CiteULike CiteULike
Delicious Delicious
Connotea Connotea

Matrix 7860 of Study 11235

About Citation title: "How the Worm Got its Pharynx: Phylogeny, Classification and Bayesian assessment of Character Evolution in Acoela".
About Study name: "How the Worm Got its Pharynx: Phylogeny, Classification and Bayesian assessment of Character Evolution in Acoela".
About This study is part of submission 11225 (Status: Published).

Matrices

Title: 18S + 28S + COI, Non-structural & unfiltered

Description: The non-structural versions of the datasets were aligned with the g-INS-i algorithms in MAFFT

Rows

Taxon Label Row Segments Characters 1?–30
Actinoposthia beklemischevi  (none) ATGCAAGTTTAAGTTCTTCTG????TTGA?
Actinoposthia haplovata  (none) ATGCAAGTCCAAGTTCAACTA?????TAG?
Amphiscolops bermudensis  (none) ATGCATGTGCAAGTTCAACTT?????GAA?
Amphiscolops sp  (none) ??????????????????????????????
Amphiscolops sp Hendelberg  (none) ATGCATGTGCAAGTTCAACTT?????GGA?
Anaperus biaculeatus  (none) ??????????????????????????????
Anaperus gardineri  (none) CATGCTGTGCAAGTTCAACTA?????TAAC
Anaperus rubellus  (none) ????ATGTGTAAGTTCAGCTT?????GAA?
Anaperus singularis  (none) ??????????????????????????????
Anaperus tvaerminnensis  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT?????TAAA
Aphanostoma bruscai  (none) ?TGCATGTGTGAGTTCAGCAT??TATTA??
Aphanostoma collinae  (none) ATGCATGTGTGAGTTTAGCAT??TA?TA??
Aphanostoma sp  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAG??AA?TA??
Aphanostoma virescens  (none) ??????????????????????????????
Archaphanostoma macrospiriferum  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT??TAAAC??
Ascoparia sp  (none) ATGCATGTCTGAGTACACACT???CTAGC?
Atriofronta polyvacuola  (none) ATGCATGTGTAA?TTCAGCTA????TTTT?
Avagina marci  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA????TTTT?
Avagina n.sp.  (none) ??GCATGTGTAAGTTCAGCTA????TTTT?
Childia brachyposthium  (none) ATGCAAGTACAAGTTCAGCTT???GAAAT?
Childia crassum  (none) ??????????????????????????????
Childia cycloposthium  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACTG??AAGCAA?
Childia groenlandica  (none) ATGCAAGTACAAGTTCAGCTT?????TAA?
Childia macroposthium  (none) ATGCAAGTACAAGTTCAGCTT????GAAT?
Childia nsp 1  (none) ?????????????????????????CCAA?
Childia nsp 2  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAGCTA????AATA?
Childia sp  (none) ATGCAAGTCTAAGTTCAACAA??????AA?
Childia submaculatum  (none) ????ATGTCCAAGTTCAACTA?????AAT?
Childia trianguliferum  (none) ATGCAAGTCTAAGTGAAACTT?????TAC?
Childia vivipara  (none) ????????????GTTCAGCTT??????GA?
Convoluta cf bohmigi  (none) ATGCATGTGTAAGTTTATCTT?????GAA?
Convoluta convoluta  (none) ATGCATGTGTAAGTTCATCTT?????GAA?
Convolutriloba hastifera  (none) ?TGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAA?
Convolutriloba longifissura  (none) ATGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAA?
Convolutriloba macropyga  (none) ATGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAA?
Convolutriloba retrogemma  (none) ATGCATGTGCAAGCGAAGCTT?????GAA?
Daku woorimensis  (none) ATGCATGTCTAAGTACACTGA?CCTATTC?
Diopisthoporus longitubus  (none) ATGCATGTCTAAGTACACGCT???CTCGA?
Diopisthoporus nsp  (none) ATGCATGTCTTAGTACACGCT???CCAGA?
Diopisthoporus psammophilus  (none) ??????????????????????????????
Endocincta nsp  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????ACGA?
Endocincta punctata  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????CAGA?
Eumecynostomum altitudi  (none) ATGCATGTC??AGTTCAACGA???TGGAA?
Faerlea glomerata  (none) ??????????????????????????????
Hallangia proporoides  (none) ATGCATGTGTAAGTACAATGT??GGGCGA?
Haplocelis dichona  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCAGTATTTGA??
Haplogonaria schillingi  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCTT??TTTGA??
Haplogonaria syltensis  (none) ATGCATGTGTAAGTCCAGCTC????TAGG?
Haplogonaria viridis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Haploposthia lactomaculata  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC???CTGAA?
Haploposthia rubra  (none) ATGCAAGTATAAGTTGAACGT????ATAT?
Haploposthia sp  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Haploposthia vandula  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Heterochaerus blumi  (none) ??????????????????????????????
Hofstenia miamia  (none) ATGCATGTCTAAGTTTTTTGAACAAATAA?
Hofsteniola pardii  (none) ATGCATGTCTAAGTTTAACGAATAAATAA?
Isodiametra bajaensis  (none) ??????????????????????????????
Isodiametra cuernos  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAACTG?????AAC?
Isodiametra divae  (none) ATGCATGTTTAAGTTCATCTT?????GAA?
Isodiametra hortulus  (none) ?TGCATGTGTGAGTTTAGCAG??AA?TA??
Isodiametra nicki  (none) ATGCATGTTTAAGTTCATCTT?????GCC?
Isodiametra norvegica  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT??AA?TC??
