childia submaculatum  (none) ????ATGTCCAAGTTCAACTA?????AATA
Childia trianguliferum  (none) ATGCAAGTCTAAGTGAAACTT?????TACG
Childia vivipara  (none) ????????????GTTCAGCTT??????GAA
Branchiostoma floridae GB  (none) ATGCACGTGCAAGTTTAAACT???GTC?TC
Ciona intestinalis GB  (none) ATGCAAGTCTAAGTACGAGCT???CTCGTA
Montastraea franksi GB  (none) ATGCATGTCTAAGTATAAGCA???CTTGTA
Rosacea flaccida GB  (none) ATGCATGTCTAAGTATAAGCA???CTTGTA
Aurelia sp GB  (none) ATGCATGTCTAAGTATAAGCA???CTTGTA
Convoluta cf bohmigi  (none) ATGCATGTGTAAGTTTATCTT?????GAAA
Convoluta convoluta  (none) ATGCATGTGTAAGTTCATCTT?????GAAA
Convolutriloba hastifera  (none) ?TGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAAA
Convolutriloba longifissura  (none) ATGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAAA
Convolutriloba macropyga  (none) ATGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAAA
Convolutriloba retrogemma  (none) ATGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAAA
Daku woorimensis  (none) ATGCATGTCTAAGTACACTGA?CCTATTCC
Diopisthoporus longitubus  (none) ATGCATGTCTAAGTACACGCT???CTCGAA
Diopisthoporus nsp  (none) ATGCATGTCTTAGTACACGCT???CCAGAA
Diopisthoporus psammophilus  (none) ??????????????????????????????
Asterias forbesi GB  (none) ATGCATGTCCAAGTACAAGCT???TTCAAA
Endocincta nsp  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????ACGAA
Endocincta punctata  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????CAGAA
Eumecynostomum altitudi  (none) ATGCATGTC??AGTTCAACGA???TGGAAA
Faerlea glomerata  (none) ??????????????????????????????
Hallangia proporoides  (none) ATGCATGTGTAAGTACAATGT??GGGCGAC
Haplocelis dichona  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCAG?TATTTGAA
Haplogonaria schillingi  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCTT???TTTGAA
Haplogonaria syltensis  (none) ATGCATGTGTAAGTCCAGCTC????TAGGA
Haplogonaria viridis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Haploposthia lactomaculata  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTGAAA
Haploposthia rubra  (none) ATGCAAGTATAAGTTGAACGT????ATATA
Haploposthia sp  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Haploposthia vandula  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Heterochaerus blumi  (none) ??????????????????????????????
Hofstenia miamia  (none) ATGCATGTCTAAGTTTTTTGAACAAATAAC
Hofsteniola pardii  (none) ATGCATGTCTAAGTTTAACGAATAAATAAT
Isodiametra bajaensis  (none) ??????????????????????????????
Isodiametra cuernos  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAACTG?????AACA
Isodiametra divae  (none) ATGCATGTTTAAGTTCATCTT?????GAAA
Isodiametra hortulus  (none) ?TGCATGTGTGAGTTTAGCAG???AA?TAA
Isodiametra nicki  (none) ATGCATGTTTAAGTTCATCTT?????GCCA
Isodiametra norvegica  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT???AA?TCA
Isodiametra pulchra  (none) ATGCACGTGTCAGTCCAAC?????????AA
Isodiametra vexillaria  (none) ATGCATGTGTTAGTTCATCTT????????G
Kuma albiventer  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Kuma viridis  (none) ATGCAAGTGTAAGTTCAGCAA????TATTA
Meara stichopi  (none) ATGCATGTCTAAGTACAGACC???CTTGTA
Mecynostomum auritum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCATTGTATATGTAAC
Mecynostomum sp  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGTCAATGTAAC
Antalis entalis GB  (none) ATGCATGTCTAAGTACAGACT???TTCAGA
Myopea callaeum  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????AAGGA
Myopea sp  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC??CAAGGAA
Oerstedia dorsalis GB  (none) ATGCATGTCTAAGTACAAACT???TTTACA
Nemertoderma sp  (none) ATGCATGTCTAAGTATAAACC???CCAGAA
Neochildia fusca  (none) ??????????????????????????????
Notocelis gullmarensis  (none) ??????????????????????????????