Isodiametra pulchra  (none) ATGCACGTGTCAGTCCAACA??????????
Isodiametra vexillaria  (none) ATGCATGTGTTAGTTCATCTT?????????
Kuma albiventer  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Kuma viridis  (none) ATGCAAGTGTAAGTTCAGCAATATT?????
Meara stichopi  (none) ATGCATGTCTAAGTACAGACC???CTTGT?
Mecynostomum auritum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCATTGTATATGTAA?
Mecynostomum sp  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGTCAATGTAA?
Myopea callaeum  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????AAGG?
Myopea sp  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC??CAAGGA?
Nemertoderma sp  (none) ATGCATGTCTAAGTATAAACC???CCAGA?
Neochildia fusca  (none) ??????????????????????????????
Notocelis gullmarensis  (none) ??????????????????????????????
Oligofilomorpha interstitiophilum  (none) ATGCACGTATGAGTTCAGCTC????GAGG?
Otocelis erinae  (none) ATGCATGTGTAAGTTCATCTA????TAGA?
Otocelis sandara  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCTT????GAGA?
Paedomecynostomum bruneum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGTCAATGTAA?
Paramecynostomum diversicolor  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAGCGT?CAGTCTA?
Paramecynostomum sp  (none) ?????????????????????????TCTA?
Paratomella rubra  (none) ATGCATGTCTACGTTCAGTAA?????AGA?
Paratomella unichaeta  (none) ATGCATGTCTATGTTCAGTAT?????AGA?
Pelophila lutheri  (none) ?TGCATGTGTAAGTTCAGCTA????TATT?
Philactinoposthia coneyi  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA??TCAAGA?
Philactinoposthia n.sp.  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA??TCAAGA?
Philactinoposthia nsp 2  (none) ATGCATGTGTAAGTTGAACTC????GAGA?
Philactinoposthia saliens  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCC????AACC?
Philactinoposthia sp  (none) ATGCATGTGTAAGTTTAACTC???GAAGG?
Philactinoposthia sp 2  (none) ??????????????????????????????
Philactinoposthia sp 3  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCT???TACCA?
Philactinoposthia sp 4  (none) ??????????????TCAACTC?CCTTAGA?
Philocelis brueggemanni  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCA????GATA?
Philocelis karlingi  (none) ATGCATGTATGAGTGTGCCTATTTGATTA?
Philocelis robrochai  (none) ATGCATGTACAAGTTAAGCCT????GATA?
Philomecynostomum lapillum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGA???TGGAA?
Philomecynostomum sp  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGA???TGGAA?
Polycanthus sp  (none) ??????????????????????????????
Polycanthus sp 2  (none) ???????????????????????CTTGA??
Polycanthus torosus  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Postmecynostomum pictum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAGCGT?CAATCAA?
Praeconvoluta bocasensis  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT??TAGTA??
Praeconvoluta castinea  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT??TT?TA??
Praeconvoluta tigrina  (none) ATGCATGTGTGAGTTCAGCAT??TTATA??
Praeconvoluta tornuva  (none) ?TGCATGTGTGAGTTTAGCAT??TA?TA??
Praesagittifera naikaiensis  (none) ?TGCATGTGTAAGTATATCTT?????GAA?
Proaphanostoma tenuissima  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTA????TTTT?
Proporus bermudensis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCAT??AATGG??
Proporus brochii  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCCT??TTTGGA?
Proporus carolinensis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCCT??GCAAGA?
Proporus sp  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCCT??GCAAGA?
Proporus sp 2  (none) ATGCATGT?TAAGTTCAGCCT??GTTGAA?
Pseudactinoposthia sanguineum  (none) ?TGCAAGTTTAAGTTCTTCTG????TTGA?
Pseudaphanostoma herringi  (none) ATGCATGTGTAAGTTCAGCTT????TTGT?
Pseudaphanostoma smithrii  (none) ?TGCATGTCTAAGTTCAGCTT??TTTGA??
Pseudmecynostomum bruneophilum  (none) ATGCATGTCCAAGTTCAACGTCAATGTAA?
Pseudmecynostomum phoca  (none) ?TGCATGTCC?AGTTCAACGTCAATGTAA?
Pseudohaplogonaria rodmani  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Pseudohaplogonaria sp  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Raphidophallus actuosus  (none) ATGCATGTGTAAGTTCATCTT????TATT?
Simplicomorpha gigantorhabditis  (none) ATGCATGTCTAAGTTCAGCGC??CTTGA??
Solenofilomorpha crezeei  (none) ATGCACGTATAAGTTCAGCTC????AAGG?
Solenofilomorpha nsp  (none) ??????????????????????????????
Solenofilomorpha n.sp. 2  (none) ??????????????TCAGCTC????GAGG?
Stromatricha hochbergi  (none) ATGCATGTGTAAGTGAAACTT?????GAA?
Symsagittifera corsicae  (none) ATGCATGTGTAAGTGAAACTT?????GCA?
Symsagittifera psammophila  (none) ??????????????????????????????
Symsagittifera roscoffensis  (none) ATGCATGTGTAAGTGAAACTT?????GCA?
Waminoa brickneri  (none) ??????????????????????????????
Waminoa sp  (none) ATGCATGTGCAAGTGTCTCTT???GGATA?

Columns

None of the columns has a description.