Oligofilomorpha interstitiophilum  (none) ATGCACGTATGAGTTCAGCTC????GAGGA
Otocelis erinae  (none) ATGCATGTGTAAGTTCATCTA????TAGAA
Otocelis sandara  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCTT????GAGAA
Paedomecynostomum bruneum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGTCAATGTAAC
Paramecynostomum diversicolor  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAGCGT?CAGTCTAT
Paramecynostomum sp  (none) ?????????????????????????TCTAT
Paratomella rubra  (none) ATGCATGTCTACGTTCAGTAA?????AGAA
Paratomella unichaeta  (none) ATGCATGTCTATGTTCAGTAT?????AGAA
Pelophila lutheri  (none) ?TGCATGTGTAAGTTCAGCTA????TATTA
Philactinoposthia coneyi  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA??TCAAGAA
Philactinoposthia n.sp.  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA??TCAAGAA
Philactinoposthia nsp 2  (none) ATGCATGTGTAAGTTGAACTC????GAGAA
Philactinoposthia saliens  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCC????AACCT
Philactinoposthia sp  (none) ATGCATGTGTAAGTTTAACTC???GAAGGA
Philactinoposthia sp 2  (none) ??????????????????????????????
Philactinoposthia sp 3  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCT???TACCAA
Philactinoposthia sp 4  (none) ??????????????TCAACTC?CCTTAGAA
Philocelis brueggemanni  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCA????GATAA
Philocelis karlingi  (none) ATGCATGTATGAGTGTGCCTATTTGATTAT
Philocelis robrochai  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCT????GATAA
Philomecynostomum lapillum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGA???TGGAAA
Philomecynostomum sp  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGA???TGGAAA
Polycanthus sp  (none) ??????????????????????????????
Polycanthus sp 2  (none) ????????????????????????CTTGAA
Polycanthus torosus  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Postmecynostomum pictum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAGCGT?CAATCAAT
Praeconvoluta bocasensis  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT???TAGTAA
Praeconvoluta castinea  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT???TT?TAA
Praeconvoluta tigrina  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT???TTATAA
Praeconvoluta tornuva  (none) ?TGCATGTGTGAGTTTAGCAT???TA?TAA
Praesagittifera naikaiensis  (none) ?TGCATGTGTAAGTATATCTT?????GAAA
Priapulus caudatus GB  (none) ATGCATGTCTAAGTACAGACG???GATACA
Proaphanostoma tenuissima  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA????TTTTA
Proporus bermudensis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCAT???AATGGA
Proporus brochii  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCCT??TTTGGAA
Proporus carolinensis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCCT??GCAAGAA
Proporus sp  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCCT??GCAAGAA
Proporus sp 2  (none) ATGCATGT?TAAGTTCAGCCT??GTTGAAC
Pseudactinoposthia sanguineum  (none) ?TGCAAGTTTAAGTTCTTCTG????TTGAT
Pseudaphanostoma herringi  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTT????TTGTA
Pseudaphanostoma smithrii  (none) ?TGCATGTCTAAGTTCAGCTT???TTTGAA
Pseudmecynostomum bruneophilum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGTCAATGTAAC
Pseudmecynostomum phoca  (none) ?TGCATGTCC?AGTTCAACGTCAATGTAAC
Pseudohaplogonaria rodmani  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Pseudohaplogonaria sp  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Raphidophallus actuosus  (none) ATGCATGTGTAAGTTCATCTT????TATTA
Simplicomorpha gigantorhabditis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTTGAA
Apionsoma misakianum GB  (none) ATGCATGTCTAAGCACAGGCC???TTAACA
Solenofilomorpha crezeei  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????AAGGA
Solenofilomorpha nsp  (none) ??????????????????????????????
Solenofilomorpha n.sp. 2  (none) ??????????????TCAGCTC????GAGGA
Stromatricha hochbergi  (none) ATGCATGTGTAAGTGAAACTT?????GAAA
Symsagittifera corsicae  (none) ATGCATGTGTAAGTGAAACTT?????GCAA
Symsagittifera psammophila  (none) ??????????????????????????????
Symsagittifera roscoffensis  (none) ATGCATGTGTAAGTGAAACTT?????GCAA
Ramazzottius oberhaeuseri GB  (none) ATGCATGTCTCAGTACTTGCT???TTTACA
Waminoa brickneri  (none) ??????????????????????????????
Waminoa sp  (none) ATGCATGTGCAAGTGTCTCTT???GGATAA

Columns

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